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CiCHI提高擬南芥總黃酮含量

2019-11-21 11:09楊飛蕓白潔劉坤王瑞剛
生物技術(shù)通報(bào) 2019年11期
關(guān)鍵詞:異構(gòu)酶查爾錦雞兒

楊飛蕓 白潔 劉坤 王瑞剛

(1. 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 內(nèi)蒙古自治區(qū)植物逆境生理與分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,呼和浩特 010011;2. 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,呼和浩特 010018)

類黃酮(Flavonoids)是廣泛存在于植物中的次級(jí)代謝產(chǎn)物,泛指2個(gè)苯環(huán)通過脂肪族三碳鏈相互聯(lián)結(jié)而成的一系列低分子量酚類化合物[1]。迄今為止,已有10000多個(gè)類黃酮類化合物被分離鑒定[2]。類黃酮分布廣泛,在植物的生長、發(fā)育、開花、結(jié)果及耐鹽、抗旱、抵抗紫外線、抗菌、抗病等方面都起著重要作用[3-4]。類黃酮類物質(zhì)是具有多種生物學(xué)活性的一類植物次級(jí)代謝產(chǎn)物,具有重要的食用和藥用價(jià)值,一直以來都受到國內(nèi)外眾多研究者的高度重視[5-6]。近年來,類黃酮研究領(lǐng)域一直非?;钴S,并取得許多重要進(jìn)展[7]。目前已發(fā)現(xiàn)其在人體內(nèi)可以發(fā)揮抗氧化活性、保護(hù)肝臟活性、抗菌活性、抗炎活性及抗癌活性及抗病毒活性等[8-9]。

類黃酮是在胞漿多酶復(fù)合體的催化下,經(jīng)由苯丙烷代謝途徑合成的[10]。參與類黃酮生物合成途徑的酶主要包括:查爾酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)、查爾酮異構(gòu)酶(Chalcone isomerase,CHI)和黃酮醇合成酶(Flavonol synthase,F(xiàn)LS)等[11]。查爾酮異構(gòu)酶(EC 5.5.1.6)是類黃酮合成途徑中的第二個(gè)關(guān)鍵酶,催化分子內(nèi)的環(huán)化反應(yīng)[12]。查爾酮異構(gòu)酶是一個(gè)多基因家族,但由于在進(jìn)化上源自共同的祖先,因此,不同基因的編碼區(qū)同源性很高,其結(jié)構(gòu)和催化機(jī)制也極其相似。但在不同物種中,其基因拷貝數(shù)和時(shí)空表達(dá)模式存在很大差異,并且受到多種因素的誘導(dǎo)[13]。查爾酮異構(gòu)酶是植物體內(nèi)花青素以及其他類黃酮合成的必需酶,通常以單體的形式存在于植物中,由于其蛋白三維折疊結(jié)構(gòu)的特異性,常作為植物特有的標(biāo)記基因[14]。作為類黃酮合成途徑上游的重要酶,查爾酮異構(gòu)酶對(duì)調(diào)控整個(gè)代謝途徑起著重要作用,直接影響下游各種類黃酮化合物,如異黃酮、花青素等的含量。近年來應(yīng)用外源CHI基因轉(zhuǎn)化植物的研究報(bào)道很多,主要集中在改變觀賞植物的花色和提高果蔬、藥用植物中類黃酮的含量等方面[15]。

中間錦雞兒(Caragana intermedia)是豆科錦雞兒屬植物,落葉灌木,具有廣泛的適應(yīng)性和很強(qiáng)的抗逆性,在長期抵御逆境的過程中,形成了一系列適應(yīng)在惡劣環(huán)境下生存的特有機(jī)制[16-17]。中間錦雞兒營養(yǎng)物質(zhì)含量豐富,還含有類黃酮、芪類、苯丙素和萜類等多種次級(jí)代謝產(chǎn)物,是傳統(tǒng)中、蒙藥藥材,其花、根、種子等部位均可入藥[18-19]。但對(duì)其抗逆機(jī)制、類黃酮代謝及其與抗逆性之間的關(guān)系鮮見報(bào)道。

本研究以豆科已知CHI基因的保守結(jié)構(gòu)域設(shè)計(jì)簡并引物,以中間錦雞兒cDNA為模板,克隆CiCHI的cDNA全長,并對(duì)其進(jìn)行了序列分析和系統(tǒng)進(jìn)化分析,通過轉(zhuǎn)基因擬南芥研究CiCHI的功能,為進(jìn)一步揭示中間錦雞兒的抗逆機(jī)制提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

中間錦雞兒種子采自內(nèi)蒙古自治區(qū)呼和浩特市和林格爾縣(111.82°E,40.38°N)。野生型擬南芥Columbia-0生態(tài)型(Col-0)、大腸桿菌DH5α、根癌農(nóng)桿菌GV3101和植物表達(dá)載體質(zhì)粒pCanG-HA由內(nèi)蒙古自治區(qū)植物逆境生理與分子生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存。T載體pMD19-T Vector購自TaKaRa公司。

1.2 方法

1.2.1CiCHI的克隆及分析 采用TRIzol法[20]提取中間錦雞兒和擬南芥總RNA。去除樣品中的DNA后,反轉(zhuǎn)錄合成cDNA第一鏈。

根據(jù)豆科已知CHI基因的保守結(jié)構(gòu)域設(shè)計(jì)簡并引物(表1),以中間錦雞兒cDNA為模板,使用Clontech公司的RACE試劑盒獲得3'-和5'-末端序列。通過分析、比對(duì)、拼接后得到CiCHI的全長序列。PCR引物合成及產(chǎn)物測序由上海生工生物公司完成。

將CiCHI的 ORF(Open reading frame) 序 列在NCBI上進(jìn)行Blast比對(duì),篩選出與其相似度最高的序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。利用Mega 5.0軟件,采用Neighbour-Joining算法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹[21]。不同物種的CHI基因序列分別從NCBI數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、TAIR 數(shù) 據(jù) 庫(http://www.arabidopsis.org/)和植物基因組數(shù)據(jù)庫(https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html)中獲得。

1.2.2 中間錦雞兒的處理方法 選取植物培養(yǎng)室(溫度22℃,16 h光照/8 h黑暗)生長一個(gè)月左右、長勢一致的中間錦雞兒幼苗進(jìn)行脅迫處理,檢測CiCHI的表達(dá)量變化。每個(gè)樣品均為3株幼苗地上部分的混合樣品。紫外(UV-C)輻照處理(紫外光強(qiáng)度為120.5 lx,紫外燈照射距離為1 m)、NaCl和脫落酸(Abscisic acid,ABA)脅迫處理(NaCl濃度200 mmol/L,ABA濃度200 μmol/L)的取樣時(shí)間為0、0.5、1、3、6、9、12和24 h。進(jìn)行3次生物學(xué)重復(fù)。提取脅迫處理樣品的總RNA,以CkEF1α(KC679842)作為內(nèi)參基因,利用qRT-PCR在Light Cycler 480實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(Roche公司)上對(duì)CiCHI的表達(dá)量進(jìn)行檢測?;虮磉_(dá)量以2-ΔCT法計(jì)算。

1.2.3 pCanG-CiCHI植物表達(dá)載體的構(gòu)建 獲得CiCHI編碼區(qū)(ORF),并插入克隆載體pEASY-Blunt Simple中(北京全式金生物公司),將測序驗(yàn)證后的序列用In-Fusion酶連入由CaMV35S啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的植物表達(dá)載體pCanG-HA中,進(jìn)行菌落PCR及雙酶切驗(yàn)證,將驗(yàn)證正確的重組質(zhì)粒電轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞,進(jìn)行菌落PCR鑒定。

表1 引物序列

1.2.4 擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化及純合體篩選 采用浸花法將重組植物表達(dá)載體pCanG-CiCHI轉(zhuǎn)入野生型擬南芥(Col-0)[22],收取成熟的種子種在含有 25 μg/mL卡那霉素的1/2 MS平板培養(yǎng)基上篩選陽性植株。提取T3代轉(zhuǎn)基因植株總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA,利用特異引物CiCHI-F-5'和CiCHI-F-3'進(jìn)行PCR鑒定。利用qRT-PCR對(duì)CiCHI在轉(zhuǎn)基因株系中的表達(dá)量進(jìn)行檢測。反應(yīng)體系為SYBR Premix ExTaq(TaKaRa公司)10 μL、稀釋的cDNA模板5 μL、上、下游引物各 0.8 μL(10 μmol/L)和 DEPC 水 3.4 μL。反應(yīng)程序?yàn)?95℃ 30 s;95℃ 5 s,60℃ 30 s,72℃ 15 s,40個(gè)循環(huán)。AtEF1α(AT5G60390)作為內(nèi)參基因,基因表達(dá)量以2-ΔCT法計(jì)算,選取4株表達(dá)水平較高的不同轉(zhuǎn)化株系進(jìn)行后續(xù)表型試驗(yàn)。

1.2.5 轉(zhuǎn)基因擬南芥總黃酮含量檢測 剪取正常生長條件下(22℃,16 h光照/8 h黑暗)40日齡的擬南芥植株地上部分,每個(gè)株系取3株植物,用液氮研磨成粉末。采用硝酸鋁比色法進(jìn)行總黃酮含量的測定[23],3次生物學(xué)重復(fù)。

2 結(jié)果

2.1 CiCHI的克隆與序列分析

據(jù)豆科已知CHI基因的保守序列設(shè)計(jì)簡并引物,擴(kuò)增得到509 bp的單一條帶(圖1-A),經(jīng)測序后比對(duì),發(fā)現(xiàn)該片段與蒺藜苜蓿CHI基因相似度最高(84%)。利用RACE技術(shù)克隆其缺失的cDNA序列,分別得到248 bp的5'-端和473 bp的3'-端cDNA序列(圖1-B)。

圖1 CiCHI的克隆

經(jīng)測序分析正確后,利用Vector NTI 10將克隆到的序列片段進(jìn)行拼接,得到CiCHI的cDNA全長序列。以中間錦雞兒cDNA為模板,使用特異引物擴(kuò)增其cDNA序列(圖1-C),連接克隆載體驗(yàn)證后,確定拼接結(jié)果正確。得到CiCHI的cDNA全長為1005 bp, 其 中 ORF為 678 bp,5'-UTR 為 110 bp,3'-UTR為217 bp,編碼225個(gè)氨基酸。

2.2 CiCHI蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析

為進(jìn)一步了解CiCHI與其他物種該類基因之間的進(jìn)化關(guān)系,將CiCHI蛋白序列與其他已知物種中相似度最高的CHI蛋白序列進(jìn)行比對(duì),并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2)。結(jié)果表明,CiCHI與蒺藜苜蓿的CHI最為相似,二者與其他豆科植物的CHI構(gòu)成一個(gè)大分支;而同為蕓香科的蜜桔、柚子和甜橙構(gòu)成一個(gè)分支。說明CiCHI與豆科植物的CHI功能最相近。進(jìn)化樹中使用的序列都是NCBI中注釋為Chalcone isomerase(CHI)的基因,即查爾酮異構(gòu)酶基因家族的成員,因此可以確定CiCHI為該基因家族的成員。

圖2 CiCHI與其他物種來源的CHI構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹

2.3 CiCHI脅迫處理下的表達(dá)分析

查爾酮異構(gòu)酶催化類黃酮的生成,起到抵抗氧化脅迫的作用。通過檢測CiCHI在紫外、NaCl和ABA等脅迫處理下的表達(dá)模式(圖3)發(fā)現(xiàn)紫外照射處理下,CiCHI表達(dá)量呈先升高后降低的趨勢,在6 h時(shí)表達(dá)量最高(圖3-A)。NaCl處理下,CiCHI表達(dá)量同樣先升高后降低,在1 h時(shí)表達(dá)量最高(圖3-B)。ABA處理下,CiCHI的表達(dá)受到抑制,在1 h表達(dá)量最低(圖3-C)。

2.4 CiCHI的組織特異性分析

通過對(duì)30日齡中間錦雞兒根、莖、葉中CiCHI進(jìn)行qRT-PCR分析(圖4)發(fā)現(xiàn),CiCHI在所有被檢測的組織中都有不同程度的表達(dá)。在室內(nèi)種植的葉中表達(dá)量最高,莖中相對(duì)較高,根中最少。在野外采摘的花中表達(dá)量高,種子中表達(dá)量低。

2.5 pCanG-CiCHI植物表達(dá)載體的構(gòu)建及轉(zhuǎn)基因純合體植株的鑒定

對(duì)重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定,可以獲得目的片段,表明載體構(gòu)建成功。

通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的浸花法獲得具有卡那霉素抗性的來自不同轉(zhuǎn)化的陽性植株10株,提取這些株系的總RNA并合成cDNA,利用qRT-PCR檢測CiCHI在轉(zhuǎn)基因株系中的表達(dá)水平(圖5),選取表達(dá)量較高的4個(gè)株系OE-13、OE-32、OE-37和OE-46進(jìn)行后續(xù)表型檢測試驗(yàn)。

2.6 轉(zhuǎn)基因擬南芥總黃酮含量的變化

按照硝酸鋁比色法的具體步驟繪制蘆丁標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖6-A)。蘆丁質(zhì)量濃度X和吸光值Y的關(guān)系為:Y=1.081X-0.004,R2=0.999,表明在蘆丁濃度0-0.96 mg/mL中,該標(biāo)準(zhǔn)曲線線性良好。按此方法進(jìn)行轉(zhuǎn)基因擬南芥總黃酮含量的測定(圖6-B)。結(jié)果表明,轉(zhuǎn)基因各株系總黃酮的含量均高于野生型,且達(dá)到顯著水平。說明過表達(dá)CiCHI可以使擬南芥中總黃酮含量明顯增加。

3 討論

類黃酮是錦雞兒中迄今為止被發(fā)現(xiàn)的最重要的活性成分,在植物-環(huán)境相互作用中發(fā)揮著極其重要的功能。類黃酮在植物體內(nèi)的生物合成幾乎完全是由氧化脅迫引起的,是植物組織在不同脅迫下的抗氧化防御系統(tǒng)。它們可以吸收最具能量的太陽光(UV),抑制活性氧的產(chǎn)生,一旦活性氧過量形成可以將其及時(shí)清除;類黃酮可以調(diào)節(jié)生長素的運(yùn)輸和代謝作用,對(duì)植物在脅迫誘導(dǎo)下形態(tài)的發(fā)生具有重要價(jià)值[24]。本研究檢測了轉(zhuǎn)基因擬南芥中總黃酮的含量,由于CiCHI的大量表達(dá),4個(gè)轉(zhuǎn)基因株系的總黃酮含量均顯著高于野生型,說明CiCHI參與了擬南芥的類黃酮代謝,為研究植物類黃酮代謝提供了新的基因源。

圖3 不同脅迫處理下CiCHI的表達(dá)分析

圖4 CiCHI的組織特異性表達(dá)分析

圖5 轉(zhuǎn)基因株系CiCHI表達(dá)水平檢測

圖6 野生型和轉(zhuǎn)基因擬南芥總黃酮含量比較

查爾酮異構(gòu)酶是類黃酮生物合成途徑的第二個(gè)限速酶,是植物體內(nèi)類黃酮合成的必需酶,對(duì)調(diào)控整個(gè)代謝途徑起著重要作用,可使反應(yīng)速率提高107倍,直接影響下游各種類黃酮化合物的生成[13]。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,CHI在整個(gè)進(jìn)化過程中相對(duì)保守,序列相似性達(dá)51%-94%[14]。經(jīng)過比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)本研究獲得的CiCHI與蒺藜苜蓿的CHI基因相似度最高,達(dá)84%,可以確定其為查爾酮異構(gòu)酶。

查爾酮異構(gòu)酶基因家族不同成員的表達(dá)具有明顯的組織特異性[13]。本研究檢測了CiCHI在不同部位的表達(dá)量發(fā)現(xiàn),其表達(dá)量存在很大差異。結(jié)果顯示CiCHI在室內(nèi)種植的葉中表達(dá)量最高;莖中相對(duì)較高;根中最少。在野外采摘的花中表達(dá)量高,種子中表達(dá)量低,與已報(bào)道的研究結(jié)果一致[25-26]。由于根、莖、葉采自室內(nèi)幼苗,花和種子采自野外自然生長的植物。因此,其生長條件、生長時(shí)間等各方面因素均不相同,使其表達(dá)量無法比較。

查爾酮異構(gòu)酶家族基因受不同脅迫處理誘導(dǎo),如UV、干旱、損傷和NaCl等,從而引起類黃酮含量的增加,使其抗氧化等抵御逆境的能力提高[15,27]。本研究發(fā)現(xiàn)中間錦雞兒CiCHI受到紫外、NaCl和ABA等處理的誘導(dǎo),不同處理方式下該基因的表達(dá)模式不同。在受到紫外和NaCl脅迫時(shí)表達(dá)模式基本一致,開始受到脅迫影響時(shí),表達(dá)量升高,生成大量類黃酮以幫助機(jī)體抵抗氧化脅迫的影響。但隨著脅迫壓力的增加,其表達(dá)量開始降低,可能其產(chǎn)物水平已經(jīng)達(dá)到一定量并不再大量增加,此時(shí)機(jī)體也可能已經(jīng)啟動(dòng)了其他的脅迫響應(yīng)機(jī)制。ABA處理使CiCHI的表達(dá)受到抑制。

4 結(jié)論

克隆得到中間錦雞兒CiCHI,其開放閱讀框678 bp,編碼225個(gè)氨基酸。CiCHI受到紫外、NaCl、ABA等脅迫誘導(dǎo)。在葉中表達(dá)量最高,莖中相對(duì)較高,根中最少;花中表達(dá)量高,種子中低。擬南芥中超表達(dá)CiCHI可使其總黃酮含量增加。

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