余覓 何杰 李小燕 孫建 王春茂
[摘要]目的 探討賴氨酰氧化酶(LOX)基因G473A多態(tài)性與亞洲人群惡性腫瘤易感性的關(guān)系。方法 通過計(jì)算機(jī)檢索PubMed、CNKI、萬方全文數(shù)據(jù)庫等數(shù)據(jù)庫,查找建庫至2017年3月關(guān)于LOX基因與惡性腫瘤易感性關(guān)系的研究文獻(xiàn)。篩選文獻(xiàn)并提取數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。結(jié)果 LOX基因G473A多態(tài)性與亞洲人群惡性腫瘤易感性之間的相關(guān)性在各基因模型中均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。假陽性報(bào)告率檢驗(yàn)結(jié)果顯示各基因模型的檢驗(yàn)值均低于預(yù)先設(shè)定的臨界值0.2,有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論 該Meta分析表明,LOX基因G473A多態(tài)性與亞洲人群惡性腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)之間可能存在相關(guān)性。
[關(guān)鍵詞]蛋白賴氨酸6-氧化酶;腫瘤;多態(tài)性,單核苷酸;Meta分析
[中圖分類號]R345.44;R394.25
[文獻(xiàn)標(biāo)志碼]A
[文章編號] 2096-5532(2019)05-0523-05
doi:10.11712/jms201905005
[開放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識碼(OSID)]
惡性腫瘤是全球亟待解決的公共衛(wèi)生問題之一,并給病人家庭和社會造成沉重的經(jīng)濟(jì)和心理負(fù)擔(dān)[1-2]。已有大量研究表明,賴氨酰氧化酶(LOX)異常表達(dá)與腫瘤細(xì)胞的發(fā)生發(fā)展、分化、黏附等密切相關(guān)[3-6]。其中LOX基因G473A位點(diǎn)是目前研究的熱點(diǎn)之一[7]。YOON等[8]研究發(fā)現(xiàn),LOX基因G473A位點(diǎn)的多態(tài)性與胃癌、乳癌的分化和進(jìn)展明顯相關(guān)。但由于單個研究的樣本量偏小,所得結(jié)論尚有爭議。為了確定LOX基因G473A是否與惡性腫瘤相關(guān),本文采用Meta分析的方法首次對LOX基因G473A位點(diǎn)多態(tài)性與亞洲人群惡性腫瘤易感性的關(guān)聯(lián)進(jìn)行研究。
1 資料與方法
1.1 文獻(xiàn)檢索
采用計(jì)算機(jī)檢索,檢索范圍為PubMed、萬方全文數(shù)據(jù)庫、CNKI、CBM、web of science、中國科技期刊數(shù)據(jù)庫等數(shù)據(jù)庫,檢索時限為建庫至2017年3月,檢索內(nèi)容為LOX基因G473A多態(tài)性與惡性腫瘤易感性的相關(guān)文獻(xiàn)。英文檢索詞:lysyl oxidase、LOX、polymorphism、cancer;中文檢索詞: LOX基因、多態(tài)性、腫瘤。文獻(xiàn)語言限定為中文、英文。
1.2 納入與排除標(biāo)準(zhǔn)
1.2.1 納入標(biāo)準(zhǔn) ①研究設(shè)計(jì)為病例-對照研究;②研究內(nèi)容包含LOX基因G473A位點(diǎn)與腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)系;③含有可供提取的基因型分布頻率及數(shù)據(jù)。
1.2.2 排除標(biāo)準(zhǔn) ①重復(fù)報(bào)道的文獻(xiàn);②中、英文以外的文獻(xiàn);③綜述、會議摘要等;④研究內(nèi)容不包含LOX基因G473A位點(diǎn)。
1.3 文獻(xiàn)質(zhì)量評價及資料提取
在資料提取的內(nèi)容和文獻(xiàn)質(zhì)量評價標(biāo)準(zhǔn)上達(dá)成共識后,由兩位評價者各自獨(dú)立地對納入的每篇文獻(xiàn)進(jìn)行質(zhì)量評價和資料提取,并進(jìn)行交叉核對,如遇不一致則立即討論協(xié)商解決。納入文獻(xiàn)的質(zhì)量參考強(qiáng)化遺傳關(guān)聯(lián)性研究報(bào)道質(zhì)量聲明(STREGA)原則[9]進(jìn)行評價。每篇文獻(xiàn)提取的內(nèi)容包括:發(fā)表時間、第一作者、癌癥類型、國家、種族、基因型檢測方法以及G473A位點(diǎn)各基因型分布情況等。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
1.4.1 異質(zhì)性檢驗(yàn)和森林圖繪制 ?使用Revman 5.3軟件。選擇優(yōu)勢比(OR)值作為評價危險(xiǎn)因素的指標(biāo)。選擇I2對所納入的研究進(jìn)行異質(zhì)性定量分析。當(dāng)異質(zhì)性檢驗(yàn)的P值(Phet)>0.05,I2<50%時選用固定效應(yīng)模型進(jìn)行分析;反之,則采用隨機(jī)效應(yīng)模型進(jìn)行分析。
1.4.2 發(fā)表偏倚的評估和敏感性分析 使用Revman 5.3和STATA 11.0軟件。通過剔除各單個研究后總體效應(yīng)的變化判斷結(jié)果的穩(wěn)定性和可靠性。通過漏斗圖、Egger’s檢驗(yàn)評估發(fā)表偏倚。
1.4.3 假陽性概率檢驗(yàn)(FPRP) ①預(yù)設(shè)FPRP的臨界值為0.2;②確定HA(備擇假設(shè))先驗(yàn)概率;③建議將OR值設(shè)為1.5;④用Power and Sample軟件計(jì)算FPRP值。如果FPRP<0.2,說明結(jié)果的假陽性率低于預(yù)期值,可以認(rèn)為LOX基因多態(tài)性與惡性腫瘤易感性之間的關(guān)聯(lián)是有意義的。
2 結(jié)果
2.1 文獻(xiàn)檢索
根據(jù)檢索詞檢索到中英文文獻(xiàn)共72篇,剔除重復(fù)和不相關(guān)文獻(xiàn)51篇,剩余21篇經(jīng)全文仔細(xì)閱讀后最終納入10篇。其中英文文獻(xiàn)8篇,中文文獻(xiàn)2篇。納入研究主要是來自中國的研究,有1篇來自韓國。共納入腫瘤病人3 275例,健康對照3 964例。文獻(xiàn)篩選流程如圖1所示。納入Meta分析各研究的基本特征和基因頻率分布情況見表1。
2.2 Meta分析
2.2.1 等位基因模型 采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行Meta分析,結(jié)果顯示,與等位基因G相比較,等位基因A可能增加亞洲人群惡性腫瘤的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(A ?vs ?G, Phet=0.900,I2=0,OR=1.48, 95%CI=1.37~1.61,P<0.001)。見圖2和表2。
2.2.2 顯性基因模型 采用固定效應(yīng)模型分析,結(jié)果顯示,與GG基因型相比,基因型AG+AA可能增加亞洲人群惡性腫瘤的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(AA+AG vs
GG,Phet=0.160,I2=29%,OR=1.40, 95%CI=1.27~1.55,P<0.001)。見圖3和表2。
2.2.3 隱性基因模型 采用固定效應(yīng)模型分析,發(fā)現(xiàn)基因型AA可能增加亞洲人群惡性腫瘤的發(fā)病率(AA ?vs ?AG+GG,Phet=0.850,I2=0,OR=2.30, 95%CI=1.92~2.77,P<0.001)。見表2。
2.2.4 純合子模型 采用固定效應(yīng)模型分析,發(fā)現(xiàn)基因型AA的亞洲人群相對于基因型GG的亞洲人群與惡性腫瘤的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)具有一定的統(tǒng)計(jì)學(xué)相關(guān)性(AA ?vs ?GG,Phet=0.990,I2=0,OR=2.44, 95%CI=2.02~2.94,P<0.001)。見表2。
2.2.5 雜合子模型 采用隨機(jī)效應(yīng)模型分析,發(fā)現(xiàn)基因型AG的亞洲人群相對于基因型GG的亞洲人群惡性腫瘤的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有一定的統(tǒng)計(jì)學(xué)相關(guān)性(AG ?vs ?GG,Phet=0.006,I2=58%,OR=1.22,95%CI=1.04~1.45,P<0.05)。見表2。
2.3 發(fā)表偏倚和影響性分析
本研究采取漏斗圖法、Egger’s 檢驗(yàn)進(jìn)行發(fā)表偏倚的分析,結(jié)果顯示研究分布對稱,且集中在漏斗頂部。見圖4。行Egger’s檢驗(yàn)提示本研究不存在發(fā)表偏倚(t=0.42,P>0.05)。影響性分析結(jié)果也表明,納入的各項(xiàng)研究均對分析結(jié)果無明顯影響。見圖5。
2.4 FPRP
本研究將Meta分析得出的陽性結(jié)果行進(jìn)一步的FPRP。設(shè)定FPRP臨界值為0.2,先驗(yàn)概率設(shè)置為中等(≈0.01),關(guān)聯(lián)強(qiáng)度指標(biāo)OR=1.5,結(jié)果表明LOX的5個基因型(AA+AG ?vs ?GG, AA ?vs ?AG+GG,AA ?vs ?GG, AG ?vs ?GG, A ?vs ?G)FPRP值均低于預(yù)先設(shè)定的臨界值0.2。見表2??梢耘袛郘OX多態(tài)性與惡性腫瘤易感性可能存在真實(shí)關(guān)聯(lián),值得進(jìn)一步深入的研究。
3 討論
LOX是一種由多功能基質(zhì)成纖維細(xì)胞所分泌的銅依賴性酶,它可以通過氧化多肽中賴氨酸殘基引起膠原蛋白、彈性蛋白及組蛋白發(fā)生共價交聯(lián),進(jìn)而形成難溶解的纖維或者纖維聚合物,以穩(wěn)定細(xì)胞外基質(zhì)和細(xì)胞核[19-22]。因此,LOX在維持組織形態(tài)及修復(fù)過程中起到重要作用。在許多腫瘤細(xì)胞系中,LOX的mRNA表達(dá)水平較低[23],表明LOX可能是一種腫瘤抑制因子,發(fā)揮調(diào)節(jié)癌基因的表達(dá)、穩(wěn)定核結(jié)構(gòu)蛋白的作用,從而維持染色體及細(xì)胞核的穩(wěn)定性[24-27]。
本文Meta分析首次探討了LOX基因G473A多態(tài)性與惡性腫瘤易感性之間的關(guān)聯(lián)性,共納入10篇文獻(xiàn),各項(xiàng)研究的對照組均符合Hardy-Weinberg平衡定律,并按照前述質(zhì)量評價標(biāo)準(zhǔn)對納入研究進(jìn)行評價,納入研究質(zhì)量均較高。本文各個研究間存在一定的異質(zhì)性,進(jìn)行Meta回歸分析檢驗(yàn)異質(zhì)性,提示異質(zhì)性原因可能有以下幾個方面。①腫瘤的易感性受多個基因影響,且各基因的作用大小各不相同,沒有綜合考慮各基因間相互協(xié)同作用。②樣本的異質(zhì)性:各個地域人種血統(tǒng)的差異;研究所選取的腫瘤的診斷標(biāo)準(zhǔn)不同;樣本中病人疾病的嚴(yán)重程度不同或者疾病的種類不同;各個研究的病例組和對照組病人生存環(huán)境不同。③納入研究樣本純化遺傳背景后數(shù)量有所不足,應(yīng)該進(jìn)一步純化,擴(kuò)大樣本量,以提高檢驗(yàn)效能。
本研究顯示,在總體人群合并分析中,LOX基因G473A多態(tài)性與惡性腫瘤之間的相關(guān)性在各個基因模型均具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,且FPRP值均低于預(yù)先設(shè)定的臨界值。上述結(jié)果表明,在亞洲人群中LOX基因G473A多態(tài)性與惡性腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)可能有一定相關(guān)性,尤其在顯性遺傳模式中,GG基因型人群惡性腫瘤的發(fā)病率明顯低于AG+AA基因型人群,說明LOX基因的突變型等位基因A可能增加罹患惡性腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)。推測原因:G473A多態(tài)性位于LOX基因前多肽序列,它是LOX基因的一個重要且高發(fā)的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),等位基因G突變?yōu)锳導(dǎo)致158位的精氨酸置換為谷氨酰胺,這一突變可能影響了LOX前多肽的抗癌機(jī)制,從而引起腫瘤的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加[28-31]。此外,本研究納入的文獻(xiàn)均只涉及亞洲人群,表明LOX基因的頻率可能在亞洲人群中分布較高。
本研究仍然存在著一些不足。首先,納入文獻(xiàn)較少,未搜索到關(guān)于高加索人、拉美人、非洲人LOX基因與惡性腫瘤關(guān)系的相關(guān)文獻(xiàn),可能會降低LOX基因G473A多態(tài)性與惡性腫瘤易感性關(guān)系的證據(jù)級別。其次,本研究的結(jié)果存在一定的異質(zhì)性,將不同類型的腫瘤進(jìn)行合并分析是導(dǎo)致異質(zhì)性的原因之一。但因?qū)膊》N類不同進(jìn)行亞組分析時,每個亞組只有1~2個研究,其結(jié)果不具有臨床意義,故未根據(jù)腫瘤的類型不同進(jìn)行亞組分析,故結(jié)論有待進(jìn)一步研究。
綜上所述,現(xiàn)有的研究表明LOX基因G473A多態(tài)性可能與惡性腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)具有一定的相關(guān)性,尤其是在亞洲人群。鑒于LOX基因作用機(jī)制的復(fù)雜性,以及納入的研究數(shù)量較少,該結(jié)論有待于更進(jìn)一步論證,期待繼續(xù)開展多中心、大樣本、高質(zhì)量的病例對照研究;并同時深入探討基因-基因及基因和環(huán)境交互作用對惡性腫瘤發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的影響,為基礎(chǔ)研究和臨床的治療提供更加可靠完善的證據(jù)。
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(本文編輯 牛兆山 于國藝)