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海洋低溫肌氨酸氧化酶生產(chǎn)菌株的篩選、鑒定及酶學(xué)特性研究

2019-07-09 06:22遲乃玉李美玉張慶芳
中國釀造 2019年6期
關(guān)鍵詞:肌酸氧化酶活力

遲乃玉,劉 洋,于 爽,希 倫,李美玉,張慶芳*

(1.大連大學(xué) 生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,遼寧 大連 116622;2.遼寧省海洋微生物工程技術(shù)研究中心,遼寧 大連 116622)

肌氨酸氧化酶(sarcosine oxidase,SOX)屬于黃素蛋白氧化酶類,在自然界中分布廣泛。其是酶法測(cè)定肌酐中研究較多的一種酶,可催化肌氨酸中的N-甲基氧化,可偶聯(lián)肌酐酶和肌酸酶降解肌酐。作為一種重要的診斷酶制劑,是測(cè)定血清或尿液中肌酐含量的關(guān)鍵酶之一,應(yīng)用于腎臟的健康程度的診斷[1]。

為了滿足工業(yè)用酶的需求,趙更鋒等[2-9]已從肌氨酸氧化酶的分布、酶學(xué)性質(zhì)以及分子生物學(xué)方面進(jìn)行了大量研究。SUZUKIM[10]最早發(fā)現(xiàn)棒狀桿菌屬(Corynebacterium sp.)可以產(chǎn)肌氨酸氧化酶,隨后相繼發(fā)現(xiàn)假單胞菌(Pseudomonas)、鏈霉菌(Streptomyces)、芽孢桿菌(Bacillus)和節(jié)桿菌(Arthrobacter)等微生物均可產(chǎn)肌氨酸氧化酶[11-16]。但目前依然存在著許多不足之處,如熱穩(wěn)定性普遍較差,使其在一些領(lǐng)域的應(yīng)用中受到限制。MORIN等[17]從土壤中篩選出一株產(chǎn)單聚體肌氨酸氧化酶的銨鐠柱胞霉菌(Cylindrocarpon didymium)M-1,測(cè)得該單聚體肌氨酸氧化酶分子質(zhì)量為48 kDa,最適pH值為7.5,最適溫度為40℃,將該酶在45℃處理10 min,殘余酶活力為75%。

本研究從渤海海泥中分離、篩選一株高產(chǎn)低溫肌氨酸氧化酶菌株,采用形態(tài)觀察、生理生化試驗(yàn)及分子生物學(xué)技術(shù)對(duì)其進(jìn)行鑒定,并對(duì)其所產(chǎn)的肌氨酸氧化酶酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行初步研究,為腎臟疾病診斷試劑盒的研發(fā)提供優(yōu)質(zhì)的菌種資源。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

1.1.1 樣品

海泥樣品:遼寧省大連渤海灣(N:39°7′,S:121°41′)。

1.1.2 試劑

肌酸:大連凱美化工工程配套有限公司;脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)純化試劑盒:大連寶生物有限公司;酵母膏、硫酸鎂、磷酸氫二鉀、磷酸二氫鉀、碘化鉀、淀粉、牛肉膏、胰蛋白胨、氯化鈉:生工生物工程(上海)股份有限公司;所有試劑均為國產(chǎn)分析純或生化試劑。

1.1.3 培養(yǎng)基[18]

富集培養(yǎng)基:肌酸5.0 g/L,酵母膏0.5 g/L,硫酸鎂0.5 g/L,磷酸氫二鉀0.5 g/L,磷酸二氫鉀2 g/L,海水1 L,pH 7.0。

分離培養(yǎng)基:肌酸5.0 g/L,酵母膏5 g/L,硫酸鎂0.5 g/L,磷酸氫二鉀0.5 g/L,磷酸二氫鉀2 g/L,碘化鉀1.7 g/L,淀粉10 g/L,海水1 L,pH 7.0。

種子培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g/L,牛肉膏5 g/L,NaCl 10 g/L,海水1 L,pH 7.0。

發(fā)酵培養(yǎng)基:肌酸5.0 g/L,酵母膏5 g/L,硫酸鎂0.5 g/L,磷酸氫二鉀0.5 g/L,磷酸二氫鉀2 g/L,海水1 L,pH 7.0。

LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物5 g/L,氯化鈉10 g/L。

以上固體培養(yǎng)基中加入20 g/L瓊脂,培養(yǎng)基均在0.1 MPa、121℃條件下高壓蒸汽滅菌20 min。

1.2 儀器與設(shè)備

HZP-256全溫振蕩培養(yǎng)箱:上海智誠分析儀器制造有限公司;CX21FS3顯微鏡:日本OLYMPUS公司;NB-1630超凈工作臺(tái)、UV-H232可見紫外分光光度計(jì):菲迪康樂(廣州)科學(xué)儀器有限公司;LDFX-50BI立式壓力蒸汽滅菌鍋:蘭州方盛生物科技有限公司;APL-204電子天平、pH-3G pH計(jì):陜西鼎盛儀器設(shè)備有限公司;MBS聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀:上海普迪生物技術(shù)有限公司。

1.3 試驗(yàn)方法

1.3.1 產(chǎn)肌氨酸氧化酶菌株的篩選

菌株初篩:取大連渤海海灣海泥10 g于100 mL富集培養(yǎng)基中,在20℃、150 r/min條件下振蕩培養(yǎng),每天測(cè)肌酸含量。待肌酸完全降解后,富集培養(yǎng)液經(jīng)10倍梯度稀釋至10-6,將稀釋液涂布于固體分離培養(yǎng)基,25℃條件下倒置培養(yǎng)24 h,挑取變?yōu)樗{(lán)綠色的菌落進(jìn)行分離、純化。將分離得到的菌株接種到新鮮的分離培養(yǎng)基中,20℃、150 r/min條件下培養(yǎng)72 h,測(cè)定肌酸的降解情況。

菌株復(fù)篩:將可降解肌酸的菌株接種于發(fā)酵培養(yǎng)基中,20℃、150 r/min條件下培養(yǎng)48 h,測(cè)定其肌氨酸氧化酶活力。

1.3.2 肌酸降解率的測(cè)定[19]

在0.5 mL的樣品中,加入1 mL含有1%α-萘酚的1.5 mol/L NaOH、0.5 mL 0.05%的雙乙酰,顯色30 min,再加入3 mL蒸餾水,于波長530 nm處測(cè)定吸光度值。計(jì)算肌酸降解率,計(jì)算公式如下:

1.3.3 肌氨酸氧化酶活力的測(cè)定[19]

將待測(cè)菌體進(jìn)行超聲破壁后,于4℃、8 000 r/min條件下離心15 min,取上清酶液0.1 mL于0.9 mL含有0.1 mol/L肌氨酸的焦磷酸鈉緩沖液(pH 7.4)中,37℃反應(yīng)10 min,再加入0.25 mL 0.1 mol/L的醋酸終止反應(yīng),并加入1.5 mL含有0.04%乙酰丙酮的20%乙酸銨溶液,于37℃反應(yīng)40 min后,在波長410 nm處測(cè)定吸光度值。

肌氨酸氧化酶活力定義:在37℃、pH 7.0條件下每分鐘分解1μmol肌氨酸的酶量為一個(gè)酶活力單位(U)。

1.3.4 菌株的鑒定

形態(tài)觀察:將試驗(yàn)菌株劃線于固體LB平板上,20℃恒溫培養(yǎng)24 h,觀察菌株的菌落形態(tài)特征,并挑取單菌落,進(jìn)行革蘭氏染色,觀察菌株的細(xì)胞形態(tài)。

生理生化試驗(yàn)[20]:對(duì)試驗(yàn)菌株進(jìn)行V-P反應(yīng)、接觸酶反應(yīng)、硝酸鹽還原試驗(yàn)、產(chǎn)生吲哚試驗(yàn)、淀粉水解試驗(yàn)、明膠水解試驗(yàn)、含碳化合物的利用等試驗(yàn)。

分子生物學(xué)鑒定:將試驗(yàn)菌株接種于富集培養(yǎng)基中,20 ℃、150 r/min條件下培養(yǎng)48 h,8 000 r/min離心15 min后棄上清,加入100μL無菌重蒸水(ddH2O)中,混勻,沸水處理10 min,12 000 r/min離心10 min,以上清液為模板對(duì)試驗(yàn)菌株的16S rDNA基因序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增[19]。正向引物為BSF8/20(5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3');反向引物為BSR1541/20(5'-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA-3')。采用DNA純化試劑盒對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化,并送至北京諾禾致源生物技術(shù)有限責(zé)任公司進(jìn)行測(cè)序。將測(cè)序結(jié)果提交至美國國家生物技術(shù)信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)的GenBank數(shù)據(jù)庫中,與已知菌種的16S rDNA序列進(jìn)行BLAST同源性比對(duì),選擇若干條同源性較高的模式菌株的16S rDNA序列,采用MEGA 5.0軟件中的鄰接(neighbor joining,NJ)法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,確定其分類地位。

1.3.5 肌氨酸氧化酶酶學(xué)性質(zhì)的初步研究

最適作用溫度:按照肌氨酸氧化酶活力的測(cè)定方法,分別在不同作用溫度條件下(5~70℃,梯度為5℃),測(cè)定肌氨酸氧化酶活力,確定酶的最適反應(yīng)溫度;將同組實(shí)驗(yàn)中最高酶活力設(shè)為100%,計(jì)算相對(duì)酶活。

熱穩(wěn)定性:將粗酶液分別在不同溫度條件下(25℃、30℃、40℃、50℃、60℃、70℃)處理60 min,測(cè)定酶活力。

最適作用pH:分別在不同pH值條件下(4.0~11.0,梯度為0.5)測(cè)定肌氨酸氧化酶酶活力,確定酶的最適反應(yīng)pH。其中pH 4.0~6.0為0.1 mol/L檸檬酸-檸檬酸鈉緩沖液;pH 6.0~8.5為0.1 mol/L磷酸鹽緩沖液;pH 8.5~9.5為0.05 mol/L硼砂-硼酸緩沖液;pH 9.5~11.0為0.05 mol/L硼砂-NaOH緩沖液。

pH穩(wěn)定性:將粗酶液分別于不同pH值(4.0~11.0,梯度為0.5)的緩沖液中,37℃保溫18 h,測(cè)定酶活力。

不同金屬離子對(duì)肌氨酸氧化酶活性的影響:將粗酶液分別加入含有1 mmol/L或10 mmol/L不同金屬離子(Co2+、Ca2+、K+、Fe2+、Zn2+、Mn2+、Mg2+、Ni2+、Cu2+)的溶液中,37 ℃保溫30 min,測(cè)定酶活力。將未加入金屬離子的酶液活力設(shè)為100%,計(jì)算各組的相對(duì)酶活。

2 結(jié)果與分析

2.1 產(chǎn)肌氨酸氧化酶菌株的初篩

通過初篩發(fā)現(xiàn),27個(gè)菌落周圍變成藍(lán)綠色,其中10株菌株(LYH03、LYH09、LYH18、LYH36、LYH44、LYH45、LYH83、LYH106、LYH186、LYH221)可降解肌酸(對(duì)照菌株肌酸降解率為4.5%),結(jié)果見表1。由表1可知,菌株LYH18降解肌酸的能力最強(qiáng),培養(yǎng)72 h后,肌酸降解率達(dá)75%。

表1 菌株的肌酸降解率Table 1 Creatine degradation rate of strains

2.2 產(chǎn)肌氨酸氧化酶菌株的復(fù)篩

將初篩獲得的10株菌進(jìn)行搖瓶發(fā)酵,測(cè)定其肌氨酸氧化酶活力,結(jié)果如表2所示。

表2 菌株產(chǎn)肌氨酸氧化酶的酶活比較Table 2 Comparison of enzyme activities of sarcosine oxidase produced by strains

由表2可知,菌株LYH18的肌氨酸氧化酶活力最高,為1.65 U/mL,與肌酸降解情況一致。因此,選取菌株LYH18為目標(biāo)菌株,對(duì)其進(jìn)行菌種鑒定。

2.3 菌株的鑒定

2.3.1 形態(tài)觀察

菌株LYH18的菌落與細(xì)胞形態(tài)見圖1。由圖1a可知,菌株LYH18在LB固體培養(yǎng)基上,菌落呈圓形,隆起,表面光滑,濕潤,邊緣整齊,無色,易挑??;由圖1b可知,革蘭氏染色呈陽性,在LB固體培養(yǎng)基上生長3 d后形成芽孢,芽孢形狀為橢圓形,菌體呈桿狀。這些特征表明,菌株LYH18呈現(xiàn)出典型的細(xì)菌特征。

圖1 菌株LYH18的菌落(a)和細(xì)胞(b)形態(tài)Fig.1 Colony(a)and cell(b)morphology of strain LYH18

2.3.2 生理生化鑒定

參照《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》(第8版)[21]對(duì)菌株LYH18進(jìn)行生理生化試驗(yàn),生理生化特征結(jié)果見表3。

由表3可知,菌株LYH18在無氧條件下不能生長,接觸酶試驗(yàn)呈陽性,V-P反應(yīng)呈陰性,對(duì)氯化鈉有較強(qiáng)的耐受性,在10%NaCI條件下能夠生長;不能分解酪酛、明膠及淀粉;可將硝酸鹽還原為亞硝酸鹽;能利用多種碳水化合物,如D-半乳糖、L(+)-鼠李糖、纖維二糖、葡萄糖、蔗糖、松三糖,但不能利用D-木糖、棉子糖和D-甘露糖;不能產(chǎn)吲哚。結(jié)合形態(tài)觀察,根據(jù)《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》(第8版)初步鑒定菌株LYH18為芽孢桿菌屬(Bacillus)。

表3 菌株LYH18的生理生化特征Table 3 Physiological and biochemical characteristics of strain LYH18

2.3.3 分子生物學(xué)鑒定

為了進(jìn)一步鑒定分離菌株LYH18,將其16S rDNA序列在GenBank數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行同源性比對(duì)。結(jié)果表明,菌株LYH18與Bacillus的多個(gè)菌種的序列相似性>97%,采用MEGA5.0軟件中的NJ法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果如圖2。由圖2可知,菌株LYH18與海泥芽孢桿菌(Bacillus oceanisediminis)H2同源性(99%)較高,親緣關(guān)系最近。結(jié)合形態(tài)觀察及生理生化試驗(yàn)結(jié)果,將菌株LYH18鑒定為海泥芽胞桿菌(Bacillus oceanisediminis)。

圖2 基于16S rDNA序列菌株LYH18的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree of strain LYH18 based on 16S rDNA sequences

2.4 酶學(xué)性質(zhì)研究

2.4.1 肌氨酸氧化酶的最適作用溫度

不同作用溫度條件下測(cè)定肌氨酸氧化酶活力,結(jié)果見圖3。由圖3可知,當(dāng)作用溫度在10~15℃時(shí),肌氨酸氧化酶的活性隨著作用溫度的升高而急劇增大;當(dāng)作用溫度為25℃時(shí),肌氨酸氧化酶活力最高;當(dāng)作用溫度在15~45℃時(shí),相對(duì)酶活力基本保持在80%以上,說明在室溫條件下,該酶即可保持較高酶活,這一特點(diǎn)可節(jié)省能源的消耗;當(dāng)作用溫度高于45℃后,酶活性急劇下降;當(dāng)作用溫度高于50℃后,相對(duì)酶活<60%。結(jié)果表明,肌氨酸氧化酶的最適作用溫度為25℃,該酶對(duì)高溫條件比較敏感,更適合低溫條件。

圖3 肌氨酸氧化酶的最適反應(yīng)溫度Fig.3 Optimal reaction temperature of sarcosine oxidase

2.4.2 肌氨酸氧化酶的熱穩(wěn)定性

肌氨酸氧化酶的熱穩(wěn)定性如圖4所示。由圖4可知,肌氨酸氧化酶在25~40℃條件下處理60 min后,相對(duì)酶活>80%,保持高酶活性,說明該酶在室溫條件下,較穩(wěn)定;當(dāng)處理溫度高于40℃以后,相對(duì)酶活力逐漸下降,符合海洋低溫酶的特性[23];該酶在50℃處理60 min后,相對(duì)酶活力急速下降,僅保留30%的相對(duì)酶活力;在60℃、70℃處理60 min,相對(duì)酶活力均<10%,說明該酶熱穩(wěn)定性較弱。

圖4 肌氨酸氧化酶的熱穩(wěn)定性Fig.4 Thermal stability of sarcosine oxidase

2.4.3 肌氨酸氧化酶的最適作用pH值

不同作用pH值條件下測(cè)定肌氨酸氧化酶活力,結(jié)果如圖5所示。由圖5可知,該肌氨酸氧化酶作用的最適作用pH為8.0,且pH值在7.5~9.0之間時(shí),相對(duì)酶活性較高,可保持在80%以上;當(dāng)pH值≤7.0或≥9.0時(shí),相對(duì)酶活性較低。

圖5 肌氨酸氧化酶的最適作用pH值Fig.5 Optimal reaction p H of sarcosine oxidase

2.4.4 肌氨酸氧化酶的pH穩(wěn)定性

肌氨酸氧化酶的pH穩(wěn)定性結(jié)果如圖6所示。由圖6可知,該酶在pH值≤6.0時(shí),相對(duì)酶活<40%;在pH值7.0~10.0之間時(shí),酶活可保持在80%以上,較穩(wěn)定;由此可以得出,在中性至弱堿性條件下,肌氨酸氧化酶活性較高,較穩(wěn)定,說明該酶耐弱堿性。

圖6 肌氨酸氧化酶的pH穩(wěn)定性Fig.6 pH stability of sarcosine oxidase

2.4.5 不同金屬離子對(duì)肌氨酸氧化酶活性的影響

不同金屬離子對(duì)肌氨酸氧化酶活力的影響見圖7。

圖7 不同金屬離子對(duì)肌氨酸氧化酶活性的影響Fig.7 Effect of different metal ions on sarcosine oxidase activity

由圖7可知,不同金屬離子對(duì)酶的作用不同;同種金屬離子在不同終濃度條件下對(duì)酶的作用也不同。其中Ca2+、Fe2+、Ni2+、Cu2+能使該酶失活,而K+對(duì)酶活性幾乎沒有影響;Co2+、Zn2+、Mg2+對(duì)酶活性有一定促進(jìn)作用,其中Co2+對(duì)酶活性促進(jìn)作用最強(qiáng)。

3 結(jié)論

本研究從渤海灣海泥樣品中分離到一株高產(chǎn)肌氨酸氧化酶的菌株LYH18,肌氨酸氧化酶活力為1.65 U/mL。通過形態(tài)觀察、生理生化分析和分子生物學(xué)技術(shù)鑒定菌株LYH18為海泥芽胞桿菌(Bacillus oceanisediminis)。經(jīng)初步探索其產(chǎn)肌氨酸氧化酶的酶學(xué)性質(zhì),結(jié)果表明,該菌株所產(chǎn)的肌氨酸氧化酶的最適作用溫度和pH值分別為25℃和8.0,在溫度25~40℃和pH 7.0~10.0范圍內(nèi),酶活性較穩(wěn)定,該酶屬于低溫酶類。菌株LYH18作為一株產(chǎn)肌氨酸氧化酶的新菌源,具有潛在的開發(fā)價(jià)值。

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