嚴(yán)春霞,陸偉宏,何國(guó)產(chǎn),聞人慶,錢(qián) 穎
1金華職業(yè)技術(shù)學(xué)院醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)系,浙江金華 3210072金華市人民醫(yī)院兒科,浙江金華 321000
肺炎支原體(Mycoplasmapneumoniae,Mp)是引起原發(fā)性非典型肺炎等呼吸道感染性疾病的常見(jiàn)病原體,通過(guò)呼吸道傳播,并以嬰幼兒多見(jiàn)。支原體肺炎的臨床表現(xiàn)不典型,與其他常見(jiàn)呼吸道疾病所致的感染非常相似,僅憑臨床癥狀、病原學(xué)診斷,往往難以做出準(zhǔn)確的早期診斷[1]。有資料顯示肺炎支原體易發(fā)生混合感染或者和其他疾病共同存在,臨床表現(xiàn)更加不典型,易漏診,延誤病情[2]。因此,為了早期診斷、及時(shí)治療支原體肺炎,快速準(zhǔn)確的診斷方法顯得頗為重要。Mp的實(shí)驗(yàn)室檢查中血清學(xué)檢測(cè)依然是目前臨床診斷和流行病學(xué)調(diào)查的主要手段,但檢測(cè)結(jié)果受患兒年齡、病程、機(jī)體免疫系統(tǒng)的影響[3- 6],因此只做單份血清抗體檢測(cè)只能作為感染的輔助診斷。PCR具有很高的敏感性,比血清抗體能更早地檢測(cè)出Mp[7],但是操作復(fù)雜、成本高、需要的時(shí)間長(zhǎng)并需昂貴儀器,不適合各醫(yī)院開(kāi)展。環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是2000年由日本學(xué)者Notomi等[8]開(kāi)發(fā)的一種新穎的恒溫核酸擴(kuò)增方法,其特點(diǎn)是針對(duì)靶基因的6個(gè)區(qū)域設(shè)計(jì)4種特異引物,利用一種鏈置換DNA聚合酶在等溫條件(63 ℃左右)保溫30~60 min,即可完成核酸擴(kuò)增反應(yīng)。采用肺炎支原體一步法可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增試劑盒[9- 10]檢測(cè)金華市人民醫(yī)院2016年4月至2018年3月在入院的第1天采集到的108例住院患者的Mp-DNA標(biāo)本,同時(shí)以PCR法和酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)法檢測(cè)同一患者標(biāo)本,作為對(duì)照。以PCR法作為診斷肺炎支原體的金標(biāo)準(zhǔn),比較該檢測(cè)方法對(duì)Mp感染的臨床診斷價(jià)值。
材料來(lái)源MpPCR檢測(cè)試劑盒(熒光法)購(gòu)于上海之江生物科技股份有限公司;Mp-Ab ELISA試劑盒購(gòu)于杭州艾康生物技術(shù)有限公司;引物由上海申能博彩生物技術(shù)有限公司合成;其他生化試劑購(gòu)于Sigma公司。
標(biāo)本來(lái)源隨機(jī)選取2016年4月至2018年3月金華市人民醫(yī)院兒科住院患兒咽拭子標(biāo)本和血清標(biāo)本108例,均在入院的第1和5天收集樣本。年齡為6個(gè)月~12歲;病程為≤3周;無(wú)哮喘、先天性或慢性肺部疾病,其中病例組73例,符合臨床診斷標(biāo)準(zhǔn)并結(jié)合PCR法檢測(cè)結(jié)果陽(yáng)性被診斷為患兒;對(duì)照組35例,取自臨床和PCR法排除兒童支原體肺炎的其他慢、急性呼吸道感染者。在入院的第1天取2份咽拭子標(biāo)本和1份血清標(biāo)本,入院的第5天盡量取2份咽拭子標(biāo)本和1份血清標(biāo)本(由于患兒采血困難,所以第2次血清標(biāo)本只收集到40份)。哺乳期嬰兒禁止吃奶2 h后取樣。一份咽拭子標(biāo)本用于MpPCR檢測(cè);一份咽拭子標(biāo)本用于文獻(xiàn)[9- 10]研制的肺炎支原體一步法可視化等溫?cái)U(kuò)增試劑盒檢測(cè);血清標(biāo)本用于ELISA法(IgM抗體)檢測(cè)。
樣本處理兩份咽拭子標(biāo)本一份用于PCR法檢測(cè),按說(shuō)明書(shū)操作提取基因組DNA,4 ℃保存?zhèn)溆?;另一份咽拭子?biāo)本用于本研究設(shè)計(jì)的一步法可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增實(shí)驗(yàn),將咽拭子加入到含1 ml TE緩沖液的無(wú)菌管中,充分混勻后吸取0.5 ml,加0.5 ml 2×一步法快速提取緩沖液(提取緩沖液為1% 十二烷基硫酸鈉,10 mmol/L Tris,0.3 mol/L乙二胺四乙酸,1%交聯(lián)聚乙烯吡絡(luò)烷酮,pH 8.0),混勻后置于90 ℃水浴中,不時(shí)顛倒混勻。孵育20 min后,置于冰浴中5 min。4 ℃下保存,用于肺炎支原體一步法可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增。血清標(biāo)本取樣后于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
反應(yīng)參數(shù)PCR法和ELISA法按產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)操作;可視化LAMP反應(yīng)參數(shù)為:外引物F3:CACCCTCGG-GGGCAGTCAG;外引物B3:GACCAGCAGGGACAATCAG;上游內(nèi)引物:FIP(F1C-F2):ATGATTACAGGCGGTTCGTTTTGTTCAGAGCTGGAGGTTGGCT;下游內(nèi)引物:BIP(B1C-B2):ACCACACCAAGTTCACGAGCGTT-TTTCATTCCTTCACCCCGCCC。反應(yīng)總體積為25.0 μl,包括2.5 μl 10×聚合酶反應(yīng)緩沖液;4.0 μl MgSO4(25 mmol/L);1.0 μl dNTPs(15 mmol/L);1.0 μl 鏈置換DNA 聚合酶(8 U/μl);各1.0 μl F3、B3(5 μmol/L);各1.0 μl 內(nèi)引物FIP、BIP(20 μmol/L);1.5 μl 3 mmol/L 羥甲基萘酚藍(lán);2.0 μl提取的Mp基因組DNA;ddH2O補(bǔ)足至25.0 μl,63 ℃反應(yīng)60 min觀察各管顏色變化,以十六烷基三甲基溴化銨法提取肺炎支原體標(biāo)準(zhǔn)菌株DNA為陽(yáng)性對(duì)照;以ddH2O為陰性對(duì)照。
結(jié)果判讀
MpPCR檢測(cè)(熒光法)判讀標(biāo)準(zhǔn):陽(yáng)性對(duì)照Ct值應(yīng)小于38,陰性對(duì)照Ct值無(wú)數(shù)據(jù),否則該次實(shí)驗(yàn)視為無(wú)效,應(yīng)檢查儀器、試劑、擴(kuò)增條件等方面的誤差。
檢測(cè)樣本Ct值≤38.0者判為陽(yáng)性;檢測(cè)樣本Ct值>38.0的樣本建議重做,重做結(jié)果Ct值<40為陽(yáng)性,否則為陰性。
MpELISA檢測(cè)結(jié)果判讀標(biāo)準(zhǔn):490 nm波長(zhǎng)依序測(cè)量各孔的吸光度(OD值)。實(shí)驗(yàn)成立的條件是:陽(yáng)性對(duì)照孔0.6≤OD 490 值≤2.0,陰性對(duì)照孔 OD 490 值≤0.2。按下列公式計(jì)算標(biāo)本吸光度/陰性對(duì)照吸光度(specimen absorbance/negative control absorbance,S/N):被檢血清 2 孔的平均 OD 490 值/陰性對(duì)照血清 2 孔的平均 OD 490 值。如果樣品 S/N ≥3,判為陽(yáng)性;如果 S/N ≤2.5,判為陰性;S/N為 2.5 ~3為可疑,應(yīng)重測(cè),重測(cè)后 S/N ≥3 判為陽(yáng)性,S/N <3 判為陰性。
一步法肺炎支原體等溫?cái)U(kuò)增判讀標(biāo)準(zhǔn):63 ℃反應(yīng)60 min后變?yōu)樘焖{(lán)色的為陽(yáng)性,紫色的為陰性。陰性對(duì)照為紫色,若陰性對(duì)照為藍(lán)色為無(wú)效,應(yīng)檢驗(yàn)檢測(cè)體系,重測(cè)。
統(tǒng)計(jì)學(xué)處理計(jì)算Kappa統(tǒng)計(jì)量,評(píng)價(jià)兩種方法檢驗(yàn)結(jié)果之間的一致性。Kappa值的判定:0.75~1.00 符合很好;0.40~0.74一般符合;0.01~0.39缺乏符合。
以熒光PCR法作為診斷肺炎支原體的金標(biāo)準(zhǔn),入院第1天采集的標(biāo)本經(jīng)3種檢測(cè)方法所得結(jié)果顯示,LAMP方法的敏感度為100%,特異度為94.3%,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為97.3%,陰性預(yù)測(cè)值為100%,陽(yáng)性似然比為17.5,陰性似然比為0,尤等指數(shù)為0.943;ELISA法的敏感度為65.8%,特異度為82.9%,陽(yáng)性預(yù)測(cè)值為88.9%,陰性預(yù)測(cè)值為53.7%,陽(yáng)性似然比為5.85,陰性似然比為0.41,尤等指數(shù)為0.487(表1)。一步法可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增與PCR法結(jié)果比較,用一致性檢驗(yàn)評(píng)價(jià)這兩種方法的一致程度,公式計(jì)算Kappa值為0.956,大于0.75,說(shuō)明肺炎支原體一步法可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增與PCR法的一致性好,兩者可以比較。肺炎支原體一步法可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增與ELISA法結(jié)果比較顯示,用公式計(jì)算Kappa值為0.38,小于0.40,說(shuō)明肺炎支原體一步法可視化環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增與ELISA方法之間缺乏一致性,不可比較(表2)。
入院第5天與第1天3種方法檢測(cè)40位患者的結(jié)果顯示,第5天與第1天患者檢測(cè)結(jié)果相同例數(shù)最多的是LAMP法,最少的是ELISA法(表3)。
早期診斷支原體肺炎,對(duì)快速準(zhǔn)確治療有重要意義。目前,診斷支原體肺炎的方法主要有培養(yǎng)法、血清學(xué)方法和PCR法。雖然Mp的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法多樣,但是各種方法均有其優(yōu)勢(shì)與不足,目前國(guó)內(nèi)外Mp實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)也沒(méi)有統(tǒng)一的診斷標(biāo)準(zhǔn)。培養(yǎng)法是診斷支原體肺炎的金標(biāo)準(zhǔn),一旦培養(yǎng)出肺炎支原體即可確診,但是培養(yǎng)法操作復(fù)雜,受樣本來(lái)源、保存、運(yùn)輸方式、樣本中Mp含量以及實(shí)驗(yàn)員技術(shù)水平等多種因素的影響,診斷Mp感染的靈敏度僅為60%[11],對(duì)臨床早期診斷的意義不大,常用于回顧性診斷和研究。有研究比較了培養(yǎng)法、血清學(xué)方法和PCR法在支原體肺炎中的差異,一致認(rèn)為培養(yǎng)法靈敏度、特異性和檢出率遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于血清學(xué)方法和PCR法[12]。國(guó)內(nèi)資料顯示,ELISA法的敏感性為71%,要高于培養(yǎng)法,但又比LAMP法和PCR法敏感性低得多[12]。ELISA法最好用雙份血清,可以提高特異度和敏感度,但由于雙份血清比較難獲得,所以不適宜用作金標(biāo)準(zhǔn)。根據(jù)《體外診斷試劑臨床研究技術(shù)指導(dǎo)原則》應(yīng)選擇原理相同或接近的作為對(duì)照,因本研究采用的是核酸等溫?cái)U(kuò)增原理,市面上尚無(wú)同類(lèi)試劑,因此選擇原理接近的MpPCR檢測(cè)試劑盒作為對(duì)照。又因PCR法的敏感度和特異度都比較高,國(guó)外也有報(bào)道以PCR法為金標(biāo)準(zhǔn)[13],PCR法的敏感度和特異度都比較高,故而本研究用PCR法作為診斷支原體肺炎的金標(biāo)準(zhǔn)。
表1 入院第1天采集的標(biāo)本經(jīng)3種檢測(cè)方法檢測(cè)結(jié)果的比較(n)Table 1 Results of three detection methods for clinical specimens obtained on the first day of admission(n)
PCR:聚合酶鏈反應(yīng);LAMP:環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù);ELISA:酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)
PCR:polymerase chain reaction;LAMP:loop-mediated isothermal amplification;ELISA:enzyme-linked immunosorbent assay
表2 LAMP法與ELISA法檢測(cè)結(jié)果的比較(n)Table 2 Comparisons of the results of LAMP and ELISA(n)
本研究LAMP法的敏感度為100%,特異度為94.3%,與日本研發(fā)的LAMP試劑盒檢測(cè)的結(jié)果基本相符[14- 15]。表1是患者入院第1天檢查結(jié)果,這個(gè)結(jié)果顯示,ELISA法對(duì)早期肺炎支原體診斷的敏感性較低,而LAMP法在早期的診斷上有比較明顯的優(yōu)勢(shì)。LAMP法與PCR法、ELISA法的比較,證實(shí)了LAMP法與PCR法具有可比性,與ELISA法差異明顯,不具有可比性。LAMP技術(shù)可用于支原體肺炎的早期診斷。
本研究顯示用ELISA法第5天為陽(yáng)性、第1天為陰性的有6例,這可能是因?yàn)镮gM抗體是在肺炎支原體感染后1周才能出現(xiàn)有關(guān),估計(jì)是這6例患者感染的時(shí)間太短無(wú)法檢測(cè)出來(lái)導(dǎo)致的。第5天為陰性、第1天為陽(yáng)性的病例有4例,根據(jù)國(guó)內(nèi)外相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道,血清特異性抗體 IgM 一般出現(xiàn)于Mp感染后 7 ~ 14 d,3 ~ 4 周達(dá)高峰,可持續(xù)數(shù)月不等[16- 17],這就無(wú)法解釋本研究的結(jié)果,但實(shí)際上IgM抗體的半衰期很短,僅有5 d,它反映的是近期感染。
用PCR法檢測(cè)第5天為陽(yáng)性、第1天為陰性的有3例,這可能和樣本的采集不當(dāng)、取樣部位太淺有關(guān)[18]。第5天為陰性、第1天為陽(yáng)性的病例有4例,這可能是這幾例患者的癥狀比較典型,用抗生素的時(shí)間較早,縮短了MpDNA存在的時(shí)間,這個(gè)結(jié)果也符合Kakuya等[14]的猜測(cè)。
用LAMP法檢測(cè)第5天為陽(yáng)性、第1天為陰性的有2例,這可能和樣本的采集不當(dāng)有關(guān),或者是在感染的第1、2天,還沒(méi)辦法檢測(cè)到MpDNA有關(guān)。第5天為陰性、第1天為陽(yáng)性的病例有4例,推測(cè)這個(gè)原因和PCR法的相同,表明患者得到了及時(shí)的治療,病情已好,所以才檢測(cè)不到MpDNA。
ELISA檢測(cè)MpIgM抗體,IgM是機(jī)體受肺炎支原體感染時(shí)出現(xiàn)的特異性抗體,一般在感染后1周出現(xiàn),因此,檢測(cè)結(jié)果中ELISA法的假陰性結(jié)果偏高。故此法檢測(cè)的陰性結(jié)果不能排除肺炎支原體感染。ELISA法最好在肺炎支原體感染后1周內(nèi)進(jìn)行檢測(cè)或者進(jìn)行2次檢測(cè),以提高檢出率,避免漏診。但雙份血清的獲得比較困難。本研究顯示血清學(xué)方法受患兒病程影響較大,特別是對(duì)肺炎支原體的早期診斷敏感性較低,不利于患者早期的正確治療。LAMP法和PCR法檢測(cè)MpDNA,具有快速、特異、敏感等優(yōu)點(diǎn),同時(shí)可避免患兒年齡、病程和抗生素治療的影響,早期診斷支原體肺炎,特別是2歲以下患兒更適合用此法。和PCR法比較,LAMP法的操作更簡(jiǎn)單,反應(yīng)時(shí)間短,結(jié)果判斷更直觀,對(duì)儀器設(shè)備、人員操作技能要求低,普通實(shí)驗(yàn)室即可開(kāi)展,特別適合現(xiàn)場(chǎng)高通量檢測(cè)和基層醫(yī)療組織開(kāi)展檢測(cè)。
表3 3種方法檢測(cè)入院第5天與第1天40例患者的結(jié)果比較(n)Table 3 Results of 40 patients tested by three methods on the fifth day and the first day(n)
由于LAMP法具有敏感、特異、快速的特點(diǎn),因此它對(duì)提高臨床檢測(cè)效率,靈敏、快速地鑒定臨床支原體肺炎有重要意義,對(duì)肺炎支原體感染的早期診治、防治并發(fā)癥和患者預(yù)后評(píng)估也有重要價(jià)值。綜上,本研究顯示LAMP法與PCR法比較,兩種方法的檢測(cè)結(jié)果符合率高,方法一致性好,LAMP法操作簡(jiǎn)便,成本低,準(zhǔn)確性高,可以代替上述兩種方法在臨床上使用。
中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報(bào)2019年2期