高曉月,董彬,張超,付建新,胡紹慶,趙宏波*,梁立軍
(1.浙江農(nóng)林大學(xué)風(fēng)景園林與建筑學(xué)院,杭州 311300;2.浙江理工大學(xué)建筑工程學(xué)院,杭州 310018)
桂花(Osmanthus fragrans)是中國(guó)十大傳統(tǒng)名花之一,是集綠化、美化和香化為一體的園林樹(shù)種,在中國(guó)有悠久的栽培歷史,深受人們喜愛(ài)。桂花(本文指的是秋桂)的花在開(kāi)放前需要一段時(shí)間的相對(duì)低溫,并且持續(xù)一段時(shí)間才能發(fā)揮作用[1]。為了解桂花的開(kāi)花機(jī)制,研究花開(kāi)放過(guò)程中的控制基因就顯得尤為重要。
擴(kuò)展蛋白作為細(xì)胞壁松弛因子,在花開(kāi)放過(guò)程中調(diào)節(jié)細(xì)胞擴(kuò)展,影響花開(kāi)放進(jìn)程[2],其作用機(jī)制一般認(rèn)為是擴(kuò)展蛋白通過(guò)打斷細(xì)胞壁纖維素與半纖維素之間的非共價(jià)鍵,促使它們之間相互位移,從而引起細(xì)胞壁伸展[3]。植物擴(kuò)展蛋白家族由4個(gè)亞家族組成,分別命名為EXPA(α-expansin)、EXPB(β-expansin)、EXLA(expansin-like A)和EXLB(expansin-like B)[4]。研究表明,擴(kuò)展蛋白影響了種子的萌發(fā)[5]、根毛的起始和延長(zhǎng)[6]、莖和葉的生長(zhǎng)發(fā)育[7-8]、花粉管的延長(zhǎng)[9]、果實(shí)的成熟[10]等,幾乎參與了植物的整個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育進(jìn)程。唐菖蒲(Gladiolus gandavensis)中的擴(kuò)展蛋白基因GgEXPA1[11]參與了花開(kāi)放進(jìn)程,在香石竹(Dianthus caryophyllus)和蠟梅(Chimonanthus praecox)中也發(fā)現(xiàn)了這種影響花開(kāi)放的基因[12-13]。擴(kuò)展蛋白家族的大多數(shù)基因受外界環(huán)境的調(diào)控,啟動(dòng)子中包含了相應(yīng)的響應(yīng)元件,因此,研究擴(kuò)展蛋白基因的啟動(dòng)子對(duì)于了解該基因的調(diào)控機(jī)制有重要意義。
本文選擇前期篩選獲得的3個(gè)與桂花花開(kāi)放緊密相關(guān)的擴(kuò)展蛋白基因OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1[14],利用染色體步移法克隆啟動(dòng)子序列,分析啟動(dòng)子中包含的順式作用元件;同時(shí),構(gòu)建啟動(dòng)子融合β-葡萄糖苷酸酶(β-glucuronidase,GUS)報(bào)告基因的表達(dá)載體,通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤(pán)法轉(zhuǎn)化煙草,利用組織化學(xué)染色觀察報(bào)告基因的表達(dá),從而檢測(cè)該啟動(dòng)子的活性。
1.1.1 植物材料
以浙江農(nóng)林大學(xué)桂花資源圃栽種的桂花丹桂品種‘堰虹桂’(Osmanthus fragrans‘Yanhong Gui’)為實(shí)驗(yàn)材料,樹(shù)齡6—8年。
1.1.2 菌株、質(zhì)粒及試劑
實(shí)驗(yàn)中所用的限制性?xún)?nèi)切酶、T4DNA連接酶、PremixTaq酶、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒、DNA純化試劑盒、DL2000標(biāo)志物、克隆載體pMD18-T、大腸埃希菌(Escherichia coli)DH5α、In-Fusion?HD克隆試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒等均購(gòu)自TaKaRa公司(大連),X-gluc購(gòu)自生工生物工程(上海)有限公司,pBI121菌液由浙江農(nóng)林大學(xué)觀賞植物遺傳育種實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2.1OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1啟動(dòng)子的克隆與調(diào)控元件分析
于2016年9月采集生長(zhǎng)健壯的桂花樹(shù)幼嫩葉片,采用十六烷基三甲基溴化銨(cetyltrimethylammonium bromide,CTAB)法提取基因組DNA。分別用平末端限制性?xún)?nèi)切酶DraⅠ、EcoRⅤ、PvuⅡ和StuⅠ對(duì)基因組DNA進(jìn)行酶切,構(gòu)建基因組酶切文庫(kù)。按照DNA純化試劑盒說(shuō)明書(shū)純化酶切產(chǎn)物,并用T4DNA連接酶將接頭序列添加至基因組DNA酶切片段的5′末端。接頭序列按照Genome Walker說(shuō)明書(shū)合成。分別以本課題組已獲得的OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1基因序列為基礎(chǔ),設(shè)計(jì)3對(duì)特異性引物OfEXPA2-GSP1/2、OfEXPA4-GSP1/2和OfEXLA1-GSP1/2,并結(jié)合2條簡(jiǎn)并引物AP1、AP2(表1)進(jìn)行2輪聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增。
以添加過(guò)接頭的基因組酶切文庫(kù)為預(yù)擴(kuò)增模板,使用接頭引物AP1與基因特異性引物GSP1進(jìn)行第1輪PCR。反應(yīng)體系:模板1 μL,簡(jiǎn)并引物AP1(10 μmol/L)1 μL,GSP1(10 μmol/L)1 μL,PremixTaq酶10 μL,ddH2O 7 μL。反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性 25 s,72 ℃退火30 s,7個(gè)循環(huán);94 ℃變性25 s,67 ℃退火3 min,35個(gè)循環(huán);67℃延伸7 min。將第1輪PCR產(chǎn)物稀釋50倍作為模板,使用簡(jiǎn)并引物AP2與GSP2配對(duì)進(jìn)行第2輪PCR。反應(yīng)體系:模板 1 μL,接頭引物 AP2(10 μmol/L)1 μL,基因特異性引物 GSP2(10 μmol/L)1 μL,PremixTaq酶10 μL,ddH2O 7 μL。反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性25 s,72 ℃退火3 min,5個(gè)循環(huán);94℃變性25 s,67℃退火3 min,20個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。
PCR產(chǎn)物經(jīng)過(guò)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),目的條帶按TaKaRa公司瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行PCR產(chǎn)物回收;連接反應(yīng)按照TaKaRa公司pMD18-T載體說(shuō)明書(shū)進(jìn)行;將連接后的重組質(zhì)粒導(dǎo)入大腸埃希菌DH5α,并用氨芐霉素篩選,挑取白色單菌落進(jìn)行菌液PCR擴(kuò)增并送出測(cè)序。測(cè)序結(jié)果用DNAman軟件進(jìn)行比對(duì),比對(duì)正確的啟動(dòng)子序列采用植物順式作用元件數(shù)據(jù)庫(kù)Plantcare(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html)在線(xiàn)預(yù)測(cè)分析可能存在的順式作用元件。
1.2.2 植物表達(dá)載體的構(gòu)建
植物表達(dá)載體pBI121是一個(gè)雙元載體,含有GUS基因系統(tǒng)和CaMV35S啟動(dòng)子。為了研究OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1啟動(dòng)子的功能,用其替換植物表達(dá)載體pBI121中的35S啟動(dòng)子,與GUS報(bào)告基因融合,構(gòu)建植物表達(dá)載體。用HindⅢ和XbaⅠ雙酶切pBI121載體,純化產(chǎn)物。按照In-Fusion?HD克隆試劑盒說(shuō)明書(shū)分別設(shè)計(jì)3對(duì)上下游引物OfEXPA2-F/R、OfEXPA4-F/R及OfEXLA1-F/R(表1),以桂花基因組DNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物純化后分別與pBI121酶切后的純化產(chǎn)物進(jìn)行連接反應(yīng),將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸埃希菌DH5α,經(jīng)PCR鑒定后送至生工生物工程(上海)有限公司測(cè)序。
表1 引物序列及用途Table 1 Primer sequences and their function
1.2.3 農(nóng)桿菌介導(dǎo)的葉盤(pán)法轉(zhuǎn)化煙草及GUS瞬時(shí)表達(dá)鑒定
將構(gòu)建好的各個(gè)重組質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101,以GV3101空菌株為陰性對(duì)照,含pBI121載體的菌株為陽(yáng)性對(duì)照,對(duì)攜帶有重組載體的菌株進(jìn)行瞬時(shí)表達(dá)分析。將煙草葉片切成0.5 cm×0.5 cm的小塊后放入吸光度值為0.6的農(nóng)桿菌菌液中侵染10 min,用無(wú)菌濾紙將葉片表面的菌液吸干,將經(jīng)侵染的外植體置于被無(wú)菌水浸潤(rùn)的濾紙上,暗培養(yǎng)24 h后進(jìn)行GUS組織化學(xué)染色,用V(醋酸)∶V(乙醇)為3∶1的脫色液浸泡至陰性對(duì)照為白色時(shí),用體視顯微鏡(ZEISS CL-6000)進(jìn)行觀察并拍照。
根據(jù)設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行2輪PCR擴(kuò)增后,分別從EcoRⅤ酶切體系中得到3條較長(zhǎng)的片段(圖1),將PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果與基因序列拼接后,得到了OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1的啟動(dòng)子片段,長(zhǎng)度分別為1 108、808、945 bp。
采用Plantcare在線(xiàn)預(yù)測(cè)網(wǎng)站對(duì)所得到的啟動(dòng)子序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),OfEXPA2啟動(dòng)子序列中含有大多數(shù)高等植物啟動(dòng)子具有的保守元件TATA盒(起始密碼子上游-94 bp)和CAAT盒(起始密碼子上游-179 bp),同時(shí)含有脫落酸響應(yīng)元件、MYB結(jié)合位點(diǎn)、多個(gè)光調(diào)控作用元件和參與晝夜節(jié)律調(diào)控的元件(圖2)。
圖1 桂花OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1啟動(dòng)子擴(kuò)增Fig.1 Amplification of OfEXPA2,OfEXPA4 and OfEXLA1 promoters from O.fragrans
對(duì)克隆的OfEXPA4啟動(dòng)子片段分析發(fā)現(xiàn),該序列含有大多數(shù)高等植物啟動(dòng)子的基本元件TATA盒(起始密碼子上游-80 bp)和CAAT盒(起始密碼子上游-397 bp),在3′端還存在一個(gè)參與基因轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控的5′-UTR Py-rich元件,除此之外,OfEXPA4啟動(dòng)子序列還含有多個(gè)光響應(yīng)順式作用元件、MYB結(jié)合位點(diǎn)、創(chuàng)傷誘導(dǎo)元件(圖3)。
利用啟動(dòng)子順式作用元件預(yù)測(cè)網(wǎng)站Plantcare上相關(guān)軟件對(duì)所得的OfEXLA1啟動(dòng)子序列進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn):該序列含有大多數(shù)高等植物啟動(dòng)子的基本元件TATA盒(起始密碼子上游-61bp)和CAAT盒(起始密碼子上游-27bp)。除了這些基礎(chǔ)元件外,在OfEXLA1啟動(dòng)子區(qū)域中,還發(fā)現(xiàn)了與激素調(diào)控有關(guān)的反應(yīng)元件:生長(zhǎng)素響應(yīng)元件、水楊酸響應(yīng)元件。另外,在OfEXLA1啟動(dòng)子序列中還發(fā)現(xiàn)了熱激響應(yīng)元件HSE、MYB結(jié)合位點(diǎn)MBSⅡ和4個(gè)光響應(yīng)元件(圖4)。
圖2 OfEXPA2啟動(dòng)子序列及順式作用元件Fig.2 Sequences and cis-elements of OfEXPA2 promoter
將構(gòu)建好的重組載體命名為OfEXPA2∶∶GUS、OfEXPA4∶∶GUS 和OfEXLA1∶∶GUS,并與 pBI121(CAMV35S∶∶GUS)空載體用凍融法轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌GV3101中,其中pBI121空載體為陽(yáng)性對(duì)照,GV3101為陰性對(duì)照,通過(guò)葉盤(pán)法轉(zhuǎn)化煙草進(jìn)行瞬時(shí)表達(dá)。結(jié)果表明:轉(zhuǎn)CAMV35S啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)化OfEXPA2∶∶GUS、OfEXPA4∶∶GUS、OfEXLA1∶∶GUS的煙草葉片經(jīng)GUS組織化學(xué)染色后均有藍(lán)色,其中OfEXPA2∶∶GUS 的染色最深,其次是OfEXLA1∶∶GUS,而OfEXPA4∶∶GUS染色最淺,而陰性對(duì)照沒(méi)有藍(lán)色(圖5)。說(shuō)明克隆的3種啟動(dòng)子均能驅(qū)動(dòng)報(bào)告基因GUS的表達(dá)。
圖3 OfEXPA4啟動(dòng)子序列及順式作用元件Fig.3 Sequences and cis-elements of OfEXPA4 promoter
圖4 OfEXLA1啟動(dòng)子序列及順式作用元件Fig.4 Sequences and cis-elements of OfEXLA1 promoter
高等植物基因的表達(dá)受到多種因素的影響,但是主要發(fā)生在調(diào)控水平上,受多種順式作用元件與反式作用因子的相互協(xié)調(diào)作用[15];因此,了解基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)取決于對(duì)順式作用元件的分析[16]。在擴(kuò)展蛋白家族中,一些擴(kuò)展蛋白基因受激素的調(diào)控。MaExp1是香蕉(Musa acuminata)果實(shí)中的特異性基因,在MaExp1啟動(dòng)子中存在乙烯和生長(zhǎng)素的響應(yīng)元件,實(shí)驗(yàn)證明乙烯和生長(zhǎng)素能夠協(xié)同作用增強(qiáng)該基因的表達(dá)[17]。棉花(Gossypium barbadense)擴(kuò)展蛋白基因GbEXPA2啟動(dòng)子中有脫落酸和赤霉素響應(yīng)元件,外源赤霉素和脫落酸分別能夠上調(diào)和下降GbEXPA2的表達(dá)[18]。水稻中擴(kuò)展蛋白的活性在干旱脅迫下受到生長(zhǎng)素和脫落酸的誘導(dǎo)[19]。在洋桔梗(Eustoma grandiflorum)中,茉莉酸甲酯能夠促進(jìn)EgEXPA2、EgEXPA3和EgXTH1的表達(dá),推動(dòng)花瓣中細(xì)胞壁的松弛,從而影響花開(kāi)放進(jìn)程[20]。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),在OfEXPA2啟動(dòng)子中含有脫落酸響應(yīng)元件,在OfEXLA1啟動(dòng)子中含有生長(zhǎng)素響應(yīng)元件、水楊酸響應(yīng)元件。因此,推測(cè)OfEXPA2和OfEXLA1啟動(dòng)子能夠在激素的誘導(dǎo)下調(diào)控基因的表達(dá)。
除各類(lèi)激素元件外,OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1的啟動(dòng)子中還存在溫度、干旱脅迫等相關(guān)元件。在OfEXLA1啟動(dòng)子中存在熱激元件HSE,該元件能夠和參與熱脅迫的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,啟動(dòng)下游基因的表達(dá),提高或降低植物的耐熱性[21]。除此之外,MBS元件、MBSⅡ元件分別與其中MYB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合參與干旱脅迫的響應(yīng)和類(lèi)黃酮的合成,其中MYB轉(zhuǎn)錄因子廣泛分布在植物中,并與脫落酸合成有關(guān),能夠與其他轉(zhuǎn)錄因子相互作用[22]。目前,參與類(lèi)黃酮合成的MYB轉(zhuǎn)錄因子有AtMYB011/AtMYB012/AtMYB111[23]、EsMYB[24]等,參與干旱脅迫響 應(yīng) 的 有AtMYB002、AtMYB060/AtMYB094[25]、AtMYB096[26]等,其中,AtMYB102和AtMYB096受外源脫落酸的誘導(dǎo)。在本研究的OfEXPA2啟動(dòng)子中有脫落酸響應(yīng)元件,推測(cè)脫落酸響應(yīng)元件與MYB結(jié)合位點(diǎn)共同作用于OfEXPA2啟動(dòng)子,從而調(diào)控目的基因的表達(dá)。
通過(guò)對(duì)啟動(dòng)子和GUS融合表達(dá)載體的轉(zhuǎn)基因煙草葉片研究發(fā)現(xiàn),OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1啟動(dòng)子均能夠驅(qū)動(dòng)下游基因的表達(dá)。其中OfEXPA2啟動(dòng)子染色最深,OfEXPA4啟動(dòng)子染色最淺,可能是由于擴(kuò)展蛋白基因在不同的組織器官中的表達(dá)活性不同。
綜上所述,在本研究中啟動(dòng)子活性可能受到激素的誘導(dǎo)并使得相關(guān)擴(kuò)展蛋白基因的表達(dá)發(fā)生變化,影響花開(kāi)放。下一步研究將構(gòu)建脫落酸、生長(zhǎng)素、水楊酸響應(yīng)元件的缺失載體,分析不同缺失啟動(dòng)子片段誘導(dǎo)表達(dá)活性的強(qiáng)弱,從而確定激素對(duì)啟動(dòng)子的作用,期望通過(guò)對(duì)OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1啟動(dòng)子的深入研究來(lái)為揭示桂花花開(kāi)放的分子機(jī)制提供理論依據(jù)。
圖5 瞬時(shí)表達(dá)檢測(cè)結(jié)果Fig.5 Detection result of transient expression
本研究克隆了桂花花開(kāi)放相關(guān)基因OfEXPA2、OfEXPA4和OfEXLA1起始密碼子上游1 108、808、945 bp的啟動(dòng)子序列,在這3個(gè)啟動(dòng)子序列中均存在基本元件TATA盒和CAAT盒,以及激素誘導(dǎo)元件和干旱、高溫等多個(gè)與植物非生物脅迫相關(guān)的元件;通過(guò)煙草葉片瞬時(shí)表達(dá)證明這3個(gè)啟動(dòng)子均能驅(qū)動(dòng)下游基因的表達(dá)。
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浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版)2019年1期