金永梅 陳莫軍 劉笑笑 林秀峰
(吉林省農(nóng)業(yè)科學(xué)院,長春 130124)
水稻是我國的重要糧食作物之一。水稻害蟲是水稻豐產(chǎn)和穩(wěn)產(chǎn)的重要限制因子,每年給我國水稻生產(chǎn)造成的損失可占總產(chǎn)量的5%-10%,且有逐年加重之趨勢,其中鱗翅目害蟲是水稻生產(chǎn)危害最大的害蟲。至今,水稻中還未發(fā)現(xiàn)抗這類害蟲的種質(zhì)資源,因此通過常規(guī)育種方法很難培育出抗鱗翅目害蟲水稻,利用生物技術(shù)手段培育抗蟲水稻為解決上述問題提供了廣闊的前景。
蘇云金芽孢桿菌(Bacillus thuringiensis,Bt)能產(chǎn)生對多種昆蟲有害的殺蟲晶體蛋白(Insecticidalcrystal proteins,ICPs)。Bt殺蟲晶體蛋白(ICP)可特異性毒殺不同的昆蟲,包括鱗翅目、鞘翅目、雙翅目和螨類等害蟲,而對人畜無害,是目前農(nóng)業(yè)生產(chǎn)轉(zhuǎn)基因育種中主要使用的抗蟲蛋白。cry1C基因所編碼的Bt殺蟲蛋白可以抑制和殺死鱗翅目害蟲,是在野生型Cry1Ca5基因的基礎(chǔ)上通過序列優(yōu)化人工合成的抗蟲基因[1]。目前,利用生物技術(shù)手段將cry1C基因?qū)氲礁鞣N植物中,包括水稻[2-4]、大豆[5-6]、玉米[7-8]和油菜[9]等,成功獲得了對抗鱗翅目害蟲具有抗性的轉(zhuǎn)基因植物。
隨著轉(zhuǎn)基因技術(shù)的發(fā)展,國內(nèi)外大量的轉(zhuǎn)基因植物已進入生物安全評價階段,部分產(chǎn)品已進入商業(yè)化階段。快速、精準、高通量的轉(zhuǎn)基因生物及產(chǎn)品檢測技術(shù)是轉(zhuǎn)基因生物安全管理的重要依據(jù)[10]。目前,轉(zhuǎn)基因作物中檢測蛋白的方法主要有Western Blot法和酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)等,很多研究團隊建立了依據(jù)這兩種方法的蛋白定性和定量檢測方法和體系[11-12],而這些方法都需要目的蛋白抗體。市面上的cry1C抗體不僅價格昂貴,而且檢測cry1C轉(zhuǎn)基因水稻特異性不強。因此,cry1C抗體的制備在抗鱗翅目害蟲轉(zhuǎn)基因植物研究中發(fā)揮重要的作用。
本研究利用生物信息學(xué)方法預(yù)測cry1C蛋白的抗原表位并命名為Δcry1C,優(yōu)化Δcry1C核苷酸序列并進行人工合成,構(gòu)建原核表達載體pET28b(+)-Δcry1C,高效表達 His6-Δcry1C重組蛋白,制備cry1C兔多克隆抗體及驗證其特異性,旨在獲得價格低廉且特異性較強的cry1C多克隆抗體,為深入研究鱗翅目害蟲提供前提條件。
1.1.1 實驗材料 轉(zhuǎn)cry1C基因抗蟲水稻由本實驗室創(chuàng)制或保存。
1.1.2 主要試劑 Taq DNA 聚合酶、限制性內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶、大腸桿菌感受態(tài)細胞均購自大連寶生物工程有限公司;植物蛋白提取試劑盒、ECL試劑盒均購自北京康為世紀生物公司;實驗引物和抗原表位區(qū)人工合成來自上海生工生物工程有限公司。
1.2.1cry1C基因抗原表位預(yù)測及核苷酸序列的人工合成 根據(jù)已報道的cry1C核苷酸序列[1]推導(dǎo)氨基酸序列,利用TMHMMOL/L Server v.2.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMMOL/L)及DNAstar軟件分析跨膜區(qū)、親水性、表面可及性及抗原性的預(yù)測,篩選cry1C蛋白的抗原表位區(qū)。在不改變抗原表位區(qū)氨基酸序列的前提下,根據(jù)大腸桿菌密碼子的偏愛性,優(yōu)化抗原表位區(qū)核苷酸序列并命名為Δcry1C,委托上海生工生物人工合成,人工合成時5′端和3′端分別設(shè)計了NdeI和XhoI酶切位點。
1.2.2 原核重組表達載體構(gòu)建 以人工合成的Δcry1C抗原片段為模板,進行PCR擴增,引物序列為Δcry1C-F:5′-CATATGGTCGAAGCATTCAAGGA-3′(下劃線序列為NdeI酶切位點),Δcry1C-R:5′-CTCGAGTTATTTCTGCGCGCGTT-3′( 下 劃 線 序列為XhoI酶切位點)。PCR產(chǎn)物與原核表達載體pET28b(+)質(zhì)粒用NdeI和XhoI進行雙酶切后用T4 DNA連接酶連接。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)菌株TOP10,篩選陽性克隆,提取重組質(zhì)粒DNA,雙酶切確認片段大小。原核重組表達載體序列經(jīng)上海生工生物測序、比對分析驗證序列的正確性。
1.2.3 重組蛋白的誘導(dǎo)表達與可溶性分析 將重組質(zhì)粒pET28b(+)-Δcry1C轉(zhuǎn)化到E.coli感受態(tài)細胞BL21(DE3),以0.5 mmol/L的IPTG,分別在20℃過夜和37℃誘導(dǎo)表達4 h,未加IPTG誘導(dǎo)劑的作為陰性對照。將離心收集的菌體用PBS緩沖液懸浮,冰浴下超聲破碎,在12 000 r/min、4℃條件下離心30 min,收集上清和沉淀。沉淀采用500 μL包涵體溶解液(8 mol/L Urea,50 mmol/L Tris-HCl,150mmol/L NaCl,pH8.0)溶解。
上清液和溶解的包涵體分別與protein loading buffer混勻、沸水處理10 min,通過SDS-PAGE電泳,考馬斯亮藍染色液染色,觀察分析重組蛋白存在的部分。
1.2.4 重組表達蛋白的擴培、純化及鑒定 將含有重組質(zhì)粒pET28b(+)-Δcry1C的BL21(DE3)菌液進行擴增培養(yǎng)4 L,以 0.5 mmol/L的IPTG、37℃誘導(dǎo)表達4 h,離心收集細胞菌體。將收集的細菌菌體用破碎 Buffer(20 mmol/L PB,300 mmol/L NaCl,0.1%Triton X-100,1 mmol/L DTT,pH 8.0)溶解,冰浴中超聲破碎菌體,棄上清、取沉淀。將收集的沉淀用破碎 Buffer(8 mmol/L Urea,20 mmol/L PB,300 mmol/L NaCl,0.1% TritonX-100,1 mmol/L DTT,pH 8.0)溶解,冰浴中超聲破碎菌體,離心后取上清。His6-Δcry1C重組蛋白采用鎳瓊脂糖親和層析方法進行純化,重組蛋白經(jīng)過0.45 μm濾膜之后上樣于Ni-NTA Spin Columns親和層析柱結(jié)合1 h,重復(fù)過柱3次,用 Wash buffer(20 mmol/L/50 mmol/L Imidazole,8 mmol/L Urea,20 mmol/L PB,300 mmol/L NaCl,0.1% TritonX-100,1 mmol/L DTT,pH 8.0) 洗 雜 4次,經(jīng)不同濃度的 Imidazole Elution buffer(20/50/500 mmol/L Imidazole,8 mmol/L Urea,20 mmol/L PB,300 mmol/L NaCl,pH 8.0)洗脫。將純度較好的500 mmol/L Imidazole洗脫組分透析至10 mmol/L PBS,0.1% SKL,pH 8.0中,濃縮,過濾除菌,保存于-80℃。
1.2.5 cry1C兔多克隆抗體血清的制備 將純化后的His6-Δcry1C重組蛋白與弗氏完全佐劑混合,分別對4只4月齡新西蘭大白兔按常規(guī)免疫周期進行免疫注射。共注射4次,一免后的第21天、第35天和第49天分別為二免、三免和四免時期。一免用0.3mg重組蛋白與等體積弗氏完全佐劑混合進行,二免、三免和四免用0.15 mg重組蛋白與等體積弗氏完全佐劑混合后進行加強免疫注射。三免和四免后7-10 d從兔耳緣靜脈取血1 mL,采用抗體間接ELISA法測定抗體滴度??寡逍r達到要求后,采集頸動脈全血,血樣先沉淀提純血清,血清進行抗原抗體親和純化。
1.2.6 抗cry1C血清效價的測定 利用間接ELISA法測定抗體效價,以免疫前兔血清作為陰性對照。將His6-Δcry1C抗原蛋白用0.05 mol/L的碳酸鹽緩沖液(pH 9.6)稀釋成2 ng/μL后,包被酶標板,4℃孵育過夜后用PBST溶液洗滌酶標板。用5% 脫脂奶粉封閉液,37℃封閉60 min,用PBST(0.05%Tween-20)洗板。將抗cry1C血清分別按照梯度稀釋后,每個梯度設(shè)置3次重復(fù),37℃孵育酶標板60min,用PBST洗板。用HRP標記的羊抗兔二抗,37℃孵育45 min,用PBST洗滌。加入底物TMB顯色液反應(yīng)15 min,加入終止液終止反應(yīng)。在450 nm波長下測定OD值,計算平均值,將OD陽性/OD陰性≥ 2.1時所對應(yīng)的最高稀釋倍數(shù)作為抗cry1C血清效價。
1.2.7 cry1C多克隆抗體的特異性分析 cry1C抗體用Western Blot方法進行特異性分析。利用植物蛋白提取試劑盒提取cry1C抗蟲轉(zhuǎn)基因水稻葉片總蛋白,測定濃度。將20 μg總蛋白用10% SDS-PAGE進行電泳。用半干轉(zhuǎn)膜儀轉(zhuǎn)到硝酸纖維素膜(Hybond-NC)之后,用5%脫脂乳在37℃封閉1 h。1∶2 000稀釋的cry1C抗體在4℃孵育12 h,用1∶5 000稀釋的HRP標記的羊抗兔二抗在37℃孵育1 h,用ECL 化學(xué)發(fā)光顯色在X-光片上。
根據(jù)已報道的抗鱗翅目害蟲Bt基因cry1C的核苷酸序列推導(dǎo)氨基酸序列并進行該蛋白的跨膜區(qū)、親水性、表面可及性及抗原性指數(shù)預(yù)測。TMHMMOL/L Server v.2.0跨膜預(yù)測結(jié)果表明cry1C的N端第1-43個氨基酸位于膜內(nèi),第44-66氨基酸肽鏈包含一個跨膜區(qū),第67-630個氨基酸位于膜外,N端跨膜區(qū)可能會使得cry1C的表達受阻(圖1-A)。運用DNAstar-Protean軟件預(yù)測結(jié)果(圖1-B)表明:cry1C蛋白親水性區(qū)段分布較廣,第37-69個氨基酸為疏水區(qū),其余區(qū)段為親水區(qū);cry1C蛋白表面可及性結(jié)果表明,N端32-109個氨基酸位置表面可及性小,表面可及性大的位置主要位于117-126、189-263、345-353、412-429和517-532區(qū)段,蛋白表面可及性較大的區(qū)段易于接觸溶劑分子,出現(xiàn)抗原表位的可能性較大;線性抗原性指數(shù)預(yù)測結(jié)果表明,cry1C蛋白存在大量潛在抗原表位位點,可能的抗原表位區(qū)域為第110-630個氨基酸區(qū)段。綜合分析跨膜區(qū)、親水性、抗原性指數(shù)預(yù)測結(jié)果,去掉N端存在的跨膜區(qū)和疏水區(qū)以免表達受阻,可能的抗原表位區(qū)為第110-630氨基酸,該區(qū)段確定為抗原表位區(qū)并命名為Δcry1C。
抗原表位區(qū)Δcry1C的氨基酸序列長度為520 aa、理論分子量大小為58.8 kD。在不改變抗原表位區(qū)氨基酸序列的前提下,根據(jù)大腸桿菌密碼子的偏愛性,優(yōu)化抗原表位區(qū)核苷酸序列,并進行人工合成,該序列長度為1 578 bp(圖2-A)。Δcry1C序列與原cry1C核苷酸序列的同源性為75%,與氨基酸序列的同源性為100%。
圖1 抗原表位區(qū)預(yù)測
抗原片段核苷酸序列Δcry1C插入到原核表達載體pET28b(+)的NdeI和XhoI酶切位點,構(gòu)建pET28b(+)-Δcry1C重組表達載體。將重組表達載體質(zhì)粒用NdeI和XhoI進行雙酶切,分別獲得了5 368 bp 和1 578 bp的載體片段和Δcry1C抗原片段,與預(yù)期片段大小一致(圖2-B)。測序結(jié)果表明抗原片段Δcry1C已正確插入到pET28b(+)載體中。
圖2 重組表達載體pET28b(+)-Δcry1C的構(gòu)建
將重組質(zhì)粒pET28b(+)-Δcry1C轉(zhuǎn)化到E.coli感受態(tài)細胞 BL21(DE3),以 0.5 mmol/L的IPTG,分別在20℃過夜和37℃條件下4 h誘導(dǎo)表達。上清液和包涵體進行SDS-PAGE分析,結(jié)果(圖3-A)在包涵體中獲得了60 kD左右的重組蛋白,其表達量高、蛋白大小與預(yù)期大小一致,可確定該蛋白就是His6-Δcry1C重組蛋白,說明該重組蛋白在大腸桿菌包涵體中成功表達。
將含有重組質(zhì)粒pET28b(+)-Δcry1C的BL21(DE3)菌液進行擴增培養(yǎng)之后,以 0.5 mmol/L的IPTG、37℃誘導(dǎo)表達4 h。將收集的細菌菌體用包涵體破碎Buffer溶解,冰浴中超聲破碎菌體,經(jīng)濾膜過濾后采用鎳瓊脂糖親和層析方法進行純化、透析。純化后的重組蛋白用SDS-PAGE電泳分析發(fā)現(xiàn)在相應(yīng)位置出現(xiàn)明顯條帶,得到了60 kD的His6-Δcry1C重組蛋白(圖3-B)。
純化的His6-Δcry1C重組蛋白為抗原免疫對新西蘭大白兔制備多克隆抗體。三免和4免后7 d,從兔耳緣靜脈取血1 mL,經(jīng)間接ELISA法測定抗體效價(圖4-A),結(jié)果表明4只不同免疫兔(A、B、C和D)抗體效價均在1∶512 000以上,達到了要求。采集頸動脈全血,血樣先沉淀提純血清,將血清進行抗原抗體親和純化。
圖3 His6-Δcry1C重組蛋白的誘導(dǎo)表達及純化
為了檢測cry1C多克隆抗體的特異性,提取cry1C轉(zhuǎn)基因水稻葉片總蛋白,采用Western Blot方法檢測目的蛋白cry1C的表達情況。結(jié)果(圖4-B)獲得71 kD左右的明顯條帶,與預(yù)期條帶大小一致,說明制備的cry1C多克隆抗體具有cry1C蛋白特異性,能夠準確檢測cry1C蛋白。
目前,利用生物技術(shù)手段將cry1C基因?qū)氲礁鞣N植物中,獲得了多種抗鱗翅目害蟲轉(zhuǎn)基因植物[2-9]。這些轉(zhuǎn)基因植物的蛋白定量和定性檢測都需要cry1C抗體。目前,鄭曉東等[13]、倪庚等[14]制備了cry1C兔單克隆抗體;林智敏等[15]制備了水稻密碼子優(yōu)化的cry1Ca多克隆抗體;張麗萍等[16]優(yōu)化改造基因序列并構(gòu)建和鑒定了cry1C重組表達載體,但尚未應(yīng)用在cry1C轉(zhuǎn)基因植物的檢測上。
本研究根據(jù)已報道的cry1C基因序列,通過TMHMMOL/L Server v.2.0和DNAstar軟件綜合分析跨膜區(qū)、親水性、抗原性指數(shù)[17-19],預(yù)測了該蛋白的抗原表位區(qū)。為了避免原核表達過程中受阻和不易形成抗原表位去掉了N端跨膜區(qū)109個氨基酸,其余非跨膜區(qū)段確定為抗原表位區(qū)。在保持原氨基酸序列不變的情況下,根據(jù)大腸桿菌密碼子的偏愛性,優(yōu)化改造核苷酸序列,構(gòu)建重組表達載體,經(jīng)過誘導(dǎo)表達獲得了預(yù)期大小的、高效表達的His6-Δcry1C重組蛋白,但重組蛋白主要以包涵體形式存在。盡管為了高效表達和避免包涵體的形成,根據(jù)大腸桿菌密碼子偏好性的優(yōu)化改造序列、優(yōu)化誘導(dǎo)表達條件(溫度、時間、IPTG濃度等),但效果不理想。在宿主系統(tǒng)中高效表達外源重組蛋白時,形成包涵體是一種普遍現(xiàn)象,主要原因是當(dāng)外源蛋白高水平表達時由于合成速度過快,沒有足夠的時間進行正確折疊或缺乏某些蛋白質(zhì)折疊的輔助因子造成[20]。本研究中包涵體經(jīng)過8M 尿素溶解液進行溶解、Ni-NTA親和層析柱純化、透析復(fù)姓、濃縮獲得了純度較高的His6-Δcry1C重組蛋白。
圖4 抗cry1C血清效價及抗體特異性檢測
以His6-Δcry1C重組蛋白為抗原,免疫新西蘭大白兔、分離并純化兔多抗血清。利用間接ELISA法測定抗體效價,結(jié)果表明cry1C兔多克隆抗體效價達到了1∶512 000。Western Blot分析結(jié)果表明cry1C兔多克隆抗體對cry1C轉(zhuǎn)基因抗蟲水稻具有較強的特異性。雖然多克隆抗體比單克隆抗體特異性差,但具有制備方法簡單、制備時間短、成本低等優(yōu)點。因此,制備特異性強、效價高的多克隆抗體可以彌補單克隆抗體制備時間長、成本高等的缺點。本研究中的cry1C抗體可應(yīng)用于cry1C轉(zhuǎn)基因植物表達的cry1C蛋白的定性或定量檢測,包括ELISA,Western Blot,IP/ChIP等免疫學(xué)手段,為深入研究抗鱗翅目害蟲植物具有重要意義。
本研究生物信息學(xué)方法預(yù)測cry1C的抗原表位區(qū),優(yōu)化并人工合成抗原序列Δcry1C,構(gòu)建原核表達載體。在大腸桿菌中原核表達,純化His6-Δcry1C重組蛋白,免疫兔子獲得cry1C多克隆抗體,其效價可達1∶512 000。采用Western Blot方法檢測cry1C轉(zhuǎn)基因水稻的目的蛋白結(jié)合,特異性較高。