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應用MSP檢測子宮內(nèi)膜異位癥相關(guān)性卵巢癌中RASSF2A基因啟動子甲基化狀態(tài)

2018-06-19 00:40嚴力鋒汪期明
現(xiàn)代實用醫(yī)學 2018年5期
關(guān)鍵詞:失活癌基因異位癥

嚴力鋒,汪期明

子宮內(nèi)膜異位癥最常異位于卵巢,是最常見的婦科良性疾病之一;但表現(xiàn)出多種惡性行為,并可發(fā)生惡變。卵巢子宮內(nèi)膜異位癥惡變的主要細胞學類型是子宮內(nèi)膜樣腺癌和卵巢透明細胞癌,稱為子宮內(nèi)膜異位癥相關(guān)性卵巢癌(EAOC)。RASSF2A基因是抑癌基因的一種,該基因的失活同胃癌、肺癌、鼻咽癌及卵巢癌等腫瘤的發(fā)生密切相關(guān)[1-4]。

MSP法檢測甲基化的原理是根據(jù)甲基化和非甲基化等位基因修飾后的序列不同,設計兩對分別針對甲基化和非甲基化狀態(tài)的引物,通過PCR擴增產(chǎn)物的不同,反映特定區(qū)域的甲基化狀態(tài)。本研究通過MSP法分析RASSF2A基因啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與EAOC的研究作用,現(xiàn)將結(jié)果報道如下。

1 資料與方法

1.1一般資料 收集2015年5月至2016年5月寧波市婦女兒童醫(yī)院因卵巢癌行手術(shù)治療患者的石蠟包埋標本。患者年齡22~69歲,平均40歲。病例組:30例卵巢透明細胞癌(OCC)患者的組織,30例卵巢子宮內(nèi)膜樣腺癌(OEA)患者的組織。對照組:正常子宮內(nèi)膜組織。剔除標準包括:原發(fā)性癌,新輔助化療患者,缺乏石蠟標本。所有病例在手術(shù)前6個月內(nèi)沒有接受GnRH-a或者性激素治療或使用抗生素。

1.2研究方法

1.2.1標本采集方法 收集各病理組織后進行常規(guī)處理,切下后放置到冰盒當中,冰箱保存,提取DNA完成甲基化研究。

1.2.2DNA提取方法 使用DNA提取試劑盒(天根生化科技有限公司TIANGEN DP215)提取DNA:(1)將重量組織處理為勻漿,轉(zhuǎn)移至EP管中,10000 r/m in,離心1 min。離心結(jié)束后,加入緩沖液GB(200l)、蛋白酶K溶液(20l),顛倒搖勻,56℃放置水浴,隔半個小時顛倒搖勻1次,孵育3~4 h,直至組織完全消化。(2)將上述EP管取出,加入-20℃的無水乙醇(200l),顛倒搖勻,可見EP管中少許絮狀物。(3)將EP管中液體置入吸附柱CB3,放入收集管,離心30 s,轉(zhuǎn)速設置為12 000 r/m in,離心結(jié)束后,取出收集管,棄管中廢液,吸附柱CB3置入收集管。(4)將緩沖液GD(500l)放入吸附柱CB3,設置轉(zhuǎn)速為12 000 r/min,離心30 s,離心結(jié)束后,棄廢液,吸附柱CB3放入收集管。(5)漂洗液PW(700l)置入吸附柱CB3,開始離心,調(diào)整轉(zhuǎn)速為12 000 r/min,時間30 s,離心結(jié)束后,棄廢液,將吸附柱CB3放入收集管中。(6)漂洗液PW(500l)置入吸附柱CB3,開始離心,設置轉(zhuǎn)速12 000 r/m in,時間30 s,離心結(jié)束后,棄廢液。(7)繼續(xù)離心,設置轉(zhuǎn)速12000 r/m in,時間 2m in,離心結(jié)束后,棄廢液。(8)為清凈參與漂洗液,在室溫下將吸附柱CB3靜置4~6 min,使漂洗液自然風干(因漂洗液中添加過乙醇,而乙醇會影響后續(xù)試驗結(jié)果,所以需室溫下靜置,風干殘留乙醇及漂洗液)。(9)吸附柱CB3換1.5m lEP管,置入洗脫緩沖液TB(150~200l),室溫下靜置 4 ~ 5 min(此步需剪去吸附柱的蓋子,EP管上寫兩個編號;且置入洗脫緩沖液TB時,需懸空滴入,吸附膜中間處最佳)。(10)繼續(xù)離心,設置轉(zhuǎn)速12000 r/min,時間2min,離心結(jié)束后,離心管中液體即為溶解的DNA。(11)將DNA溶液保存在―20℃冰箱中備用。

1.2.3DNA的SssI修飾和純化 (1)稀釋S-腺苷甲硫氨酸(SAM):取1l的32 mmol/L濃度的SAM,加入19l去離子水,使終濃度為160mol/L。(2)依次加入以下組分:10×NEBBuffer2l,SAM(160mol/L)2l,DNA 1g,M.ssI(4 U/l)1l,去離子水15l,總體積20l。(3)輕輕混勻,37℃孵育 1 h,65 ℃熱失活20 m in終止反應。

1.2.6修飾后DNA純化回收 (1)按照Promega Wizard Cleanup DNA純化回收說明,70℃水浴預熱雙蒸水;配置80%異丙醇。(2)加1m lPromega’s Wizard DNA Clean-up resin,輕柔顛倒混勻,使DNA充分與樹脂結(jié)合。(3)將混合物移入注射器針筒,緩慢移動針栓,排出液體,小柱內(nèi)有回收的白色樹脂。(4)將80%的異丙醇2m l移入針筒內(nèi)(針筒與回收小柱相連)。緩慢移動針栓排出液體,洗脫小柱內(nèi)已回收的白色樹脂。(5)將回收小柱放入新管內(nèi),12 000 r/min離心2 m in,去除殘余液體,甩干樹脂。(6)加入70℃水浴預熱的雙蒸水50l,5m in后,12000 r/m in離心 20 s。(7)移液器加3M NaOH 5.5l,作用15m in,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.7甲基化特異性PCR (1)引物序列:甲基化特異 性 引 物 MSP-forward 5’-GTTCGTCGTCGTTTTTTAGGCG-3’和 MSP-reverse 5’-AAAAACCAACGACCCCCGCG-3’,非甲基特異性引物為USP- forward,USP- forward 5’-AGTTTGTTGTTGTTTTTTAGGTGG-3’和 USP-reverse 5’-AAAAAACCAACAACCCCCACA-3’,擴增片段均為 108 bp。(2)應體體系:10×PCR Buffer 2l,dNTPmix(2.5 mmol/L dNTP)1.6l,上游引物(10mol/L)0.4l,下游引物(10mol/L)0.4l,修飾后的DNA 2l,熱啟動酶&DNA聚合酶0.1l,去離子水13.5l,總體積 20l。(3)反應條件:95℃預變性5 min,94℃變性30 s,甲基化特異性引物58℃退火30 s,非甲基化特異性引物54℃30 s,然后72℃延伸30 s,共35個循環(huán),最后72℃延伸6 min反應完成。(4)2%瓊脂糖凝膠電泳PCR產(chǎn)物。(5)甲基化判斷標準:同一標本,如果非甲基化引物和甲基化引物均有產(chǎn)物擴出,或僅甲基化引物有產(chǎn)物擴出,判斷為甲基化;如果僅有非甲基化引物有產(chǎn)物擴出,而無甲基化引物產(chǎn)物擴出,判斷為非甲基化。

1.3統(tǒng)計方法 采用SPSS 13.0軟件進行統(tǒng)計學分析,兩組計數(shù)資料比較采用2檢驗。<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

2 結(jié)果

本研究采用針對RASSF2A啟動子MSP特異性引物對啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)進行檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)卵巢透明細胞癌組織RASSF2A基因啟動子甲基化陽性率明顯高于正常子宮內(nèi)膜組織(2=27.8,<0.05),卵巢子宮內(nèi)膜樣腺癌組織RASSF2A基因啟動子甲基化陽性率明顯高于正常子宮內(nèi)膜組織(2=34.7<0.05),見表1。部分組織的MSP結(jié)果見封二彩圖4。

3 討論

子宮內(nèi)膜異位癥發(fā)生率在育齡期女性是7%~15%,絕經(jīng)后女性少于2%[5]。雖然子宮內(nèi)膜異位癥是一種良性疾病,但表現(xiàn)出多種惡性行為,包括局部和遠處轉(zhuǎn)移,與鄰近組織粘連,然后侵襲和破壞。目前子宮內(nèi)膜樣腺癌和透明細胞癌是EAOC主要的組織病理學亞型[6],而且其他惡性腫瘤的病理組織學亞型也與子宮內(nèi)膜異位癥相關(guān),已知的有交界性漿液性癌或漿液性癌,但發(fā)生率很少[7]。

子宮內(nèi)膜異位癥惡性轉(zhuǎn)變?yōu)槟[瘤的過程中存在許多基因?qū)W事件,如染色體雜合性缺失(LOH)和基因突變等,如LINE-1、ARID1A和BAF250a、PIK3CA等的突變[8-10]。近些年隨著對腫瘤發(fā)生的分子生物學機制研究的不斷深入,表觀遺傳學在腫瘤發(fā)生中的作用逐漸受到人們的重視。它的主要表現(xiàn)形式有:DNA甲基化、組蛋白修飾、基因組印記、母體效應及RNA編輯等。DNA甲基化是重要的表觀遺傳學修飾形式,研究表明抑癌基因啟動子區(qū)CpG島的高甲基化是導致抑癌基因失活的一個重要機制[11]。

表1 不同組織中RASSF2A基因啟動子甲基化率的比較

RAS蛋白通過一些重要的信號傳導途徑調(diào)節(jié)細胞的分化、增殖及凋亡等生命活動。研究表明:RAS信號通路的改變可導致腫瘤的發(fā)生,近年來一組含有RAS相關(guān)結(jié)構(gòu)域的蛋白被命名為RASSF家族,是 RAS激活信號傳導通路中非常重要的負效應調(diào)節(jié)子。迄今為止,共發(fā)現(xiàn)10種RAS相關(guān)結(jié)構(gòu)域家族成員,其中有9種在人類腫瘤中低表達或缺失[12]。RASSF2A基因作為一個潛在的抑癌基因,其表達減弱或缺失已見于結(jié)腸癌、胃癌、胰腺癌、卵巢癌、梅克爾細胞癌及尤文氏肉瘤等腫瘤。但目前有關(guān) RASSF2A基因表達及其啟動子區(qū)甲基化狀態(tài)與子宮內(nèi)膜異位惡變關(guān)系的研究尚未見報道。

本實驗采用 MSP方法測定各個組織的 RASSF2A啟動子甲基化情況,MSP法檢測甲基化的原理是根據(jù)甲基化和非甲基化等位基因修飾后的序列不同,設計兩對分布針對甲基化和非甲基化狀態(tài)的引物,通過PCR擴增產(chǎn)物的不同,反映特定區(qū)域的甲基化狀態(tài)。MSP法特異性高、簡單易行、費用和耗時小。在本研究中,30例卵巢透明細胞癌和30例卵巢子宮內(nèi)膜樣腺癌,分別有63.33%和73.33%的患者發(fā)生RASSF2A啟動子甲基化,而正常的子宮內(nèi)膜組織中沒有發(fā)生甲基化,差異有統(tǒng)計學意義(< 0.05)。

DNA甲基化是復制 DNA之后重要的調(diào)節(jié)方式,與胚胎發(fā)育及細胞分化相關(guān)。有研究認為基因啟動子的甲基化在抑癌基因失活過程中的影響很大,RASSF2A失活的主要途徑是啟動子區(qū)的甲基化[13-14]。RASSF2A甲基化之后喪失負向調(diào)節(jié)細胞的作用,導致細胞容易出現(xiàn)惡變。有文獻報道,在結(jié)腸癌細胞系中存在70%~89%的RASSF2A啟動子甲基化,結(jié)腸癌中有42.0%~72.6%的RASSF2A啟動子甲基化[15-16]。

綜上所述,RASSF2A啟動子甲基化跟EAOC的發(fā)生相關(guān)。隨著對該領(lǐng)域研究的深入尤其是抑癌作用的明確,RASSF2A啟動子甲基化可以作為早期診斷EAOC的重要生物學方法。

參考文獻:

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