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MYCT1-GST原核表達(dá)載體的構(gòu)建及鑒定

2018-05-30 23:09:32孫媛媛劉佳富偉能
關(guān)鍵詞:凝膠電泳瓊脂糖克隆

孫媛媛,劉佳,富偉能

(中國醫(yī)科大學(xué) 1. 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室,沈陽 110122; 2. 實驗動物部,沈陽 110001)

MYCT1是本課題組前期應(yīng)用定位克隆策略發(fā)現(xiàn)的與喉癌相關(guān)的致病基因,位于6q25,全長21 000 bp,含有2個外顯子和1個內(nèi)含子,mRNA序列長約1 006 bp[1]。MYCT1基因在不同腫瘤中發(fā)揮著不同的作用,如在多數(shù)實體瘤中發(fā)揮抑癌基因作用,在白血病中卻發(fā)揮癌基因作用,提示MYCT1基因通過不同的信號通路發(fā)揮不同的功能[2-6]。然而,有關(guān)MYCT1基因在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的具體分子機(jī)制仍不清楚,其相互作用蛋白質(zhì)的篩查和鑒定將有助于明確其發(fā)揮作用的分子機(jī)制。

本研究中擬通過構(gòu)建含有GST標(biāo)簽的MYCT1原核表達(dá)載體,獲得大量的MYCT1-GST融合蛋白,為MYCT1相互作用蛋白質(zhì)的篩查和鑒定奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 實驗材料與試劑

全血RNA 提取試劑盒 (美國Galen Biopharm公司),反轉(zhuǎn)錄試劑盒、膠回收試劑盒、JM109菌株 (日本TaKaRa公司),pET28a (+) 載體 (中國上海吉凱基因公司) 、限制性內(nèi)切酶NcoⅠ/ HindⅢ及PCR 相關(guān)試劑(日本TaKaRa 公司),無內(nèi)毒素質(zhì)粒中提試劑盒、BL21 (DE3) 菌株 (中國Tiangen公司),IPTG、瓊脂糖粉末、胰蛋白胨、酵母提取物、氯化鈉、卡那霉素 (美國Sigma公司),小鼠源GST標(biāo)簽抗體、辣根過氧化物酶標(biāo)記的山羊抗鼠二抗 (中國Proteintech公司),ECL化學(xué)發(fā)光液、SDS-PAGE凝膠配制試劑盒、細(xì)菌蛋白提取試劑盒 (中國南京凱基公司) 。

1.2 實驗方法

1.2.1 載體酶切和鑒定:將純化的pET28a (+) 質(zhì)粒應(yīng)用NcoⅠ/ HindⅢ雙酶切,并對載體酶切產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,回收目的條帶。

1.2.2 目的片段的獲?。喝≌H诵迈r抗凝血,1 500 r/min離心10 min進(jìn)行血漿分離,將血漿轉(zhuǎn)移至1.5 mL無RNA酶離心管中,加500 mL TRIzol進(jìn)行總RNA提取。以提取的RNA為模板,反轉(zhuǎn)錄成cDNA;然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增目片段。引物序列如下:Forward,5’-AAGAAGGAGATATACCATGGTGTCCCCTATACT AGGTTATTGG- 3’;Reverse,5’- CGAGTGCGGCCGC AAGCTTTCAGGAATCTGGGAATGCCTTGATGATG -3’;CCATGG表示插入的NcoⅠ切酶位點,AAGCTT表示插入的HindⅢ內(nèi)切酶位點。按照試劑盒說明書配制PCR 反應(yīng)液,擴(kuò)增條件如下:98 ℃ 5 min;98 ℃ 10 s、55 ℃ 10 s、72 ℃ 90 s,共30個循環(huán);72 ℃ 8 min;4 ℃+∞。

1.2.3 MYCT1-GST表達(dá)載體的構(gòu)建和鑒定:將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,回收和純化目的條帶,與酶切后的pET28a (+) 空載體按1∶4比例混合,16℃連接過夜,并將連接產(chǎn)物加入含有100 μ L JM109感受態(tài)細(xì)菌中進(jìn)行轉(zhuǎn)化;將轉(zhuǎn)化產(chǎn)物加入1 mL LB培養(yǎng)液,37℃恒溫?fù)u床培養(yǎng)1 h;將菌液涂布于含有卡納霉素的LB平板,繼續(xù)培養(yǎng)12~16 h;挑選單克隆菌落6~10個,放入2 mL含有卡納霉素的LB液體培養(yǎng)基,37℃振搖培養(yǎng)10~12 h,提取重組質(zhì)粒進(jìn)行序列分析。挑取陽性克隆進(jìn)行菌液PCR鑒定,按照試劑盒說明書配制PCR 反應(yīng)液,擴(kuò)增條件:94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s、55 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s,30個循環(huán);72 ℃ 5 min;4 ℃ +∞,引物序列:Forward,5’- GAAATCCAG CAAGTATATAGC- 3’;Reverse,5’-TGCTAGTTATT GCTCAGCGG-3’ 。

1.2.4 中量提取質(zhì)粒:將鑒定出的陽性轉(zhuǎn)化子接種于50 mL含相應(yīng)抗生素的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)12~16 h,6 000 g離心收集菌體。按照試劑盒說明書提取質(zhì)粒DNA。

1.2.5 原核融合蛋白MYCT1-GST的純化和鑒定:將MYCT1-GST重組質(zhì)?;D(zhuǎn)BL21 (DE3) 菌株,挑取單個克隆進(jìn)行PCR鑒定。選取陽性克隆加入5 mL LB的10 mL試管里,37 ℃培養(yǎng)過夜。 將培養(yǎng)菌液轉(zhuǎn)移到含有500 mL LB的1L錐形瓶中,37 ℃,225 r/min培養(yǎng)至OD600≈1.0~1.5,加入適當(dāng)濃度的IPTG,在37℃下培養(yǎng)8 h。6 000 g離心收集細(xì)菌體,加入20 mL細(xì)菌裂解液 (PBS 1%Triton-100 PMSF) ,吹打混勻,冰上超聲破碎至裂解液充分清涼,11 000 r/min,15 min,4 ℃離心分離上清。取50~70 μ L GST-瓊脂糖微球到EP管中,用800 μ L PBS 1%Triton-100潤洗1次,將提取的融合蛋白MYCT1-GST與之混勻,4 ℃層析柜旋轉(zhuǎn)結(jié)合1 h。PBS 1%Triton-100洗3次,PBS洗3次,離心收集瓊脂糖微球,加入40 μ L 5×上樣緩沖液溶解瓊脂糖微球上的蛋白,煮沸3 min,收集純化好的重組蛋白。

配置10% SDS-PAGE凝膠,每孔上樣量為20 μ L。連接電泳裝置,以恒電壓80 V進(jìn)行電泳。當(dāng)?shù)鞍譓arker進(jìn)入分離膠后,將電壓提至120 V,直至溴酚蘭泳至凝膠下端附近 (約1.5 h) ,關(guān)閉電源,停止電泳。200 mA電轉(zhuǎn)膜1 h,取出PVDF膜,放入封閉液中置于水平搖床上,室溫封閉1 h。加入一抗溶液,置于搖床上4 ℃雜交過夜,加入二抗溶液,室溫雜交1 h,ECL化學(xué)發(fā)光。

2 結(jié)果

2.1 載體酶切結(jié)果

提取純化pET28a (+) 質(zhì)粒 (圖1A) ,應(yīng)用NcoⅠ/HindⅢ雙酶切該質(zhì)粒,1%瓊脂糖凝膠電泳分析得到1條5 400 bp條帶,電泳結(jié)果與預(yù)期相符 (圖1B) 與預(yù)期結(jié)果一致,提示酶切成功。

2.2 目的片段獲取

通過實時PCR實驗進(jìn)行擴(kuò)增MYCT1 CDS區(qū),產(chǎn)物大小1 424 bp,通過1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,結(jié)果與預(yù)期一致,見圖2。

2.3 MYCT1-GST 表達(dá)載體的構(gòu)建和鑒定

挑取陽性克隆進(jìn)行菌液PCR鑒定,陽性轉(zhuǎn)化子PCR產(chǎn)物大小為919 bp,與預(yù)期結(jié)果一致 (圖3A) 。將鑒定出的陽性轉(zhuǎn)化子進(jìn)行測序,對測序結(jié)果與目的基因序列進(jìn)行比對分析。結(jié)果顯示,測序所得序列與目的基因MYCT1的CDS區(qū)完全一致 (圖3B) 。

圖1 pET28a (+) 空載體酶切結(jié)果Fig.1 Restriction digestion of the empty vector pET28a (+)

圖2 MYCT1目的片段獲取Fig.2 MYCT1 target fragment

2.4 融合蛋白MYCT1-GST的純化與鑒定

通過PCR方法檢測MYCT1-GST重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化效率,結(jié)果顯示1~7號克隆均轉(zhuǎn)化成功 (圖4A) 。應(yīng)用GST標(biāo)簽抗體通過Western blotting實驗對融合蛋白MYCT1-GST進(jìn)行鑒定,結(jié)果顯示重組蛋白組 (M1-G)有融合蛋白MYCT1-GST表達(dá)而對照組只有GST蛋白表達(dá),提示純化成功 (圖4B) 。

3 討論

蛋白質(zhì)是組成細(xì)胞結(jié)構(gòu)的重要組分,也是行使功能的主要形式。在細(xì)胞中存在大量的蛋白通過與其他蛋白質(zhì)結(jié)合形成復(fù)合體參與生命活動的調(diào)控[7-9]。因此,研究MYCT1相互作用蛋白將有助于揭示其在腫瘤中發(fā)揮的功能和參與的信號通路。

圖3 MYCT1-GST 表達(dá)載體的構(gòu)建和鑒定Fig.3 Identification of MYCT1-GST clones

圖4 融合蛋白MYCT1-GST的獲得與鑒定Fig.4 Acquisition and identification of MYCT1-GST fusion protein

常用的相互作用蛋白研究方法包括GST-pull down、Co-IP、噬菌體展示技術(shù)、熒光共振能量轉(zhuǎn)移顯微成像技術(shù)以及酵母雙雜交技術(shù)等,其中GST-pull down技術(shù)實驗周期短,操作步驟簡便,比較容易純化得到大量的重組蛋白,且能夠提供2個蛋白質(zhì)直接相互作用的有力證據(jù)[10-12]。因此GST-pull down技術(shù)不但可以作為研究蛋白質(zhì)相互作用的首選方案,同樣也可以作為那些通過了其他研究手段如免疫共沉淀,酵母雙雜交等方法篩選得到的相互作用對的再次鑒定。

本研究中,通過提取外周血RNA進(jìn)行實時PCR來獲取MYCT1模板,構(gòu)建至具有PT7啟動子的pET28a (+) 載體質(zhì)粒DNA中,并通過PCR和質(zhì)譜的方法對其進(jìn)行了鑒定。結(jié)果成功構(gòu)建了MYCT1-GST載體,并在IPTG誘導(dǎo)下成功表達(dá)了GST融合蛋白,進(jìn)一步應(yīng)用GST對谷胱甘肽偶聯(lián)球珠的親和性,純化到了MYCT1-GST融合蛋白。MYCT1-GST載體的構(gòu)建為研究MYCT1奠定了基礎(chǔ),對進(jìn)一步研究其參與的信號通路及在腫瘤中的分子作用機(jī)制具有重要意義。

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