徐淑菲,孔繁德,苗 麗,林雙慶
(1. 廈門出入境檢驗(yàn)檢疫局,福建廈門 361026;2. 河南出入境檢驗(yàn)檢疫局,河南鄭州 450003)
肉和肉制品中的“摻雜使假”是食品質(zhì)量控 制面臨的主要挑戰(zhàn)之一[1],也是消費(fèi)者投訴的焦點(diǎn)之一。由于價(jià)格差異帶來(lái)的利益誘惑,驅(qū)使一些不法商販或企業(yè)在牛、羊、鹿等高價(jià)肉制品中摻雜一些低價(jià)值的肉原料,如豬肉、雞肉、鴨肉,以及皮毛類動(dòng)物肉,如狐貍、水貂、海貍鼠、貉等,甚至還用鼠肉充當(dāng)羊肉,或者將低價(jià)肉經(jīng)過(guò)香精處理后冒充高價(jià)肉[2-3]。這些“摻雜使假”行為不僅侵害了消費(fèi)者權(quán)益,有時(shí)還涉及到民族問題或是宗教問題,從而造成惡劣的社會(huì)影響。如果問題產(chǎn)品出口到國(guó)外,則會(huì)損害我國(guó)食品企業(yè)的整體形象,從而影響出口貿(mào)易[4]。盡管國(guó)外食品生產(chǎn)有較嚴(yán)格的可追溯程序(即每份產(chǎn)品中的所有成分都可以追溯到來(lái)源養(yǎng)殖場(chǎng),所有中間環(huán)節(jié)產(chǎn)品處理也可以追溯到相關(guān)供應(yīng)商),但也有類似的肉類摻假報(bào)道,同樣使人擔(dān)憂。為了快速鑒別牛羊肉中是否摻雜了雞肉、鴨肉等其他肉類,本文建立了比PCR和qPCR更為快速簡(jiǎn)便的熒光LAMP方法。
1.1.1 樣品的采集和處理 試驗(yàn)所用的雞肉、鴨肉、豬肉、牛肉、犬血液、鴿子、魷魚、羅非魚等:廈門出入境檢驗(yàn)檢疫局動(dòng)物檢疫實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)項(xiàng)目樣品;山羊肉、綿羊肉:購(gòu)自廈門市市場(chǎng);鼠肉:來(lái)自實(shí)驗(yàn)用動(dòng)物;狐貍?cè)猓汉幽铣鋈刖硻z驗(yàn)檢疫局提供;TaKaRa馬核酸、TaKaRa兔核酸:寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品。
1.1.2 主要試劑和儀器 組織DNA提取試劑盒:LabServ公司產(chǎn)品;IMM(Isothermal master mix)試劑:北京晟泰勃科技有限公司產(chǎn)品;2×Taq PCR MasterMix、DL 2000 DNA Marker:TaKaRa公司產(chǎn)品;Veriti 96孔型PCR儀:ABI公司;Genie II等溫?cái)U(kuò)增熒光檢測(cè)系統(tǒng):OptiGene公司;Biophotometer plus型核酸蛋白測(cè)定儀:Eppendorf公司。
1.1.3 引物
1.1.3.1 LAMP引物序列 對(duì)不同動(dòng)物的線粒體基因序列進(jìn)行比對(duì),選取雞、鴨CytB基因作為雞或鴨源性成分的檢測(cè)基因,對(duì)應(yīng)的GenBank號(hào)分別為AY029583.1、EU585609.1(表1)。
1.1.3.2 vLAMP擴(kuò)增片段 紅色粗字體為外引物豬F3序列和豬B3的顛倒互補(bǔ)序列,紅色粗字體之間的基因序列為L(zhǎng)AMP擴(kuò)增片段(表2)。
1.1.3.3 PCR引物 根據(jù)文獻(xiàn)[5]中的雞鴨特異性引物序列合成引物。雞擴(kuò)增片段大小為256 bp,鴨擴(kuò)增片段大小為292 bp(表3)。
表1 LAMP引物序列
表2 雞、鴨CytB基因LAMP擴(kuò)增片斷
表3 PCR引物序列
1.1.3.4 引物濃度 雞FIP、BIP,鴨FIP、BIP均為20 μmol/L;雞F3、B3、LoopB、loopF,鴨F3、B3、LoopB、loopF均為10 μmol/L。PCR所有引物濃度均為10 μmol/L。
1.2.1 DNA提取 按照LabServ公司生產(chǎn)的組織DNA提取試劑盒說(shuō)明書,提取各樣品DNA。經(jīng)核酸蛋白測(cè)定儀測(cè)定,雞肉、鴨肉提取的核酸濃度分別為2.2×102、8.3×102μg/mL。
1.2.2 LAMP方法的建立及優(yōu)化 參考本課題組牛、羊、豬源性成分LAMP方法優(yōu)化的過(guò)程及方案,將雞、鴨源性成分LAMP檢測(cè)的反應(yīng)組分進(jìn)行內(nèi)外引物工作濃度比優(yōu)化、引物工作濃度優(yōu)化、Loop引物加速試驗(yàn)和反應(yīng)溫度優(yōu)化等試驗(yàn)[6-7]。
1.2.3 溶解曲線 根據(jù)優(yōu)化后的最佳反應(yīng)體系和條件進(jìn)行本試驗(yàn)。對(duì)雞(或鴨)源性成分的LAMP檢測(cè)進(jìn)行2個(gè)重復(fù),設(shè)置1個(gè)空白對(duì)照。
1.2.4 靈敏度試驗(yàn) 將雞、鴨源性成分核酸分別進(jìn)行10倍連續(xù)梯度稀釋。稀釋倍數(shù)依次為10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6。
1.2.4.1 LAMP方法 根據(jù)優(yōu)化的最佳反應(yīng)體系和條件進(jìn)行。反應(yīng)管內(nèi)依次加入10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6倍稀釋的對(duì)應(yīng)雞(或鴨)源性成分核酸1 μL,補(bǔ)充水至25 μL。
1.2.4.2 PCR方法 反應(yīng)體系包括:2×Taq PCR MasterMix 12.5 μL,引物各1 μL,依次加入10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6倍稀釋的雞或鴨源性成分核酸各1 μL,補(bǔ)充水至25 μL。反應(yīng)條件:94 ℃3 min;94 ℃ 30 s、54 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃ 3 min。
1.2.5 特異性試驗(yàn) 根據(jù)優(yōu)化后的最佳反應(yīng)體系和條件進(jìn)行本試驗(yàn)。第1~15管依次加入雞核酸、鴨核酸、豬核酸、綿羊核酸、鼠核酸、狐核酸、TaKaRa馬核酸、羅非魚核酸、魷魚核酸、鴿核酸、犬核酸、山羊核酸、牛核酸、TaKaRa兔核酸各1 μL,補(bǔ)充水至25 μL。
雞或鴨源性成分LAMP檢測(cè)方法的內(nèi)外引物最佳工作濃度比(FIP+BIP)∶(F3+B3)均為4∶1(圖1);引物FIP、BIP、F3、B3的最佳工作濃度分別為1.6、1.6、0.4、0.4 μmol/L(圖2)。對(duì)于雞源性成分LAMP檢測(cè)方法,63~68 ℃均可得到較好的試驗(yàn)結(jié)果;對(duì)于鴨源性成分LAMP檢測(cè)方法,最佳反應(yīng)溫度范圍為62~65 ℃(圖3)。
圖1 內(nèi)外引物工作濃度比的優(yōu)化
圖2 引物FIP、BIP、F3、B3工作濃度優(yōu)化
A. 雞源性成分檢測(cè)LAMP方法;B. 鴨源性成分檢測(cè)LAMP方法;1. 工作濃度分別為0.4、0.4、0.1、0.1 μmol/L;2. 工作濃度分別為0.8、0.8、0.2、0.2 μmol/L;3. 工作濃度分別為1.6、1.6、0.4、0.4 μmol/L;4. 工作濃度分別為3.2、3.2、0.8、0.8 μmol/L;5. 工作濃度分別為6.4、6.4、1.6、1.6 μmol/L;6. 工作濃度分別為12.8、12.8、3.2、3.2 μmol/L;7、8. 空白對(duì)照
圖3 方法反應(yīng)條件優(yōu)化
雞或鴨源性成分LAMP檢測(cè)方法的加速引物試驗(yàn)證明,加速雙引物的加速作用強(qiáng)于加速單引物;兩條加速單引物的加速作用相似;無(wú)加速引物的反應(yīng)所需反應(yīng)時(shí)間最久(圖4)。加速引物的加速作用僅限于加快反應(yīng)速度,縮短反應(yīng)時(shí)間,并不會(huì)增加假陽(yáng)性概率。加速單引物可以使反應(yīng)時(shí)間縮短一半左右,反應(yīng)時(shí)間應(yīng)該適當(dāng)縮短,可設(shè)置為20 min左右;加速雙引物可以使反應(yīng)時(shí)間縮短2/3左右,反應(yīng)時(shí)間可設(shè)置為15 min左右。
LAMP方法中的溶解曲線是報(bào)告中的退火導(dǎo)數(shù)(Anneal derivative)。雞、鴨LAMP的溶解曲線的峰值分別為87.1、85.2 ℃,均只有1個(gè)峰,且重復(fù)性良好,進(jìn)一步佐證了雞、鴨LAMP方法的可信度(圖5)。
圖4 Loop引物的加速結(jié)果
圖5 溶解曲線
雞鴨源性成分LAMP檢測(cè)方法:10-1~10-4倍稀釋的核酸孔均出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,10-4倍稀釋的核酸孔出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,30 min內(nèi)未出現(xiàn)Ct值,延長(zhǎng)時(shí)間會(huì)出現(xiàn)Ct值。雞源性成分PCR檢測(cè)方法:10-1~10-3倍稀釋的核酸孔均出現(xiàn)清晰的256 bp的目的條帶。兩者LAMP方法的靈敏度比PCR方法高10倍。鴨源性成分LAMP檢測(cè)方法:10-1~10-4倍稀釋的核酸均出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,30 min內(nèi)均出現(xiàn)Ct值;鴨源性成分PCR檢測(cè)方法:10-1~10-3倍稀釋的核酸孔均出現(xiàn)清晰的292 bp的目的條帶。鴨源性成分LAMP檢測(cè)方法比PCR方法更靈敏(圖6、表4)。
圖6 靈敏度試驗(yàn)
表4 靈敏度試驗(yàn)結(jié)果
雞鴨源性成分LAMP檢測(cè)方法只有相對(duì)應(yīng)的反應(yīng)孔有典型的擴(kuò)增曲線,其他11種動(dòng)物核酸均未出現(xiàn)擴(kuò)增曲線(圖7)。由此可見,本文建立的雞鴨動(dòng)物源性成分LAMP檢測(cè)方法具有良好的特異性,結(jié)合溶解曲線只有1個(gè)峰值,說(shuō)明該方法具有更高的可信度。
對(duì)市場(chǎng)上50份牛肉、羊肉、雞肉、鴨肉制品等進(jìn)行了雞鴨源性成分檢測(cè)。在市場(chǎng)中的牛肉、羊肉制品中未發(fā)現(xiàn)雞鴨源性成分;在雞肉制品中檢出雞源性成分,鴨肉制品中檢出鴨源性成分。應(yīng)用結(jié)果說(shuō)明該方法特異性較好,可以用于市場(chǎng)檢測(cè)。而且本文建立的方法和PCR方法檢測(cè)結(jié)果一致。
圖7 LAMP檢測(cè)方法特異性分析
傳統(tǒng)的LAMP方法靈敏度高(比傳統(tǒng)的PCR方法高2~5個(gè)數(shù)量級(jí)),反應(yīng)時(shí)間短(30~60 min就能完成反應(yīng)),臨床使用不需要特殊的儀器,操作簡(jiǎn)單。但傳統(tǒng)的LAMP方法也有缺點(diǎn):(1)反應(yīng)完畢開蓋加熒光染料,易形成氣溶膠污染,加上目前國(guó)內(nèi)大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室不能嚴(yán)格分區(qū),使得假陽(yáng)性問題較嚴(yán)重;(2)肉眼觀察判定結(jié)果的主觀性強(qiáng),對(duì)于弱陽(yáng)性試驗(yàn),易出現(xiàn)錯(cuò)判;(3)引物設(shè)計(jì)要求高。
為了克服傳統(tǒng)LAMP方法的缺點(diǎn),本文建立了檢測(cè)雞鴨源性成分的熒光LAMP方法。這是在傳統(tǒng)LAMP方法的基礎(chǔ)上,通過(guò)等溫?cái)U(kuò)增熒光檢測(cè)系統(tǒng)完成的。核酸等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)與生物熒光檢測(cè)技術(shù)相結(jié)合,通過(guò)對(duì)溫度的精確控制,使核酸在恒溫條件下進(jìn)行快速擴(kuò)增,擴(kuò)增過(guò)程中熒光激發(fā)和檢測(cè)系統(tǒng)完成對(duì)擴(kuò)增過(guò)程的實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)監(jiān)控,通過(guò)實(shí)時(shí)擴(kuò)增曲線和產(chǎn)物溶解曲線,判定陰陽(yáng)性并分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。本方法也兼容多種熒光指示劑,如生物熒光,熒光染料,鈣黃綠素和熒光探針等。
相對(duì)于傳統(tǒng)的LAMP方法,本文建立的方法優(yōu)點(diǎn):(1)反應(yīng)時(shí)間更短(最快僅需15~20 min;10 min左右就可進(jìn)行實(shí)時(shí)初判);(2)通過(guò)實(shí)時(shí)擴(kuò)增曲線和產(chǎn)物溶解曲線判定陰陽(yáng)性并分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果,更可靠;(3)反應(yīng)前加入染料,不需二次開蓋,減少了污染。其缺點(diǎn)和傳統(tǒng)的LAMP一樣,對(duì)引物設(shè)計(jì)要求高。
本文在建立了牛、羊、豬源性成分LAMP檢測(cè)方法的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步建立了雞鴨源性成分LAMP檢測(cè)方法。對(duì)照最佳反應(yīng)體系發(fā)現(xiàn),最佳內(nèi)外引物工作濃度比(FIP+BIP)∶(F3+B3)均為4∶1,最佳引物FIP、BIP、F3、B3工作濃度均分別為1.6、1.6、0.4、0.4 μmol/L。牛、豬、雞和鴨源性成分的最佳擴(kuò)增反應(yīng)溫度范圍分別為64~66、65~68、63~68、62~65 ℃,默認(rèn)擴(kuò)增反應(yīng)溫度是65 ℃。故這4種動(dòng)物源性成分檢測(cè)的LAMP方法均采用65 ℃作為擴(kuò)增反應(yīng)溫度。羊最佳擴(kuò)增反應(yīng)溫度范圍為66~68 ℃,選擇最接近默認(rèn)擴(kuò)增反應(yīng)溫度的66 ℃作為擴(kuò)增反應(yīng)溫度。
為防止污染,本試驗(yàn)在操作過(guò)程中,將核酸樣本加樣區(qū)和其他試劑加樣區(qū)分別設(shè)在2個(gè)PCR專用超凈工作臺(tái)。除核酸樣本外的其他試劑加入到反應(yīng)管后,蓋好蓋子,然后移至核酸樣本加樣區(qū),打開蓋子并加入對(duì)應(yīng)的核酸樣本后,立即蓋緊蓋子,再操作下一個(gè)核酸樣本,避免交叉污染。核酸樣本加樣順序?yàn)榭瞻讓?duì)照、陰性對(duì)照、各反應(yīng)核酸樣本、陽(yáng)性對(duì)照。
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