陳 超,趙娟娟,胡 艷,郭萌萌,陶弋婧,周 涯,秦娜琳,鄭 靜,徐 林
(1.遵義醫(yī)學(xué)院 免疫學(xué)教研室暨貴州省免疫學(xué)研究生創(chuàng)新基地,貴州 遵義 563099;2.遵義醫(yī)學(xué)院 醫(yī)學(xué)物理學(xué)教研室,貴州 遵義 563099)
近年來研究顯示,一類長度大約22nt的非編碼小分子RNA-微小RNA(microRNA,miRNA)在肺癌發(fā)生中具有關(guān)鍵調(diào)控作用,且逐漸發(fā)展為肺癌臨床診斷和基因治療的重要靶標(biāo)[1-4]。新近研究顯示miRNAs家族成員miR-7在肺癌發(fā)生中具有重要作用,其低表達(dá)與肺癌的轉(zhuǎn)移相關(guān)[5]。我們前期研究發(fā)現(xiàn)miR-7模擬物(mimics)可顯著抑制人肺癌細(xì)胞的體外增殖[6]。此外,基于CMV啟動子的miR-7的真核表達(dá)載體過表達(dá)miR-7可顯著抑制人肺癌細(xì)胞體內(nèi)外生長、侵襲和轉(zhuǎn)移[7-9]。然而,miR-7為代表的miRNAs分子是否可作為臨床肺癌基因治療或診斷靶標(biāo)仍待繼續(xù)研究探討。
甲狀腺轉(zhuǎn)錄因子-1(thyroid transcription factor-1,TTF-1)基因是1989年civitarale等在甲狀腺濾泡上皮細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的一種轉(zhuǎn)錄因子,其特征性表達(dá)于甲狀腺濾泡上皮細(xì)胞和肺上皮細(xì)胞中[10]。研究發(fā)現(xiàn)TTF-1在肺癌組織中高表達(dá),且其表達(dá)水平與肺癌預(yù)后密切相關(guān),提示其可作為肺癌基因靶向表達(dá)的重要候選靶標(biāo)[11-12]。因此本研究中,我們擬利用分子克隆技術(shù),構(gòu)建TTF-1啟動子調(diào)控miR-7的真核表達(dá)載體,并初步探討該真核載體過表達(dá)miR-7對人肺癌細(xì)胞體外生長的可能影響,以期為后續(xù)基于miR-7的臨床肺癌診斷和基因治療新靶標(biāo)開發(fā)提供前期實驗基礎(chǔ)。
1.1 材料和儀器 PCR試劑,Premix Ex Taq Version2.0,限制性內(nèi)切酶,快速連接酶均購自Takara公司;引物合成由上海英駿公司完成,PGL3-basic載體購自Promega公司。質(zhì)粒抽提試劑盒購自天根生化科技有限公司;DNA凝膠回收試劑盒購自碧云天公司。人源性肺巨細(xì)胞癌95D細(xì)胞株,購于中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所。DH5α大腸桿菌菌株由本實驗室保存。SW-CJ-2FD型超凈工作臺(蘇州凈化設(shè)備廠);空氣恒溫?fù)u床(上海新苗醫(yī)療器械制造公司);TD5A-WS臺式低速離心機(jī)(湘儀儀器);IX-51倒置顯微鏡(OLYMPUS);低溫臺式高速離心機(jī)(Thermo公司);-80℃超低溫冰箱(Thermo公司)。
1.2 PCR擴(kuò)增miR-7基因 根據(jù)pri-miR-7序列設(shè)計引物。上游引物:5’-CGACGCGTAAGAGAGAAATGAGCCACTTGC-3’;下游引物:5’-CCCAAGCTTCCTGCCACAGTGGGGGATG-3’; 劃痕為酶切位點。以人肺癌95D細(xì)胞基因組DNA為模板,PCR擴(kuò)增miR-7序列,PCR條件:95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s;56 ℃ 30 s;72 ℃ 1 min;35個循環(huán);72℃ 10 min。
1.3 PGL3-basic-miR-7載體的構(gòu)建 將miR-7的PCR產(chǎn)物克隆入PGL3-basic載體中,連接產(chǎn)物經(jīng)轉(zhuǎn)化、挑克隆、搖菌后提取質(zhì)粒,使用限制性內(nèi)切酶Mul I酶和Hind Ⅲ酶做雙酶切鑒定,酶切鑒定后測序,通過測序鑒定后得到正確的重組質(zhì)粒PGL3-basic-miR-7。
1.4 PCR擴(kuò)增TTF-1啟動子基因 根據(jù)TTF-1啟動子序列設(shè)計引物。上游引物:5’-CGGGGTACCTGTTTCGGCAACTAC-3’;下游引物:5’-CGACGCGTCCTTCTGGGTCCTT-3’;劃痕為酶切位點。以人肺癌95D細(xì)胞基因組DNA為模板,PCR擴(kuò)增TTF-1啟動子序列,PCR條件:95 ℃ 5 min;95 ℃ 30 s;58 ℃ 30 s;72 ℃ 2 min20 s;35個循環(huán);72 ℃ 10 min。
1.5 p-T-miR-7載體的構(gòu)建 將TTF-1啟動子的PCR產(chǎn)物克隆入PGL3-basic-miR-7載體中,連接產(chǎn)物經(jīng)轉(zhuǎn)化、挑克隆、搖菌后提取質(zhì)粒,使用限制性內(nèi)切酶Kpn I酶和Mul I酶做雙酶切鑒定,酶切鑒定后測序,通過測序鑒定后得到正確的重組質(zhì)粒p-T-miR-7。
1.6 Real-time PCR探針法分析各組細(xì)胞中miR-7表達(dá)情況。
1.6.1 引物設(shè)計 GAPDH 上游(5’-3’)GGTGAAGGTCGGAGTCAACG。下游(5’-3’) CAAAGTTGTCATGGATGGACC。miR-7逆轉(zhuǎn)錄GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTAT-TCGCACTGGATACGACACAACAA,下劃線部分為莖環(huán)結(jié)構(gòu)。
注:A:下劃線部分為酶切位點。 圖1 PGL3.0-Basic-TTF-1-promoter-miR-7真核表達(dá)載體
1.6.2 總RNA提取 以上各組細(xì)胞用0.2%胰酶消化,加入適量完全培養(yǎng)基終止消化,移至離心管中,1 200 rmp離心5 min,取出倒掉上清液,彈開管底的沉淀物。向離心管中加入適量的 RNAiso Plus(10 cm295D細(xì)胞加入1 mL RNAiso Plus),輕輕吹打,吸出至1.5 mL EP管,室溫靜置5 min,至完全融化。12 000g 4 ℃離心5 min,吸取上清液,移入新1.5 mL EP管中。向勻漿裂解液中加入氯仿(RNAiso Plus的1/5體積),劇烈振蕩15s,待溶液充分乳化后,室溫靜置5 min,12 000g 4 ℃離心15 min。取出離心管,吸取上清液轉(zhuǎn)移至另一新的離心管中,向上清中加入等體積的異丙醇,上下顛倒充分混勻后,室溫下靜置10 min。12 000 g 4 ℃離心10 min。小心棄去上清,緩慢地沿離心管壁加入75%的乙醇1 mL,輕微上下顛倒洗滌,12 000 g 4 ℃離心5 min后棄去乙醇。室溫干燥沉淀2~5 min,加入適量的RNase-free水溶解沉淀。1.0%瓊脂糖凝膠電泳分析RNA完整性。
1.6.3 Real-time PCR探針法檢測miR-7表達(dá) 內(nèi)參基因GAPDH逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系及條件按試劑盒說明書操作,Real-time PCR反應(yīng)體系及條件: 2×SYBR?Premix Ex TaqTM10 μL,ddH2O 8 μL,cDNA 1μL,PCR Forward Primer(10 μM) 0.5 μL,PCR Reverse Primer(10μM)0.5 μL;95℃預(yù)變性30 s,95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,40個循環(huán);84 ℃采集熒光信號,以排除引物二聚體的干擾。miR-7逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系及條件按試劑盒說明書操作,Real-time PCR反應(yīng)體系及條件:20×TaqMan?Small RNA Assay 1 μL,cDNA 1 μL,PCR Master Mix II 10 μL,ddH2O 8 μL;95 ℃預(yù)變性30 s,95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,40個循環(huán);60 ℃采集熒光信號[7]。
1.7 CCK-8實驗檢測細(xì)胞增殖情況 95D細(xì)胞以3×103個細(xì)胞/孔接種于96孔培養(yǎng)板,每孔培養(yǎng)基總量200 μL,分別將p-T-miR-7重組質(zhì)粒和p-Cont質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞,于37 ℃、5% CO2的條件下培養(yǎng)72 h;每孔加入10 μL CCK-8,繼續(xù)培養(yǎng)3 h;使用酶標(biāo)儀檢測各孔吸光度(OD)值(波長450 nm)。
1.8 劃痕實驗檢測95D細(xì)胞的體外遷移 收集95D細(xì)胞,按細(xì)胞密度1×105個細(xì)胞/孔接種于24孔板,培養(yǎng)12 h;分別轉(zhuǎn)染p-T-miR-7質(zhì)粒和p-Cont質(zhì)粒,培養(yǎng)6 h;用1mL槍頭沿板中線刮出2 mm刮痕,PBS洗滌3次,顯微鏡下觀察刮痕內(nèi)無細(xì)胞,加入培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48 h;光學(xué)顯微鏡下計算刮痕內(nèi)細(xì)胞總數(shù),并拍照。
1.9 克隆形成實驗檢測95D細(xì)胞的長期體外生長 分別轉(zhuǎn)染p-T-miR-7質(zhì)粒和p-Cont質(zhì)粒,培養(yǎng)48 h;分別制成細(xì)胞懸液;將各轉(zhuǎn)染組按200、800個細(xì)胞/孔接種于6孔板中;置37 ℃、5%CO2中培養(yǎng)10~15 d,中間根據(jù)培養(yǎng)基變化適時更換新鮮培養(yǎng)基,當(dāng)出現(xiàn)肉眼可見克隆時,終止培養(yǎng),倒掉孔里的培養(yǎng)基,PBS小心洗滌2次,空氣干燥,4%多聚甲醛固定30 min,空氣干燥,用1%結(jié)晶紫染液染色30 min,洗去染液,干燥后拍照。
2.1 PGL3-basic-miR-7真核表達(dá)載體的構(gòu)建 以人肺癌95D細(xì)胞基因組DNA為模板,PCR擴(kuò)增miR-7前體序列,瓊脂糖凝膠電泳后在1302bp左右的位置出現(xiàn)目的條帶(見圖2A)。經(jīng)Mul I酶和Hind Ⅲ酶雙酶切純化后,亞克隆入PGL3-basic載體中,連接產(chǎn)物經(jīng)轉(zhuǎn)化、挑克隆、搖菌后做菌液PCR鑒定(見圖2B)。進(jìn)一步提取質(zhì)粒,利用Mul I酶和Hind Ⅲ酶做雙酶切后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳出現(xiàn)了1302bp和4818左右的兩條帶(見圖2C)。并通過質(zhì)粒測序結(jié)果(見圖2D),證明PGL3-basic-miR-7載體構(gòu)建成功。
注:A:PCR擴(kuò)增miR-7片段;B:菌液PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳圖;C:重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定;D:重組質(zhì)粒的測序鑒定。 圖2 PGL3-basic-miR-7載體構(gòu)建
2.2 p-T-miR-7真核表達(dá)載體的構(gòu)建 以人肺癌95D細(xì)胞基因為模板,PCR擴(kuò)增TTF-1啟動子序列,瓊脂糖凝膠電泳后在2300bp左右的位置出現(xiàn)目的條帶(見圖3A)。經(jīng)Kpn I酶和Mul I酶雙酶切純化后,亞克隆入PGL3-basi-miR-7載體中,連接產(chǎn)物經(jīng)轉(zhuǎn)化、挑克隆、搖菌后做菌液PCR鑒定(見圖3B)。進(jìn)一步提取質(zhì)粒,利用Kpn I酶和Mul I酶做雙酶切后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳出現(xiàn)了2300bp和6120bp左右的兩條帶(見圖3C)。并通過質(zhì)粒測序結(jié)果(見圖3D),證明載體構(gòu)建成功。
2.3 重組質(zhì)粒p-T-miR-7瞬時轉(zhuǎn)染人肺癌細(xì)胞后miR-7的表達(dá)水平 我們將p-T-miR-7重組質(zhì)粒和p-Cont質(zhì)粒分別體外瞬時轉(zhuǎn)染人肺癌95D細(xì)胞。72 h后,觀察細(xì)胞中miR-7成熟體的表達(dá)水平。結(jié)果顯示,與對照組p-Cont轉(zhuǎn)染組相比,p-T-miR-7轉(zhuǎn)染組中miR-7成熟體的表達(dá)水平顯著升高,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,見圖4)。
2.4 瞬時轉(zhuǎn)染p-T-miR-7抑制95D細(xì)胞體外增殖 我們進(jìn)一步觀察了人肺癌95D細(xì)胞體外生長的變化。光鏡下觀察發(fā)現(xiàn),與p-Cont轉(zhuǎn)染組相比,p-T-miR-7轉(zhuǎn)染組95D細(xì)胞的生長明顯受到抑制,細(xì)胞數(shù)量明顯減少(見圖5A、B、C、D,P<0.05);CCK-8檢測結(jié)果表明,細(xì)胞的增殖能力明顯下降,1.5μg和2.0μg重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組的D值分別為0.85±0.02和0.83±0.02,與p-Cont組D值1.22±0.02相比,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,見圖5E)。
注:A:PCR擴(kuò)增TTF-1啟動子片段;B:菌液PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳圖;C:重組質(zhì)粒的雙酶切鑒定;D:重組質(zhì)粒的測序鑒定。 圖3 p-T-miR-7載體構(gòu)建
圖4 Real-time PCR方法檢測p-T-miR-7轉(zhuǎn)染人肺癌95D細(xì)胞后miR-7的表達(dá)
2.5 瞬時轉(zhuǎn)染p-miR-7抑制95D細(xì)胞的長期體外生長 我們進(jìn)而利用克隆形成實驗,觀察了p-T-miR-7轉(zhuǎn)染后對人肺癌細(xì)胞長期生長的作用。結(jié)果顯示,在接種200 cells/well和800 cells/well條件下,p-T-miR-7轉(zhuǎn)染組中95D細(xì)胞的克隆形成數(shù)較p-Cont轉(zhuǎn)染組均明顯降低(11±3 vs 30±3個,P<0.05;80±3 vs 160±4個,P<0.05)(見圖6A~D)。這提示,p-T-miR-7轉(zhuǎn)染組中95D細(xì)胞的長期生長能力也顯著削弱。
2.6 瞬時轉(zhuǎn)染p-T-miR-7抑制95D細(xì)胞的體外遷移 我們前期研究顯示,miR-7模擬物(mimics)可顯著抑制人肺癌細(xì)胞的體外遷移能力。為了進(jìn)一步明確利用p-T-miR-7載體表達(dá)miR-7對人肺癌細(xì)胞的生物學(xué)特性的影響,我們又觀察了95D細(xì)胞體外遷移的變化。劃痕法結(jié)果顯示:與p-Cont組相比,p-T-miR-7組細(xì)胞的體外遷移能力受到顯著抑制(120±5,45±3,40±3,P<0.05),提示p-T-miR-7載體表達(dá)miR-7可抑制95D細(xì)胞體外遷移能力。
注:A:p-Cont組(2μg); B:p-T-miR-7組(1.5μg);C:p-T-miR-7組(2μg);D:A-C組的細(xì)胞計數(shù)比較(*P<0.05),E:CCK-8實驗結(jié)果(*P<0.05)。 圖5 瞬時轉(zhuǎn)染p-T-p-miR-7對人肺癌95D細(xì)胞體外生長的影響(×100)
注:A、B:p-Cont轉(zhuǎn)染組;C、D:p-T-miR-7轉(zhuǎn)染組。A、C:200cells/well;B、D:800cells/well。 圖6 轉(zhuǎn)染p-T-miR-7抑制人肺癌95D細(xì)胞的克隆形成能力
注:A:p-Cont組(2μg);B:p-T-miR-7組(1.5μg);C:p-T-miR-7組(2μg);D:A~C組劃痕部位的細(xì)胞計數(shù)比較(*P<0.05)。圖7 p-T-miR-7轉(zhuǎn)染抑制人肺癌95D細(xì)胞的體外遷移(×100)
現(xiàn)有的臨床肺癌治療的主要方法有外科手術(shù)治療、化學(xué)治療、放射治療。但肺癌的發(fā)生、侵襲和轉(zhuǎn)移過程十分復(fù)雜,涉及多因素、多水平的分子調(diào)控機(jī)制,因此現(xiàn)有的治療方法的療效仍十分有限[13-15]。所以新治療策略的開發(fā)仍顯得十分必要。腫瘤的基因治療技術(shù)是近年來得到快速發(fā)展的一項生物學(xué)新技術(shù),主要指將外源或內(nèi)源基因?qū)肽[瘤細(xì)胞以達(dá)到治療腫瘤的目的。目前,已知與肺癌的發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移密切相關(guān)的基因數(shù)目龐大且機(jī)制復(fù)雜,其中近年發(fā)現(xiàn)的一類小分子RNA-miRNAs與肺癌間的關(guān)系已成為該領(lǐng)域的研究熱點和重點之一[16-17]。
越來越多的研究表明,miRNAs分子參與調(diào)控了生物體的生長發(fā)育過程并參與一系列的生命活動,如細(xì)胞的生長、侵襲、凋亡等等。如:我們在前期研究中發(fā)現(xiàn)miR-7在正常腦、胸腺、淋巴結(jié)等組織中均高表達(dá),尤其以肺組織表達(dá)水平最高[18]。而在臨床肺癌組織中,miR-7的表達(dá)水平則顯著降低,且與肺癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移密切相關(guān)[5]。同時,體外利用miR-7模擬物(mimics)可顯著抑制人肺癌細(xì)胞的體外增殖[6]。而Xiong[19]等的研究發(fā)現(xiàn),miR-7在非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞中呈現(xiàn)低表達(dá),而miR-7模擬物可以抑制細(xì)胞的增殖和遷移并誘導(dǎo)其凋亡。此外他們的研究還顯示,miR-7的表達(dá)水平與Bcl-2呈負(fù)相關(guān)性。因此,該miRNA的缺失或表達(dá)水平下調(diào),均可導(dǎo)致Bcl-2表達(dá)水平的升高,從而促進(jìn)肺癌的發(fā)生。Lee等[20]的研究還提示,miR-7還可以增加肺癌細(xì)胞對化療的敏感性。我們在近期的研究中利用分子生物學(xué)技術(shù)成功構(gòu)建了基于CMV啟動子的miR-7的真核表達(dá)載體,發(fā)現(xiàn)過表達(dá)miR-7可顯著抑制人肺癌細(xì)胞體內(nèi)外生長、侵襲和轉(zhuǎn)移[7-9]。以上的研究表明:改變腫瘤細(xì)胞中特定miRNA分子的表達(dá)水平將為肺癌的基因治療提供了新的策略和嘗試。
在本研究中,我們構(gòu)建了TTF-1啟動子調(diào)控miR-7表達(dá)的真核表達(dá)載體,并觀察其在體外的表達(dá)活性。我們以人肺巨細(xì)胞癌細(xì)胞系95D細(xì)胞基因組DNA為模板,利用PCR分別擴(kuò)增TTF-1啟動子序列和miR-7前體序列,純化產(chǎn)物分別經(jīng)Kpn I和Mul I雙酶切與Mul I和HindⅢ雙酶切,克隆入pGL3-basic-載體,分別經(jīng)菌液PCR、雙酶切鑒定以及測序驗證,結(jié)果表明成功構(gòu)建了真核表達(dá)載體PGL3-basic-TTF-1-promoter-miR-7(命名為p-T -miR-7)。此外,我們發(fā)現(xiàn)將p-T-miR-7瞬時轉(zhuǎn)染人肺癌95D細(xì)胞可顯著增加miR-7成熟體的表達(dá)水平,提示TTF-1啟動子可有效啟動miR-7在真核細(xì)胞中的表達(dá)。重要的是,CCK-8實驗和克隆形成實驗進(jìn)一步顯示,轉(zhuǎn)染p-T-miR-7后,95D細(xì)胞的增殖和生長能力受到明顯抑制。同時劃痕法檢測結(jié)果顯示p-T-miR-7載體過表達(dá)miR-7后還可顯著抑制95D細(xì)胞的體外遷移,與我們前期發(fā)現(xiàn)CMV啟動過表達(dá)miR-7的結(jié)果是一致的[8-9]。這些結(jié)果提示基于TTF-1啟動子調(diào)控的miR-7真核表達(dá)載體可有效表達(dá)miR-7成熟體,且具有顯著的生物學(xué)效應(yīng)。然而,TTF-1調(diào)控miR-7表達(dá)在人肺癌細(xì)胞中的確切靶向性仍待后續(xù)研究探討。
總之,在本研究中我們成功構(gòu)建TTF-1啟動子調(diào)控的miR-7真核表達(dá)載體,這為后續(xù)開發(fā)基于miR-7靶向基因治療肺癌的新策略提供了重要的前期實驗基礎(chǔ)。
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