盛駿楨,王亞軍,羅 希,鄭裕國
(浙江工業(yè)大學 生物工程研究所 生物轉(zhuǎn)化與生物凈化教育部工程研究中心,杭州 310014)
他汀類藥物作為一類高效的降血脂藥物,能夠競爭性抑制羥甲基戊二酰輔酶A(HMG-CoA)還原酶,限制膽固醇生物合成[1],是全球銷量最高的降血脂藥物[2]。作為合成阿托伐他汀藥效基團的關(guān)鍵手性中間體,6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯的合成是生產(chǎn)阿托伐他汀的關(guān)鍵技術(shù)[3]。化學法合成6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯存在能耗大、溶劑消耗高和產(chǎn)物光學純度低等缺陷,利用生物催化的高效率、高立體選擇性和環(huán)境友好等特性,開發(fā)6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯手性生物合成技術(shù)具有重要的意義,也逐漸成為研究熱點[4-5]。
羰基還原酶在生物催化反應中具有空間選擇性的特點,因而為生物催化還原酮酯制備光學純β-羥基酯提供了一條有效的途徑[6]。然而,在立體化學方面大多數(shù)天然羰基還原酶催化的非對稱還原大多遵守Prelog法則,具有反Prelog法則的羰基還原酶相對較少,反Prelog法則立體選擇性酶的精確機理也尚未解析[7-8]。筆者所在課題組成功篩選得到具有非對映選擇性還原 (R)-6-氰基-5-羥基 -3-羰基己酸叔丁酯活性的菌株 ZJB-09225,對其進行菌種鑒定,并研究其催化性能,以建立6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯的生物催化合成工藝(圖1)。
圖1 羰基還原酶不對稱還原(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯制備6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯Fig.1 Enzymatic conversion of t-butyl 6-cyano-(5R)-hydroxy-3-oxohexanoate to t-butyl 6-cyano-(3R,5R)-dihydroxyhexanoate by ketoreductase.
1.1.1 試劑
6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯標準品購自Toronto化學制品研究公司,(R)-6-氰基-5-羥基 -3-羰基己酸叔丁酯(質(zhì)量分數(shù)約73.5%)由浙江新東港藥業(yè)股份有限公司饋贈。麥芽浸粉和瓊脂為市售生化材料。其他化學試劑均為市售色譜純或分析純試劑。
2,4-二硝基苯肼溶液:稱取0.60 g 2,4-二硝基苯肼,溶解于15.0 mL濃H2SO4。充分溶解后,與90.0 mL 73.9%乙醇水溶液混合,加水定容至100.0 mL,即為6.0 g/L 2,4-二硝基苯肼溶液。
1.1.2 培養(yǎng)基組成
富集培養(yǎng)基:豆芽汁培養(yǎng)基(50.0 g葡萄糖,黃豆芽100.0 g煮沸30 min,過濾后加水補足至1.0 L,pH自然),滅菌后加入22.8 g(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯。
斜面與平板培養(yǎng)基:豆芽汁培養(yǎng)基(50.0 g葡萄糖,黃豆芽100.0 g煮沸30 min,過濾后加水補足至1.0 L,pH自然),瓊脂質(zhì)量濃度為20.0 g/L。
發(fā)酵培養(yǎng)基(1 L):麥芽浸粉30.0,葡萄糖20.0,(NH4)2HPO41.0,K2HPO4·3H202.28,NaCl 1.0,CuSO43.0 mg;pH 7.0。
1.2.1 菌株篩選
土樣采集自江浙一帶的果園、食品廠及制藥廠等地。稱取 1.0 g土樣,分散到 10.0 mL、0.85%生理鹽水溶液中,充分混勻;移取1.0 mL菌懸液接種至29.0 mL含100 mmol/L(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯富集培養(yǎng)基;在28℃、150 r/min條件下,搖床振蕩培養(yǎng)至培養(yǎng)液變渾濁;按照體積分數(shù)3.0%接種量轉(zhuǎn)接到新鮮的無菌富集培養(yǎng)基中,繼續(xù)在28℃、150 r/min條件下?lián)u床振蕩培養(yǎng)至培養(yǎng)液渾濁。連續(xù)富集3次后對富集培養(yǎng)物逐級稀釋、涂布到固體平板上,30℃培養(yǎng)至形成明顯的單菌落。將平板上形成的單菌落通過無菌牙簽接種到無菌豆芽汁培養(yǎng)基中。30℃、150 r/min條件下培養(yǎng)2 d,收集發(fā)酵液。各取0.75 mL菌液與等體積30%(體積分數(shù))甘油于EP管內(nèi)混合,-20℃保藏。
移取20.0 mL發(fā)酵液,12000 r/min離心,收集菌體并用生理鹽水洗滌2次。細胞分散于10.0 mL、pH 7.0磷酸緩沖液(50.0 mmol/L)中,加入0.10 g(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯,充分混合后置于30℃水浴搖床,反應24 h。轉(zhuǎn)化液12000 r/min離心5 min,上清液采用0.45 μm微濾膜過濾,濾液采用2,4-二硝基苯肼法[9]、HPLC分析,計算各株菌的羰基還原酶活性。
1.2.2 菌體生理生化及分子鑒定
利用Vetik 2 Compact自動微生物鑒定系統(tǒng),考察菌株對46種鑒定試驗的鑒定結(jié)果。將菌株接種到酵母平板培養(yǎng)基,30℃恒溫培養(yǎng)2 d,用無菌棉簽拭轉(zhuǎn)移形態(tài)相似菌落至無菌水中,利用濁度計調(diào)節(jié)菌懸液濁度至1.8~2.2麥氏單位。移取菌懸液至鑒定卡,培養(yǎng)18 h后置于 Vetik 2自動微生物鑒定系統(tǒng)分析。
分子鑒定首先提取ZJB-09225的基因組DNA。利用引物pITS1:5'-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3'和 pITS4:5'- TCCTCCGCTTATTGATATGC -3',在PCR儀PTC-200(Bio-Rad,USA)進行擴增,條件如下:95℃ 4 min;94℃ 50 s,55℃ 1 min,72℃ 1.5 min,35個循環(huán);72℃ 10 min。擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測,并用AxyPrep DNA凝膠回收試劑盒從瓊脂糖凝膠中回收DNA。根據(jù)T/A克隆步驟(Takara,日本),將得到的目的基因與pMD18-T載體連接[10]。獲得的重組質(zhì)粒導入感受態(tài)E.coli JM109[11],然后接種在含有50 μg/mL氨芐青霉素的LB平板上培養(yǎng),陽性克隆標記為E.coli JM109/pMD18-T-ZJB-09225。E.coli JM109/pMD18-T-ZJB-09225接種在含有50 μg/mL氨芐青霉素的LB培養(yǎng)基,37℃過夜培養(yǎng),收集菌體,采用AxyPrep質(zhì)粒DNA試劑盒提取質(zhì)粒,測序,并與GenBank中的基因序列進行對比。18S rDNA全序列用 CLUSTAL W ver.1.81 A 軟件包排序,使用MEGA version 2.1軟件計算進化距離,利用Neighour-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.2.3 轉(zhuǎn)化條件
取1.0 g P.caribbic ZJB-09225細胞分散于10.0 mL含20.0 g/L葡萄糖酸鈉的磷酸緩沖液(pH 7.0,50 mmol/L)中,加入(R)-6-氰基 -5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯(終質(zhì)量濃度14.0 g/L)。混勻后于30℃反應3 h。轉(zhuǎn)化液12000 r/min離心10 min,上清液經(jīng)0.45 μm微濾膜過濾。取澄清濾液測定生成的6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯濃度和殘余(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯濃度。
1.2.4 高底物濃度下的轉(zhuǎn)化條件
取10.0 g P.caribbic ZJB-09225細胞分散于100.0 mL含20.0 g/L葡萄糖酸鈉的磷酸緩沖液(pH7.5,50 mmol/L)中,加入50 g/L(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯?;靹蚝笥诖帕嚢桢亙?nèi)反應12 h,溫度35℃,轉(zhuǎn)速300 r/min。每小時取樣 0.8 mL,加入 100.0 μL 1.0 mol/L HCl終止反應,然后再加入100 μL 1.0 mol/L NaOH溶液中和,12000 r/min離心10 min。上清液經(jīng)0.45 μm微濾膜過濾,濾液采用HPLC檢測生成的6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯濃度和殘余的(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯濃度。
1.2.5 2,4 - 二硝基苯肼顯色法
根據(jù)2,4-二硝基苯肼顯色法工作原理[9],繪制(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯工作曲線。取 20.0 μL轉(zhuǎn)化后的澄清濾液,與100.0 μL 2,4-二硝基苯肼溶液充分混合并靜置1 h,加入5.0 mL 0.8 mol/L NaOH,混勻后靜置 15 min。采用酶標儀測定樣品在450 nm下的吸光值,計算出樣品中殘余(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯的濃度。
1.2.6 液相分析方法
6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯及其非對映異構(gòu)體用LC-20AD型高效液相色譜儀(島津)檢測。色譜條件:液相色譜柱選擇大連依利特Hypersil ODS2 C18 柱 (4.6 mm ×250 mm,2.5 μm),流動相為 V(乙腈)∶V(水)=1∶3,流速1.0 mL/min,柱溫40 ℃。
產(chǎn)物6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯d.e.值按式(1)計算。
式中:A(3R,5R)表示產(chǎn)物6- 氰基 -(3R,5R)- 二羥基己酸叔丁酯的峰面積,A(3S,5R)為6-氰基-(3S,5R)-二羥基己酸叔丁酯的峰面積。
得率Y按式(2)計算。
式中:c0表示(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯的起始濃度,mol/L;V0為起始時反應體系體積,L;cP為反應生成 產(chǎn)物6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯的濃度,mol/L;V為反應后反應體系體積,L。
采用顯色法進行R-羰基還原酶菌株篩選,結(jié)果如圖2所示。由圖2可知:篩選獲得的多株菌株中,菌株ZJB-09225作用于(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯的羰基還原酶活力最好,24 h轉(zhuǎn)化后殘余(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯較少。通過HPLC分析檢測,ZJB-09225菌株還原生成的6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯的量最高且立體選擇性較好,產(chǎn)物構(gòu)型符合反Prelog法則。
圖2 顯色法篩選非對映選擇性還原(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯活性菌株示意Fig.2 Screening strains with diastereoselective ketoreductase activity towards t-butyl 6-cyano-(5R)-hydroxyl-3-oxohexanoate using colorimetric reaction
菌株ZJB-09225細胞呈卵圓狀,細胞大小1.5 μm×2.5 μm。在豆芽汁平板上培養(yǎng)2 d,形成圓形、乳白色、不透明、中間凸起、表面光滑的菌落,直徑約3 mm(圖3)。
圖3 菌落ZJB-09225在豆芽汁平板上的菌落形態(tài)Fig.3 Morphological characteristics of strain ZJB-09225
ZJB-09225生理生化鑒定結(jié)果示于表1。菌株ZJB-09225對其中的33種鑒定指標顯示陽性反應,對其他13種鑒定指標顯示陰性反應(表1)?;赩etik 2 Compact自動鑒定系統(tǒng)分析結(jié)果,菌株ZJB-09225與Pichia caribbic A標準菌株相似,相似性指數(shù)為0.980。
表1 利用Vitek 2 Compact微生物自動鑒定系統(tǒng)分析菌種ZJB-09225碳/氮源利用結(jié)果Table 1 Utilization of carbon and nitrogen sources by strain ZJB-09225 detected with Vitek 2 Compact system
提取菌株ZJB-09225的18S rDNA測序。從GenBank中挑選與ZJB-0922518S rDNA序列相似的序列,采用MegAlign軟件(DNAStar公司,美國)繪制進化樹(圖4)。將獲得的序列與GenBank中保存的數(shù)據(jù)進行相似性分析發(fā)現(xiàn),菌株ZJB-09225與Pichia caribbic(FN.428931.1)同源性最高 (100%,607 bps,18S rDNA)。因此,本實驗鑒定的微生物屬于Pichia屬的caribbic種。結(jié)合生理生化與18S rDNA分子鑒定,菌株ZJB-09225被鑒定屬于Pichia caribbic,已遞交CCTCC保藏,保藏號CCTCC M 2012411。
圖4 菌株ZJB-09225系統(tǒng)進化發(fā)育樹Fig.4 Phylogenetic dendrogram for strain ZJB-09225 and related strains based on 18S rDNA sequence
將P.caribbic ZJB-09225接種于發(fā)酵培養(yǎng)基,每隔4 h取樣分析發(fā)酵液羰基還原酶活性,結(jié)果見圖5。由圖5可知:培養(yǎng)時間顯著影響 P.caribbic ZJB-09225羰基還原酶體積酶活和生物量,培養(yǎng)32 h后,P.caribbic ZJB-09225發(fā)酵液體積酶活達到峰值,約7.2 U/L,生物量為8.8 g/L。
圖5 P.caribbic ZJB-09225發(fā)酵進程曲線Fig.5 Profiles of biomass density,volumetric activity during P.caribbic ZJB-09225 culture
溫度、pH對P.caribbic ZJB-09225細胞羰基還原酶活性的影響見圖6。由圖6(a)可知,在轉(zhuǎn)化pH7.0、轉(zhuǎn)化溫度 28 ~37 ℃范圍內(nèi),P.caribbic ZJB-09225細胞表現(xiàn)出較好的差向選擇性,產(chǎn)物d.e.值在95%左右;35℃時P.caribbic ZJB-09225細胞羰基還原酶活力達到最高,溫度超過37℃時,細胞活性急劇下降。由圖6(b)可知:在35℃、pH 6.0~8.0范圍內(nèi),P.caribbic ZJB-09225細胞羰基還原酶具有較高的活性和立體選擇性,在pH 7.5磷酸緩沖液中P.caribbic ZJB-09225細胞羰基還原酶活力最高 (圖6(b))。因此,P.caribbic ZJB-09225細胞的最適作用溫度為35℃,最適作用pH為7.5。
圖6 轉(zhuǎn)化溫度和pH對P.caribbic ZJB-09225細胞羰基還原酶活性的影響Fig.6 Temperature and pH dependence of P.caribbic ZJB-09225 ketoreductase
P.caribbic ZJB-09225立體選擇性還原 50.0 g/L(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯的進程曲線見圖7。由圖7可知:轉(zhuǎn)化3 h,產(chǎn)物6-氰基 -(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯得率為3.4%,產(chǎn)物d.e.值99.5%以上,幾乎檢測不到反式6-氰基-(3,5)-二羥基己酸叔丁酯形成。轉(zhuǎn)化12 h后,產(chǎn)物6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯得率達19.4%,產(chǎn)物d.e.值94.3%,提高(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯轉(zhuǎn)化率導致6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯d.e.值降低。
圖7 P.caribbic ZJB-09225還原生成6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯的反應進程曲線Fig.7 Time course of 6-cyano-(3R,5R)-dihydroxylhexanoate formation catalyzed by P.caribbic ZJB-09225
從土壤中篩選得到具有不對稱還原6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯的羰基還原酶菌株ZJB-09225。經(jīng)過生理生化和分子遺傳學鑒定,確定該菌株屬于Pichia caribbic。P.caribbic ZJB-09225發(fā)酵32 h后羰基還原酶活性達到最高值,體積酶活約7.2 U/L,P.caribbic ZJB -09225 生物量密度 8.8 g/L。P.caribbic ZJB-09225對(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯的最佳作用條件為35℃、pH 7.5;在轉(zhuǎn)化率3.4%以內(nèi),產(chǎn)物d.e.值99.5%以上。利用P.caribbic ZJB-09225細胞成功建立了光學純6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯的生物催化合成工藝,豐富了他汀藥物關(guān)鍵手性側(cè)鏈的合成技術(shù)。首次報道了P.caribbic不對稱還原(R)-6-氰基-5-羥基-3-羰基己酸叔丁酯制備6-氰基-(3R,5R)-二羥基己酸叔丁酯,后續(xù)P.caribbic ZJB-09225羰基還原酶純化、基因克隆具有重要的研究價值。
[1]Endo A.Competitive inhibition of 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme areductasebyML-236A and ML-236B fungal metabolites,having hypocholesterolemic activity[J].FEBS Lett,1976,72(2):323-326.
[2]Casar Z.Historic overview and recent advances in the synthesis of super-statins[J].Curr Org Chem,2010,14(8):816-845.
[3]Wolberg M,Villela M,Bode S,et al.Chemoenzymatic synthesis of the chiralside-chain ofstatins:application ofan alcohol dehydrogenase catalysed ketone reduction on a large scale[J].Bioproc Biosyst Eng,2008,31(3):183-191.
[4]Ramesh N P.Biocatalytic synsthesis of intermediates for the synthesis of chiral drug substances[J].Curr Opin Biotechnol,2001,12(6):587-604.
[5]Pfruender H,AmidjojoM,HangF,etal.Production of Lactobacillus kefir cells for asymmetric synthesis of a 3,5-dihydroxycarboxylate[J].Appl Microbiol Biot,2005,67(5):619-622.
[6]Goldberg S,Guo Z W,Chen S,et al.Synthesis of ethyl-(3R,5S)-dihydroxy-6-benzyloxyhexanoates via diastereo-and enantioselective microbial reduction:cloning and expression of ketoreductase III from Acinetobacter sp SC 13874[J].Enzyme Microb Tech,2008,43(7):544-549.
[7]Nie Y,Xiao R,Xu Y,et al.Novel anti-Prelog stereospecific carbonyl reductases from Candida parapsilosis for asymmetric reduction of prochiral ketones[J].Org Biomol Chem,2011,9(11):4070-4078.
[8]Ltoh N,MizuguclliN.Production ofchiralalcoholby enantioselectiive reduction with NADH-dependent phenylacetaldehyde reductase[J].J Mol Catal B:Enzymatic,1999,6(2):41-50.
[9]Xue Y P,Wang Y J,Liu Z Q.Isolation of enantioselective αhydroxyacid dehydrogenase based on a high-throughput screening method[J].Bioproc Biosyst Eng,2012,35(9):1515-22.
[10]LiuZ Q,Sun Z H, Leng Y.Directed evolution and characterization of a novel d-pantonohydrolase from Fusarium moniliforme[J].J Agric Food Chem,2006,54(16):5823-5830.
[11]Chung C T,Niemela S L,Miller R H.One-step preparation of competent Escherichia coli:transformation and storage of bacterial cells in the same solution[J].Proc Natl Acad Sci USA,1989,86(7):2172-2175.