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Taq DNA聚合酶的制備和純化

2013-09-04 03:40:14詹慶才詹祎捷劉之熙朱克永
湖南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2013年13期
關(guān)鍵詞:層析柱市售菌體

詹慶才,詹祎捷,劉之熙,朱克永

(1.湖南省水稻研究所,湖南 長(zhǎng)沙 410125;2.北京聯(lián)合大學(xué)應(yīng)用文理學(xué)院,北京 100083)

PCR技術(shù)被廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)、食品科學(xué)、醫(yī)學(xué)等相關(guān)研究領(lǐng)域。作為PCR技術(shù)的主要試劑的Taq DNA聚合酶用量日益增多。而目前大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室主要依賴公司商品化的Taq DNA聚合酶。為了降低研究和開發(fā)成本,一些實(shí)驗(yàn)室利用不同的分離純化方法生產(chǎn)Taq DNA聚合酶[1-4]。湖南省水稻研究所生物技術(shù)室利用含Taq DNA聚合酶基因的p Taq表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)化大腸桿菌E.coli菌株,誘導(dǎo)表達(dá)耐熱Taq DNA聚合酶,然后提取純Taq DNA聚合酶,并用考馬斯亮藍(lán)法和PCR分析其純度、濃度和活性。該技術(shù)旨在制備Taq DNA聚合酶,降低分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)成本。

1 材料與方法

1.1 材 料

含Taq酶基因的載體p Taq由中國科學(xué)院遺傳與發(fā)育研究所提供,氨芐青霉素(Amp)、溶菌酶、苯甲基磺酰氟(PMSF)、異丙基硫代-b-D-半乳糖苷(IPTG)、Taq DNA 聚合酶、DNA Marker等生物化學(xué)試劑購自鼎國生物科技有限公司。

1.2 方法

1.2.1 外源基因在大腸桿菌中的表達(dá) 取出菌種,將少許的冰凍菌種培養(yǎng)物在LB平板(含Amp100 mg/mL)上劃線,37℃培養(yǎng) 16~20 h。挑取單菌落接種到6 mL含100 mg/mL氨芐青霉素的LB培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜;用1.25 mL過夜培養(yǎng)的菌種接種到250 mL的LB液體搖瓶中(Amp終濃度為100 mg/mL),37℃培養(yǎng)4.5 h;在總量1 000 mL的培養(yǎng)液中加入120 mg的IPTG誘導(dǎo)(終濃度為0.5 mmol/L)。培養(yǎng)液在37℃,繼續(xù)培養(yǎng)16~20 h。

1.2.2 重組Taq DNA聚合酶的提取 3 000 g離心20 min收集菌體,每1 000 mL菌液離心后加入60 mL(30 mL×2)溶液 A(50 mmol/L Tris-HCl pH值 8.0;50 mmol/L Dextrose (glucose);1 mmol/L EDTA)中重懸;將收集菌體洗,7 000 g離心10 min重新收集菌體。菌體再懸在40 mL(20 mL×2)溶液A中,混勻。加入終濃度為4 mg/mL的lysozyme(Sigma),室溫(25℃)放置 15 min。加入 40 mL的溶液B(10 mmol/L Tris-HCl pH值 8.0;50 mmol/L KCl;1 mmol/L EDTA (pH 值 8.0);1 mmol/L PMSF;0.5%Tween 20;0.5%NP-40),75℃水浴保溫1 h,期間要晃動(dòng)幾次。4℃,10 000 g離心20 min重新收集上清液。上清液中加入5%PE(I聚乙烯亞胺),使終濃度為0.15%(體積比),加入時(shí)用磁力攪拌器攪拌,慢慢地逐滴加入。室溫下繼續(xù)攪拌10 min。4℃,10 000 g離心15 min重新收集沉淀。用24 mL的含25 mmol/L KCl的溶液C(20 mmol/L Hepes pH 值 7.9;1 mmol/L EDTA(pH 值 8.0);0.5 mmol/L PMSF;0.5%Tween 20;0.5%NP-40)再懸,并洗滌沉淀。4℃,7 000 g離心15 min,收集沉淀。用24 mL含150 mmol/L KCl的溶液C再懸沉淀。4℃,2 500 g離心10 min,收集上清液。測(cè)量收集上清液的體積,使收集的上清液最終KCl的濃度為50 mmol/L(通過加入2倍體積的不含KCl的溶液C)。此時(shí)即完成了上柱前樣品的準(zhǔn)備。

1.2.3 重組Taq DNA聚合酶的純化 稱取7 g Bio-Rex 70的干樹脂,放在小燒杯中,用雙蒸H2O洗,去掉漂浮的小顆粒,室溫溶脹2 h,期間換幾次雙蒸H2O。用含50 mmol/L KCl的溶液C預(yù)平衡,裝層析柱。裝好樹脂后再用6~10倍柱床體積的含50 mmol/L KCl的溶液C平衡柱子。檢查進(jìn)入柱子和流出柱子的溶液C的pH值不變,將樣品裝在平衡好的層析柱上。

層析柱用6倍體積(約60 mL)以上的含50 mmol/L KCl的溶液C再次平衡。樣品用含200 mmol/L KCl的溶液C洗脫。一般準(zhǔn)備50 mL洗脫液,以3 mL體積在試管中分部收集。將含Taq酶較集中的分部收集在一起,放在透析袋中。用500 mL溶液 D(20 mmol/L Hepes pH 值 7.9;100 mmol/L KCl;0.1 mmol/L EDTA;0.5 mmol/L PMSF;1 mmol/L DTT;50%glycerol),4℃透析 20 h 左右,期間換一次透析液。透析后得到約2~3 mL的酶液。從透析袋中取出酶液,立即與20 mL溶液D混合,儲(chǔ)存在-20℃以下,以保持酶的長(zhǎng)期穩(wěn)定性。

1.2.4 重組Taq DNA聚合酶的活性測(cè)定 PCR擴(kuò)增反應(yīng)檢查所純化的Taq DNA聚合酶的活力,以目前實(shí)驗(yàn)室所用的Taq DNA聚合酶商品酶為對(duì)照。PCR反應(yīng)在10μL的反應(yīng)體積中進(jìn)行,包含1 μmol引物,1 μL DNA 樣品(10 ng),0.5單位市售Taq DNA聚合酶或0.1μL自制的Taq DNA聚合酶,1μLlO倍PCR反應(yīng)液(100 mmol/L Tris-HC1,pH 值 8.3;15 mmol/L MgCl2,500 mmol/L KC1,質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.01%的明膠)。所用引物為:正向序列5’-TGCCCTGTTATTTTCTTCTCTC-3’;反向序列:5’-GGTGATCCTTTCCCATTTCA-3’。

擴(kuò)增反應(yīng)條件為:94℃變性4 min,然后是94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 1 min,進(jìn)行 35 個(gè)循環(huán),最后72℃延伸7 min。反應(yīng)采用96孔PCR盤在PE公司9700型基因擴(kuò)增儀上進(jìn)行。擴(kuò)增產(chǎn)物在質(zhì)量濃度為4%的Nusieve 3∶1瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳分離,溴化乙錠染色,紫外光下觀察拍照。

2 結(jié)果與分析

2.1 重組Taq DNA聚合酶分離純化的結(jié)果

用3 mL的離心管分部收集層析分離的Taq DNA聚合酶,在SDS-PAGE上電泳,以購買的Taq DNA聚合酶做對(duì)照。確定哪個(gè)部分含Taq DNA聚合酶和含量的多少,根據(jù)電泳結(jié)果判斷酶的制備是否成功。一般Taq DNA聚合酶在第3、4、5個(gè)分部中被洗脫下來。

2.2 重組Taq DNA聚合酶的活性

利用等量的分離純化的重組Taq DNA聚合酶與市售的Taq DNA聚合酶同時(shí)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。結(jié)果表明,自制重組Taq DNA聚合酶與市售重組DNA聚合酶有相似的活性,都可擴(kuò)增出目的DNA片段,等量自制重組Taq DNA聚合酶和市售產(chǎn)品擴(kuò)增出的DNA量相同(圖1),說明自制產(chǎn)品與市售產(chǎn)品有相似的比活性。

3 討論

重組DNA Taq DNA聚合酶的分離純化有硫酸銨沉淀法[1,5-6]、利用 Ni柱親和色譜法[2]、AKTA 蛋白純化系統(tǒng)[3]及凍溶法[4]等方法。研究利用Taq DNA聚合酶耐熱性強(qiáng)的特點(diǎn),采用溶菌酶、NP40裂解細(xì)菌熱變性沉淀雜蛋白,Bio-Rex 70柱層析透析,克服了溶凍法、硫酸銨沉淀法不能充分除去雜蛋白,AKTA蛋白純化系統(tǒng)雖然能得到高質(zhì)量的產(chǎn)品,但成本較高。通過優(yōu)化分離純化條件,得到了高純度的重組Taq DNA聚合酶,且保持了很高的活性,制備的Taq DNA聚合酶完全能滿足分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的要求。

[1]肖朝文,杜 娟,李晚忱,等.Taq DNA聚合酶制備技術(shù)的優(yōu)化[J].四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2004,(22):318-321.

[2]丁燕華,劉樹濤,齊慶遠(yuǎn),等.Taq DNA聚合酶熱純化制備[J].安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2011,(39):10153-10155.

[3]劉欽松,劉孟剛,張叢叢,等.重組Taq DNA聚合酶的表達(dá)和純化鑒定[J].江西農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2012,(5):124-126.

[4]何 鋼,王義強(qiáng),李 樊,等.大腸桿菌表達(dá)重組Taq DNA聚合酶的分離和純化[J].中南林學(xué)院學(xué)報(bào),2006,(5):50-54.

[5]王云天,秦 川,楊 瑞,等.基因重組Taq DNA聚合酶的制備[J].新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào),2007,(24):551-553.

[6]劉天磊,薛守斌,王 芳,等.大腸桿菌表達(dá)的Taq DNA聚合酶的純化[J].遺傳,2012,34(3):371-378.

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