国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

雜合抗菌肽MgJ 基因真核表達載體的構(gòu)建

2013-04-23 11:53:30
中國釀造 2013年8期
關鍵詞:凝膠電泳瓊脂糖雜合

尹 佳

(吉林化工學院環(huán)境與生物工程學院,吉林 吉林 132022)

抗菌肽(antimicrobial peptides)是具有抗菌活性的一類肽的總稱。通常由13~50個氨基酸組成,為陽離子型多肽[1]。兩性α-螺旋結(jié)構(gòu)和兩性β-折疊結(jié)構(gòu)是抗菌肽最顯著的結(jié)構(gòu)特征??咕膶毦哂泻軓姷臍饔茫灰嗽谠讼到y(tǒng)中直接表達,一般采用融合表達或在酵母中表達[2-3]。

本研究通過對抗菌肽Magainin-Ⅱ和JaponicinⅡ兩個基因(簡稱M和J)的一級結(jié)構(gòu)和二級結(jié)構(gòu)的分析,用一段編碼ser-ser-gly-ser-gly-ser的柔性連接肽序列將M基因和J基因相連,以利于M和J基因各自的空間折疊。選用巴斯德畢赤酵母(Pichia pastoris)偏愛的密碼子,通過重疊區(qū)基因擴增法(SOE法)[4]人工合成MgJ基因,然后將其連接至在巴斯德畢赤酵母中高效表達的表達載體pPICZα A上。其設計目的是獲得比MagaininⅡ和JaponicinⅡ生物活性更高的抗菌肽,為雜合抗菌肽MgJ的高效分泌表達奠定了基礎。

1 材料與方法

1.1 材料

大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α、質(zhì)粒pPICZα A 均由本實驗室保存,內(nèi)切酶、dNTP、T4連接酶、DNA marker、PCR 擴增試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒購自TaKaRa寶生物工程有限公司。引物由聯(lián)星生物合成,其他試劑均為國產(chǎn)分析純試劑。

1.2 方法

1.2.1 基因的合成

引物設計:根據(jù)GenBank中的基因序列,在M基因和J基因中間用鉸鏈ser-ser-gly-se r-gly-ser連接,按照畢赤酵母偏愛密碼子表[5]設計合成8個引物,其中Up1含有EcoRⅠ酶切位點,Down2含有XbaⅠ酶切位點。各引物序列見表1。

表1 合成MgJ基因的引物序列Table 1 MgJ primers sequencs

各引物與模板之間的互補關系見圖1。

圖1 各引物與模板之間的互補關系示意圖Fig.1 Complementation of primers

MgJ基因的合成:M1+M2(J1+J2):94℃、5min;94℃、30s,60℃、30s,72℃、30s,每一個循環(huán)增加0.2℃,共35個循環(huán);72℃、10min。經(jīng)電泳檢測后割膠回收DNA片段,并命名為M基因。相同條件下J1和J2合成J基因。

Up1-M-Down1(Up2-J-Down2):94℃預變性5min;94℃變性30s、56℃退火30 s、72℃延伸30s;每一個循環(huán)增加0.1℃,共30個循環(huán);72℃延伸10min。

全長片段:Up1-M-Down1、Up2-J-Down2互為引物,94℃預變性5min;94℃變性30s、56℃退 火30s、72℃延伸30s;每一個循環(huán)增加0.1℃,共30個循環(huán);72℃延伸10min。

以上各PCR體系均為100mL。

1.2.2 目的基因的鑒定目的基因經(jīng)PCR擴增后,取5μLPCR產(chǎn)物與DNA marker 2.0%瓊脂糖凝膠電泳。

1.2.3 表達載體的構(gòu)建目的基因表達載體的構(gòu)建策略見圖2。

圖2 重組質(zhì)粒pPICZαA-MgJ構(gòu)建策略Fig.2 Construction of recombinant pPICZα A-MgJ

1.2.4 酶切和連接

目的基因全片段和pPICZα A均用EcoRⅠ和XbaⅠ雙酶切,膠回收后,16℃連接過夜。

1.2.5 感受態(tài)細胞DH5α的制備和轉(zhuǎn)化

按常規(guī)方法操作[6-8]。

1.2.6 陽性克隆的篩選

Zeocin篩選法[9]。

1.2.7 重組質(zhì)粒的鑒定及DNA序列分析

挑取重組菌培養(yǎng),提取質(zhì)粒[10],用EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切初步鑒定重組子。DNA序列分析由上海生工生物工程公司完成。

2 結(jié)果與分析

2.1 MgJ基因的合成

各引物片斷拼接采用重疊PCR擴增出完整的基因。PCR產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測,大小與預計的163bp相符。結(jié)果見圖3、圖4。

圖3 目的基因的2%瓊脂糖凝膠電泳Fig.3 Agarose gel electrophoresis of genes

圖4 MgJ的2%瓊脂糖凝膠電泳Fig.4 Agarose gel electrophoresis ofMgJ

2.2 陽性克隆的篩選結(jié)果

目的基因PCR擴增產(chǎn)物回收后與pPICZα A載體連接轉(zhuǎn)化至EcoDH5α中,由于EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切線性化的pPICZα A不可能自身環(huán)化[11-12],因此Zeocin 抗性菌落應含有所需要的重組質(zhì)粒pPICZα A-MgJ。

2.3 重組質(zhì)粒的鑒定及測序

將獲得的重組質(zhì)粒pPICZα A-MgJ用EcoRⅠ和XbaⅠ雙酶切,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測,在相應位置出現(xiàn)條帶,表明pPICZα A-MgJ構(gòu)建成功,結(jié)果見圖5。測序表明,基因序列與預期相符。

圖5 pPICZα A-MgJ雙酶切的瓊脂糖凝膠電泳Fig.5 Agarose gel electrophoresis of pPICZα A-MgJ digestion

3 結(jié)論

抗菌肽必須具備兩親結(jié)構(gòu)和正電荷,較多的正電荷與穩(wěn)定的兩性α-螺旋結(jié)合,有助于提高殺菌活性。因此,可利用這一原則來設計新型的雜合抗菌肽[13]。本研究在MagaininⅡ和JaponicinⅡ之間用一段ser-ser-gly-ser-gly-ser的柔性連接肽序列將2個基因相連,以利于增強兩段序列的連接,而且還可防止連接的過程中兩條序列單獨表達互補配對形成二聚體。為了獲得抗菌肽MgJ的全長基因片段,本研究采用了重疊區(qū)擴增基因拼接法,用互有一段互補序列的8個引物,通過PCR擴增得到了具有EcoRⅠ/XbaⅠ雙酶切位點的全長基因。

本研究以pPICZα A作為表達載體。因為pPICZα A即可以在原核細胞中表達,也可在真核細胞中表達,同時其表達盒的N端帶有引導分泌的α交配因子(α-MF)信號序列,表達產(chǎn)物可以分泌到細胞外的培養(yǎng)基中[14-15]。由于酵母本身分泌到培養(yǎng)基中的蛋白很少,因此表達上清中的雜質(zhì)蛋白含量很低,為進一步純化表達蛋白提供了極大的方便。

研究結(jié)果表明,成功地構(gòu)建了抗菌肽MgJ基因穿梭表達載體pPICZα A-MgJ,為雜合抗菌肽MgJ的高效分泌表達奠定了基礎。

[1]劉立偉,鄧 磊.抗菌肽作用機制的研究進展[J].河北化工,2012,35(7):13-15.

[2]RAMANATHAN B,DAVIS EG,ROSS CR,et al.Cathelicidins:microbicidal activity,mechanisms of action,and roles in innate immunity[J].Microbes Infect,2002,4(3):361-372.

[3]胡功鈴,陳國平,胡宗利,等.雜合抗菌肽HMCM 的原核表達及其活性鑒定[J].藥物生物技術(shù),2012,19(1):6-10.

[4]韓晉輝,施用暉,呂文平,等.多重PCR 合成天蠶素基因及其在E.Coli中的克隆[J].食品與生物技術(shù)學報,2006,25(4):109-112.

[5]趙 翔,霍克克,李育陽.畢赤酵母的密碼子用法分析[J].生物工程學報,2000,16(3):308-31.

[6]明雙喜,劉 艷,王沂蒙,等.抗菌肽PMAP37 基因RT-PCR 擴增、序列分析及重組原核表達載體構(gòu)建[J].中國釀造,2008,26(12):33-35.

[7]喬紅偉,韓俊友,趙瑞利,等.中國林蛙抗菌肽基因在畢赤酵母中的表達及其活性檢測[J].中國獸醫(yī)學報,2008,28(6):663-666.

[8]李桂平,陳儀本.一種新融合抗菌肽Hex-Mag 基因的克隆、表達及其抗菌活性的研究[J].微生物學報,2007,41(1):115-120.

[9]趙巖巖,崔敬愛,李 帥,等.抗菌肽Cryptonin 基因真核表達載體的構(gòu)建[J].農(nóng)業(yè)機械.2012,21(7):145-148.

[10]張素芳,曹瑞兵,賈 赟,等.雜合抗菌肽CecA_mil 的改造及在畢赤酵母中的分泌表達[J].微生物學報,2005,45(2):215-219.

[11]GHOSALKAR A,SAHAI V,SRIVASTAVA A.Optimization of chemically defined medium for recombinanantPichia pastorisfor biomass production[J].Bioresource Technol,2008,99(16):7906-7910.

[12]RAJESH T,ANTHONY T,SARANYA S,et al.Functional characterization of a new holin-like antibacterial protein coding genetmp1from goat skin surface metagenome[J].Appl Microbiol Biot,2011,89(4):1061-1073.

[13]周磊磊.促血管生成素-2 在畢赤酵母中的分泌表達及功能研究[D].北京:中國人民解放軍軍事醫(yī)學科學院碩士論文,2008.

[14]蘇 琦,孫 燕,李 治.抗菌肽對細菌胞內(nèi)殺傷作用的分子機制[J].中國生物制品學雜志,2010,23(3):325-329.

[15]齊長學.牛乳溶菌酶在畢赤酵母中的分泌表達及活性分析[D].大慶:黑龍江八一農(nóng)墾大學碩士論文,2010.

猜你喜歡
凝膠電泳瓊脂糖雜合
“PCR擴增DNA片段及凝膠電泳鑒定”實驗改進與優(yōu)化
中學生物學(2024年4期)2024-01-01 00:00:00
基于膠原-瓊脂糖的組織工程表皮替代物構(gòu)建研究
甘藍型油菜隱性上位互作核不育系統(tǒng)不育系材料選育中常見的育性分離及基因型判斷
種子(2021年3期)2021-04-12 01:42:22
水乳化法制備羅丹明B接枝瓊脂糖熒光微球?
水乳化法制備羅丹明B接枝瓊脂糖熒光微球?
瓊脂糖以及高分辨率瓊脂糖制備方法研究進展*
廣州化工(2016年11期)2016-09-02 00:42:59
從翻譯到文化雜合——“譯創(chuàng)”理論的虛涵數(shù)意
擠壓添加耐高溫α—淀粉酶高粱輔料麥汁的蛋白質(zhì)組分分析
4種核酸染料在實驗教學中的應用研究
雄激素可調(diào)節(jié)的腎臟近端腎小管上皮細胞靶向雜合啟動子的優(yōu)化
彰化市| 禹州市| 金秀| 花莲县| 镇平县| 苏尼特右旗| 龙江县| 比如县| 五常市| 阿克苏市| 桦川县| 易门县| 兴安盟| 哈尔滨市| 白水县| 庆阳市| 合作市| 五家渠市| 微博| 五台县| 甘泉县| 岳阳市| 建瓯市| 台州市| 南陵县| 肥乡县| 泸西县| 东安县| 双鸭山市| 邮箱| 天等县| 桦甸市| 屏山县| 杭锦后旗| 咸阳市| 建湖县| 喜德县| 大荔县| 凯里市| 宜州市| 南江县|