周紅霞,華 春,張紅琳,李俊芳,祝長青,黃 明,周光宏,*
(1.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)國家肉品質(zhì)量安全控制工程技術(shù)研究中心,江蘇南京210095; 2.南京曉莊學(xué)院生物化工與環(huán)境工程學(xué)院,江蘇南京211171; 3.江蘇出入境檢驗檢疫局,江蘇南京 210001)
PCR法定性檢測大豆食用油中轉(zhuǎn)基因成分
周紅霞1,2,華 春2,張紅琳2,李俊芳2,祝長青3,黃 明1,周光宏1,*
(1.南京農(nóng)業(yè)大學(xué)國家肉品質(zhì)量安全控制工程技術(shù)研究中心,江蘇南京210095; 2.南京曉莊學(xué)院生物化工與環(huán)境工程學(xué)院,江蘇南京211171; 3.江蘇出入境檢驗檢疫局,江蘇南京 210001)
針對大豆食用油中核酸含量低且被嚴(yán)重破壞、DNA難以提取的問題,對CTAB法進(jìn)行優(yōu)化,有效從食用油中提取到可用于PCR擴(kuò)增反應(yīng)的DNA模板。同時定性檢測出大豆內(nèi)源基因lectin,外源調(diào)控序列啟動子CaMV35S、終止子Nos及目的基因CP4-EPSPS序列,成功建立了基于PCR技術(shù)在大豆食用油中快速檢測轉(zhuǎn)基因成分的方法。
大豆食用油,轉(zhuǎn)基因檢測,DNA提取,PCR
由于轉(zhuǎn)基因生物(GMO)具有抗逆性,產(chǎn)量高,生產(chǎn)成本相對較低,具有較好的市場競爭性和應(yīng)用前景,故隨著轉(zhuǎn)基因技術(shù)的飛速發(fā)展,加速了轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品的市場化、商品化,使其具有較好的市場競爭性及應(yīng)用前景[1]。但轉(zhuǎn)基因生物的廣泛應(yīng)用是否會對生態(tài)環(huán)境和人類生物的健康造成不良影響,至今仍無定論[1]。據(jù)此,歐盟、日本等國家先后制定了轉(zhuǎn)基因食品標(biāo)識管理政策,以保護(hù)消費(fèi)者的知情權(quán)和選擇權(quán)。我國也要求從2002年3月20日起標(biāo)識市售轉(zhuǎn)基因大豆、玉米、油菜、番茄、棉花及其加工產(chǎn)品[2]。PCR的技術(shù)手段由于其高效性而成為轉(zhuǎn)基因食品的最常用檢測方法[3-7]。國際通用方法是以PCR技術(shù)為平臺,通過特異擴(kuò)增轉(zhuǎn)基因調(diào)控原件花椰菜花葉病毒(CaMV35S)啟動子、胭脂堿合酶(NOS)終止子以及目的基因抗除草劑基因CP4-EPSPS來篩選檢測轉(zhuǎn)基因食品[3-7]。食用油作為一種精深加工食品,經(jīng)過240℃高溫和高壓等加工步驟之后,核酸嚴(yán)重破壞,且含量低,提取困難,成為限制檢測其中轉(zhuǎn)基因成分的瓶頸[8-19]。另外食用油的主要成分是脂類物質(zhì),水溶性的DNA含量相當(dāng)少,因此精煉油中DNA的提取重點是如何有效富集其中的微量DNA。國內(nèi)外有食用大豆油轉(zhuǎn)基因檢測的報道,但多采用試劑盒的方法[8-18],欒鳳俠[12]比較了CTAB法和W izard試劑盒法提取精煉大豆油DNA的效果,結(jié)果表明試劑盒法提取效果優(yōu)于CTAB法。程紅梅[15]采用了離心柱法從10m L大豆油中提取到0.4μg的DNA,白立群[17]采用冷凍干燥法從20m L食用油中提取到可用于檢測的DNA。Paul[20]和Zhang[21],分別采用W izard試劑盒法及W izard Magnetic DNA Purification System for Food Kit(Promega)試劑盒提取大豆油中DNA,均認(rèn)為大豆精煉油中不能提取出DNA,因此如何高效提取精煉油中的DNA始終是轉(zhuǎn)基因檢測的瓶頸難點。盡管油脂中轉(zhuǎn)基因成分的檢測已有相關(guān)國家標(biāo)準(zhǔn)出臺,但作者通過多次實驗發(fā)現(xiàn),標(biāo)準(zhǔn)中介紹的方法并不能完全有效地提取油脂中DNA。我們參照前人介紹的方法[11-18],對其中的某些步驟進(jìn)行了改進(jìn),結(jié)果發(fā)現(xiàn),改進(jìn)的方法較之于標(biāo)準(zhǔn)方法,其DNA提取的有效性大大提高,所提取的DNA完全能夠用于后續(xù)的PCR檢測,并通過PCR擴(kuò)增CaMV35S啟動子、NOS終止子以及抗除草劑基因CP4-EPSPS來定性檢測轉(zhuǎn)基因食用油,為大豆深加工食品的轉(zhuǎn)基因檢測提供切實可行的基礎(chǔ)。
表1 檢測不同基因所用引物及產(chǎn)物大小Table 1 List of different specific primer and the size of their product
表2 PCR反應(yīng)條件Table 2 PCR reaction conditions
1.1 材料與儀器
福臨門一級大豆食用油、豆維家大豆食用油、金龍魚大豆食用油 均從超市購得;轉(zhuǎn)基因大豆、非轉(zhuǎn)基因大豆 江蘇出入境檢驗檢疫局惠贈;CTAB、Tris、SDS、Taq酶、核酸共沉淀劑(DNAmate)、引物上海生工。
凝膠成像儀GelDoc 2000 system 美國BioRad公 司;Mastercyclerep personal PCR 儀 德 國Enpendorf公司;水平電泳儀 北京百晶生物技術(shù)有限公司;Ultraturrax T25高速勻漿器 德國 IKAWERKE公司。
1.2 引物
大豆食用油中Lectin內(nèi)源基因、CaMV35S啟動子基因、NOS終止子基因、CP4-EPSPS外源基因的引物序列見表1[19]。
1.3 實驗方法
1.3.1 大豆食用油中DNA的提取 參照前人方法[11-18],取1m L食用油到2m L離心管中,加入400μL的TE緩沖液,顛倒搖勻5m in,常溫13000 r/min離心3min,去除上層油脂層,在同一只離心管中再加入1m L的食用油,顛倒搖勻5m in,常溫13000 r/m in離心3m in,去除上層油脂層,以上步驟重復(fù)15~20次。取水相轉(zhuǎn)移至新的 2m L離心管中,在水相中加400μL的CTAB提取液和2μL的RNA酶,渦旋震蕩1~3s,65℃水浴30m in后加入等體積的三氯甲烷/異戊醇(24∶1),輕緩顛倒數(shù)次后靜置 5m in,常溫13000 r/min離心3m in,轉(zhuǎn)移上清液置于另一個2m L的離心管中。加入上清液 1/10體積的3mmol/L NaAc(pH 5.2)溶液,均勻混合,再加入4μL的DNA共沉淀劑溶液,均勻混合。轉(zhuǎn)移離心管中一半的溶液于另一個新的2m L離心管中,分別加入2.5倍體積的-20℃預(yù)冷的無水乙醇,充分混勻,12000 r/m in 4℃條件下離心20min,棄溶液,留白色沉淀。加入-20℃預(yù)冷的70%乙醇1m L,洗滌沉淀兩次。12000 r/m in 4℃條件下離心5m in后小心棄去乙醇,自然干燥。每個離心管中加30μL 0.1×TE緩沖液溶解沉淀,4℃保存?zhèn)溆谩R匀ルx子水作空白對照。
1.3.2 PCR檢測大豆食用油DNA的轉(zhuǎn)基因成分
1.3.2.1 PCR反應(yīng)體系及反應(yīng)條件 反應(yīng)體系:10× PCR Buffer 2.5μL,25mmol/L MgCl22.5μL,dNTP 2.5mmol/L 2.0μL,20pmol/μL引物(正:0.25μL,反: 0.25μL),5U/μL Taq酶0.125μL,DNA模板通常取量為2~5.0μL,所補(bǔ)超純水量隨DNA模板量而變化,最終補(bǔ)足25μL。PCR反應(yīng)條件見表2,同時設(shè)陽性對照、陰性對照、空白對照。
1.3.3 瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物 取5μL PCR產(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠中電泳,緩沖液為用1×TAE電泳緩沖液,在5V/cm電壓中電泳20m in,凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果。
2.1 DNA的提取
將提取的DNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果沒有條帶出現(xiàn)(結(jié)果未顯示),分析原因是由于食用油脂中DNA含量非常低,以致常規(guī)的凝膠電泳無法顯示。因為提取過程加入核酸共沉淀劑,因此提取后的目標(biāo)DNA含量及純度無法用紫外分光光度法確定,紫外所獲取的OD值,都可能是核酸共沉淀劑和目標(biāo)DNA的混合信息。
2.2 大豆內(nèi)源基因Lectin的檢測
Lectin基因是大豆所特有的內(nèi)源性基因,任何以大豆為原料制備的產(chǎn)品均應(yīng)含有該基因。檢測內(nèi)源基因可以判斷從食用油中是否成功提取到DNA,以及所提取的DNA是否適合于PCR擴(kuò)增,同時還可以判斷所提取的DNA是否含有PCR擴(kuò)增抑制物,從而避免結(jié)果出現(xiàn)假陰性。按表2的PCR條件首先檢測了Lectin基因,以水代替DNA模板為空白對照,以非轉(zhuǎn)基因大豆為陰性對照,以轉(zhuǎn)基因大豆為陽性對照,以提取過程中添加的DNA共沉淀劑代替DNA模板作為對照,排除其引物模板的可能性。圖1顯示了大豆內(nèi)源基因Lectin的檢測結(jié)果,三種油、轉(zhuǎn)基因大豆、非轉(zhuǎn)基因大豆均能擴(kuò)增出約118bp左右的片段,說明所提取的DNA質(zhì)量較好,可用作PCR檢測模板。DNA共沉淀劑在PCR檢測中無新條帶出現(xiàn),說明其增加了提取效率但并沒有引入外源基因,可以作為安全的DNA共沉淀劑。第六泳道陽性對照擴(kuò)增的條帶亮度低于三種大豆食用油的主要原因為陽性對照DNA和食用油中DNA提取時間不一致,陽性對照大量提取一次,存放備用,可能存放的時間比較久。
圖1 PCR檢測大豆油內(nèi)源基因LectinFig.1 PCR amplification results of endogenous Lectin in DNA sample of soybean oil
2.3 大豆食用油中外源基因的檢測
外源基因的檢測通常包括兩方面:一是調(diào)控基因的檢測,另一個是目的基因的檢測。首先我們對調(diào)控基因CaMV35S啟動子和NOS終止子按表2的PCR條件進(jìn)行擴(kuò)增檢測,結(jié)果見圖2和圖3。由此可以看出轉(zhuǎn)基因大豆和三個品種的大豆食用油均能擴(kuò)增出約195bp的CaMV35S啟動子(圖2)和約180bp的NOS終止子片段(圖3)。
圖2 大豆食用油CaMV35S啟動子的PCR檢測Fig.2 PCR amplification results of CaMV35S promoter in DNA sample of soybean oil
圖3 大豆食用油NOS終止子的PCR檢測Fig.3 PCR amplification results of NOS terminator in DNA sample of soybean oil
由于CaMV35S啟動子來源于花椰菜花葉病毒,NOS終止子來源于根癌農(nóng)桿菌,因此若原料大豆被花椰菜花葉病毒或被根癌農(nóng)桿菌侵染,就會有假陽性出現(xiàn)。因此除了檢測調(diào)控基因還要檢測目的基因CP4-EPSPS才能下最終結(jié)論。
利用改進(jìn)方法提取的三個品種大豆食用油中的DNA,用CP4-EPSPS引物按表2的PCR條件進(jìn)行擴(kuò)增,以水代替DNA模板為空白對照,以非轉(zhuǎn)基因大豆為陰性對照,以轉(zhuǎn)基因大豆為陽性對照,結(jié)果見圖4。由圖4可以看出,所提取的DNA可以成功檢測到目的基因CP4-EPSPS320bp片段,且擴(kuò)增出的片段與轉(zhuǎn)基因大豆一致,而非轉(zhuǎn)基因大豆和水空白對照均未檢測出該片段。據(jù)國內(nèi)檢測機(jī)構(gòu)反映,通常在精煉食用油中能檢測到35S啟動子和NOS終止子,但是檢測不到CP4-EPSPS目的基因,因此,本研究所建立的大豆食用油DNA提取方法簡單方便,可用于大豆深加工DNA提取的檢測。
精煉油中DNA提取的重點是如何有效地富集大豆油中微量DNA,本文在前人基礎(chǔ)上分別對DNA提取和PCR檢測作了如下改進(jìn),取得了滿意的檢測效果。
a.提取樣品的初始量是能否成功提取DNA的關(guān)鍵因素。文獻(xiàn)[9-11]中報道的1~5m L的樣品量難以提取到可供PCR檢測的DNA量,當(dāng)樣品量增加到20m L時,可成功檢測到(見圖1~圖3)。
圖4 大豆油目的基因CP4-EPSPS的PCR檢測Fig.4 PCR amplification results of CP4-EPSPS in DNA smample of soybean oil
b.提取開始前利用DNA可溶于水溶液的特性,在食用油脂中加入一定體積的TE溶液進(jìn)行洗滌以萃取其中含量極少的DNA;另外顛倒搖勻時切忌劇烈震蕩,否則會破壞DNA。
c.為了提高食用油中DNA的沉淀效果可加入核酸共沉淀劑,共沉淀劑最好選擇與目標(biāo)DNA相差較遠(yuǎn)的物種,以本研究所用的核酸共沉淀劑作為PCR反應(yīng)的陰性對照,結(jié)果發(fā)現(xiàn)不干擾待測目標(biāo)片段的檢出(見圖1第6泳道)。
d.沉淀DNA的步驟中加入NaAc,NaAc提供弱酸環(huán)境,可促使DNA沉淀。
e.本文研究中發(fā)現(xiàn),為了提高CP4-EPSPS基因檢出成功率,目的片段的穩(wěn)定性比長短更重要。本文曾經(jīng)選擇170bp大小的目的片段,但沒有檢測到(結(jié)果未顯示),最后選擇富含GC堿基對的823-1143序列作為檢測目的片段,PCR最終獲得成功(見圖4),分析可能的原因是,這段序列富含GC,在加工中穩(wěn)定性好,不容易被破壞,所以雖然目的片段變長,但依然可以成功檢測到。這一發(fā)現(xiàn)可應(yīng)用于其他深加工轉(zhuǎn)基因食品的檢測中。
本研究成功建立了基于PCR技術(shù)在大豆食用油中快速檢測轉(zhuǎn)基因成分的方法。該方法所檢測的CaMV35S啟動子、NOS終止子、CP4-EPSPS等基本覆蓋了世界上已商品化的轉(zhuǎn)基因大豆及其深加工產(chǎn)品,因此所建立的檢測體系具有通用性,該方法利用大豆內(nèi)源基因Lectin作為內(nèi)參照,可以直接檢測提取的DNA質(zhì)量,同時設(shè)立了陽性質(zhì)控、陰性質(zhì)控和空白對照,從而避免了假陰性、假陽性以及污染可能造成的假性結(jié)果,保證了檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性、可靠性,基本滿足各國及地區(qū)定性檢測,在篩選過程中若為陰性的樣品,可直接判斷為陰性,若為陽性,可進(jìn)一步做鑒定檢測。
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Detection of genetically modified com ponents in soybean oil by PCR
ZHOU Hong-xia1,2,HUA Chun2,ZHANG Hong-lin2,LI Jun-fang2,ZHU Chang-qing3,HUANG M ing1,ZHOU Guang-h(huán)ong1,*
(1.National Center of Meat Quality and Safety Control,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China; 2.School of Biochemical and Environmental Engineering,Nanjing Xiaozhuang University,Nanjing 211171,China; 3.Nanjing Entry-exit Inspection and Quarantine Bureau,Nanjing 210001,China)
A qualitative m ethod for detecting of transgenic genes in ed ib le oils was reported.It was norm ally considered that ed ib le oils,especially refining oils,w ith low content DNA,RNA and p roteins.A usefulmethod for extrac tion DNA from the ed ib le oilsam p les was estab lished,it could be used as tem p late for PCR.The endogenous genes(Lec tin)and transgenic genes(CaMV35S,Nos,CP4-EPSPS)were detec ted in the ed ib le oil sam p les by the PCRmehtod.
soybean oils;detection GMO;DNA extrac tion;PCR
TS207.3
A
1002-0306(2012)06-0087-05
2011-04-26 *通訊聯(lián)系人
周紅霞(1976-),女,副教授,博士后,研究方向:食品生物技術(shù)。
農(nóng)業(yè)部《轉(zhuǎn)基因重大專項》(2009ZX08012-014B);江蘇省教育廳高校自然科學(xué)與研究項目(10KJD550005)。