韓若喬, 高 艾, (首都醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生與家庭醫(yī)學(xué)學(xué)院, 北京 00069;北京市臨床流行病學(xué)重點(diǎn)實驗室;通訊作者,E-mail:gaoai48@ccmu.edu.cn.)
microRNA(miRNA),是一種21-25 nt長的單鏈小分子非編碼RNA[1]。它廣泛存在于真核生物中,可通過堿基配對的方式結(jié)合到靶mRNA的3'非翻譯區(qū)(3'UTR),從而降解靶mRNA或抑制其翻譯,但不影響其轉(zhuǎn)錄[2]。miRNA的主要功能是調(diào)節(jié)與個體生長、發(fā)育、疾病發(fā)生過程有關(guān)的基因的表達(dá),參與生命過程中一系列的重要進(jìn)程,包括早期發(fā)育、細(xì)胞增殖、細(xì)胞凋亡、細(xì)胞死亡、脂肪代謝和細(xì)胞分化[3]。越來越多的研究顯示,miRNA在白血病中起著癌基因和抑癌基因的作用。本文對miRNA在人類白血病發(fā)生中作用的研究進(jìn)展進(jìn)行綜述。
1.1 miRNA具有抑癌基因的功能
1.1.1 miR-15和 miR-16 第一個有關(guān) miRNA與癌癥的報道,是Calin等[4]發(fā)現(xiàn)成人慢性淋巴細(xì)胞白血病(chronic lymphocytic leukemia,B-CLL)患者的染色體13q14.3一個30 kb的區(qū)域內(nèi)常伴有兩個miRNA基因miR-15和miR-16的缺失或下調(diào)。之后,Cimmino等[5]又發(fā)現(xiàn),在 B-CLL細(xì)胞中 miR-15a和miR-16a的表達(dá)與Bcl-2蛋白表達(dá)呈負(fù)相關(guān),實驗證明它們直接與bcl-2 mRNA的3'端UTR序列相互作用調(diào)控Bcl-2蛋白的表達(dá)。Bcl-2蛋白是一種通過作用于線粒體來抑制細(xì)胞凋亡的蛋白,能夠使腫瘤細(xì)胞逃避細(xì)胞凋亡。因此推測,miR-15a和miR-16a對bcl-2的抑制誘導(dǎo)了白血病細(xì)胞的凋亡,從而發(fā)揮了類似抑癌基因的作用[6]。
1.1.2 miR-29 b和 miR-181 b T細(xì)胞白血病 -1(TCL1)基因也是一個原癌基因,位于染色體14q32.1處,該基因可以作為Akt癌蛋白的輔激活因子增強(qiáng)Akt激酶(也稱蛋白激酶B,PKB)的活性,而Akt癌蛋白則是T細(xì)胞和B細(xì)胞抗凋亡信號傳導(dǎo)中一個重要的分子[7]。TCL1在T細(xì)胞白血病和淋巴瘤中常發(fā)生重排,而且過表達(dá)的TCL1可能參與了CLL的形成[8]。研究表明在CLL中 miR-29b和miR-181b因調(diào)控癌基因TCL1而表現(xiàn)出其抑癌基因的特性[9]。
1.1.3 miR-221 和 miR-222 miR-221、miR-222 的靶基因是原癌基因c-kit。Nadia等[10]指出miR-221和miR-222的致癌機(jī)制可能是與miR-221、miR-222結(jié)合的kit的3'端UTR結(jié)合區(qū)域關(guān)鍵部位出現(xiàn)單核苷酸多態(tài)性(3169 G→A),從而導(dǎo)致kit轉(zhuǎn)錄下降和Kit蛋白水平低下,抑制正常紅細(xì)胞生成及紅白血病細(xì)胞的增殖,引起急性髓細(xì)胞白血病(acute myeloid leukemia,AML)的發(fā)生,起到了抑癌基因的作用[11]。
1.2 miRNA具有癌基因的功能
1.2.1 miR-155 人類BIC基因是已知的癌基因之一,在BIC基因上具有一段138個核苷酸的保守序列,即編碼miR-155的發(fā)夾結(jié)構(gòu)。轉(zhuǎn)錄因子PU.1 mRNA是B細(xì)胞的分化過程中所必需的,其可能是miR-155的靶基因[12],哺乳動物細(xì)胞中發(fā)現(xiàn) PU.1 mRNA的3'端非編碼區(qū)(3'UTR)存在類似miR-155的靶序列。miR-155另一個可能的靶基因是ICOSL[13],ICOSL在 T細(xì)胞活化、增殖中發(fā)揮重要作用,其缺乏可能會影響機(jī)體的免疫反應(yīng)[14]。miR-155水平在兒童Burkitt淋巴瘤、Hodgkin淋巴瘤及彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)等腫瘤中均有提高。miR-155也與Myc在B細(xì)胞中的高表達(dá)有關(guān),Myc是一個通過調(diào)控細(xì)胞增殖和死亡,從而調(diào)控細(xì)胞生長的轉(zhuǎn)錄因子[15]。因此,miR-155可能是作為一個癌基因和Myc協(xié)同作用,而其正常功能是在 B細(xì)胞的分化中起作用[16]。
1.2.2 miR-17-92簇 MiR-17-92簇由 7種miRNA(miR-17 -5p、miR-17 -3p、miR-18a、miR-19a、miR-20a、miR-19b-1和 miR-92-1)組成,位于13q31.3的 Cl3orf25 的內(nèi)含子。He等[17]比較了正常組織和B細(xì)胞淋巴瘤樣本,發(fā)現(xiàn)從miR-17-92位點(diǎn)衍生出來的前體和成熟miRNA在癌細(xì)胞中大量增加,miRNA作為癌基因調(diào)節(jié)腫瘤的形成。在隨后的實驗中發(fā)現(xiàn),miR-17-19b-1具有促進(jìn)細(xì)胞增殖、抑制細(xì)胞凋亡的能力。通過生物信息學(xué)的預(yù)測發(fā)現(xiàn),miR-17-92簇中的miR-17-5p和miR-20a成員,以轉(zhuǎn)錄因子E2F1為靶目標(biāo)。E2F1是通過調(diào)節(jié)與DNA復(fù)制、細(xì)胞分裂和凋亡相關(guān)的基因來調(diào)節(jié)細(xì)胞周期從G1期向S期的轉(zhuǎn)變[18]。Myc可以誘導(dǎo)E2F1和miR-17-92的轉(zhuǎn)錄,而miR-17-5p和miR-20a可以抑制E2F1的翻譯。在Myc存在的情況下,miR-17-92基因簇中的miRNA限制了E2F1的活性,通過阻斷Myc和E2F1的正反饋循環(huán)削弱了Myc對于細(xì)胞增殖的影響。此時,miR-17-92基因簇所起的作用是抑癌基因的作用,這與He等的發(fā)現(xiàn)相反。然而,當(dāng)E2F1的表達(dá)水平超過一閾值,它也可以引起細(xì)胞凋亡,在此情況下,miRNA對于E2F1的負(fù)調(diào)控可能是通過阻斷E2F1的誘導(dǎo)凋亡活性,促進(jìn)Myc介導(dǎo)的細(xì)胞增殖,又支持了He等提出的模型[19]。
1.2.3 miR-106-363簇 在小兒和成人初診急性淋巴細(xì)胞白血病(acute lymphocytic leukemia,ALL)中,大約分別有15%和25%患者是T細(xì)胞ALL(TALL),而T-ALL與患者的預(yù)后不良有關(guān)。Landais等的研究表明,由 miR-106a,miR-18b,miR-20b,miR-19b-2,miR-92-2和miR-363等6個miRNA組成的miR-106-363簇在46%的T細(xì)胞白血病中高表達(dá)并可能起著原癌基因的作用[20]。
1.2.4 miR-142與miR-21 在侵襲性B細(xì)胞白血病(aggressive B-cell leukemia)中,常有t(8;17)號染色體的異位,miR-142基因正好位于這個區(qū)域。異位的結(jié)果是miR-142基因與截短的c-Myc基因形成融合基因,導(dǎo)致c-Myc在miR-142基因啟動子控制下高表達(dá)[21],促使低度惡性的慢性淋巴瘤演變?yōu)楦叨葠盒缘腂細(xì)胞性白血病。MiR-21位于染色體脆性區(qū)域17q23.2,是一個發(fā)現(xiàn)較早且備受關(guān)注的miRNA分子,在多種腫瘤中表達(dá)異常,miR-21可以通過抑制PTEN表達(dá),激活PI3K/AKT信號通路使白血病K562細(xì)胞系產(chǎn)生對道諾霉素的耐受性[22]。道諾霉素是一種用于白血病治療的蒽環(huán)霉素化療制劑。產(chǎn)生耐藥性是腫瘤化療的一大障礙,從分子水平上認(rèn)識耐藥性產(chǎn)生的機(jī)制有助于探索出更好的治療腫瘤的方法。
檢測miRNA最常用和直接的方法是Northern雜交、基因芯片技術(shù)、定量PCR、熒光素報告分析(luciferase reporter assay)和MiRNAs靶基因預(yù)測技術(shù)。Northern印跡是經(jīng)典的探針雜交檢測法,從miRNAs發(fā)現(xiàn)到現(xiàn)在,它一直被用于miRNAs的定性研究,若結(jié)合使用miRNAs標(biāo)記(miRNAs marker)也可用于miRNAs的半定量分析。miRNA基因芯片技術(shù)具有高通量的優(yōu)點(diǎn),是一種理想的快速檢測miRNA表達(dá)圖譜的方法。定量PCR(quantitative PCR,qPCR)是對miRNAs進(jìn)行定量研究的方法,故與前兩種miRNAs檢測方法相比,靈敏度明顯提高。但是因為成熟miRNAs分子很短、且沒有poly(A)尾巴,無法按常規(guī)方法設(shè)計隨機(jī)引物進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄和PCR擴(kuò)增,所以通常先用poly(A)聚合酶直接使miRNAs的3'端加上一段 poly(A)尾巴,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增。熒光素報告分析不同于以上三種方法,它主要用于檢測miRNAs與靶基因相互作用的機(jī)制,一般用于已知 mRNA 3'-UTR確實存在相應(yīng)miRNAs潛在結(jié)合位點(diǎn)的情況?;痉椒ㄊ菍晒馑孛阜謩e連于mRNA 3'-UTR片段和突變3'-UTR片段下游,然后導(dǎo)入相應(yīng)miRNAs,通過檢測熒光信號強(qiáng)弱鑒別miRNAs是否通過與mRNA 3'-UTR結(jié)合來發(fā)揮作用[23]。MiRNAs靶基因預(yù)測可以用于尋找未知的miRNAs結(jié)合位點(diǎn)。因為miRNA與mRNA的相互作用是一個十分復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò),一種miRNA可以作用于多種mRNAs,一種mRNA又同時受多種miRNAs協(xié)同調(diào)控,所以目前已知的miRNA-mRNA模塊不能涵蓋所有可能的結(jié)合情況,而miRNAs靶基因預(yù)測技術(shù)可以通過對可能存在相互作用的miRNAs和mRNAs進(jìn)行微陣列表達(dá)分析,發(fā)現(xiàn)miRNAs新的靶位,從而擴(kuò)充miRNA-mRNA模塊,故有廣泛的應(yīng)用價值[24]。
miRNA在不同腫瘤中具有特定的表達(dá)模式,這為腫瘤基因診斷開拓了一條新思路。通過對人不同癌組織中miRNA表達(dá)譜與正常組織表達(dá)譜的對比分析,發(fā)現(xiàn)各種腫瘤各自特定的miRNA表達(dá)水平均發(fā)生了變化。Calin等[25]采用基因芯片分析慢性B細(xì)胞淋巴瘤與正常B細(xì)胞中miRNA表達(dá)譜的差異,該定量分析技術(shù)可作為慢性B細(xì)胞淋巴瘤有效的新型診斷方法。
腫瘤的發(fā)生可能由兩方面因素引起:一方面,可能由于某些特定的miRNA低表達(dá)或不表達(dá),因此可采用基因治療的方法,導(dǎo)入相應(yīng)的外源miRNA;另一方面,可能由于某些特定的miRNA高表達(dá),因此可采用多種方法下調(diào)或抑制相應(yīng)miRNA的表達(dá)。如果miRNA作為癌基因發(fā)揮功能,則可以設(shè)計與miRNA互補(bǔ)的反義寡核苷酸(AMOs),使其與miRNA結(jié)合,通過競爭性抑制miRNA與靶mRNA的結(jié)合,而抑制miRNA的功能,降低miRNA過表達(dá)所帶來的負(fù)面效應(yīng)[26]。如果miRNA作為抑癌基因發(fā)揮功能,則可以加入人造miRNA以抵制不足和抑制惡性腫瘤的生長。利用病毒或者脂質(zhì)體的表達(dá)系統(tǒng)可以瞬時引入大量miRNA。這些技術(shù)可以保證在某些組織特異性的啟動子控制之下,表達(dá)pre-miRNA及其兩側(cè)序列,并且刺激內(nèi)源性的miRNA加工,產(chǎn)生正確的miRNA,抑制特定基因表達(dá)。然而這一方法僅在細(xì)胞培養(yǎng)中有所嘗試,仍需要進(jìn)一步在動物模型中檢測[27]。
雖然目前miRNA在多種癌癥中的研究已經(jīng)取得了一些成果,但其參與白血病的致病機(jī)制并沒有完全了解,這些問題仍然需要更加深入地研究。
[1] Lim LP,Glasner ME,Yekta S,et al.Vertebrate microRNA genes[J].Science,2003,299(5612):1540.
[2] David PB.MicroRNAs:Target recognition and regulatory functions[J].Cell,2009,136(2):215 -233.
[3] Sandhu SK,Croce CM,Garzon R.Micro-RNA expression and function in lymphomas[J].Adv Hematol,2011,2011:347137.
[4] Calin GA,Dumitru CD,Shimizu M,et al.Frequent deletions and down-regulation of micro-RNA genes miR15 and miR16 at 13q14 in chronic lymphocytic leukemia[J].Proc Natl Acad Sci USA,2002,99(24):15524 -15529.
[5] Cimmino A,Calin GA,F(xiàn)abbri M,et al.MiR-15 and miR-16 induce apoptosis by targeting BCL2[J].Proc Natl Acad Sci USA,2005,102(39):13944 -13949.
[6] 張艷,徐廣賢,賈浩,等.microRNA對腫瘤細(xì)胞增殖與分化的調(diào)控[J].科技導(dǎo)報,2009,2(2):94 -98.
[7] Pekarsky Y,Koval A,Hallas C,et al.Tcl1 enhances Akt kinase activity and mediates its nuclear translocation[J].PNAS,2000,97(7):3028–3033.
[8] Bichi R,Shinton SA,Martin ES,et al.Human chronic lymphocytic leukemia modeled in mouse by targeted TCL1 expression[J].Proc Natl Acad Sci USA,2002,99(10):6955 -6960.
[9] 楊桂花,王芳,張俊武.MicroRNAs在血液細(xì)胞分化及相關(guān)腫瘤中的作用[J].中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報,2007,29(3):425-429.
[10] Nadia F,Laura F,Elvira P,et al.MicroRNAs 221 and 222 inhibit normal erythropoiesis and erythroleukemic cell growth via kit receptor down-modulation[J].Proc Natl Acad Sci USA,2005,102(50):18081-18086.
[11] He H,Jazdzewski K,Li W,et al.The role of microRNA genes in papillary thyroid carcinoma[J].PNAS,2005,102(52):19075 -19080.
[12] John B,Enright AJ,Aravin A,et al.Human microRNA targets[J].PLoS Biol,2004,2(11):1862 - 1879.
[13] Pfeffer S,Zavolan M,Grasser FA,et al.Identification of virus-encoded microRNAs[J].Science,2004,304(5671):734 - 736.
[14] 徐衛(wèi),李建勇.MicroRNA與淋巴增殖性疾?。跩].國際病理科學(xué)與臨床雜志,2007,27(1):1 -5.
[15] Pelengaris S,Khan M,Evan GI.Suppression of Myc-induced apoptosis in β cells exposes multiple oncogenic properties of myc and triggers carcinogenic progression[J].Cell,2002,109:321 -334.
[16] Els PS,Tam W,Sun L,et al.Accumulation of miR-155 and BIC RNA in human B cell lymphomas[J].PNAS,2005,102(10):3627-3632.
[17] He L,Thomson JM,Hemann MT,et al.A microRNA polycistron as a potential human oncogene[J].Nature,2005,435:828 -833.
[18] Trimarchi JM,Lees JA.Sibling rivalry in the E2F family[J].Nat Rev Mol Cell Biol,2002,3(1):11 -20.
[19] O’Donnell KA,Wentzel EA,Zeller KI,et al.C-Myc-regulated microRNAs modulate E2F1 expression[J].Nature,2005,435:839-843.
[20] Landais S,Landry S,Legault P,et al.Oncogenic potential of the miR-106-363 cluster and its implication in human T-cell leukemia[J].Cancer Res,2007,67(12):5699 -5707.
[21] Lagos-Quintana M,Rauhut R,Yalcin A,et al.Identification of tissue-specific microRNAs from mouse[J].Curr Biol,2002,12(9):735-739.
[22] Bai H,Xu R,Cao Z,Wei D,et al.Involvement of miR-21 in resistance to daunorubicin by regulating PTEN expression in the leukaemia K562 cell line[J].FEBS Lett,2011,585(2):402 -408.
[23] Jindra PT,Bagley J,Godwin JG,et al.Costimulation-dependent expression of microRNA-214 increases the ability of T cells to proliferate by targeting Pten[J].J Immunol,2010,185(2):990-997.
[24] Jayaswal V,Lutherborrow M,Ma DDF,et al.Identification of microRNA-mRNA modules using microarray data[J].BMC Genomics,2011,12:138.
[25] Calin GA,Liu CG,Sevignani C,et al.MicroRNA profiling reveals distinct signatures in B cell chronic lymphocytic leukemias[J].PNAS,2004,101(32):11755 -11760.
[26] Weiler J,Hunziker J,Hall J.Anti-miRNA oligonucleotides(AMOs):ammunition to target miRNAs implicated in human disease?[J].Gene Ther,2006,13(6):496 -502.
[27] Johnson SM,Grosshans H,Shingara J,et al.RAS is regulated by the let-7 MicroRNA family[J].Cell,2005,120:635 - 647.