劉 洋,李 媛,董 惠,張美晶,姜海芳,陳 維,辛九慶*
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/動(dòng)物細(xì)菌病研究室/國(guó)家牛傳染性胸膜肺炎指定檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室,黑龍江哈爾濱 150001;2.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,黑龍江哈爾濱 150001)
牛支原體雙重PCR檢測(cè)方法的建立
劉 洋1#,李 媛1#,董 惠2,張美晶1,姜海芳1,陳 維2,辛九慶1*
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/動(dòng)物細(xì)菌病研究室/國(guó)家牛傳染性胸膜肺炎指定檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室,黑龍江哈爾濱 150001;2.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,黑龍江哈爾濱 150001)
為鑒別牛支原體(Mycoplasma bovis)與絲狀支原體絲狀亞種SC(M.mycoidessubsp.mycoides SC),本實(shí)驗(yàn)通過(guò)優(yōu)化M.bovis特異性引物pMB81-1/pMB81-2s和MmmSC特異性引物SC1/SC2的退火溫度,建立了鑒別M.bovis和MmmSC的雙重PCR檢測(cè)方法。該方法能夠分別由M.bovis和MmmSC擴(kuò)增得到528 bp和270 bp片段。敏感性試驗(yàn)結(jié)果顯示該方法檢測(cè)M.bovis和MmmSC培養(yǎng)物的最低濃度分別為106cfu/mL和105cfu/mL。特異性試驗(yàn)結(jié)果顯示,該方法對(duì)無(wú)乳支原體代表株P(guān)G2、絲狀支原體絲狀亞種LC型代表株Y-goat、山羊支原體山羊肺炎亞種Mccp、綿羊支原體Y-98、豬鼻支原體BST-7、巴氏桿菌以及結(jié)核分枝桿菌擴(kuò)增結(jié)果均為陰性。應(yīng)用該方法對(duì)臨床病料的檢測(cè)結(jié)果與培養(yǎng)鑒定結(jié)果的符合率為100%,表明該方法具有良好的特異性和敏感性,可以應(yīng)用于臨床檢測(cè)。
牛支原體;絲狀支原體絲狀亞種SC;雙重PCR
#共同第一作者:劉 洋(1983-),男,黑龍江齊齊哈爾人,碩士研究生,主要從事動(dòng)物支原體病研究;
李 媛(1972-),女,山東海陽(yáng)人,助理研究員,主要從事動(dòng)物分子流行病學(xué)與診斷學(xué)研究.
*通信作者:E-mail:xinjiuqing2001@sohu.com
牛支原體(Mycoplasma bovis)屬支原體科支原體屬,可引起犢牛肺炎、乳腺炎、角膜炎和關(guān)節(jié)炎,是危害犢牛的重要病原體[1]。牛傳染性胸膜肺炎(Contagious bovine pleuropneumonia)簡(jiǎn)稱牛肺疫,是由與M.bovis同屬的絲狀支原體絲狀亞種SC型(M.mycoidessubsp.mycoides SC)引起的烈性傳染病,被世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(OIE)列為必須呈報(bào)疾病。1961年Hale在美國(guó)首次從一例患乳腺炎的牛乳中分離出M.bovis[2]。目前,M.bovis已呈全球流行,給養(yǎng)牛業(yè)造成嚴(yán)重?fù)p失[3,7]。2008年4月,我國(guó)南方爆發(fā)了以發(fā)熱、咳嗽及呼吸困難為主要特征的牛肺炎樣傳染病疫情,經(jīng)鑒定病原體為M.bovis,而不是MmmSC[4]。自2008年以來(lái),本實(shí)驗(yàn)室在內(nèi)蒙古等北方地區(qū)分離到M.bovis,表明該病已在我國(guó)流行。
M.bovis所導(dǎo)致的牛呼吸道相關(guān)疾病的臨床癥狀及病理特征與牛肺疫極為相似,嚴(yán)重干擾了我國(guó)無(wú)牛肺疫認(rèn)證進(jìn)程[3-4]。因此,需要一種可以快速鑒別診斷M.bovis與牛肺疫的檢測(cè)方法。本實(shí)驗(yàn)通過(guò)優(yōu)化退火溫度等條件建立了可以同時(shí)鑒別檢測(cè)M.bovis和MmmSC的雙重PCR方法,為我國(guó)無(wú)牛肺疫認(rèn)證以及M.bovis相關(guān)疾病診斷提供技術(shù)支持。
1.1 菌 株M.bovis湖北分離株(HB)由本實(shí)驗(yàn)室分離并鑒定[4]。MmmSC標(biāo)準(zhǔn)株P(guān)G1、絲狀支原體絲狀亞種LC型(M.mycoidessubsp.mycoides LC)Y-goat株、綿羊肺炎支原體(M.ovipneumonia)Y-98株及無(wú)乳支原體(M.agalactiae)PG2株均購(gòu)自中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所;臨床病料均來(lái)自于各地方送檢牛肺臟病料,由本實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)鑒定為M.bovis陽(yáng)性;多殺性巴氏桿菌(P.multocida,PM)、豬鼻支原體(BST-7)和山羊肺炎支原體(M.capricolumsubsp.Capripneumoniae,Mccp)由本實(shí)驗(yàn)室保存;牛結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium bovis,MB)基因組DNA由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所細(xì)菌室劉思國(guó)研究員提供。
1.2 主要試劑 組織/細(xì)胞DNA(小量)抽提試劑盒購(gòu)自上海華舜生物技術(shù)公司;rTaq酶購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司。
1.3 引物設(shè)計(jì) 選用MmmSC的公開(kāi)引物SC1/SC2[5]和文獻(xiàn)[6]中M.bovis的上游引物 pMB81-1,參考GenBank中登錄的M.bovisp81基因序列,設(shè)計(jì)下游引物 pMB81-2s(表 1)。
表1 引物序列Table 1 Primers sequences of PCR
1.4 菌體培養(yǎng)與基因組提取 將PG1和HB株接種含10%馬血清的馬丁肉湯培養(yǎng)基中,37℃培養(yǎng)至108cfu/mL~109cfu/mL。分別取純培養(yǎng)物按組織/細(xì)胞DNA(小量)抽提試劑盒說(shuō)明書(shū)提取基因組DNA。
1.5 最佳退火溫度選擇 以HB和PG1株等比例混合的基因組DNA為模板,退火溫度分別設(shè)置為47℃、52℃和57℃,進(jìn)行PCR反應(yīng)。20 μL體系:混 合 模 板 1 μL,SC1/SC2、 pMB81-1/pMB81-2S 各0.002 pmol, dNTP Mixture 0.004 μmol, 10 ×PCR Buffer 2 μL,滅菌去離子水 13.6 μL,rTaq酶 1 U。反應(yīng)條件:94℃5 min;94℃ 45 s、退火溫度下40 s、72℃1 min,35個(gè)循環(huán);72℃10 min。
1.6 特異性試驗(yàn) 按優(yōu)化的PCR條件,分別對(duì)各菌種基因組DNA(HB、PG1、PM、PG2、BST-7、Y-goat、Mccp、MB和BST-7)進(jìn)行雙重PCR擴(kuò)增,瓊脂糖凝膠電泳觀察結(jié)果。
1.7 敏感性試驗(yàn) 將純培養(yǎng)物稀釋至濃度為108cfu/mL、107cfu/mL、106cfu/mL和105cfu/mL,分別進(jìn)行雙重PCR擴(kuò)增,凝膠電泳觀察結(jié)果。將PG1和HB株的基因組DNA等比例混合加入體系中,檢測(cè)混合感染情況下該方法的敏感性。
1.8 臨床病料樣品檢測(cè) 提取病原培養(yǎng)鑒定為M.bovis陽(yáng)性病料的基因組DNA,用本實(shí)驗(yàn)建立的雙重PCR方法進(jìn)行檢測(cè)并與培養(yǎng)鑒定結(jié)果進(jìn)行比較分析。
2.1 退火溫度的優(yōu)化 將退火溫度分別設(shè)為47℃、52℃和57℃進(jìn)行雙重PCR擴(kuò)增。當(dāng)退火溫度為47℃和57℃時(shí),在240 bp左右處擴(kuò)增出一條非特異性片段。退火溫度為52℃時(shí),針對(duì)M.bovis的528 bp片段和針對(duì)MmmSC的270 bp片段擴(kuò)增效率較高且無(wú)雜帶。因此,最佳退火溫度確定為52℃(圖1)。
2.2 特異性試驗(yàn) 以優(yōu)化的退火溫度檢測(cè)該方法對(duì)PM、PG2、BST-7、Y-goat、Mccp、MB、Y-98的特異性。結(jié)果顯示:PG1和HB均擴(kuò)增出特異性片段,PM、PG2、BST-7、Y-goat、Mccp、MB、Y-98均無(wú)擴(kuò)增片段。表明該方法對(duì)MmmSC和M.bovis特異性良好,與其它病原無(wú)交叉反應(yīng)(圖2)。
2.3 敏感性試驗(yàn) 單一模板情況下,該方法可以檢測(cè)出HB株基因組DNA和PG1株基因組DNA最低濃度分別為106cfu/mL和105cfu/mL;混合模板情況下,可以檢出最低濃度分別為106cfu/mL的各基因組 DNA(圖 3)。
2.4 臨床病料的檢測(cè) 應(yīng)用本方法檢測(cè)臨床病料樣品,并將檢測(cè)結(jié)果與培養(yǎng)鑒定結(jié)果相比較。結(jié)果顯示,該雙重PCR鑒定結(jié)果與病原培養(yǎng)鑒定結(jié)果符合率為100%(表2)。證明本方法可以準(zhǔn)確地檢測(cè)出病料中的M.bovis和MmmSC,可代替病原培養(yǎng)鑒定應(yīng)用于臨床樣品檢測(cè)。
表2 雙重PCR與病原培養(yǎng)符合試驗(yàn)Table 2 The coincidence test of duplex-PCR and culture tests
M.bovis常與其它病原體混合感染,但實(shí)驗(yàn)室做常規(guī)病原學(xué)診斷時(shí),由于M.bovis需要特殊培養(yǎng)基,如果不做特殊要求,一般不檢測(cè)M.bovis,這可能是M.bovis流行病學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)與實(shí)際發(fā)病情況不符的原因。M.bovis可引起犢牛肺炎、乳腺炎、角膜炎和關(guān)節(jié)炎[7-8],臨床癥狀及病理變化與牛肺疫相似[3]。兩者存在血清學(xué)交叉反應(yīng),這給無(wú)牛肺疫認(rèn)證進(jìn)程造成嚴(yán)重干擾。因此,需要建立一種高特異性、高敏感性的快捷鑒別檢測(cè)方法。
多重PCR具有高效、快捷、經(jīng)濟(jì)、簡(jiǎn)便等優(yōu)點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于病原學(xué)診斷[9-10]。Foddai等建立了檢測(cè)無(wú)乳支原體和M.bovis的多重PCR方法,證明多重PCR方法可以被應(yīng)用于M.bovis的檢測(cè)[11]。因此,逐步建立可同時(shí)檢測(cè)多種病原的多重PCR方法是牛呼吸道相關(guān)傳染病病原鑒別診斷的發(fā)展方向之一。本實(shí)驗(yàn)建立了可同時(shí)鑒別檢測(cè)M.bovis和MmmSC的雙重PCR方法,敏感性試驗(yàn)結(jié)果表明該方法敏感性較高,而且可以在PG1和M.bovis混合感染時(shí)檢測(cè)出最低菌體拷貝數(shù)為106cfu/mL的培養(yǎng)物。本方法與MmmLC、Mccp代表株、結(jié)核桿菌、無(wú)乳支原體和巴氏桿菌均無(wú)交叉反應(yīng),證明該方法的特異性良好。PCR檢測(cè)臨床病料試驗(yàn)結(jié)果與病料培養(yǎng)鑒定結(jié)果完全符合,表明該方法能夠準(zhǔn)確鑒別檢測(cè)M.bovis和MmmSC,可應(yīng)用于臨床診斷。本研究建立的雙重PCR方法能夠縮短病原診斷周期,提高臨床檢測(cè)的工作效率,為我國(guó)M.bovis病診斷和無(wú)牛肺疫認(rèn)證提供技術(shù)支持。
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Establishment of a duplex-PCR assay for detecttion ofMycoplasma bovis
LIU Yang1#,LI Yuan1#,DONG Hui2,ZHANG Mei-jing1,JIANG Hai-fang1,CHEN Wei2,XIN Jiu-qing1*
(1.State Contagious Bovine Pleuropneumonia Designated Detection Laboratory,Division of Bacterial Diseases,State Key Laboratory of Veterinary Biotechnology,Harbin Veterinary Research Institute,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Harbin 150001,China;2.College of Veterinary Medicine,Northeast Agricultural University,Harbin 150001,China)
Mycoplasma bovisis a primary agent of respiratory disease which has similar sydromes and pathology characters to the contagious bovine pleuropneumonia caused byM.mycoidessubsp.mycoides SC(MmmSC).In this study,a duplex-PCR assay was established for the differential detection ofM.bovisandMmmSCusing primers specific toM.bovisandMmmSC,repectively.The duplex-PCR had a detection limit of 106cfu/mL forM.bovisand 105cfu/mL forMmmSC.It specifically amplified a DNA fragment of 528 bp from theM.bovisand 270 bp from theMmmSCtype strain PG1,and no PCR products were amplified from theMycoplasma agalactiaetype strain PG2,Mycoplasma mycoidessubsp.mycoides LCtype strain Y-goat,M.capricolumsubsp.Capripneumoniae,M.ovipneumoniatype strain Y-98,M.hyorhinis,Pasteurella multocidaandMycobacterium.The method was applied to detect clinical samples and the results showed 100%consistence with those of the bactera culture test.
Mycoplasma bovis;Mycoplasma mycoidessubsp.mycoidesSC;duplex-PCR
S852.6
A
1008-0589(2010)08-0599-04
10.3969/j.issn.1008-0589.2010.08.05
*Correspondingauthor;#Equal contributors
2009-12-07
獸醫(yī)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)(NKLVBP200809)
(本文編輯:張朝霞、楊朋欣)