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一株擬南芥寬葉形突變體atscamp的分離鑒定

2024-03-19 08:14郝雪峰賈曉宇曹海艷亢春霞裴雁曦
植物研究 2024年2期
關(guān)鍵詞:葉形突變體周齡

郝雪峰 賈曉宇 曹海艷 亢春霞 裴雁曦

(1.太原師范學院,生物科學與技術(shù)學院,晉中 030619; 2.山西大學,生命科學學院,特色植物資源研究與利用山西省重點實驗室,太原 030006)

隨著世界人口的增加,耕地面積的減少,提高農(nóng)作物產(chǎn)量成為亟待解決的問題之一[1]。植物器官大小直接影響作物的產(chǎn)量和生物量[2]。對植物來說,光合性能是影響農(nóng)作物產(chǎn)量的一個重要指標。葉片作為光合作用的主要器官,其理想的形態(tài)有利于塑造株型并提高光合效率[3]。此外,葉片形態(tài)對于植物光合儲能、抵御逆境等都有非常重要的意義。葉片是植物最重要的根外營養(yǎng)器官,葉片在吸收水分的同時也能像根一樣將養(yǎng)分轉(zhuǎn)運到植物體內(nèi)[4]。水稻(Oryza sativa)籽粒灌漿所需營養(yǎng)物質(zhì)的60%~80%來自葉片光合作用[5]。小麥(Triticum sativum)灌漿期籽粒碳水化合物的30%~50%主要來源于旗葉的光合作用[6]。因此,利于提高光合作用的株型、葉形成為重要的產(chǎn)量育種指標。

葉片形態(tài)對于實現(xiàn)作物高效光合影響很大,目前,已開展了很多對于葉片形態(tài)的相關(guān)研究。已有報道表明,植物葉片窄葉性狀的發(fā)育與生長素的合成和極性運輸密切相關(guān),生長素在葉片和維管組織的發(fā)育和形態(tài)建成上起著重要的作用[7]。在單子葉植物中,一些水稻葉形相關(guān)調(diào)控基因被報道,水稻葉形調(diào)控基因的共同特點是參與激素的合成或運輸,其突變性狀為葉片窄化且伴隨植株矮化[8]。目前,已經(jīng)報道了定位于水稻不同染色體的nal1~nal7七個窄葉突變體,對部分基因進行了功能驗證[9]。NAL1基因編碼1 個植物特有的蛋白,它可以調(diào)節(jié)生長素的極性運輸,使得水稻葉片橫向生長[10-11];NAL7基因編碼1 個YUCCA 家族酶蛋白,參與生長素的合成,并影響葉形發(fā)育[12]。雙子葉植物中,張海瑞[13]發(fā)現(xiàn)yuan1突變體可導致擬南芥(Arabidopsis thaliana)葉片表現(xiàn)出短而圓的表型;AN3/AtGIF1和At-GRF5的功能缺失突變體表現(xiàn)出窄葉表型,該表型由葉片細胞數(shù)目變少引起[14-15]。黃淦等[16]發(fā)現(xiàn)GRXC9基因過表達株系中葉片細胞體積變小,葉片出現(xiàn)短小的表型。但是葉片寬大性狀相關(guān)基因的研究還很少。

分泌載體膜蛋白(secretory carrier membrane protein,SCAMP)廣泛存在于包括線蟲、昆蟲、魚類、兩棲動物、哺乳動物等的真核生物中,也存在于單子葉植物和雙子葉植物中[17]。SCAMP參與植物細胞內(nèi)吞作用和信號傳導,以及胞吐的調(diào)節(jié)和多泡內(nèi)體生物發(fā)生[18-19]。植物中SCAMPs是一個基因家族,其家族成員參與調(diào)控花粉管發(fā)育[20],AtSCAMP在種子萌發(fā)階段及生長發(fā)育階段對鹽脅迫較為敏感[21]。在小麥中,TaSCAMP1可以與液泡膜Na+/H+逆向轉(zhuǎn)運蛋白發(fā)生互作,推測與植物耐鹽性相關(guān)[22]。目前,尚未發(fā)現(xiàn)該基因與葉形調(diào)控相關(guān)研究的報道,因此,探索SCAMP 與葉形發(fā)育這兩者之間的聯(lián)系是一個十分有意思的研究。

本研究前期發(fā)現(xiàn)了1 個寬葉表型的擬南芥突變體,從表型看這一突變體的表現(xiàn)與前述已經(jīng)報道[8]的突變體有顯著不同,一是基因突變表現(xiàn)為葉片加寬,另外該突變體并沒有伴隨矮化表型。推測該突變位點與已經(jīng)報道的單子葉植物葉形調(diào)節(jié)基因不屬于同一類型。目前寬葉相關(guān)性狀研究及基因定位克隆很少。本研究將對這一突變體進行鑒定,以期為研究葉形發(fā)育分子調(diào)控機理提供新的突破點,也為培育高光合效能作物品種提出全新的研究思路。

1 材料與方法

1.1 植物材料

所用材料為哥倫比亞生態(tài)型(Col-0)擬南芥和化學誘導型擬南芥XVE 誘導型激活突變體(中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所的左建儒教授提供)。

1.2 培養(yǎng)條件

選擇均勻飽滿的擬南芥種子,4 ℃春化2~4 d,經(jīng)70%乙醇和6.5%次氯酸鈉消毒后先種植于1/2MS 培養(yǎng)基上生長1 周,然后挑選生長健壯的幼苗定植于V(營養(yǎng)土)∶V(珍珠巖)∶V(蛭石)=1∶1∶1的混合基質(zhì)中;培養(yǎng)條件均為23 ℃、相對濕度60%、光照強度160 μE·m-2·s-1、光周期為16 h 光照/8 h 黑暗[23]。收集1~5 周齡植株葉片(用于發(fā)育時期特異性測定)和第5 周齡植株的根、莖、葉、花(進行組織特異性測定)后,立即置于液氮中,冰箱中-80 ℃存儲備用。

1.3 試驗方法

1.3.1 突變體的Genotyping 鑒定以及RT-PCR表達分析

取4 周齡的擬南芥野生型(WT)和atscamp突變體植株,用CTAB 法提取葉片總DNA。以DNA為模板,采用三引物法,進行PCR 擴增。引物為AtSCAMP基因特異的引物P1、P2 與T-DNA 上的引物P3,詳細引物序列信息見表1。

表1 基因分型及表達量鑒定引物列表Table 1 Primer list for genotyping and expression level analysis

DNA提取、PCR擴增、膠回收,T載體克隆等參考Liu等[24]的方法進行;委托北京華大基因公司測序;序列在NCBI 進行比對分析,用Tail-PCR 技術(shù)[24]確定T-DNA 插入位點;RNA 提取、單鏈cDNA的 合 成 以 及 半 定 量RT-PCR 參 見Dixit 等[25]的方法。

1.3.2 突變體的觀察

利用直尺和拍照式葉面積儀(JC-LAM-D,中國),分別對5 周齡植株冠幅及其最大的4~5 片葉進行葉長、葉寬和葉面積的測量。

1.3.3 葉綠素熒光參數(shù)、葉綠素含量和葉片氣體交換參數(shù)的測定

利用植物效率分析儀(Handy PEA,英國)測定葉綠素熒光參數(shù),將葉片表面擦凈,植株遮光暗適應30 min 之后測定葉片初始熒光(Fo),用飽和脈沖光照射測量可變熒光(Fv),根據(jù)Fo和Fv計算PSⅡ的潛在光化學效率(Fv/Fo),每組處理重復3次,取平均值作為測定數(shù)值。

參考李合生[26]的方法,取0.05 g 新鮮葉片,加入1 mL 95%乙醇于研缽中進行勻漿,后將勻漿液轉(zhuǎn)入5 mL 的EP 管,再用2 mL 95%清洗研缽后再次歸入EP 管,共3 mL,操作時注意避光,于室溫3 000 r·min-1離心3 min 取上清液備用。取200 μL上清液于多功能酶標儀(BioTek,美國)測定665 nm 和649 nm 處的吸光值(即D665,D649)。以95%乙醇為空白,樣品和空白均設(shè)置3 個重復,記錄數(shù)值,并按如下公式計算:ρ(Chl a)=13.95×D665-6.88×D649;ρ(Chl b)=24.96×D649-7.32×D665;各葉綠體色素質(zhì)量分數(shù)=(色素質(zhì)量濃度×提取液體積)/葉片鮮質(zhì)量。

利用光合作用測定儀(SY-1020,中國)于09:00—11:00 檢測植株葉片氣體交換參數(shù):凈光合速率(Pn)、蒸騰速率(Tr)、胞間二氧化碳摩爾分數(shù)(Ci)、氣孔導度(Gs)和水分利用率(WUE)。測定時光源充足,CO2流速穩(wěn)定。

1.3.4 氣孔孔徑測定

取4 周齡的WT、atscamp植株的葉片,每個樣本撕取表皮條3~4個(取材于不同幼苗),置于75%乙醇中固定,在光學顯微鏡下觀察氣孔,每個表皮條至少觀察5個視野,統(tǒng)計至少90個氣孔孔徑。

1.4 數(shù)據(jù)處理

使用Excel 2016 和IBM SPSS Statistics 26 軟件對數(shù)據(jù)進行單因素方差分析,并用平均值±標準差表示,用Duncan’s分析不同處理間的差異顯著性,使用SigmaPlot 10.0及Photoshop 2020作圖。

2 結(jié)果與分析

2.1 突變體的T-DNA插入位點

從化學誘導型擬南芥突變體庫(約6 000 株系)中篩選獲得1 株葉片性狀寬大的突變體(見圖1A)。單株收種性狀穩(wěn)定后,Tail-PCR 結(jié)果表明T-DNA 插入位點位于AT1G11180(NC_003070.9,Tair Accession 6530298368,2 784 bp)基因第5個外顯子(1 190~1 312 bp)中第1 215~1 216 bp(見圖1B)。查 詢GenBank 數(shù) 據(jù) 庫,AT1G11180編 碼SCAMP2家族蛋白,因此將該突變體命名為atscamp。Genotyping 結(jié)果表明,atscamp突變體是純合植株(見圖1C)。 RT-PCR 檢 測 發(fā) 現(xiàn),AtSCAMP2基 因 在atscamp突變體中轉(zhuǎn)錄表達水平極低(見圖1D)。SCAMP 家族蛋白一般具有4 個跨膜結(jié)構(gòu)域(TMDs),廣泛存在于許多真核生物中,在植物中是植物細胞內(nèi)吞和分泌途徑的有用標記,但是目前功能尚不清楚。

2.2 突變體表型與分析

擬南芥野生型和突變體atscamp播種后28 d,植株抽薹前,對植株冠幅、葉長、葉寬和葉面積進行測量。數(shù)據(jù)顯示,突變體atscamp葉片冠幅、葉片長度與野生型植株相似;但是突變體的葉片寬度和比葉面積均極顯著大于野生型植株(見表2)。

表2 WT和atscamp的形態(tài)結(jié)構(gòu)性狀Table 2 Morphological structure characteristics of WT and atscamp

另外,與野生型植株相比,該突變體的葉色明顯較深。因此對atscamp突變體的葉綠素含量進行測定,結(jié)果顯示(見表3):與野生型植株相比,atscamp突變體葉綠素b含量雖然未發(fā)生顯著變化,但是葉片葉綠素a含量顯著增加,相應地葉綠素a/b比值也顯著增加。

表3 WT和atscamp葉綠素含量的差異Table 3 Differences of chlorophyll content between WT and atscamp

2.3 突變體atscamp葉綠素熒光和光合相關(guān)指標

鑒于atscamp突變體中葉綠素含量的變化,暗示該突變體光合性能可能發(fā)生變化。因此,進一步對該突變體植株葉綠素熒光和光合相關(guān)指標進行分析,結(jié)果如表4 所示:atscamp突變體葉片葉綠素初始熒光與野生型植株相比,無顯著差異;但是突變體中葉綠素最大熒光(Fm)、PSⅡ最大光化學效率和PSⅡ潛在光化學效率都顯著高于野生型植株。

表4 WT和atscamp葉綠素熒光參數(shù)的差異Table 4 Differences of chlorophyll fluorescence parameters between WT and atscamp

結(jié)果發(fā)現(xiàn),atscamp突變體的凈光合速率(Pn)較野生型植物極顯著增加;同時該突變體葉片水分利用效率(WUE)和葉片蒸騰系數(shù)(Tr)都顯著增加;但是該突變體的氣孔導度(Gs)和氣孔開度(Sa)與野生型植物相比均無顯著差異(見表5)。

表5 WT和atscamp葉片光合指標的差異Table 5 Differences of leaf photosynthetic indexes between WT and atscamp

2.4 AtSCAMP基因在植物中的時空性表達特性

關(guān)于擬南芥AtSCAMP基因功能的報道非常少,筆者沒有獲得該基因影響植物葉形的可能調(diào)控機制信息。為了進一步了解該基因在植物中的表達特性,利用RT-PCR 方法對擬南芥中AtSCAMP的表達特性進行分析,結(jié)果表明:該基因在葉片中高表達,但是在根、莖、花中表達量非常低,表現(xiàn)出明顯的組織特異性(見圖2A~B)。對1~5周齡不同發(fā)育時期葉片中AtSCAMP基因表達量進行分析表明,該基因在1周齡幼苗葉片中幾乎檢測不到表達,隨著植株發(fā)育,該基因在葉片中的表達量逐漸增加,到4~5周齡時,表達量達到最高值(見圖2C~D)。

3 討論

植物葉形受基因型控制,也受到激素互作的影響。在單子葉植物尤其是水稻中,越來越多與葉片形態(tài)相關(guān)的基因被克隆,對葉形形成的分子機制的了解逐步加深[10-12],但是關(guān)于雙子葉植物這方面的報道非常有限。本研究從擬南芥突變體庫中篩選獲得1株新型葉片寬大突變體,進一步分析發(fā)現(xiàn)突變體植株突變位點發(fā)生在AT1G11180,該位點編碼蛋白AtSCAMP。Genotyping 技術(shù)鑒定獲得純合突變體植株。研究表明atscamp突變體冠幅沒有發(fā)生改變,但是葉片的寬度和葉面積極顯著大于野生型植株,同時葉綠素熒光和光合相關(guān)指標顯著高于野生型植株,這是極為少見的1個葉形突變體。

葉形性狀的概念有兩個方面,一類是直接影響作物生產(chǎn)性狀的寬窄薄厚等方面的性狀差異。它與植物同化能力、環(huán)境的適應性和光合作用能力等密切相關(guān)[27-28],本研究的突變體應該屬于這一類型;第二類葉形性狀是異形葉性狀,植物葉形會隨著環(huán)境條件的變化而變化,同一植株在不同環(huán)境下產(chǎn)生截然不同的葉形,而不同的葉形具有不同的響應環(huán)境變化的能力。異形葉是植物適應環(huán)境條件的現(xiàn)象。近年來,一些基因影響葉形態(tài)發(fā)育的分子機制研究也有重要進展。王利等[29]發(fā)現(xiàn)ASL25/LBD28基因的過量表達可導致轉(zhuǎn)基因擬南芥的葉片變得狹長;Adal 等[30]發(fā)現(xiàn)在擬南芥植株中過表達AGAMOUS-like和SEPALLATA3-like,擬南芥葉片會出現(xiàn)卷曲現(xiàn)象。邊界基因NAM/CUC調(diào)節(jié)葉緣發(fā)育[31],Vlad 等[32]在碎米薺(Cardamine hirsuta)中鑒定到1個影響葉邊緣發(fā)育的基因RCO;Li等[33]在異葉水蓑衣(Hygrophila difformis)中探明了HdSTM在異形葉發(fā)育中的調(diào)控作用。AN3/AtGIF1和At-GRF5的功能缺失突變體出現(xiàn)窄葉表型[14-15],本研究中葉片寬大突變體的發(fā)現(xiàn),為研究植物尤其是雙子葉植物的葉形發(fā)育分子調(diào)控機理,提供了重要線索和研究思路,也展現(xiàn)出作物高光效品種創(chuàng)制方面的潛在應用價值。

SCAMP2是一種相對保守的膜蛋白,主要分布在一些膜上,例如某些細胞器的膜、分泌囊泡膜及細胞膜等,它通常在分揀蛋白、囊泡的形成及胞吞胞吐過程中發(fā)揮物質(zhì)運輸功能,比如在高爾基體轉(zhuǎn)運途徑中協(xié)助將物質(zhì)進行跨細胞膜運輸[34-35]。前人研究[21]表明,SCAMP2在葉中表達量高于根,本研究與其結(jié)果一致。熒光定量PCR 分析表明,隨著植株發(fā)育,該基因在葉片中的表達量逐漸增加,到4~5 周齡時,表達量達到最高值;且葉綠素熒光和光合相關(guān)指標顯著高于野生型植株。

本研究中,獲得了1 個完全敲除的擬南芥atscamp突變體,表現(xiàn)出非常顯著的葉片寬大表型,以及增強的光合能力。這是該蛋白家族功能研究的一個重要的新線索。在目前突變體線索的基礎(chǔ)上,未來需要對該基因的功能進行進一步的驗證,并嘗試在雙子葉植物尤其是在十字花科(Brassicaceae)作物中尋找該基因的同源基因并證實其功能,為高光效作物品種創(chuàng)制方面提供理論支撐。

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