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Vitek2 Compact AST-P639中國(guó)定制藥敏卡對(duì)金黃色葡萄球菌體外藥敏、耐藥表型及AES修正能力評(píng)估

2023-08-09 02:27:36梁美春王萍張小姣何秋麗呂黎周宜慶張海旺茅國(guó)峰王朵
浙江醫(yī)學(xué) 2023年13期
關(guān)鍵詞:克林紅霉素葡萄球菌

梁美春 王萍 張小姣 何秋麗 呂黎 周宜慶 張海旺 茅國(guó)峰 王朵

金黃色葡萄球菌是醫(yī)院和社區(qū)獲得性感染最重要和最具挑戰(zhàn)性的病原體之一,尤其是耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus au‐reus,MRSA)引起抗菌藥物耐藥性不斷增加而越來(lái)越受到人們的關(guān)注。因此快速準(zhǔn)確的藥敏結(jié)果對(duì)臨床實(shí)現(xiàn)快、準(zhǔn)、狠的個(gè)性化抗感染精準(zhǔn)治療顯得尤為重要。目前臨床微生物實(shí)驗(yàn)室的體外藥敏試驗(yàn)多數(shù)采用Vitek2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌藥敏分析系統(tǒng),其自帶的高級(jí)專家系統(tǒng)(advanced expert system,AES)可對(duì)細(xì)菌的藥敏結(jié)果進(jìn)行自動(dòng)判斷,根據(jù)藥敏結(jié)果綜合分析篩選出MRSA、紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn),并根據(jù)耐藥表型對(duì)藥敏結(jié)果進(jìn)行修正。2016年,梅里埃公司聯(lián)合中國(guó)的行業(yè)專家共同定制出了更符合中國(guó)臨床需求的藥敏卡即中國(guó)定制藥敏卡,其中包括革蘭陽(yáng)性球菌AST-P639藥敏卡,該卡在原來(lái)卡片的基礎(chǔ)上刪除了四環(huán)素、呋喃妥因,增加了頭孢洛林、達(dá)托霉素、替考拉寧等,基本覆蓋了臨床常用的各類抗菌藥物,無(wú)需手工補(bǔ)貼藥敏紙片。為評(píng)估AST-P639中國(guó)定制藥敏卡(以下稱中國(guó)定制卡)對(duì)金黃色葡萄球菌體外藥敏、MRSA、紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)、AES修正能力的準(zhǔn)確性和可靠性,本研究以美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(CLSI)推薦的微量肉湯稀釋法、D試驗(yàn)及PCR測(cè)mecA、mecC基因?yàn)閰⒖挤椒?,?duì)中國(guó)定制卡的可靠性進(jìn)行評(píng)估,現(xiàn)報(bào)道如下。

1 資料和方法

1.1 一般資料選取2020年5月至2021年9月紹興市人民醫(yī)院臨床分離的非重復(fù)金黃色葡萄球菌100株,其中痰液35株,膿液15株,手術(shù)切緣14株,分泌物14株,血液6株,滲出液11株,其余5株。

1.2 方法標(biāo)本采集和培養(yǎng)參照《全國(guó)臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程》第4版進(jìn)行,血瓊脂平板購(gòu)于鄭州安圖生物工程股份有限公司。

1.3 儀器與試劑采用梅里埃Vitek MS質(zhì)譜鑒定儀及Vitek2 Compact型自動(dòng)微生物藥敏儀,配套中國(guó)定制卡,均購(gòu)自法國(guó)梅里埃公司。萬(wàn)古霉素、替考拉寧、替加環(huán)素、利奈唑胺、達(dá)托霉素、苯唑西林、紅霉素、克林霉素、左氧氟沙星、復(fù)方新諾明和利福平同時(shí)采用微量肉湯稀釋法進(jìn)行藥敏檢測(cè),試劑購(gòu)自溫州康泰生物科技有限公司(批號(hào):VE06160)。紅霉素紙片(規(guī)格:15 μg,批號(hào):3380421)、克林霉素紙片(規(guī)格:2 μg,批號(hào):3443630)購(gòu)自英國(guó)Oxoid公司;MH瓊脂平板購(gòu)自鄭州安圖生物工程股份有限公司。DNA提取試劑盒購(gòu)自上海生工生物工程有限公司;PCR儀購(gòu)自美國(guó)塞默飛公司(型號(hào):7300PLUS);Taq酶和PCR反應(yīng)相關(guān)試劑購(gòu)自杭州擎科生物工程有限公司;電泳儀購(gòu)自上海天能科技有限公司(型號(hào):EPS-300);紫外成像系統(tǒng)為購(gòu)自法國(guó)Teleflex Incorporated公司(型號(hào):TFX-20M)。

1.4 藥敏試驗(yàn)質(zhì)譜儀鑒定為金黃色葡萄球菌的菌株,采用PCR方法檢測(cè)金黃色葡萄球菌特異性熱核酸酶基因nucA[1]確認(rèn)菌株為金黃色葡萄球菌。采用微量肉湯稀釋法進(jìn)行藥敏試驗(yàn),按照CLSIM100 S31[2]判定結(jié)果;中國(guó)定制卡的操作按照廠家說(shuō)明書進(jìn)行,藥敏結(jié)果根據(jù)系統(tǒng)自帶專家系統(tǒng)自動(dòng)給出,質(zhì)控菌株采用ATCC29213。

1.5 MRSA表型測(cè)定及基因確證試驗(yàn)中國(guó)定制卡以頭孢西丁6.00 μg/mL篩選MRSA表型,并根據(jù)頭孢西丁表型結(jié)果對(duì)苯唑西林的藥敏結(jié)果進(jìn)行修正;采用常規(guī)PCR檢測(cè)mecA、mecC基因進(jìn)行確證。MRSA陽(yáng)性質(zhì)控菌株為ATCC43300,MRSA陰性質(zhì)控菌株為ATCC29213。

1.6 DNA的提取用無(wú)菌環(huán)挑取適量金黃色葡萄球菌單個(gè)菌落,于300 μL 0.9%氯化鈉注射液中研磨混勻,10 000 r/min離心3 min,棄上清液,收集菌體。嚴(yán)格按照細(xì)菌DNA提取試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行操作,并對(duì)提取后的DNA使用超微量核酸蛋白測(cè)定儀檢測(cè)濃度和純度。

1.7 mecA、mecC基因PCR擴(kuò)增mecA、mecC基因的擴(kuò)增根據(jù)參考文獻(xiàn)[3-4]進(jìn)行,引物序列委托杭州擎科生物工程有限公司合成。擴(kuò)增產(chǎn)物送至上海生工生物工程有限公司進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)。

1.8 紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)D試驗(yàn)參照《全國(guó)臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程》第4版,紅霉素紙片、克林霉素紙片中心點(diǎn)相距為15~20 mm,在靠近紅霉素紙片一側(cè)克林霉素的抑菌環(huán)有截平現(xiàn)象,即D試驗(yàn)陽(yáng)性。中國(guó)定制卡采用微量肉湯稀釋法,以克林霉素0.5 μg/mL和紅霉素0.25 μg/mL來(lái)監(jiān)測(cè)紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥,如果2個(gè)孔都明顯渾濁或都不渾濁,則為紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)陰性,如果第1個(gè)孔不渾濁而第2個(gè)孔渾濁則為紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)陽(yáng)性。AES根據(jù)紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)陽(yáng)性結(jié)果,對(duì)克林霉素藥敏結(jié)果進(jìn)行修正。

1.9 相關(guān)定義極大錯(cuò)誤(very major error,VME):參考方法判讀為耐藥,待測(cè)方法為敏感;大錯(cuò)誤(major error,ME):參考方法判讀為敏感,待測(cè)方法為耐藥;小錯(cuò)誤(minor error,MIE):任何一方為中介,另一方為敏感或耐藥。分類一致性(categorical agreement,CA):待測(cè)方法與參考方法判讀結(jié)果的一致性,如兩者均判讀為敏感、中介或耐藥[5]。

1.10 方法學(xué)比對(duì)當(dāng)待測(cè)方法與參考方法的比對(duì)結(jié)果同時(shí)完全滿足以下要求時(shí),則為可接受:VME<1.50%、ME<3.00%、VME+ME<5.00%、VME+ME+MIE均<10.00%(即CA>90.00%)[5]。

1.11 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理采用WHONET 5.6軟件和SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)數(shù)資料以例(%)表示,組間比較采用Fisher確切概率法。一致性檢驗(yàn)采用Kappa檢驗(yàn),Kappa值≥0.90為一致性非常好,0.75<Kappa值<0.90為一致性較好,0.4<Kappa值≤0.75為一致性中等,Kappa值≤0.4為一致性較差。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 中國(guó)定制卡體外藥敏結(jié)果可靠性分析與參考方法比較,中國(guó)定制卡對(duì)金黃色葡萄球菌體外藥敏CA為95.38%,VME、ME、MIE分別為0.31%、3.77%、0.54%,均在可接受范圍內(nèi)。其中萬(wàn)古霉素、替考拉寧、替加環(huán)素、利奈唑胺、達(dá)托霉素CA均為100.00%,紅霉素、左氧氟沙星、復(fù)方新諾明和利福平的CA分別為95.00%、94.00%、98.00%、97.00%。紅霉素的VME為1.00%,ME為2.00%,MIE為2.00%;左氧氟沙星、復(fù)方新諾明和利福平的ME均為2.00%,利福平出現(xiàn)了1.00%的MIE,而左氧氟沙星出現(xiàn)了4.00%的MIE范圍,但均在可接受范圍內(nèi)。見表1。

表1 中國(guó)定制卡與參考方法間的差異性分析

2.2 MRSA、紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)結(jié)果可靠性分析將100株金黃色葡萄球菌進(jìn)行DNA提取,采用PCR方法檢測(cè)mecA、mecC基因,檢出mecA 71株,未檢出mecC菌株;采用中國(guó)定制卡篩選出69株MRSA菌株,CA為98.00%。中國(guó)定制卡69株MRSA菌株均檢出mecA基因,2株mecA基因在對(duì)甲氧西林敏感的金黃色葡萄球菌(methicillin sensitive Staphylococcus aureus,MSSA)中檢出。擴(kuò)增結(jié)果見圖1。

圖1 PCR擴(kuò)增金葡菌mecA基因凝膠電泳圖

中國(guó)定制卡檢出紅霉素耐藥、克林霉素敏感菌株30株,紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)陽(yáng)性28株,陽(yáng)性率為93.33%(28/30);D試驗(yàn)檢出紅霉素耐藥、克林霉素敏感菌株27株,D試驗(yàn)陽(yáng)性27株,陽(yáng)性率為100.00%,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),其中紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)2種方法的CA為97.00%。

2.3 中國(guó)定制卡與參考方法的一致性檢驗(yàn)中國(guó)定制卡與參考方法一致性較好(Kappa=0.87,P<0.01),其中萬(wàn)古霉素、替考拉寧、替加環(huán)素、利奈唑胺、達(dá)托霉素與參考方法完全一致(Kappa=1.00,P<0.01),MRSA、紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)的一致性非常好(Kappa=0.95、0.93,均P<0.01),克林霉素的一致性較差(Kappa=0.36,P<0.01),苯唑西林、紅霉素、左氧氟沙星、復(fù)方新諾明、利福平的一致性均為中等。見表1。2.4 AES修正結(jié)果分析及AES修正能力評(píng)估中國(guó)定制卡檢出35株苯唑西林敏感菌株,因頭孢西丁篩選陽(yáng)性,AES將4株苯唑西林敏感菌株修正為耐藥,與參考方法比較修正前CA為97.00%,出現(xiàn)了1.00%VME和2.00%ME。AES修正后雖然CA下降為95.00%,ME也上升至5.00%,但避免了VME的出現(xiàn)。被AES修正為耐藥的4株苯唑西林敏感菌株,經(jīng)PCR證實(shí)均攜帶mecA基因,為MRSA菌株。中國(guó)定制卡檢出73株克林霉素敏感菌株,因紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)陽(yáng)性,AES將28株克林霉素敏感株修正為耐藥,修正前克林霉素CA為92.00%,VME為1.00%、ME為7.00%;AES修正后雖然避免了VME,但CA下降至66.00%,ME也升至34.00%,遠(yuǎn)超出了VME+ME+MIE<10.00%的可接受范圍。被AES修正的28株菌株經(jīng)D試驗(yàn)證實(shí),26株為D試驗(yàn)陽(yáng)性,即AES存在7.14%(2/28)的錯(cuò)誤修正率,見表1。

3 討論

Vitek2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌藥敏儀自動(dòng)化流程操作簡(jiǎn)便,實(shí)現(xiàn)動(dòng)態(tài)觀察,方便快捷。既往研究表明Vitek2 Compact全自動(dòng)細(xì)菌藥敏儀在測(cè)定臨床常用抗菌藥物的體外藥敏、常見耐藥表型[5]和AES修正系統(tǒng)[6]具有較好的可靠性。中國(guó)定制卡對(duì)金黃色葡萄球菌藥敏結(jié)果、耐藥表型鑒定和AES修正能力目前尚不清楚。本研究發(fā)現(xiàn),中國(guó)定制卡對(duì)金黃色葡萄球菌體外藥敏的CA為95.38%,略低于田月如等[7]報(bào)道的中國(guó)定制卡,略高于喬寧等[8]報(bào)道的非定制卡,其中萬(wàn)古霉素、替考拉寧、替加環(huán)素、利奈唑烷與參考方法完全一致(CA均為100.00%,Kappa均為1.00,均P<0.05),由于萬(wàn)古霉素、替考拉寧、替加環(huán)素、利奈唑烷、達(dá)托霉素對(duì)大多數(shù)革蘭陽(yáng)性菌具有很強(qiáng)的抗菌作用,據(jù)CH‐NET網(wǎng)(http://www.chinets.com/Chinet)顯示,截至2022年上半年止,我國(guó)未檢測(cè)出對(duì)萬(wàn)古霉素、替考拉寧、替加環(huán)素、利奈唑烷耐藥的金黃色葡萄球菌,所以不能排除因無(wú)耐藥菌株而導(dǎo)致的高一致性。復(fù)方新諾明、利福平、左氧氟沙星、紅霉素的CA均>90.00%,但均出現(xiàn)了不同程度的ME,紅霉素甚至出現(xiàn)了1.00%的VME,這可能會(huì)誤導(dǎo)臨床醫(yī)師錯(cuò)誤選擇抗菌藥物而導(dǎo)致治療失敗。紅霉素、左氧氟沙星、利福平分別出現(xiàn)了2.00%、4.00%、1.00%的MIE,提示在中介范圍內(nèi)的抗菌藥物應(yīng)謹(jǐn)慎使用。

MRSA的耐藥機(jī)制主要是由mecA基因編碼與β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物親和力低的PBP2a[9]。mecC基因與mecA基因在DNA水平上約有70%相似性,在氨基酸水平上有63%同源性[10]。mecC基因主要與動(dòng)物有關(guān),在人類中的患病率極低[11],目前也德國(guó)、英國(guó)、丹麥、捷克檢出[4,9-10],國(guó)內(nèi)未見相關(guān)報(bào)道,本研究也未檢出mecC基因。中國(guó)定制卡篩選的MRSA表型與PCR方法一致性非常好(Kappa=0.95,P<0.05),CA為98.00%,略高于魏丹丹等[12]報(bào)道的非中國(guó)定制卡。中國(guó)定制卡篩選的MRSA菌株均檢出mecA基因,2株mecA基因在MSSA菌株中檢出,表明定制卡篩選MRSA準(zhǔn)確性高,但還是會(huì)有2%(2/100)的漏檢,應(yīng)引起關(guān)注。

苯唑西林不一致的結(jié)果中,1例菌株肉湯稀釋法判讀為耐藥,而中國(guó)定制卡在AES修正前判讀為敏感,修正后判讀對(duì)相對(duì)耐藥;5株菌株肉湯稀釋法判讀為敏感而中國(guó)定制卡判讀為耐藥,其中3株AES修正為相對(duì)耐藥,即苯唑西林在AES修正前出現(xiàn)了1.00%的VME,修正后出現(xiàn)了5.00%的ME,同時(shí)修正后的CA值略低于修正前,但在AES修正為相對(duì)耐藥的4株苯唑西林敏感菌株中均檢出mecA基因,即與AES修正相符。多數(shù)情況下攜帶mecA基因或產(chǎn)生PBP2a的金黃色葡萄球菌對(duì)苯唑西林耐藥,中國(guó)定制卡檢出6株,肉湯稀釋法檢出7株苯唑西林敏感mecA基因陽(yáng)性菌株(OS-MRSA),其中中國(guó)定制卡中4株苯唑西林敏感菌株AES將其修正為耐藥,即中國(guó)定制卡檢出2株、肉湯稀釋法檢出7株OS-MRSA菌株。有研究認(rèn)為OSMRSA菌株的出現(xiàn)可能與PBP2a蛋白的低表達(dá)[13]、me‐cA基因的不穩(wěn)定[14]、青霉素結(jié)合蛋白4(PBP4)和Fem酶活性以及blaR1基因[15]的缺乏有關(guān),其機(jī)制有待于進(jìn)一步研究。提示當(dāng)存在OS-MRSA菌株時(shí),中國(guó)定制卡AES修正結(jié)果的可靠性較高,可適當(dāng)避免上述原因造成臨床治療失敗。

克林霉素具有優(yōu)越的藥代動(dòng)力學(xué),能口服、經(jīng)濟(jì)、有效穿透組織的能力、不良反應(yīng)少等優(yōu)點(diǎn),被臨床廣泛應(yīng)用于革蘭陽(yáng)性菌引起的感染,尤其可作為青霉素和頭孢菌素過(guò)敏患者的首選藥物。紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)陽(yáng)性表現(xiàn)為紅霉素耐藥而克林霉素敏感,但在實(shí)際治療中克林霉素的治療是無(wú)效的,故紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)結(jié)果可為臨床規(guī)范使用抗菌藥物提供指導(dǎo)。本研究中國(guó)定制卡紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)與D試驗(yàn)一致性非常好(Kappa=0.93,P<0.01,CA=97.00%),與報(bào)道一致[16]。中國(guó)定制卡檢出紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)陽(yáng)性而D試驗(yàn)陰性菌株2株,中國(guó)定制卡檢出紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥試驗(yàn)陰性而D試驗(yàn)陽(yáng)性菌株1例,其中國(guó)定制卡紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥陽(yáng)性率(93.33%)低于D試驗(yàn)(100.00%),但差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,且均高于相關(guān)報(bào)道[17],這可能與各地區(qū)用藥情況和耐藥基因差異有關(guān)。提示中國(guó)定制卡紅霉素誘導(dǎo)克林霉耐藥的準(zhǔn)確性非常高,但應(yīng)注意假陽(yáng)性和假陰性的發(fā)生。

克林霉素不一致的結(jié)果中,1株肉湯稀釋法判讀為耐藥,中國(guó)定制卡在AES修正前判讀為敏感,修正后判讀對(duì)相對(duì)耐藥;27株肉湯稀釋法判讀為敏感,中國(guó)定制卡AES修正前判讀為敏感,修正后判讀對(duì)相對(duì)耐藥;修正前出現(xiàn)了1.00%的VME,修正后雖然出現(xiàn)了很高的ME(34.00%),一致性也較差(Kappa=0.36),但可以避免誘導(dǎo)性耐藥而錯(cuò)誤的選擇無(wú)效抗菌藥物,同時(shí)應(yīng)注意AES對(duì)克林霉素存在的錯(cuò)誤修正率(7.14%)。因本研究未對(duì)erm基因進(jìn)行檢測(cè),故不能排除中國(guó)定制卡對(duì)紅霉素誘導(dǎo)克林霉耐藥表型的準(zhǔn)確性、AES錯(cuò)誤修正率存在一定的影響。

綜上所述,Vitek2 Compact AST-P639中國(guó)定制藥敏卡對(duì)金黃色葡萄球菌體外藥敏、MRSA表型、紅霉素誘導(dǎo)克林霉素耐藥的篩選有高的準(zhǔn)確性,AES對(duì)苯唑西林、克林霉素的修正結(jié)果可以有效避免抗菌藥物的錯(cuò)誤選擇,存在很好的可靠性,且實(shí)現(xiàn)了自動(dòng)化,是微生物日常工作中理想的檢測(cè)工具。但由于本研究納入的菌株數(shù)量較少,只對(duì)部分抗菌藥物進(jìn)行評(píng)估,結(jié)果存在一定的局限性,為使研究結(jié)果更加準(zhǔn)確可靠,有待增加菌株和抗菌藥物以作進(jìn)一步研究。

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