韓穎,周宏宇,李子孝,3,4,5
高脂血癥是心血管疾病的主要危險因素之一,而血脂水平是心血管疾病的可遺傳、可改變的危險因素,HDL-C、LDL-C、TG和TC的遺傳率在40%~60%[1]。一項大型全基因組研究發(fā)現(xiàn)了157個與血脂水平相關(guān)的基因座,但是這些位點僅可解釋12%的血脂個體間變異[2]。還有其他因素可能對血脂水平的遺傳與變異產(chǎn)生影響,其中包括表觀遺傳修飾。DNA甲基化是最常見的表觀遺傳修飾形式。既往研究表明,DNA甲基化在肥胖、血脂異常、2型糖尿病等代謝性疾病中發(fā)揮重要作用[3]。利用整體DNA甲基化、位點特異性甲基化和全表觀基因組關(guān)聯(lián)研究(epigenome-wide association studies,EWAS)方法,DNA甲基化與脂質(zhì)水平的關(guān)系已經(jīng)被廣泛研究。還有研究發(fā)現(xiàn)外界因素(如藥物)可能通過改變DNA甲基化影響血脂水平。然而,目前這些研究的結(jié)論并不一致,DNA甲基化與血脂的因果關(guān)系還未明確。
本文綜述了DNA甲基化與血脂水平之間關(guān)系的現(xiàn)有研究成果,包括飲食、環(huán)境因素和降脂藥物對兩者關(guān)系的影響,并對未來的研究方向進(jìn)行展望。
目前,表觀遺傳學(xué)研究發(fā)現(xiàn)較多基因的甲基化水平與脂質(zhì)水平有關(guān),本文主要介紹已經(jīng)被廣泛研究證實的相關(guān)基因,包括肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶1A(carnitine palmitoyl transferase 1 A,CPT1A)基因、三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運體G1(adenosine triphosphate binding cassette transporter G1,ABCG1)基因、固醇調(diào)控元件結(jié)合蛋白1(sterol regulatory element-binding factor 1,SREBF1)基因、腫瘤壞死因子誘導(dǎo)蛋白3相互作用蛋白1(tumor necrosis factor α-induced protein 3-interacting protein 1,TNIP1)基因、24-脫氫膽固醇還原酶(3-β-hydroxysteroid-Δ-24-reductase,DHCR24)基因,同時簡要介紹其他脂質(zhì)相關(guān)基因的研究成果。
1.1 肉堿棕櫚酰轉(zhuǎn)移酶1A基因 通過線粒體進(jìn)行的脂肪酸β-氧化是脂肪酸分解代謝的主要途徑,CPT1位于線粒體外膜,是長鏈脂肪酸從線粒體膜外轉(zhuǎn)運到膜內(nèi)的關(guān)鍵酶。人體內(nèi)存在3種組織特異性CPT1亞型,分別位于肝臟(CP T1A)、肌肉(CP T1B)和大腦(CPT1C)[4-5]。2014年,有研究者對991例降脂藥物遺傳學(xué)和飲食網(wǎng)絡(luò)研究參與者(發(fā)現(xiàn)隊列)進(jìn)行了EWAS分析,發(fā)現(xiàn)CPT1A基因的4個胞嘧啶-磷酸-鳥嘌呤(c y tosinephosphate-guanine,CpG)位點(cg00574958、cg17058475、cg01082498和cg09737197)的甲基化與TG水平和CPT1A的表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。在復(fù)制隊列中進(jìn)一步證實了cg00574958位點與TG水平的相關(guān)性,該位點分別解釋了發(fā)現(xiàn)隊列和復(fù)制隊列中TG變化的11.6%和5.5%[6]。CPT1A基因與TG的負(fù)相關(guān)性在之后的多項研究中被進(jìn)一步證實[7-9]。還有研究在男性家族性高膽固醇血癥的基因突變陰性患者中,發(fā)現(xiàn)cg00574958位點甲基化與LDL-C水平呈負(fù)相關(guān)[9]。
目前CPT1A基因甲基化與脂蛋白水平因果關(guān)系尚不明確。在目前研究脂質(zhì)變化與表觀遺傳學(xué)機制相互作用和因果關(guān)系的方法中,以孟德爾隨機化使用最廣泛[10-11]。孟德爾隨機化指用遺傳變異來確定某因素和結(jié)果之間的觀察性關(guān)聯(lián)是否與因果關(guān)系一致。有研究者使用孟德爾隨機化方法發(fā)現(xiàn)CPT1A基因甲基化變異是TG水平變化的結(jié)果而不是原因,TG水平越高,cg00574958和cg17058475位點的甲基化水平越低,同時CPT1A的表達(dá)水平越高[12-13]。而另一項雙向孟德爾隨機化研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),空腹TG水平對CPT1A基因cg00574958位點甲基化有影響,但反過來后者對TG水平也有影響,該研究提示了人體脂質(zhì)穩(wěn)態(tài)機制的復(fù)雜性[14]。
1.2 三磷酸腺苷結(jié)合盒轉(zhuǎn)運體G1基因 脂代謝中的逆轉(zhuǎn)運途徑是指HDL顆粒將膽固醇從外周組織轉(zhuǎn)運到肝臟。在動脈粥樣硬化斑塊處,巨噬細(xì)胞吞噬氧化的LDL-C后,通過細(xì)胞膜上的ATP結(jié)合盒轉(zhuǎn)運體(adenosine triphosphate binding cassette transporter,ABC)(包括ABCA1和ABCG1)將膽固醇轉(zhuǎn)移到HDL顆粒中。HDL顆粒是逆轉(zhuǎn)運途徑的關(guān)鍵參與者,具有降解動脈粥樣硬化斑塊和防止新斑塊形成的作用[15]。多項關(guān)于DNA甲基化和脂質(zhì)水平的研究發(fā)現(xiàn),ABCG1基因的cg06500161位點甲基化與HDL-C水平負(fù)相關(guān),與TG水平正相關(guān)[8,16-17],另外有研究在男性高膽固醇血癥患者的白細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)了ABCG1-CpGC3與LDL-C的負(fù)相關(guān)性[18]。進(jìn)一步的研究表明,肥胖患者ABCG1基因cg06500161位點的甲基化與該基因的低轉(zhuǎn)錄活性有關(guān),同時與高TG水平和TG/HDL-C比例增高有關(guān)[19]。ABCG1基因低表達(dá)還被報道與脂蛋白脂肪酶(lipoprteinlipase,LPL)的生物利用度和活性降低有關(guān),后者的主要作用是水解TG[20]。一項孟德爾隨機化研究表明,低TG水平或高HDL-C水平均可誘導(dǎo)ABCG1的cg06500161和cg27243685位點低甲基化,該基因低甲基化與ABCG1的高表達(dá)有關(guān),該研究結(jié)果提示,脂質(zhì)水平改變可以誘導(dǎo)ABCG1的DNA甲基化[12]。
外周組織細(xì)胞膜上的ABCA1參與膽固醇逆轉(zhuǎn)運途徑,在逆轉(zhuǎn)運過程中,ABC A1與ABCG1具有協(xié)同作用[15,21]。較多研究發(fā)現(xiàn),ABCA1基因甲基化與HDL-C水平負(fù)相關(guān)[22-24]。還有研究表明,老年人群(≥61歲)白細(xì)胞中的ABCA1基因甲基化與TG、TC、LDL-C水平正相關(guān)[25]。另一項研究發(fā)現(xiàn),妊娠期女性胎盤和臍帶血中ABCA1-CPG5基因甲基化與HDL-C和TG水平均呈負(fù)相關(guān)[26]。目前還缺乏ABCA1基因甲基化與脂質(zhì)水平因果關(guān)系的孟德爾隨機化研究。
1.3 固醇調(diào)控元件結(jié)合蛋白1基因 SREBF是一個調(diào)節(jié)脂質(zhì)穩(wěn)態(tài)的膜結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子家族,受TC水平的影響。SREBF可以直接激活合成和攝取膽固醇、脂肪酸、TG和磷脂等脂質(zhì)的基因表達(dá)。當(dāng)循環(huán)中膽固醇不足時,細(xì)胞內(nèi)的SREBF經(jīng)過一系列蛋白酶作用,與靶細(xì)胞固醇反應(yīng)元件(sterol regulatory element,SRE)結(jié)合并激活靶基因的轉(zhuǎn)錄。人體內(nèi)主要包含SREBF2和SREBF1c兩種SREBF蛋白,其中SREBF2優(yōu)先激活膽固醇代謝基因,而SREBF1c優(yōu)先激活脂肪酸和TG代謝基因[27]。
2015年一項針對1776例受試者的EWAS分析證明,血液中SREBF1基因cg11024682和cg20544516位點甲基化與TG水平正相關(guān),并且這種相關(guān)性在脂肪和皮膚組織中也存在[7]。之后的研究進(jìn)一步證明了SREBF1基因cg11024682位點甲基化水平與TG具有正相關(guān)性[8,17]。編碼于SREBF1內(nèi)含子17的微小RNA——miR33B是靶向膽固醇代謝和脂肪酸氧化相關(guān)途徑的基因[28-29],其蛋白產(chǎn)物可導(dǎo)致極低密度脂蛋白(very low density lipoprotein,VLDL)中TG含量的增加[30]。Dekkers等[12]通過孟德爾隨機化研究證明了SREBF1基因甲基化是TG升高的結(jié)果而不是原因。SREBF1基因還可以通過miR33B抑制ABCG1、CPT1A等基因的活性,降低ABCG1和CPT1A的表達(dá),從而影響脂質(zhì)代謝平衡[7]。
1.4 腫瘤壞死因子誘導(dǎo)蛋白3相互作用蛋白1基因TNIP1基因編碼T N I P1蛋白,既往研究發(fā)現(xiàn),TNIP1基因的cg22178392位點與LDL-C水平正相關(guān),與TG水平負(fù)相關(guān)[7]。另外,TNIP1蛋白是核受體中過氧化物酶體增殖物激活受體(peroxisome proliferatorsactivated receptors,PPARs)和維甲酸受體(retinoic acid receptors,RAR)轉(zhuǎn)錄活性的輔抑制因子[31-32]。研究發(fā)現(xiàn)PPARα/γ激活因子和PPARγ可以誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞中ABCA1的表達(dá)[33-34],而激活的RAR可以誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞中ABCA1和ABCG1的表達(dá)[35]。這些研究結(jié)果表明,TNIP1基因可能通過影響ABCA1和ABCG1基因的表達(dá)間接影響脂質(zhì)代謝。目前仍缺乏關(guān)于TNIP1基因甲基化與脂蛋白之間因果關(guān)系的研究。
1.5 24-脫氫膽固醇還原酶基因DHCR24基因編碼DHCR24,主要通過催化脫氫膽固醇轉(zhuǎn)化為膽固醇參與脂質(zhì)代謝[36-37]。2017年,Braun等[8]通過EWAS發(fā)現(xiàn)DHCR24基因cg17901584位點甲基化與HDL-C水平正相關(guān),與TG水平負(fù)相關(guān)。之后,另一項EWAS研究進(jìn)一步證實了cg17901584甲基化水平與HDL-C水平存在正相關(guān)性[16]。Dekkers等[12]通過孟德爾隨機化研究發(fā)現(xiàn),DHCR24基因cg27168858位點的甲基化水平與LDL-C正相關(guān),且LDL-C水平變化是DHCR24甲基化水平變化的原因。另一項孟德爾隨機化研究也發(fā)現(xiàn),DHCR24基因cg17901584位點甲基化是脂質(zhì)變化的結(jié)果而不是原因[13]。DHCR24的表達(dá)調(diào)控也是由SREBF介導(dǎo)的[38]。此外,DHCR24基因位于與膽固醇水平相關(guān)的PCSK9基因附近,因此有研究者提出DHCR24基因甲基化與HDL-C之間的關(guān)聯(lián)可能是由PCSK9單核苷酸多態(tài)性變異引起的[2]。
1.6 其他脂質(zhì)相關(guān)基因甲基化 Fas凋亡抑制分子2(Fas apoptotic inhibitory molecule 2,F(xiàn)AIM2)是一種肥胖相關(guān)基因,有研究探討了FAIM2啟動子甲基化與中國兒童肥胖和血脂異常的相關(guān)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn)FAIM2啟動子8個CpG位點的DNA甲基化水平與TG、TC、LDL-C水平正相關(guān),與HDL-C水平負(fù)相關(guān)[39]。瘦素(leptin,LEP)和脂聯(lián)素(adiponectin,ADIPOQ)基因編碼主要由脂肪組織分泌的脂肪因子,在肥胖導(dǎo)致葡萄糖和胰島素穩(wěn)態(tài)損害中發(fā)揮作用。Houde等[40]測量了73例嚴(yán)重肥胖患者的皮下脂肪、內(nèi)臟脂肪和血液樣本中LEP和ADIPOQ基因的DNA甲基化水平,發(fā)現(xiàn)這兩個基因甲基化與TC和LDL-C水平正相關(guān),與HDL-C水平負(fù)相關(guān)。
既往研究顯示,硫氧還蛋白相互作用蛋白(thioredoxin interacting protein,TXNIP)基因表達(dá)對脂代謝和糖代謝有影響。一項關(guān)于產(chǎn)前饑荒暴露與成年期血脂水平的研究發(fā)現(xiàn),TXNIP基因cg19693031位點甲基化與TG水平呈正相關(guān)[41],而另一項EWAS研究發(fā)現(xiàn),該位點甲基化與總血漿TG水平負(fù)相關(guān)[17]。針對cg19693031位點甲基化與基因表達(dá)的關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),該位點基因與脂質(zhì)相關(guān)基因SREBF1和ABCG1的表達(dá)相關(guān)[16]。
其他值得關(guān)注的脂蛋白相關(guān)基因,如胰島素樣生長因子2(insulin like growth factor 2,IGF2)基因編碼胰島素樣生長因子2,與TC水平正相關(guān)[42];細(xì)胞因子信號通路抑制因子3(suppressor of cytokine signaling 3,SOCS3)基因參與瘦素和胰島素信號傳導(dǎo),與TG水平負(fù)相關(guān),與HDL-C水平正相關(guān)[43];載脂蛋白A5(apolipoprotein A5,APOA5)基因與空腹和餐后TG水平正相關(guān)[6]。
截至目前,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了眾多可能與脂質(zhì)相關(guān)的甲基化基因,但關(guān)于這些基因的研究尚未形成統(tǒng)一觀點,上述基因的甲基化水平與脂質(zhì)水平相關(guān)性的因果關(guān)系及具體機制也未明確,未來還需更多針對性的研究進(jìn)行深入探索。
不良飲食習(xí)慣是高脂血癥的危險因素之一,飲食對血脂水平影響的表觀遺傳學(xué)機制被廣泛研究。既往有研究提示CPT1A基因cg00574958位點DNA甲基化與TG水平負(fù)相關(guān),Lai等[44]檢驗了碳水化合物(carbohydrate,CHO)和脂肪(fat,F(xiàn)AT)攝入量、總膳食能量百分比,以及CHO/FAT比值與CPT1A基因cg00574958位點甲基化和代謝性疾病風(fēng)險之間的關(guān)系,結(jié)果表明,CHO攝入量和CHO/FAT比值與cg00574958甲基化呈正相關(guān),而FAT攝入量與cg00574958甲基化水平呈負(fù)相關(guān)。同時,CPT1A表達(dá)水平與CHO攝入量呈負(fù)相關(guān),與FAT攝入量和TG水平呈正相關(guān)。中介分析支持CHO攝入誘導(dǎo)CPT1A基因甲基化,從而降低TG水平,而FAT攝入抑制CPT1A基因甲基化,從而提高TG水平。餐后血脂(postprandial lipemia,PPL)反應(yīng)是指高脂飲食后血漿TG濃度升高,是心血管疾病的獨立危險因素。Lai等[6]對979例受試者高脂飲食后血脂和DNA甲基化水平進(jìn)行EWAS分析后發(fā)現(xiàn),脂磷酸磷酸酶(lipid phosphate phosphatase,LPP)、CPT1A、APOA5、SREBF1和ABCG1基因的甲基化與PPL反應(yīng)正相關(guān),CPT1A甲基化與PPL反應(yīng)負(fù)相關(guān)。果糖攝入是另一個血脂異常的危險因素。有研究喂食大鼠果糖14周,發(fā)現(xiàn)CPT1A基因啟動子的甲基化程度升高,大鼠肝臟CPT1A的表達(dá)減少[45]。來自日本的一項研究發(fā)現(xiàn),女性攝入維生素會使ABCA1基因呈低甲基化,后者與HDL-C負(fù)相關(guān),研究者分析,維生素可能通過ABCA1基因低甲基化間接提高HDL-C的含量[23]。
環(huán)境也可以通過影響DNA甲基化改變血脂水平。環(huán)境內(nèi)分泌干擾物(environmental endocrine disrupting chemicals,EDCs),如廣泛應(yīng)用于人類各種消費品的對羥基苯甲酸酯、雙酚類和鄰苯二甲酸酯等,均可導(dǎo)致多種代謝性疾病。Lu等[46]通過測量24 h尿EDCs排泄物,對622例參與者進(jìn)行了基于血液的EWAS分析,發(fā)現(xiàn)了20個差異甲基化的CpG位點與EDCs相關(guān),其中酪酪肽(peptide tyrosine tyrosine,PYY)、MIR1246和鋅指蛋白641(zinc finger protein 641,ZNF641)等8個基因位點差異甲基化與血脂水平異常有關(guān)。砷是一種重要的環(huán)境污染物,多存在于受污染的飲用水中,與多種血管疾病的發(fā)生有關(guān)。有研究發(fā)現(xiàn),砷暴露可以通過氧化應(yīng)激介導(dǎo)DNA甲基轉(zhuǎn)移酶1的轉(zhuǎn)錄和活性上調(diào),導(dǎo)致ABCA1基因高甲基化,抑制巨噬細(xì)胞的膽固醇外流,從而影響脂代謝水平[47]。
目前DNA甲基化的分子機制仍未完全明確,通過改變DNA甲基化水平治療高脂血癥的研究還不充足。青錢柳多糖是從中國特有的植物——青錢柳中提取的生物大分子物質(zhì),已被發(fā)現(xiàn)具有抗癌、抗菌、抗高血脂、抗氧化和抗炎等多種生物活性。Yang等[48]發(fā)現(xiàn),對高脂乳劑誘導(dǎo)的高脂血癥小鼠應(yīng)用高濃度青錢柳多糖后,小鼠肝臟全基因組DNA甲基化水平降低,并通過調(diào)節(jié)腺苷酸激活蛋白激酶(adenosine 5’-monophosphateactivated protein kinase,AMPK)激活的蛋白激酶信號通路、脂肪酸代謝通路、脂肪酸生物合成通路和脂肪細(xì)胞因子信號通路,最終起到降低血脂的作用。非諾貝特是一種用于治療血脂異常的PAR-α抑制劑,具有良好的抗炎作用。Yusuf等[49]對接受每日160 mg非諾貝特治療患者的炎癥反應(yīng)進(jìn)行了表觀基因組研究,發(fā)現(xiàn)KIAA1324L、鞘磷脂磷酸二酯酶3(sphingomyelin Phosphodiesterase 3,SMPD3)、突觸足蛋白2(synaptopodin 2,SYNPO2)、白細(xì)胞介素增強子結(jié)合因子3(interleukin enhancer binding fac tor 3,ILF3)、富脯氨酸3(prolinerich polypeptides 3,PRR3)、G蛋白核仁1(guanine nucleotide binding protein like 1,GNL1)、序列相似度為50的家族成員B(family with sequence similarity 50 member B,F(xiàn)AM50B),以及幾個基因間區(qū)域的CpG位點甲基化與炎癥細(xì)胞因子的血漿濃度變化顯著相關(guān)。羥甲基戊二酰輔酶A(DL-3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A disodium,HMG-CoA)還原酶抑制劑(他汀類)降脂藥物被廣泛用于心腦血管疾病,有研究認(rèn)為,他汀類藥物對人體的表觀遺傳修飾也有影響[50]。Ochoa-Rosales等[51]的研究發(fā)現(xiàn),使用他汀類藥物與DHCR24、ABCG1和甲基甾醇單加氧酶1(methylsterol monooxygenase 1,MSMO1)基因甲基化水平改變有關(guān),其中他汀類藥物暴露與ABCG1基因甲基化升高和ABCG1表達(dá)降低相關(guān),并能誘發(fā)糖尿病等代謝性疾病。
綜上所述,目前的研究發(fā)現(xiàn)DNA甲基化水平與血脂水平改變存在相關(guān)性,并且已在多個隊列中得到驗證。兩者之間的因果關(guān)系可以用孟德爾隨機化研究方法來檢驗,現(xiàn)有的研究結(jié)果更多傾向于DNA甲基化是脂質(zhì)水平改變的結(jié)果而不是原因,但是研究證據(jù)尚不充分。目前該領(lǐng)域的大型研究主要為橫斷面研究,研究地區(qū)主要集中在西方國家,研究結(jié)論也尚未統(tǒng)一。未來研究還應(yīng)繼續(xù)探究DNA甲基化與血脂水平相關(guān)性的因果關(guān)系及其具體機制,以探索DNA甲基化在高脂血癥的診斷和治療等臨床實踐中的應(yīng)用價值。
【點睛】綜述現(xiàn)有針對DNA甲基化與血脂水平關(guān)系的研究結(jié)果,包括飲食環(huán)境因素和降脂藥物對兩者關(guān)系的影響,并展望未來研究方向。