文爽爽 王留強(qiáng) 盧孟柱
關(guān)鍵詞:PagWOX11/12a;銀腺楊;節(jié)間伸長(zhǎng);株高;功能分析
中圖分類號(hào):S718.46 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):1001-1498(2023)01-0039-08
WUSCHEL-related homeobox(WOX)家族是真核生物中Homeobox(HB)轉(zhuǎn)錄因子超家族的成員,該家族成員均含有同源異型結(jié)構(gòu)(Homeodomain, HD),且為植物特異性轉(zhuǎn)錄因子。擬南芥(Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.)WOX家族共有15個(gè)成員,這些成員可分成3個(gè)分支:現(xiàn)代/WUS型分支(WUS、WOX1-7)、中間型分支(WOX8-9、WOX11-12)和古老型分支(WOX10、WOX13-14)。除WOX7外,現(xiàn)代/WUS型分支的成員中均含有1個(gè)特定的WUS-box結(jié)構(gòu)域,該結(jié)構(gòu)域在中間型分支及遠(yuǎn)古型分支成員中并不完整。
WOX基因家族的成員參與調(diào)控了植物體不同的生長(zhǎng)發(fā)育過程,它們?cè)谡{(diào)節(jié)細(xì)胞增殖和分化方面發(fā)揮著重要功能,同時(shí)也參與了植物頂端分生組織和干細(xì)胞的維持、側(cè)生器官和花器官的形成、胚胎發(fā)育、激素信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和逆境響應(yīng)等過程。擬南芥WUS蛋白可以通過和SHOOT MERISTEMLESS(STM)的相互作用,增強(qiáng)WUS對(duì)CLAVATA3(CLV3)基因啟動(dòng)子的結(jié)合能力,二者共同調(diào)控CLV3的表達(dá),維持干細(xì)胞穩(wěn)態(tài)。同時(shí),AtWOX1基因也可以調(diào)控CLV3基因的表達(dá),且能通過調(diào)節(jié)脫羧酶蛋白(Decarboxylase,SAMDC)活性以及多胺的穩(wěn)態(tài),參與擬南芥分生組織的發(fā)育。AtWOX4基因可以促進(jìn)原形成層的發(fā)育,調(diào)節(jié)植物的側(cè)向生長(zhǎng)。毛白楊Pto WOX5a基因可以調(diào)控楊樹不定根的發(fā)育,過表達(dá)該基因能夠增加轉(zhuǎn)基因楊樹不定根的數(shù)量。過表達(dá)WOX14可以促進(jìn)擬南芥體內(nèi)赤霉素的積累,促進(jìn)花序莖中的維管細(xì)胞分化及木質(zhì)化。過表達(dá)毛白楊WOX11/12a基因可以促進(jìn)形成層的發(fā)育,影響楊樹木質(zhì)部分化。
楊樹(Populus)是重要的速生造林樹種,同時(shí)也是木本植物分子生物學(xué)研究的模式植物。已有報(bào)道指出,WOX11/12基因可以調(diào)控植物的根系發(fā)育和莖部次生生長(zhǎng),并能參與植物對(duì)非生物脅迫的響應(yīng),這表明WOX11/12基因在植物生長(zhǎng)發(fā)育中起著重要作用。為明確WOX11/12基因?qū)顦淦渌M織及器官生長(zhǎng)發(fā)育的作用,本研究以非轉(zhuǎn)基因銀腺楊(Populus alba×P.glandulosa,即‘84K)和PagWOX11/12a顯性抑制轉(zhuǎn)基因楊樹(35S::Pag WOX11/12a-SRDX)為材料,研究了顯性抑制該基因后楊樹高生長(zhǎng)及莖中細(xì)胞長(zhǎng)度的變化趨勢(shì),揭示了Pag WOX11/12a基因?qū)顦淝o部生長(zhǎng)發(fā)育的影響,為進(jìn)一步探討其作用機(jī)制提供參考。
1材料與方法
1.1研究材料
本研究以84K楊和35S::Pag WOX11/12a-SRDX(DR)轉(zhuǎn)基因楊樹為研究材料,35S::Pag WOX11/12a-SRDX是由編碼SRDX肽的核酸序列與Pag WOX11/12a的cDNA融合構(gòu)建的載體轉(zhuǎn)化84K楊所得到的轉(zhuǎn)基因苗,該載體可以特異性抑制目標(biāo)基因的表達(dá),該轉(zhuǎn)基因苗由前期研究獲得,組培苗保存于中國林業(yè)科學(xué)研究院林木遺傳育種國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。上述組培苗在生根培養(yǎng)基中培養(yǎng),培養(yǎng)基組成為:1/2 MS(Murashige& Skoog Basal Medium w/Vitamins)基礎(chǔ)培養(yǎng)基、0.05 mg·L-13-吲哚丁酸(3-indole butyric acid,IBA)、0.02 mg·L-1萘乙酸(Naphthylacetic acid,NAA)及5 mg·L-1瓊脂粉(pH=5.8~6.0)。組培苗培養(yǎng)于人工氣候室(溫度:24±1℃;光周期:16 h/8 h光照,黑暗;相對(duì)濕度:50%~60%:光照強(qiáng)度:55~65μmol·m-2·s-1)。待生長(zhǎng)21 d后,將組培苗轉(zhuǎn)入營(yíng)養(yǎng)土(土壤:珍珠巖= 3:1)中,并置于溫室培養(yǎng)。
本研究中定量試劑盒SYBR PremixExTaqTMKit及反轉(zhuǎn)錄試劑盒PrimeScriptTMRT reagent Kit購自TaKaRa,RNA提取試劑盒(RNAprep pure Plant Kit)購自QIAGEN。
1.2研究方法
1.2.1生物信息學(xué)分析 使用在線網(wǎng)站ExPASy(https://web.expasy.orglprotparaml)分析PagWOX11/12a蛋白的理化性質(zhì)。利用植物基因組網(wǎng)站(https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html)獲得毛果楊(Populus trichocarpa Torr.&Gray) WOX基因家族的氨基酸序列。84K楊基因組獲取于Figshare database( https://doi.org/10.6084/m9.figsh are.12369209),利用本地BLAST獲得84K楊中WOX基因家族的蛋白序列。使用MEGA 11軟件,根據(jù)鄰接法(Neighbor-joiningmethod)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,節(jié)點(diǎn)旁的數(shù)字表示基于1000次重復(fù)次數(shù)的自展值(Bootstrap)。
1.2.2基因組織表達(dá)特異性分析 利用RNA提取試劑盒提取生長(zhǎng)60 d的84K楊不同組織的總RNA,包括莖部木質(zhì)部、韌皮部及形成層、成熟葉、1/2株高處莖部、主根和側(cè)根,提取方法參照說明書。分別用Nanodrop8000和1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RNA的濃度及質(zhì)量。利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒合成cDNA,反應(yīng)體系及條件參照說明書。通過在線網(wǎng)站(https://sg.idtdna.com/Scitools/Applications/RealTimePCR/)設(shè)計(jì)PagWOX71/72a的定量引物PagWOX11/12a-RT-F和PagWOX11/12a-RT-R(表1)。利用SYBR Premix Ex TaqTMKit(TaKaRa)定量試劑及實(shí)時(shí)熒光PCR儀器Light Cycler 480(Roche Applied Science, Penzberg,Germany)進(jìn)行qRT-PCR分析。選用PagActin作為內(nèi)參基因,且進(jìn)行3次生物學(xué)重復(fù)和3次技術(shù)重復(fù),相對(duì)表達(dá)量根據(jù)2-△△CT方法進(jìn)行計(jì)算。
1.2.3轉(zhuǎn)基因植株表型鑒定 分別選取84K、DR1和DR9各9株長(zhǎng)勢(shì)一致的組培苗移入營(yíng)養(yǎng)土中,并將其置于溫室培養(yǎng)。拍照記錄其表型變化,測(cè)量植株在培養(yǎng)第7、14、21、28天后的株高及節(jié)間數(shù),統(tǒng)計(jì)第28天時(shí)前9節(jié)間的節(jié)間長(zhǎng)度。上述實(shí)驗(yàn)均進(jìn)行3次生物學(xué)重復(fù)。
1.2.4莖段解剖結(jié)構(gòu)分析 選取生長(zhǎng)28 d的植株第9節(jié)間莖段進(jìn)行解剖結(jié)構(gòu)分析。于第9節(jié)間莖段中部取約0.5~1 cm的材料,使用5%瓊脂糖包埋后,將其水平放置固定于樣品架上,通過震蕩切片機(jī)(LEICA VT1000)進(jìn)行縱切,切片厚度設(shè)置為40 pm。將切片置于去離子水中等待后續(xù)觀察。觀察莖段解剖結(jié)構(gòu)時(shí)使用0.05%甲苯胺藍(lán)O(Toluidine blue O,TBO)進(jìn)行染色,待染色結(jié)束后用去離子水對(duì)樣品進(jìn)行沖洗;隨后,用OlympusBX51顯微鏡進(jìn)行觀察并及時(shí)拍照,利用ImageJ軟件測(cè)量照片中髓心及韌皮部細(xì)胞的長(zhǎng)度。
1.2.5纖維離析 將生長(zhǎng)28 d的植株相同節(jié)間莖段切成1 cm長(zhǎng)度,去除樹皮,并將莖段置于離析液(30%過氧化氫:去離子水:冰乙酸=1:4:5)中,樣品至少在56℃金屬浴中放置72 h;隨后用去離子水將樣品洗滌3~5次,并浸泡過夜;最后將樣品搗碎,使用TBO進(jìn)行染色并吸取適量混懸液至載玻片中,置于Olympus BX51顯微鏡下觀察、拍照,通過Image J軟件測(cè)量木質(zhì)部纖維細(xì)胞的長(zhǎng)度。
1.2.6數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) 使用軟件IBM SPSS Statistics23對(duì)統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,使用f檢驗(yàn)法分析差異顯著水平。
2結(jié)果與分析
2.1 84K楊WOX基因家族的鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析
毛果楊PtWOX基因家族共有18個(gè)成員。利用從Phytozome網(wǎng)站獲取的Pt WOX基因序列在84K楊基因組數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行BLAST分析,最后在84K楊中鑒定出18個(gè)PagWOX基因家族成員?;赑tWOX和PagWOX的蛋白序列,利用鄰接法構(gòu)建了毛果楊和84K楊WOX家族的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(圖1)。根據(jù)構(gòu)建好的系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹,對(duì)84K楊PagWOX進(jìn)行命名。
2.2 Pag WOX11/12a序列分析
對(duì)Pag WOX11/12a基因的核酸及蛋白序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明:84K楊與毛果楊WOX11/12a基因的核酸序列相似度為96.88%,蛋白序列相似度為95.29%。Pag WOX11/12a基因編碼區(qū)長(zhǎng)度為768 bp,編碼的蛋白序列包含255個(gè)氨基酸,該蛋白的分子量約為28.18 kDa,等電點(diǎn)為5.30,脂肪系數(shù)為67.22,不穩(wěn)定系數(shù)為62.31,蛋白平均親水性(GRAVY)為-0.461。
2.3 Pag WOX11/12a基因組織表達(dá)特異性分析
為探究Pag WOX11/12a基因在84K楊不同組織中的表達(dá)情況,分別提取生長(zhǎng)60 d的84K楊的木質(zhì)部、韌皮部及形成層、成熟葉、1/2株高處莖部節(jié)間、主根和側(cè)根的總RNA,反轉(zhuǎn)錄后對(duì)各部位進(jìn)行qRT-PCR檢測(cè)。結(jié)果表明:PagWOX11/12a基因在各個(gè)部位中均有不同程度的表達(dá),在主根、側(cè)根及韌皮部和形成層中表達(dá)量較高,在葉片及莖段中也有一定的表達(dá)量,在木質(zhì)部中表達(dá)量最低(圖2)。
2.4轉(zhuǎn)基因植株表型分析
為了明確Pag WOX11/12a基因?qū)顦渖L(zhǎng)發(fā)育的影響,分別統(tǒng)計(jì)了非轉(zhuǎn)基因84K和DR轉(zhuǎn)基因植株在溫室生長(zhǎng)7、14、21和28 d后的表型(圖3)。通過統(tǒng)計(jì)不同株系的株高與節(jié)間數(shù)發(fā)現(xiàn),DR轉(zhuǎn)基因植株的株高在第7、14、21、28天時(shí)均顯著小于非轉(zhuǎn)基因84K,而二者的節(jié)間數(shù)則無明顯差異(圖3A,F(xiàn)~G)。同時(shí)比較了非轉(zhuǎn)基因84K和DR轉(zhuǎn)基因植株在第28天時(shí)前9節(jié)間的表型(圖3B)以及第1~3、4~6、7~9節(jié)間的變化(圖3 C~E),可見DR轉(zhuǎn)基因植株的節(jié)間長(zhǎng)度小于對(duì)應(yīng)84K的節(jié)間長(zhǎng)度。為進(jìn)一步明確各株系節(jié)間長(zhǎng)度的變化,測(cè)量了第28天時(shí)非轉(zhuǎn)基因84K和DR轉(zhuǎn)基因植株前9節(jié)間的長(zhǎng)度(圖3H)。結(jié)果表明:從第2節(jié)間開始,DR轉(zhuǎn)基因植株的節(jié)間長(zhǎng)度均顯著小于非轉(zhuǎn)基因84K。上述結(jié)果表明,顯性抑制Pag WOX11/12a基因抑制了楊樹節(jié)間的伸長(zhǎng)。
為進(jìn)一步明確Pag WOX11/12a基因?qū)顦淝o部生長(zhǎng)發(fā)育的影響,取生長(zhǎng)28 d的非轉(zhuǎn)基因84K和DR轉(zhuǎn)基因植株第9節(jié)間莖段,通過縱切切片觀察髓心和韌皮部細(xì)胞的結(jié)構(gòu)特征,并統(tǒng)計(jì)其長(zhǎng)度(圖4)。結(jié)果表明:DR轉(zhuǎn)基因植株的韌皮部細(xì)胞及髓心細(xì)胞與非轉(zhuǎn)基因84K相比,長(zhǎng)度均有不同程度的減?。▓D4A~C)。DR1和DR9的韌皮部細(xì)胞及髓心細(xì)胞長(zhǎng)度顯著小于非轉(zhuǎn)基因84K。與84K相比,DR轉(zhuǎn)基因株系DR1和DR9的韌皮部細(xì)胞分別減小了30%與21%,髓心細(xì)胞長(zhǎng)度分別縮短了25%及15%(圖4D、E)。
除了韌皮部及髓心外,木質(zhì)部也是楊樹莖段的重要組成,利用木質(zhì)部纖維離析對(duì)非轉(zhuǎn)基因84K和DR轉(zhuǎn)基因植株的木質(zhì)部纖維細(xì)胞長(zhǎng)度進(jìn)行了分析(圖5)。通過對(duì)木質(zhì)部纖維細(xì)胞的長(zhǎng)度統(tǒng)計(jì)(圖5D)可知:DR1和DR9的木纖維細(xì)胞與非轉(zhuǎn)基因84K相比,分別減小了26%與20%。上述結(jié)果表明,DR轉(zhuǎn)基因植株節(jié)間縮短是由莖中細(xì)胞長(zhǎng)度減小導(dǎo)致。
3討論
楊樹是我國重要的速生造林樹種,具有繁殖容易、生長(zhǎng)快等特性,是生產(chǎn)建筑、造紙工業(yè)及生物燃料生產(chǎn)的重要材料。同時(shí)其轉(zhuǎn)基因體系相對(duì)成熟,也是最早完成全基因組測(cè)定的樹種,是木本植物進(jìn)行分子生物學(xué)研究的模式樹種。研究參與調(diào)控楊樹生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)基因,對(duì)于楊樹的分子育種具有重要意義。本研究選取了與分生組織相關(guān)的WOX家族基因,以期明確Pag WOX11/12a基因?qū)顦涓呱L(zhǎng)發(fā)育的作用,進(jìn)而提高木材產(chǎn)量。
已有研究表明,毛果楊PtWOX基因家族共有18個(gè)成員,本研究利用84K楊的基因組信息,通過序列比對(duì)在84K中找到了18個(gè)同源序列,并構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(圖1)。通過序列分析發(fā)現(xiàn),PagWOX11/12a基因與毛果楊PtWOX11/12a基因序列相似度較高。
Pag WOX11/12a基因的組織表達(dá)特異性分析結(jié)果(圖2)表明,該基因在主根中的表達(dá)量最高,在側(cè)根中表達(dá)量也相對(duì)較高,這表明PagWOX11/12a基因可能影響楊樹根系發(fā)育。已有研究表明,在楊樹中過表達(dá)WOX11/12a可以促進(jìn)植物根系發(fā)育。同時(shí)該基因在韌皮部及形成層中也有較高的表達(dá)量,暗示該基因很有可能參與韌皮部及分生組織發(fā)育的調(diào)控。
植株的高度通常由節(jié)間數(shù)量及節(jié)間長(zhǎng)度決定。本研究對(duì)非轉(zhuǎn)基因84K及DR轉(zhuǎn)基因植株進(jìn)行表型分析(圖3),發(fā)現(xiàn)在不同時(shí)期內(nèi),二者的節(jié)間數(shù)量均無明顯差異,而DR轉(zhuǎn)基因植株的株高則顯著低于非轉(zhuǎn)基因84K,表明DR轉(zhuǎn)基因植株的節(jié)間長(zhǎng)度小于非轉(zhuǎn)基因84K。為明確PagWOX11/72a基因?qū)?jié)間長(zhǎng)度的影響,觀察并統(tǒng)計(jì)了在溫室生長(zhǎng)28d后非轉(zhuǎn)基因84K及DR轉(zhuǎn)基因植株的節(jié)間長(zhǎng)度(圖3B~E,H),結(jié)果顯示從第2節(jié)間開始,DR轉(zhuǎn)基因植株的節(jié)間長(zhǎng)度均低于非轉(zhuǎn)基因84K,且差異顯著。由此可知,PagWOX11/12a基因可以通過改變節(jié)間伸長(zhǎng)來影響植株高度,節(jié)間長(zhǎng)度的降低是DR轉(zhuǎn)基因植株矮化的主要原因。為更精準(zhǔn)的分析Pag WOX11/12a基因?qū)顦涓呱L(zhǎng)的影響,對(duì)楊樹莖段進(jìn)行了解剖學(xué)分析,通過觀察對(duì)比非轉(zhuǎn)基因84K與DR轉(zhuǎn)基因植株莖段縱切切片(圖4),發(fā)現(xiàn)DR轉(zhuǎn)基因楊樹莖中韌皮部細(xì)胞及髓心細(xì)胞長(zhǎng)度小于非轉(zhuǎn)基因84K,同時(shí)纖維離析結(jié)果(圖5)表明,與非轉(zhuǎn)基因84K相比,DR轉(zhuǎn)基因植株的纖維細(xì)胞的長(zhǎng)度也顯著變短。上述結(jié)果進(jìn)一步說明,DR轉(zhuǎn)基因植株節(jié)間長(zhǎng)度的降低是由莖中細(xì)胞長(zhǎng)度縮短所致,PagWOX11/12a基因可以通過影響楊樹莖中細(xì)胞長(zhǎng)度來控制節(jié)間伸長(zhǎng),進(jìn)而改變植株高度。已有研究表明,毛白楊PtoWOX11/12a基因可以影響楊樹莖的發(fā)育,改變轉(zhuǎn)基因植株株高及地徑,過表達(dá)毛白楊PtoWOX11/12a基因后可以促進(jìn)形成層細(xì)胞層數(shù)的增加,但會(huì)抑制木質(zhì)部的發(fā)育,表明Pto WOX11/12a基因可以影響形成層干細(xì)胞的活動(dòng)及木質(zhì)部的分化;而84K楊PagWOX11/12a基因可以通過調(diào)控韌皮部、髓心細(xì)胞及木質(zhì)部纖維細(xì)胞的伸長(zhǎng),影響植株的節(jié)間長(zhǎng)度,說明了WOX11/12a基因?qū)ηo生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)控途徑。前期已有研究表明,PagWOX11/12a基因可以促進(jìn)根系生長(zhǎng),增強(qiáng)植物的抗旱性及耐鹽性,而本研究指出,該基因也可以調(diào)控楊樹莖的生長(zhǎng)發(fā)育,進(jìn)一步明確了PagWOX11/12a基因?qū)顦渖L(zhǎng)發(fā)育新的調(diào)控途徑。
通過了解Pag WOX11/12a基因?qū)?jié)間伸長(zhǎng)的調(diào)控作用有助于提高木材產(chǎn)量。已有研究表明,莖段節(jié)間伸長(zhǎng)主要由生長(zhǎng)素(Auxin)、赤霉素(Gibberellins,GAs)、油菜素內(nèi)酯(Brassinosteroids,BRs)和獨(dú)角金內(nèi)酯(Strigolactones,SLs)等激素控制。雖然上述激素在莖段節(jié)間伸長(zhǎng)中發(fā)揮的作用不同,但它們的生物合成或信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過程均可能影響植株高度。后續(xù)可以通過測(cè)定激素含量進(jìn)一步明確PagWOX11/12a基因影響節(jié)間伸長(zhǎng)的途徑。
4結(jié)論
株高是林木遺傳育種中的重要性狀之一,本研究明確了PagWOX11/12a基因可以通過影響節(jié)間伸長(zhǎng)改變植株高度,通過統(tǒng)計(jì)韌皮部細(xì)胞、髓心細(xì)胞及木質(zhì)部纖維細(xì)胞的長(zhǎng)度可以得知,該基因?qū)?jié)間伸長(zhǎng)的抑制主要是通過控制莖中細(xì)胞長(zhǎng)度來實(shí)現(xiàn)的,上述結(jié)果對(duì)揭示PagWOX11/12a基因?qū)顦涞纳L(zhǎng)調(diào)控機(jī)制具有重要意義。