王力敏 王東陽 王丹 王海燕 王紅巖 王雪君 王斌 王旭初
摘 要 以‘華南8號木薯塊根膨大期的韌皮部和木質(zhì)部為材料,采用改進(jìn)酚抽法提取總蛋白,進(jìn)行一維和二維電泳,電泳圖譜經(jīng)Image Master分析,得到差異蛋白點(diǎn)進(jìn)行質(zhì)譜鑒定。結(jié)果表明:改進(jìn)酚抽法可以從木薯塊根韌皮部和木質(zhì)部中提取高質(zhì)量總蛋白,用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究;獲得分離性好、分辨率及重復(fù)性較高的雙向電泳圖譜;比較木薯塊根韌皮部和木質(zhì)部雙向電泳圖譜發(fā)現(xiàn)265個差異表達(dá)蛋白點(diǎn),其中29個在韌皮部特異表達(dá),17個在木質(zhì)部特異表達(dá);成功鑒定出8種差異蛋白,這些蛋白主要參與翻譯后修飾、無機(jī)離子和氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)代謝、分子伴侶和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等代謝通路。本研究初步比較木薯塊根韌皮部和木質(zhì)部的蛋白表達(dá)差異性,為進(jìn)一步從蛋白質(zhì)組水平研究木薯塊根膨大過程中淀粉轉(zhuǎn)運(yùn)、積累和合成調(diào)控機(jī)制奠定了技術(shù)基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞 木薯;塊根;韌皮部;木質(zhì)部;比較蛋白質(zhì)組學(xué);質(zhì)譜分析
中圖分類號 S533 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A
木薯(Manihot esculenta Crantz)是多年生熱帶亞熱帶淀粉作物,木薯塊根為其主要營養(yǎng)貯藏器官,淀粉含量高達(dá)40%,是南美洲、非洲、亞洲發(fā)展中國家重要的糧食來源[1-2]。除食用外,木薯淀粉還可以用作生產(chǎn)變性淀粉、酒精、山梨醇等工業(yè)原料,用途十分廣泛[3]。鑒于其巨大的經(jīng)濟(jì)價(jià)值,提高木薯產(chǎn)量及淀粉含量便成為各國木薯基礎(chǔ)研究的重要目標(biāo)。
木薯塊根淀粉合成和調(diào)控機(jī)制已在生理和基因工程方面取得了一定的研究進(jìn)展。研究人員對木薯塊根發(fā)育及淀粉積累做了一些生理方面的研究[4-5],并運(yùn)用基因工程手段來改變木薯根部淀粉合成相關(guān)基因如AGPase、SBE等的表達(dá)水平[6-8],對塊根中一些淀粉積累相關(guān)基因做了初步研究[9-10]。但在蛋白質(zhì)組水平上的研究報(bào)道相對較少。有少數(shù)研究者對木薯根部的蛋白表達(dá)做了初步研究,如Sheffield等[11]對木薯的塊根和須根做了比較蛋白組學(xué)分析;Li等[12]利用液相色譜-電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)(LC-ESI-MS/MS)從華南8號(SC8)木薯體細(xì)胞胚胎、幼苗和塊根組織中分離鑒定出383種蛋白,并對已鑒定蛋白的功能分類和組織特異性進(jìn)行分析,為從“組學(xué)”方法上大規(guī)模、系統(tǒng)性研究木薯提供了借鑒;施涯鄰等[13]對木薯根、莖、葉組織的蛋白提取方法進(jìn)行改進(jìn),將SDS提取法和TCA-丙酮法相結(jié)合可以制備出適合雙向電泳的蛋白樣品。目前,有關(guān)木薯的蛋白質(zhì)組學(xué)的研究主要集中在不同組織器官上,而對木薯塊根韌皮部和木質(zhì)部進(jìn)行細(xì)致的比較蛋白質(zhì)組學(xué)研究則鮮有報(bào)道。
在高等植物中,韌皮部含有篩管和伴胞復(fù)合體,擔(dān)任著從“源”(如葉片等)到“庫”(如塊根、種子等)運(yùn)輸光合產(chǎn)物的重要作用,而木質(zhì)部中含有大量的薄壁細(xì)胞,起著貯藏淀粉等營養(yǎng)物質(zhì)的作用[14-15]。木薯塊根是由纖維狀須根膨大發(fā)育形成,淀粉主要積累在其膨大的塊根木質(zhì)部中。在塊根膨大過程中,木薯地上部分形成的光合產(chǎn)物,由韌皮部運(yùn)輸?shù)礁?,?jīng)過卸載轉(zhuǎn)運(yùn)及淀粉再合成貯藏在薄壁細(xì)胞中。塊根的韌皮部和木質(zhì)部在此過程起著不同的作用,前者涉及光合產(chǎn)物的卸載和轉(zhuǎn)運(yùn),而后者則涉及淀粉再合成和貯藏積累。劉斌[16]對木薯塊根蔗糖卸載相關(guān)酶進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞壁酸性轉(zhuǎn)化酶(CWI)在質(zhì)外體卸載中起著關(guān)鍵作用。在塊根膨大后期,木質(zhì)部CWI活性和表達(dá)量較高,韌皮部則在膨大前期較高,且高淀粉品種CWI蛋白的表達(dá)量整體要高于低淀粉品種。光合產(chǎn)物從“源”到“庫”的運(yùn)輸和貯藏是一個復(fù)雜的、協(xié)調(diào)的系統(tǒng),對于木薯根部同化物如何卸載轉(zhuǎn)運(yùn)、淀粉高效積累貯藏以及整個生物學(xué)過程涉及的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制,目前還不是很清楚。本研究以華南8號(SC8)木薯膨大期塊根韌皮部及木質(zhì)部為材料,采用改進(jìn)酚抽法盡量減少塊根中多糖類和其他雜質(zhì)成分的干擾,以便提取到高質(zhì)量蛋白,系統(tǒng)建立木薯塊根韌皮部及木質(zhì)部蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)體系,為進(jìn)一步通過比較蛋白質(zhì)組學(xué)方法揭示木薯塊根發(fā)育和淀粉積累的調(diào)控機(jī)制提供技術(shù)基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料 SC8木薯種莖由中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶作物品種資源研究所提供。當(dāng)年3月中旬扦插種植,正常生長5個月左右,選取生長健壯植株,采集粗壯的木薯塊根,清洗干凈后切取塊根中間段,剝離塊根韌皮部和木質(zhì)部(圖1,A~D),液氮速凍,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.1.2 試劑 BPP法蛋白提取緩沖液:100 mmol/L Tris, 100 mmol/L EDTA, 50 mmol/L硼砂, 50 mmol/L 維生素C, 1% PVPP(W/V), 1% Triton X-100(V/V),2% β-巰基乙醇(V/V)和30%蔗糖(W/V), pH 8.0;蛋白裂解液: 7 mol/L 尿素, 2 mol/L 硫脲, 2% CHAPS(W/V), 13 mmol/L DTT, 1% IPG buffer(V/V);標(biāo)準(zhǔn)Laemmli buffer:62.5 mmol/L Tris-HCl ,2% SDS(W/V), 10% 甘油, 5 % -巰基乙醇(V/V), 0.001% 溴酚藍(lán)(W/V);膠條平衡液: 50 mmol/L Tris-HCl, 6 mol/L尿素, 30% 甘油(V/V), 2% SDS(W/V),0.002%溴酚藍(lán)(W/V); GAP凝膠染色液: 0.125%考馬斯亮藍(lán)G-250(W/V), 10% 硫酸銨(W/V), 5%磷酸(V/V), 30%(V/V)乙醇 , 10% 甲醇(V/V); 凝膠脫色液: 30%乙醇(V/V), 5%乙酸(V/V); 酶緩沖液: 1 mmol/L 氯化鈣, 25 mmol/L 碳酸氫銨, pH 8.5。
1.2 方法
1.2.1 蛋白提取 基于酚抽法[17]改進(jìn)的BPP法,具體參考Wang等[18]操作步驟。
1.2.2 蛋白定量 采用Bradford方法[19],每個樣品至少重復(fù)3次。
1.2.3 SDS-PAGE凝膠電泳 使用不連續(xù)膠SDS-PAGE法[20],濃縮膠濃度為4%,分離膠濃度為12.5%,每孔上樣量約為30 μg,與Laemmli buffer等體積混勻后上樣。電泳條件為16 ℃恒溫電泳3 h左右,參數(shù)設(shè)置為3 W/gel 50 min,6 W/gel 2 h。
二維凝膠電泳(2-DE):2-DE蛋白上樣量約為1 000 μg,上樣總體積為455 μL。蛋白樣品在水化盤內(nèi)使24 cm的pH 4-7線性IPG干膠條被動吸脹,水化16 h左右。等電聚焦程序設(shè)定為:250 V,3 h;500 V,2 h;1 000 V,1 h; 10 000 V,3 h;10 000 V,130 000 Vhr。聚焦結(jié)束后,用含1% DTT的平衡液和含4%碘乙酰胺的平衡液各平衡膠條15 min,平衡結(jié)束后在Ettan Daltsix電泳儀(GE Healthcare)中進(jìn)行第二向SDS- PAGE,16 ℃恒溫電泳4.5 h左右,電泳參數(shù)設(shè)置為1.5 W/gel 1 h,8 W/gel 3.5 h。
1.2.4 凝膠染色及圖像采集分析 凝膠染色采用改進(jìn)的考馬斯亮藍(lán)染色法[21]。染色后的凝膠用ImageScanner Ⅲ掃描儀(GE Healthcare)進(jìn)行掃描和圖像采集。用ImageMaster 2D Platinum軟件(GE Healthcare)進(jìn)行蛋白點(diǎn)檢測、凝膠匹配、將各個蛋白點(diǎn)的表達(dá)量歸一化后進(jìn)行比較分析,獲得差異表達(dá)蛋白。
1.2.5 蛋白點(diǎn)膠內(nèi)酶解 選取目標(biāo)差異蛋白,進(jìn)行膠內(nèi)酶解,具體參考簡化膠內(nèi)酶解方法[22]。對挖取的蛋白點(diǎn),酶解后收集上清液直接用于質(zhì)譜鑒定。
1.2.6 酶解產(chǎn)物質(zhì)譜鑒定及數(shù)據(jù)庫搜索 酶解產(chǎn)物質(zhì)譜鑒定采用Bruker公司的基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(MALDI-TOF MS/MS Ⅱ,Bruker),主要操作參考Shen等[23]的方法進(jìn)行。所得數(shù)據(jù)通過Mascot Distiller軟件分析,分析結(jié)果(即肽指紋圖譜PMF)利用Matrix science網(wǎng)站(http://www.matrixscience.com)進(jìn)行數(shù)據(jù)搜索和匹配。檢索條件為:數(shù)據(jù)庫(為NCBInr分類(Taxonomy)選擇綠色植物界,酶類型選擇胰蛋白酶,允許一個位點(diǎn)漏切, 固定修飾為Carbamidomethyl(C),可變修飾為Oxidation(M),肽段偏差為±300 ppm。軟件設(shè)定檢索得分閾值為72分,超過72分即認(rèn)為匹配達(dá)到>95%的可信度(p<0.05)。
2 結(jié)果與分析
2.1 木薯塊根韌皮部及木質(zhì)部總蛋白的1-DE及2-DE
采用BPP法從每克木薯塊根韌皮部和木質(zhì)部鮮重材料中可以提取得到(0.522±0.132)mg和(0.408±0.045)mg總蛋白(圖2-A),說明木薯塊根中蛋白含量很低,且韌皮部蛋白含量略高于木質(zhì)部。從1-DE結(jié)果(圖2-B)可以看出,蛋白條帶清晰,且分離性較好,沒有出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象,在高分子量區(qū)域(>100 ku)和低分子量區(qū)域(<20 ku)都可以檢測到明顯的蛋白條帶。另外,從塊根韌皮部和木質(zhì)部的1-DE圖譜中分別可以檢測到(49±2)和(46±1)條蛋白帶,而且2種組織的蛋白條帶圖譜很相似,個別條帶在豐度上出現(xiàn)差異(圖2-B 箭頭所指)。
從2-DE圖譜(圖3-A、B)上看,不管是塊根韌皮部還是木質(zhì)部,其凝膠背景都很干凈,蛋白點(diǎn)呈圓形或橢圓形,邊界清晰,基本無拖尾現(xiàn)象。應(yīng)用ImageMaster軟件對這2種組織蛋白的2-DE圖譜進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果從韌皮部中檢測出(1 068±49)個蛋白點(diǎn),從木質(zhì)部中檢測出(982±31)個蛋白點(diǎn)(圖3-C),韌皮部分離的蛋白點(diǎn)數(shù)比木質(zhì)部稍多,說明韌皮部中可能含有種類更為豐富的蛋白。對2-DE圖譜中的蛋白點(diǎn)的分布區(qū)域進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),2種組織的蛋白在不同pH值范圍分布相對較為均勻,而在pH 5~6范圍內(nèi)稍多(圖3-D)。2種組織的蛋白分子量主要集中在20~100 ku,低于20 ku和高于100 ku蛋白相對較少,在低于20 ku區(qū)域一些高豐度蛋白較多,尤其是在塊根木質(zhì)部中,高豐度蛋白分子量多集中在20 ku左右,而高于100 ku區(qū)域含有較多的低豐度蛋白(圖3-E)。
2.2 塊根韌皮部及木質(zhì)部蛋白質(zhì)組差異分析
為了研究木薯塊根2個不同組織部位蛋白表達(dá)模式的差異,利用ImageMaster軟件對同一發(fā)育時(shí)期塊根韌皮部和木質(zhì)部2-DE圖譜進(jìn)行比較分析,找到了265個差異表達(dá)的蛋白點(diǎn)(表達(dá)豐度變化1.5倍以上),包括46個組織特異性蛋白點(diǎn)及219個豐度差異蛋白點(diǎn)(圖4-A、B),在韌皮部發(fā)現(xiàn)了29個特異蛋白點(diǎn)(圖4-A),119個相對于木質(zhì)部表達(dá)上調(diào)的蛋白點(diǎn),在木質(zhì)部發(fā)現(xiàn)17個特異蛋白點(diǎn)(圖4-B),100個相對于韌皮部表達(dá)上調(diào)的蛋白點(diǎn)。這些差異蛋白點(diǎn)有可能與韌皮部和木質(zhì)部的不同代謝調(diào)控生理活動相關(guān)。因此,鑒定出這些差異蛋白信息將對于理解木薯塊根同化物轉(zhuǎn)運(yùn)和淀粉積累調(diào)控機(jī)制具有十分重要的參考價(jià)值。
2.3 差異蛋白點(diǎn)膠內(nèi)酶解及MALDI-TOF-MS分析
在木薯塊根韌皮部和木質(zhì)部2-DE凝膠上各選取7個重復(fù)性好且分離性好的代表性差異蛋白點(diǎn)進(jìn)行膠內(nèi)酶解,隨后進(jìn)行質(zhì)譜鑒定,獲得PMF圖譜(圖5-A)。從所得的PMF圖譜上看(圖5-A),主要肽段峰集中在800~2 500(m/z)之間,這樣的酶切片段更加有利于后續(xù)的數(shù)據(jù)庫搜索以及進(jìn)一步的二級質(zhì)譜分析。肽段主峰的信噪比較高,角蛋白峰(1 475.754)較少且信號較低,說明肽段抽提產(chǎn)物中含雜質(zhì)較少,無角蛋白污染。大多數(shù)蛋白的總肽段數(shù)在30~50左右,最高可達(dá)118條(表1),而且典型的胰蛋白酶自切峰(2 163.071)強(qiáng)度也較低,說明該方法中酶切效率也較高,自切程度低。由于熱帶作物木薯沒有專用蛋白數(shù)據(jù)庫,因此將質(zhì)譜結(jié)果通過Mascot Distiller軟件分析后,利用Matrix Science搜索引擎(http://www.matrixscience.com/search)在NCBInr綠色植物總庫中進(jìn)行搜索,最終有8個蛋白點(diǎn)的一級質(zhì)譜搜庫得分值超過了72分可信值(p<0.05),鑒定成功率在60%左右。
2.4 鑒定蛋白的生物信息學(xué)分析
在鑒定出的8個蛋白點(diǎn)中,有2個為組織特異性蛋白(Spot C1,Spot C8),其余蛋白點(diǎn)為組織表達(dá)差異蛋白。對搜庫得到的可信蛋白理論等電點(diǎn)和分子量與實(shí)驗(yàn)測得等電點(diǎn)和分子量進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)值和理論值基本一致,在雷達(dá)示意圖中比值都集中在1附近(圖5-B)。只有個別蛋白的等電點(diǎn)和分子量出現(xiàn)偏差,例如Spot C1,鑒定結(jié)果發(fā)現(xiàn)這些蛋白是某些蛋白的亞基,而執(zhí)行生物學(xué)功能的蛋白通常是由多亞基組成,在進(jìn)行變性膠電泳時(shí)可以將其各個亞基分離。因此,等電點(diǎn)和分子量會出現(xiàn)偏移現(xiàn)象。另外一些鑒定蛋白,如Spot C5,是葡萄物種的推測蛋白,將其氨基酸序列在NCBI數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行Blast比對,與其同源性較高的大多數(shù)蛋白基本都是18 ku熱激蛋白(18.2 ku class I heat shock protein)家族成員,從而確定該蛋白也屬于這一家族??梢园l(fā)現(xiàn),木薯塊根中尤其是木質(zhì)部中18 ku熱激蛋白表達(dá)量非常高(表1;圖4),這可能與木薯的優(yōu)良耐干旱特性密切相關(guān)。
同時(shí),利用NCBI中的COG數(shù)據(jù)庫對已鑒定蛋白進(jìn)行功能分類分析,發(fā)現(xiàn)蛋白功能可歸于5類:1)翻譯后修飾、蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)或分子伴侶相關(guān)(O), 有3個蛋白, 分別是C1,C5,C6; 2)無機(jī)離子轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝(P),有2個蛋白,分別是C2,C4;3)轉(zhuǎn)譯,核糖體結(jié)構(gòu)和生物起源,有1個蛋白;4)氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)和代謝,有1個蛋白;5)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制,有1個蛋白(表1;圖5-C)。
3 討論與結(jié)論
3.1 木薯塊根韌皮部和木質(zhì)部蛋白提取及雙向電泳方法的確定
植物蛋白提取技術(shù)一直是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的關(guān)鍵技術(shù),蛋白提取質(zhì)量的好壞會直接影響到后續(xù)實(shí)驗(yàn)的可靠性。不同的植物組織結(jié)構(gòu)及成分不同,適用的蛋白提取方法也不盡相同。木薯塊根尤其是木質(zhì)部中含有大量的淀粉及可溶性糖,而韌皮部中含有大量纖維成分,傳統(tǒng)的蛋白提取方法(如TCA/丙酮沉淀法[24-25])通常難以高效去除這些物質(zhì)獲得高純度蛋白,而且繁瑣的提取過程會增加蛋白損失率。酚抽法[26-27]可以選擇性將蛋白分離至酚相中,多糖、多酚及鹽分可以保留在水相中,得到純度較高的蛋白產(chǎn)物。采用BPP法優(yōu)化改進(jìn)了傳統(tǒng)酚抽法,其蛋白提取液中含有強(qiáng)除雜能力的試劑硼砂(Borax)和聚乙稀聚吡咯烷酮(PVPP),較高濃度的β-巰基乙醇和維生素C可以降低蛋白酶活性從而避免蛋白降解。本研究采用BPP蛋白提取方法,制備出適合雙向電泳的質(zhì)量較高的蛋白樣品。除了蛋白提取質(zhì)量的好壞會影響2-DE結(jié)果外,水化上樣、等電聚焦、膠條平衡、二向SDS-PAGE電泳及凝膠染色等技術(shù)環(huán)節(jié)也會對結(jié)果產(chǎn)生較大的影響。等電聚焦是否充分直接影響到蛋白一向分離效果,聚焦不足蛋白不能有效分離會導(dǎo)致橫向拖尾,聚焦過度同樣會出現(xiàn)橫向拖尾現(xiàn)象且易丟失低豐度點(diǎn)。在進(jìn)行木薯葉片蛋白質(zhì)組學(xué)研究發(fā)現(xiàn),蛋白上樣量在1~1.5 mg范圍時(shí),10 000 V電壓聚焦至130 000 Vh可以獲得較好的聚焦效果,得到較多的蛋白點(diǎn)[28]。因而將該聚焦條件應(yīng)用到木薯塊根時(shí),同樣獲得不錯的分離效果。同時(shí)考慮后續(xù)質(zhì)譜分析,采用具有高靈敏度和質(zhì)譜兼容性的改進(jìn)考馬斯亮藍(lán)染色法[21],獲得背景干凈,蛋白點(diǎn)圓形或橢圓形的木薯塊根2-DE圖譜。
3.2 鑒定蛋白的功能分析
所鑒定蛋白涉及到蛋白翻譯后修飾,無機(jī)離子和氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)代謝,分子伴侶以及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等生物學(xué)功能,可能與同化物在韌皮部卸載轉(zhuǎn)運(yùn),信號感受和遠(yuǎn)距離傳遞,糖代謝相關(guān)酶活性調(diào)控以及淀粉積累等生物學(xué)過程密切相關(guān)。
本研究發(fā)現(xiàn)已鑒定的8個蛋白中有2個是組織特異表達(dá)的,其中Spot C1鑒定為26S蛋白酶調(diào)節(jié)亞基,在韌皮部中特異表達(dá),而Spot C8為蛋白激酶,在木質(zhì)部中特異表達(dá),前者與蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)相關(guān),而后者與蛋白質(zhì)磷酸化相關(guān),功能分類上與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)。
抗壞血酸氧化酶(Spot C2)、MnSOD(Spot C4)和過氧化還原酶(Spot C6)都是生物體內(nèi)重要的抗氧化酶。植物即使在最佳的生長條件下也能通過新陳代謝途徑產(chǎn)生活性氧比如電子傳遞等途徑,過多的活性氧會使植物產(chǎn)生氧化損傷,而抗壞血酸氧化酶、MnSOD和過氧化還原酶能夠有效消除活性氧的產(chǎn)生,是阻止氧化脅迫的重要組分[29]。本研究中,抗壞血酸氧化酶、MnSOD和過氧化還原酶在木質(zhì)部中大量上調(diào)表達(dá),可能是木質(zhì)部中淀粉形成和貯藏過程會消耗大量的能量,由于能量消耗和無機(jī)離子轉(zhuǎn)運(yùn)過程中產(chǎn)生許多活性氧,而抗壞血酸氧化酶、MnSOD和過氧化還原酶大量表達(dá)就是為了消除活性氧的產(chǎn)生,避免對木薯塊根木質(zhì)部在淀粉積累過程中產(chǎn)生氧化脅迫,而使細(xì)胞內(nèi)氧化還原內(nèi)環(huán)境受到破壞,從而影響細(xì)胞的正常代謝和植物正常的生長發(fā)育過程。因此,初步推斷木薯塊根淀粉積累的過程中能夠促進(jìn)抗氧化蛋白的表達(dá)。
翻譯起始因子5A(Spot C3)是調(diào)控生物生長發(fā)育、衰老及環(huán)境適應(yīng)等的重要因子,有研究表明它是調(diào)控細(xì)胞增殖生長和衰老的重要分子開關(guān)[30]。對正在衰老的番茄花、子葉、果實(shí)和成熟的鳳梨果實(shí)的研究發(fā)現(xiàn)eIF5A的大量表達(dá),證實(shí)eIF5A與植物細(xì)胞衰老關(guān)系密切[30,31]。本研究中,翻譯起始因子5A在木薯塊根木質(zhì)部中大量上調(diào)表達(dá),可能與本試驗(yàn)取材是成熟的木薯塊根相關(guān),淀粉在木薯塊根木質(zhì)部薄壁細(xì)胞中大量積累,但同時(shí)有許多細(xì)胞不斷的衰老死亡,以此促進(jìn)了翻譯起始因子5A的表達(dá)。
谷氨酰胺合成酶(Spot C7)是一種控制氮代謝的酶,能夠吸收無機(jī)氮轉(zhuǎn)換為有機(jī)氮,能夠催化銨離子和谷氨酸相結(jié)合產(chǎn)生谷氨酸鹽,并伴隨有能量的消耗,而給植物供給營養(yǎng)[32]。研究表明,木薯塊根淀粉含量與谷氨酰胺合成酶是正相關(guān)[33]。本研究所鑒定的谷氨酰胺合成酶在木薯塊根木質(zhì)部的表達(dá)量高于韌皮部,結(jié)合已有的研究初步說明木薯塊根木質(zhì)部淀粉積累過程中,需要大量表達(dá)谷氨酰胺合成酶來調(diào)節(jié)體內(nèi)的氮代謝,促進(jìn)光合產(chǎn)物的運(yùn)輸和淀粉的有效合成及積累。
18 ku熱激蛋白Ⅰ(Spot C5)在木質(zhì)部中相對上調(diào)表達(dá),已有研究發(fā)現(xiàn)其與植物的水分脅迫應(yīng)答及耐旱特性相關(guān)[34]。該蛋白主要作為分子伴侶執(zhí)行功能,除了與植物水分脅迫應(yīng)答相關(guān)外,小分子熱激蛋白還可以提高植物的耐寒性[35],為提高木薯的抗寒能力提供了一個新思路。
木薯塊根主要是由于少數(shù)(約3~10條)纖維狀須根的次級生長活動造成[36],形成層活動分化出大量次生薄壁細(xì)胞,使得根部迅速膨大[37],與此同時(shí)光合作用產(chǎn)生的大量糖類運(yùn)輸至薄壁細(xì)胞中,以淀粉形式積累貯藏。在此過程中,木薯塊根的韌皮部和木質(zhì)部的蛋白表達(dá)發(fā)生了相應(yīng)變化,從而調(diào)節(jié)淀粉積累過程的有效進(jìn)行。雖本研究結(jié)果為研究木薯塊根淀粉積累調(diào)控提供了一定的線索,但仍有許多差異蛋白未鑒定,這些蛋白中可能也存在著許多有價(jià)值的關(guān)鍵蛋白,需要在今后的研究中進(jìn)一步做功能鑒定分析。
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