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甲型流感病毒基質(zhì)蛋白M1的研究進展

2023-04-05 22:32:29孫藝學叢彥龍
中國獸醫(yī)學報 2023年2期
關(guān)鍵詞:質(zhì)膜絲狀殘基

孫藝學,叢彥龍

(1.長春大學 吉林省生物醫(yī)學工程研發(fā)中心,吉林 長春 130022;2.吉林大學 動物醫(yī)學學院,吉林 長春 130062)

甲型流感病毒(influenza A virus,IAV)屬于正黏病毒科、α流感病毒屬,是感染各種鳥類和多種哺乳動物的病原體。IAV基因組由8條分節(jié)段的、單股負鏈RNA組成,編碼至少17種蛋白[1]。其中,基質(zhì)蛋白1(matrix protein 1,M1)是IAV第7基因節(jié)段所編碼、294個氨基酸組成,且是病毒粒子內(nèi)含量最高的結(jié)構(gòu)蛋白,約占病毒蛋白總量的40%[2]。每個病毒粒子約含有3 000個M1分子[3],緊挨在病毒囊膜下層形成一層基質(zhì)。但M1并不是孤立存在的,其向外與IAV的兩種跨膜纖突蛋白血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)的胞質(zhì)尾區(qū)結(jié)合[4],向內(nèi)與病毒的8個核糖核蛋白(viral ribonucleoprotein,vRNP)互作[5]。M1不僅保持了病毒粒子的完整性,維持并調(diào)節(jié)病毒粒子的形態(tài),而且在病毒生命周期的不同階段發(fā)揮著多種功能[6-7]。

1 M1的結(jié)構(gòu)

在負染電鏡下,M1是長約60?的桿狀物,其與病毒囊膜接觸,但沒有嵌入膜內(nèi)[8]。高分辨率冷凍電子斷層掃描顯微鏡顯示,M1為空心圓柱體,類似一串螺旋盤升的“珠子”[9]。X射線分析顯示,約90%的M1的二級結(jié)構(gòu)由α-螺旋組成,具體包括3個結(jié)構(gòu)域,即由4個α-螺旋(H1~H4)構(gòu)成的氨基端結(jié)構(gòu)域(殘基1~66),由4個α-螺旋(H6~H9)構(gòu)成的中間結(jié)構(gòu)域(殘基88~158),以及預測的同樣由4個α-螺旋(H10~H13)構(gòu)成的羧基端結(jié)構(gòu)域(殘基167~252)。其中,氨基端結(jié)構(gòu)域和中間結(jié)構(gòu)域位于M1的N-末端,二者由L4-H5-L5連接,即所謂的“連接區(qū)”(殘基67~87)[2]。中間結(jié)構(gòu)域和位于C-末端的羧基端結(jié)構(gòu)域由一個環(huán)區(qū)L9(殘基162~166)連接,其間保守的163RQMV166基序具有Q-M裂解位點[10]。

2 M1在IAV復制周期中的功能

M1合成于IAV感染的晚期,在病毒生命周期中的脫殼、vRNP出核、病毒組裝和出芽等多個階段均發(fā)揮作用。

2.1 介導vRNP的釋放IAV進入細胞后需要將vRNP釋放到細胞質(zhì)以開啟病毒的復制周期,而拆除基質(zhì)層M1的骨架結(jié)構(gòu)(即病毒的脫殼)是vRNP釋放的前提條件。三維結(jié)構(gòu)分析表明,IAV的8段vRNP的排列方式是基于M1骨架結(jié)構(gòu)的支撐[11],但這種支撐作用在病毒復制周期中的不同階段時有時無。在pH6.0左右時,基質(zhì)層的構(gòu)象開始發(fā)生變化,使M1與vRNP的互作弱化,導致病毒粒子的剛性喪失[12],此時是病毒脫殼的啟動階段。當pH值下降至4.9時,M1骨架解體,不再靠近病毒囊膜,此時vRNP出現(xiàn)非對稱性定位,M1與vRNP形成一個聚集體,并促使vRNP進入細胞質(zhì)[9]。由此可見,M1與vRNP的互作與pH的改變有關(guān)。進一步研究發(fā)現(xiàn),在pH 6.5~7.0和5.0~5.5時,M1的電荷數(shù)明顯不同,由此導致病毒的結(jié)構(gòu)發(fā)生明顯變化[13]。

2.2 介導新組裝的vRNP出核研究發(fā)現(xiàn),當M1的合成受阻時,vRNP的出核將受到抑制[14],表明M1是子代vRNP出核的必需蛋白,同時也暗示新合成的M1需要入核才能幫助vRNP出核。研究顯示,在M1的多功能基序(殘基91~105)中,有富含堿性氨基酸的經(jīng)典核定位信號(nuclear localization signal,NLS),位于殘基101RKLKR105。在空間構(gòu)象上,NLS位于M1的N-末端結(jié)構(gòu)的表面,在α-螺旋H6和H7之間形成一個暴露的環(huán)。NLS是M1入核的關(guān)鍵因素,缺失NLS的M1不能入核[15]。新合成的M1在入核后,位于M1轉(zhuǎn)錄抑制區(qū)中的殘基R/K95、K98和K102可以與vRNP互作[16],調(diào)節(jié)vRNP中RNA聚合酶的活性,從而適時阻止vRNA的轉(zhuǎn)錄,以利于vRNP的順利出核。但是,新合成的M1并非全部入核,留在細胞質(zhì)中的部分M1能夠阻止已經(jīng)出核的vRNP再次入核[14]。

2.3 介導病毒的裝配和出芽M1被稱為IAV組裝的“適配器”。作為樞紐,M1通過與病毒的其他蛋白協(xié)同作用以誘導細胞質(zhì)膜彎曲,再通過與NP的互作將vRNP整合到出芽部位。M1與細胞質(zhì)膜結(jié)合和M1的寡聚化是病毒粒子組裝過程中兩個密切相關(guān)的過程。當M1單體(或二聚體)與質(zhì)膜結(jié)合后,會觸發(fā)M1在質(zhì)膜下重排形成螺旋狀的寡聚體,并暴露出另一側(cè)以便與未結(jié)合的M1分子互作[9]。結(jié)合到質(zhì)膜上的M1通過與HA、NA和/或M2的胞質(zhì)尾區(qū)互作,從而誘導質(zhì)膜彎曲,此即病毒的出芽位置。作為招募vRNP的??奎c,與質(zhì)膜結(jié)合的M1通過其C-末端與vRNP中的NP蛋白結(jié)合,由此將vRNP運送至質(zhì)膜處。在此,vRNP被選擇性地裝配到出芽的病毒粒子中[17]。

3 M1對IAV生物學表型的影響

3.1 維持病毒形態(tài)M1在出芽病毒粒子的囊膜下形成一層基質(zhì),為病毒囊膜提供剛性支撐。多項研究表明,M1是維持和調(diào)節(jié)IAV形態(tài)表型的決定性遺傳因素[18]。例如,將以絲狀表型為主的2009年新甲型H1N1流感病毒的M1基因替換到A/Puerto Rico/8/1934(H1N1)(PR8)中,可以使PR8由球形變?yōu)榻z狀[19]。此外,M1的氨基酸殘基突變也可以影響病毒粒子的形態(tài)表型。例如,N30D和T215A突變會使A/Duck/Guangxi/53/2002(H5N1)由球狀變?yōu)榻z狀。K102A突變的A/WSN/1933(H1N1)(WSN)可以形成絲狀粒子,而K95A、K98A、R101A、K102A的協(xié)同突變則可使WSN的形狀和大小各異,并且其形態(tài)表型會隨溫度改變[20]。R95K和E204D突變會降低A/Udorn/307/1972(H3N2)的絲狀表型[21]。將PR8經(jīng)豚鼠反復傳代后,它的M1逐漸出現(xiàn)87,92,101,157等位點的累積突變,最終使PR8由球形變?yōu)榻z狀[22]。但是,某些M1位點變異會導致病毒粒子出芽異常,由此釋放出更長的病毒粒子[23]。進一步研究發(fā)現(xiàn),在IAV組裝時,不同的M1螺旋轉(zhuǎn)角也會影響病毒的形態(tài)[9]。

3.2 影響病毒的復制研究顯示,M1能夠通過自身的代償性突變修復基因缺失病毒的復制力。例如,缺失NS1的WSN經(jīng)過連續(xù)傳代后發(fā)生M1/A14U變異,盡管M1的mRNA水平受到影響,但是病毒的其他蛋白表達水平均不受影響。NINPAN等[24]研究發(fā)現(xiàn),A/ostrich/Zimbabwe/222-E3/1996(H7N1)的NP蛋白在A549細胞中存在出核缺陷,但是NP的297位和M1的227位在傳至第10代的協(xié)同突變可以挽救病毒的復制缺陷。此外,M1的翻譯后修飾也影響病毒的復制。研究發(fā)現(xiàn),M1/242K的SUMO化在M1-vRNP復合體形成,vRNP出核、轉(zhuǎn)運、裝配,以及病毒的出芽過程中均發(fā)揮重要作用。當M1發(fā)生K242E突變時,M1與vRNP的結(jié)合能力降低,影響M1-vRNP復合體的形成和vRNP的出核,從而阻礙病毒的復制[25]。M1還可以發(fā)生磷酸化修飾。M1的絲氨酸、蘇氨酸和酪氨酸殘基可以被蛋白激酶C和細胞外信號調(diào)節(jié)蛋白激酶磷酸化[26]。磷酸化位點在M1入核和病毒復制中的作用至關(guān)重要。去除M1第132位的磷酸化,會損害M1與importin-α1的結(jié)合,從而因M1的入核受阻導致病毒的復制力下降[27]。

3.3 影響病毒的毒力M1是IAV毒力的基礎。例如,A/Port Chalmers/1/73、A/FPV/34、PR8和WSN在適應小鼠的過程中,M1的A41V突變能夠增強病毒對小鼠的致病力。FAN等[28]發(fā)現(xiàn),2株鴨源H5N1病毒均能致死雞,但只有1株對小鼠具有致病力。究其原因,發(fā)現(xiàn)M1的30和215位是影響H5N1病毒毒力的重要氨基酸位點。

3.4 影響病毒的傳播能力M1影響病毒傳播能力的證據(jù)基于2009年新甲型H1N1流感病毒。當將A/California/4/2009的M1基因替換到PR8時,能夠恢復PR8在豚鼠的傳播能力。二者的差別在于PR8的M1第41位編碼V,而A/California/4/2009的M1編碼A[19]。后經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),M1/41位是IAV有效傳播的重要位點[29]。由于M1/41位不僅影響病毒的形態(tài),還與傳播能力有關(guān),據(jù)此推測病毒的形態(tài)與其傳播能力有關(guān)。一般認為,天然的絲狀表型更有利于病毒的傳播[30]。

4 小結(jié)與展望

作為一種多功能蛋白質(zhì),M1在病毒復制過程中發(fā)揮著重要作用。與暴露在IAV表面的兩種糖蛋白HA和NA相比,IAV的內(nèi)部蛋白進化速度較慢,其中M1是進化最慢的蛋白之一。對全球不同物種來源的、不同亞型IAV的序列分析顯示,M1氨基酸的序列一致性超過95%[31]。較低的變異頻率可能是由于M1受到的選擇壓力強度較低,因此沒有必要經(jīng)常“變臉”。而更可能的原因是,M1的多功能角色使其對變異做出了自我約束,當然也可能是因為其自身承受不了過多的突變。此外,M1殘基的低突變耐受性也反映了其位點在病毒感染周期中的重要作用。作為豐度最高的IAV蛋白,M1的低突變耐受性暗示它在維持病毒結(jié)構(gòu)與功能方面所發(fā)揮的作用不容小覷。從M1蛋白的適應性著手,開展以M1各個變異表型功能為導向的分子基礎研究,有望成為解析IAV物種適應性差異和流行優(yōu)勢更迭的切入點。

此外,序列的高度保守性使M1成為一個理想的廣譜抗病毒靶點。據(jù)推測,通過一個小分子“楔形物”與M1-M1界面緊密結(jié)合,以此破壞M1的寡聚化,將產(chǎn)生一類全新的抗流感藥物。為了證明其可行性,KORDYUKOVA等[13]對一個超過70 000種的商用小分子庫進行了虛擬篩選,結(jié)果發(fā)現(xiàn)了有進一步研究價值的M1的“楔形物”抑制劑。生物物理學研究表明,一些抑制劑確實能夠通過與M1結(jié)合,由此削弱M1-M1的自締合作用,進而降低了成熟病毒粒子中基質(zhì)層的厚度,導致季節(jié)性H1N1、大流行性H1N1、H3N2和H5N1等多株流感病毒在雞胚中的復制受到抑制。因此,M1有望成為一個全新的抗流感廣譜藥物的理想靶點。

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