孫京京,黃建東
中國科學(xué)院深圳先進技術(shù)研究院深圳合成生物學(xué)創(chuàng)新研究院,廣東 深圳 518055
細菌外膜囊泡(outer membrane vesicle,OMV)是革蘭陰性菌生長過程中分泌的球形顆粒,直徑為20 ~ 250 nm,表面攜帶母體菌的外膜成分,如膜蛋白、脂多糖等,內(nèi)部包裹細菌蛋白質(zhì)、核酸等[1]。由于OMV 表面含有病原相關(guān)分子模式,可激活免疫系統(tǒng),具有作為疫苗載體的潛力。目前,采用腦膜炎球菌OMV 生產(chǎn)的疫苗已應(yīng)用于B 群流行性腦脊髓膜炎的預(yù)防[2]。近年,有研究將OMV 作為載體用于遞送核酸、藥物等[3],還將 OMV 作為抗原呈遞平臺,經(jīng)外膜蛋白將異源蛋白呈遞于OMV 表面,從而遞送至機體內(nèi),并獲得了較好的免疫效果[4]。目前的研究常用溶血素A(cytolysin A,ClyA)、外膜蛋白A(outer membrane protein A,OmpA)、外膜蛋白 W(outer membrane protein W,OmpW)等膜蛋白與抗原融合表達,將抗原定位至 OMV 表面[5?6]。質(zhì)譜研究證實,OMV 表面還攜帶其他外膜蛋白,如外膜蛋白C(outer membrane protein C,OmpC)[7],以O(shè)mpC 作為蛋白呈遞平臺將抗原定位至細菌OMV 表面的相關(guān)研究較少。因此,本研究將金黃色葡萄球菌EsxA抗原基因(esxA基因)與ompC基因進行重組,并經(jīng)原核細胞表達融合蛋白,高速離心法提取重組菌OMV,采用福流納米流式儀檢測OMV 表面的融合蛋白,探討OmpC 作為蛋白呈遞平臺將抗原定位至OMV表面的可行性。
1.1 菌株、基因及載體 感受態(tài)E.coliDH5α和E.coliBL21(DE3)均購自北京全式金生物技術(shù)股份有限公司;ompC基因片段及esxA基因均由深圳合成生物學(xué)創(chuàng)新研究院制備,載體pET21a由該研究院保存。
1.2 主要試劑及儀器 內(nèi)切酶SalⅠ、HindⅢ及T4 DNA連接酶均購自英國NEW ENGLAND BioLabs公司;PCR產(chǎn)物回收試劑盒、質(zhì)粒抽提試劑盒及PrimeSTAR Max DNA Polymerase 均購自日本 TaKaRa 公司;One Step Cloning試劑盒購自南京諾維贊生物科技股份有限公司;小鼠抗His?Tag單克隆抗體及HRP標記的山羊抗小鼠IgG 均購自美國Proteintech Group 公司;Al?exa Fluor 488 偶聯(lián)抗體購自美國 Abcam 公司;LB 培養(yǎng)基及IPTG 均購自上海阿拉丁生化科技股份有限公司;ECL 發(fā)光液、超濾管(100 KDa)、0.45 μm 濾膜及PVDF膜均購自美國Millipore公司;SDS?PAGE蛋白上樣緩沖液(5 ×)購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;福流納米流式儀購自廈門福流生物科技有限公司。
1.3 重組表達質(zhì)粒的構(gòu)建 將載體pET21a 經(jīng)SalⅠ限制性內(nèi)切酶線性化后,用One Step Cloning 試劑盒與ompC基因片段進行重組,于50 ℃孵育15 min,轉(zhuǎn)化感受態(tài)E.coliDH5α,于42 ℃孵育1 min;挑選陽性菌株,送深圳華大基因股份有限公司測序。取鑒定正確菌株,用質(zhì)粒抽提試劑盒提取含ompC基因的質(zhì)粒,將其及esxA基因均經(jīng)SalⅠ和HindⅢ雙酶切后,回收載體片段及目的基因片段,以T4 DNA 連接酶于室溫連接30 min;轉(zhuǎn)化感受態(tài)E.coliDH5α,于42 ℃孵育1 min;挑選陽性菌株,送深圳華大基因股份有限公司測序。取鑒定正確的菌株,用質(zhì)粒抽提試劑盒提取含ompC?esxA基因的重組表達質(zhì)粒。將空載體pET21a、含ompC基因的表達質(zhì)粒和含ompC?esxA基因的重組表達質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化感受態(tài)E.coliBL21(DE3),即為陰性對照菌、重組蛋白OmpC 重組菌和融合蛋白OmpC?EsxA重組菌,于42 ℃孵育1 min。
1.4 融合蛋白的表達 將3 個菌株于37 ℃振蕩培養(yǎng)過夜;按1∶100 的比例轉(zhuǎn)接至LB 培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)3 h;加入 IPTG 至終濃度為1 mmol/L,于30 ℃誘導(dǎo)培養(yǎng)5 h;11 973 ×g離心5 min,取沉淀,進行12%SDS?PAGE分析。
1.5 OMV的分離 將陰性對照菌和融合蛋白OmpC?EsxA 重組菌按1∶100 的比例分別轉(zhuǎn)接至LB 培養(yǎng)基,于37 ℃振蕩培養(yǎng)過夜;加入IPTG 至終濃度1 mmol/L,于30 ℃誘導(dǎo)表達16 h;于4 ℃,10 775 ×g離心20 min;收集上清,經(jīng)0.45 μm濾膜過濾,于4 ℃,50 000×g離心2 h;取沉淀,用PBS重懸,經(jīng)100 kDa截留的超濾管濃縮,即獲得OMV,取 5 μL OMV,用1 ×SDS?PAGE 蛋白樣品緩沖液重懸,進行12% SDS?PAGE分析。
1.6 融合蛋白定位至OMV表面的鑒定
1.6.1 Western blot 檢測 分別取陰性對照菌和融合蛋白OmpC?EsxA重組菌及1.5項提取的OMV各5 μL,用1 × SDS?PAGE 蛋白樣品緩沖液重懸,經(jīng)12%SDS?PAGE 分離后,轉(zhuǎn)移至PVDF 膜,用5%脫脂奶粉室溫封閉1 h;加入小鼠抗His?Tag 單克隆抗體(1∶5 000稀釋),4 ℃孵育過夜;TBST 洗滌3 次,加入HRP 標記的羊抗鼠IgG(1∶10 000 稀釋),室溫孵育1 h;TBST洗滌3次,ECL顯色。
1.6.2 納米流式檢測 將陰性對照菌OMV 和融合蛋白OmpC?EsxA重組菌OMV與小鼠抗His?Tag單克隆抗體按1∶100比例混合,于室溫孵育30 min;50 000×g離心2 h,去除多余抗體,標記Alexa Fluor 488偶聯(lián)抗體;標記的樣品用PBS 進行1∶1 000 稀釋,用福流納米流式儀檢測OMV表面融合蛋白的熒光強度。
2.1 重組表達質(zhì)粒的鑒定 含ompC基因的重組質(zhì)粒及含ompC?esxA基因的重組表達質(zhì)粒經(jīng)測序鑒定,與目標序列完全一致,見圖1(含ompC基因的重組質(zhì)粒測序圖略)。
圖1 含ompC?esxA基因的重組表達質(zhì)粒的測序結(jié)果Fig. 1 Sequencing results of recombinant expression plas?mid containing ompC?esxA gene
2.2 融合蛋白的鑒定 分別于相對分子質(zhì)量約54 000及39 000 處可見融合蛋白OmpC?EsxA 及重組蛋白OmpC 目的條帶(目的蛋白條帶上方可見1 條相對分子質(zhì)量約43 000 的非目的條帶,推測可能為重組蛋白OmpC 的前體蛋白),大小與預(yù)期相符;陰性對照未見該目的蛋白條帶。見圖2。
圖2 融合蛋白的SDS?PAGE分析Fig.2 SDS?PAGE profile of fusion protein
2.3 OMV 的鑒定 融合蛋白OmpC?EsxA 重組菌和陰性對照菌提取的 OMV 經(jīng) 12% SDS?PAGE 分析,均可見多條蛋白條帶,且前者總蛋白量高于后者,見圖3。
圖3 OMV總蛋白的SDS?PAGE分析Fig.3 SDS?PAGE profile of total protein of OMV
2.4 融合蛋白定位至OMV表面的鑒定
2.4.1 Western blot 檢測 融合蛋白OmpC?EsxA 重組菌及其OMV 中的融合蛋白可與小鼠抗His?Tag 抗體發(fā)生特異性結(jié)合,且于相對分子質(zhì)量約54 000 處可見特異性結(jié)合條帶,大小與預(yù)期相符;陰性對照未見該條帶。見圖4。表明融合蛋白OmpC?EsxA 成功定位于OMV。
圖4 OMV中融合蛋白OmpC?EsxA的Western blot檢測Fig.4 Western blotting of fusion protein OmpC?EsxA of OMV
2.4.2 納米流式檢測 融合蛋白OmpC?EsxA 重組菌OMV可被熒光抗體標記(877/17 522個顆粒),陰性對照OMV 未被熒光抗體標記(7/14 619個顆粒),見圖5。表明融合蛋白OmpC?EsxA成功定位至OMV表面。
圖5 OMV表面融合蛋白OmpC?EsxA的納米流式分析Fig.5 Analysis of fusion protein OmpC?EsxA of OMV sur?face by Flow NanoAnalyzer
OMV 具有多種生物學(xué)功能,如在生理條件下,OMV 可促進細菌對營養(yǎng)物質(zhì)的攝?。辉趹?yīng)激條件下,OMV 可促進有毒物質(zhì)包括錯誤折疊的蛋白、重金屬、抗生素等的排出;OMV 還可促進遺傳物質(zhì)(如耐藥基因)在細菌間的水平傳播。另外,對于致病菌,OMV 可介導(dǎo)毒力因子向宿主細胞的傳輸,從而破壞宿主的防御系統(tǒng),增強對宿主細胞的感染。
近年,OMV 的研究熱點逐漸從產(chǎn)生機制及生物學(xué)功能轉(zhuǎn)移至 OMV 疫苗的研發(fā)[8?9]。許多研究對致病菌產(chǎn)生的OMV 進行了抗感染試驗,包括假單銅綠胞菌、沙門菌、腦膜炎球菌等革蘭陰性菌,均取得較好的抗感染效果[2,10?11];另外,革蘭陽性菌,如金黃色葡萄球菌、肺炎鏈球菌、結(jié)核分枝桿菌等產(chǎn)生的OMV 也具有類似的抗感染效果[12?14]。目前,將 OMV改造為疫苗或藥物呈遞載體的研究也取得了較大進展,如有研究將金黃色葡萄球菌蛋白構(gòu)建為重組脂蛋白后,經(jīng)E.coliOMV包裹形成疫苗,該疫苗免疫小鼠后產(chǎn)生了較好的抗金葡菌感染作用[15];另有研究以E.coli外膜蛋白作為錨定蛋白將抗原定位至OMV上,常用的外膜蛋白有OmpA、ClyA、OmpW 等,均能有效呈遞抗原[16?19]。
本研究采用E.coli表達系統(tǒng)表達了OmpC 與金黃色葡萄球菌EsxA 抗原的融合蛋白;提取重組菌的OMV,經(jīng)Western blot 檢測和福流納米流式儀檢測表明,重組的融合蛋白可以O(shè)mpC 為載體將其定位至OMV 表面。有研究證明,OmpC 及 OmpA 均是 OMV中的通道蛋白,OmpC 可替代OmpA 用于抗原呈遞[20?21],本研究結(jié)果也證明了該結(jié)論的可行性。綜上所述,OmpC 作為蛋白平臺將抗原定位至OMV 表面具有可行性,有望用于抗原呈遞疫苗的研發(fā)。