蔣紅偉 田洪青
1臨沂市疾病預(yù)防控制中心,山東臨沂,276001;2山東第一醫(yī)科大學(xué)附屬皮膚病醫(yī)院(山東省皮膚病醫(yī)院),山東省皮膚病性病防治研究所,山東濟(jì)南,250022
艾滋病(acquired immunodeficiency syndrome,AIDS)是由人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)引起的慢性傳染病,近年來,男男性行為者(men who have sex with men, MSM)多性伴、無保護(hù)性行為較為普遍,已成為HIV傳播的重點(diǎn)人群[1-4],進(jìn)一步從源頭上探索對該人群有效的防控措施至關(guān)重要,大量研究表明趨化因子及其受體作為HIV感染的重要輔助受體,參與HIV感染宿主細(xì)胞甚至?xí)绊懓滩〉募膊∵M(jìn)程[5-8]。關(guān)于MSM人群趨化因子及其受體多態(tài)性與HIV感染相關(guān)文獻(xiàn)較少,工作中發(fā)現(xiàn)不是所有暴露于HIV的人都會(huì)被感染,少數(shù)有暴露史的MSM多性伴無保護(hù)性行為一直未被感染,這種抵抗現(xiàn)象與宿主基因多態(tài)性的關(guān)系有待進(jìn)一步明確,本調(diào)查通過檢測山東漢族MSM人群CCR5、CCR2、CXCR4、SDF1基因多態(tài)性變化,分析病例組和對照組基因型差異與HIV-1感染的關(guān)系,以更好地為本地區(qū)艾滋病防控工作提供參考依據(jù)。
1.1 研究對象 193例調(diào)查對象全部為山東漢族MSM,均有過MSM不安全性行為,依據(jù)是否感染HIV病毒分成病例組和對照組,病例組收集102例經(jīng)HIV-1抗體確證檢測陽性的患者,對照組納入91例HIV抗體篩查檢測呈陰性者。所有樣本來源于臨沂市各縣、區(qū)疾控中心、抗病毒治療定點(diǎn)醫(yī)院和艾滋病自愿咨詢檢測門診收集,經(jīng)過個(gè)案流行病學(xué)調(diào)查、填寫問卷并采集血液標(biāo)本,由臨沂市疾病預(yù)防控制中心按照《全國艾滋病檢測技術(shù)規(guī)范(2015年修訂版)》[9]的要求進(jìn)行的樣品檢測,陽性患者均經(jīng)臨沂市艾滋病確認(rèn)實(shí)驗(yàn)室蛋白印跡法(western blot,WB)確認(rèn)的HIV-1抗體陽性病例。
1.2 方法
1.2.1 標(biāo)本采集 在知情同意的前提下填寫調(diào)查問卷,采集外周靜脈血3~5 mL,EDTA抗凝,置-80℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 外周血DNA提取 基因組DNA提取使用TIANamp Genomic DNA Kit試劑盒,按照試劑盒說明書進(jìn)行,所提取DNA產(chǎn)物經(jīng)濃度和純度測定合格后置-20℃條件保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 PCR反應(yīng) 基因擴(kuò)增儀 ETC811由東勝創(chuàng)新生物科技有限公司生產(chǎn);全自動(dòng)數(shù)碼凝膠圖像分析系統(tǒng)由上海天能科技有限公司生產(chǎn);ABI3730XL型DNA 測序儀為Applied Biosystems;試劑為BGI 2×Super PCR Mix(with dye)BGI。
引物設(shè)計(jì)根據(jù)NCBI中人類CCR5基因rs333和rs1799987位點(diǎn)、CCR2、SDF1、CXCR4外顯子序列設(shè)計(jì)合成引物,引物序列和大小見表1。擴(kuò)增條件為96℃預(yù)變性5 min,96℃變性20 s,52-62touchdown退火30 s,72℃延伸1 min,10個(gè)循環(huán),96℃變性20 s,52℃退火30 s,72℃延伸1 min,30個(gè)循環(huán),72℃延伸5 min保存。
表1 CCR5、CCR2、SDF1、CXCR4擴(kuò)增位點(diǎn)上下游引物
1.2.4 PCR產(chǎn)物純化和測序 全程委托華大基因公司對樣品進(jìn)行基因重測序。產(chǎn)物純化按照Millipore公司96純化板操作流程進(jìn)行。測序反應(yīng)體系為2 μLMix(Bigdye3.1、5X sequencing buffer、 H2O),2 μL純化后的PCR產(chǎn)物,1 μL引物(5 mmol/L)。測序反應(yīng)程序?yàn)椋貉h(huán)條件為:95℃15s→(95℃15 s→50℃5 s→60℃90 s)×3 5cycles→終止反應(yīng)。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 運(yùn)用SPSS 21.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,群體代表性采用哈-溫平衡(Hardy-Weinberg equilibrium, HWE)檢驗(yàn),若P>0.05,則認(rèn)為各基因型的分布符合HWE平衡。等位基因頻率(allelic frequency, AF)分布差異應(yīng)用卡方檢驗(yàn)或Fisher精確概率法,多因素分析采用二分類Logistic回歸模型,分析比值比和95%置信區(qū)間(CI),以P<0.05認(rèn)為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 人口學(xué)和行為學(xué)特征 193例均為男性,年齡中位數(shù)為31歲(17~62歲);其中未婚98例(50.7%),已婚68例(35.2%),離異或喪偶27例(13.9%);小學(xué)文化程度8例(4.1%),初中81例(41.9%),高中或中專47例(24.3%),大專及以上57例(29.5%); 商業(yè)服務(wù)40例(20.7%),農(nóng)民60例(31%),學(xué)生12例(6.2%),自由職業(yè)者63例(32.6%),干部工人18例(9.3%);與性伴發(fā)生性行為時(shí)使用安全套頻率:從未使用56例(29%),有時(shí)使用117例(60.6%),每次都用20例(10.3%);性伴數(shù)>3個(gè)94例(48.7%),性伴數(shù)≤3個(gè)99例(51.2%);無保護(hù)性行為次數(shù)>3次116例(60.1%),無保護(hù)性行為次數(shù)≤3次77例(39.8%)。
2.2 哈-溫平衡檢驗(yàn)結(jié)果 經(jīng)HWE平衡檢驗(yàn),除CCR2基因rs777084052、rs369723235、rs993589500、SDF1和CXCR4基因rs1299134173及第一外顯子位點(diǎn)外,病例組和對照組CCR5、CCR2和CXCR4基因rs1799987、rs1799864、rs1799865、rs2228014位點(diǎn)基因型及其相對應(yīng)的預(yù)測值如下,所研究群體符合HWE平衡(P>0.05)(表2),調(diào)查對象具有群體代表性和可比性。
2.3 CCR5測序結(jié)果 193例樣本未發(fā)現(xiàn)rs333位點(diǎn)存在插入缺失突變,參考序列為GTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAGACA;rs1799987A/G位點(diǎn)檢出三種基因型(表2),分別為AA占18.1%(35例)、AG占44.6%(86例)和GG占37.3%(72例),A/G突變頻率為59.6%,對照組、病例組等位基因A、G發(fā)生頻率分別為43.41%、56.59%和37.75%、62.25%,兩組不同年齡、職業(yè)和安全套使用頻率進(jìn)行比較,基因型分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05),將基因型AA與其他(AG、GG)兩類基因型作為因變量(突變=0,未突變=1),將病例組和對照組差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)的變量作為自變量,進(jìn)行非條件二分類 Logistic 回歸分析,顯示rs1799987A/G位點(diǎn)變異可能為影響HIV-1感染的風(fēng)險(xiǎn)因素[比值比(OR)=2.998,95%可信區(qū)間(CI):1.034~8.696],結(jié)果見表3。
表2 CCR5、CCR2、SDF1、CXCR4多態(tài)性位點(diǎn)測序分析
表3 rs1799987位點(diǎn)基因型分布二分類Logistic回歸分析結(jié)果
2.4 CCR2測序結(jié)果 共擴(kuò)增兩個(gè)外顯子,發(fā)現(xiàn)5個(gè)已知多態(tài)性位點(diǎn)(rs1799864、rs1799865、rs777084052、rs369723235、rs993589500)。第2外顯子T>C突變82例,其中病例組47例,對照組35例;病例組發(fā)現(xiàn)C>T突變1例;G>A突變71例,其中病例組38例,對照組33例;發(fā)現(xiàn)CC純合子17例,其中病例組10例,對照組7例;AA純合子8例,病例組2例,對照組6例。第3外顯子發(fā)現(xiàn)復(fù)等位基因9組,SNP位點(diǎn)堿基均為雜合突變,發(fā)現(xiàn)A>T突變23例,病例組和對照組比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),結(jié)果見表2;將基因型AA與其他(AG、GG)兩類基因型作為因變量(突變=0,未突變=1),將年齡、職業(yè)、婚姻狀況、文化程度、安全套使用頻率、性伴數(shù)等納入多因素Logistic回歸模型分析,均顯示無明顯相關(guān)。
2.5 SDF1測序結(jié)果 193例樣本SDF1共擴(kuò)增4個(gè)外顯子,發(fā)現(xiàn)2個(gè)已知多態(tài)性位點(diǎn)(rs1444139047、rs17880170),第1外顯子對照組發(fā)現(xiàn)T>C突變1例;第2外顯子病例組發(fā)現(xiàn)G>A突變1例;第3外顯子未發(fā)現(xiàn)插入缺失突變;第4外顯子對照組發(fā)現(xiàn)C>A、G>A突變各1例、病例組發(fā)現(xiàn)G>T突變1例,見表2。
2.6 CXCR4測序結(jié)果 擴(kuò)增1個(gè)外顯子,發(fā)現(xiàn)2個(gè)已知多態(tài)性位點(diǎn)(rs2228014、rs1299134173),C>T突變對照組發(fā)現(xiàn)21例,病例組發(fā)現(xiàn)22例;病例組和對照組各發(fā)現(xiàn)1例TT純合突變;病例組1例雜合缺失TG插入AT,見表2。
研究發(fā)現(xiàn)HIV侵入機(jī)體,除CD4分子介導(dǎo)外,必須有趨化因子受體作為輔助受體參與,HIV-1才能有效感染人體,并在HIV感染及疾病進(jìn)程中發(fā)揮重要作用[5-8,10],CCR5作為HIV病毒傳播最重要的受體,發(fā)生CCR5△32雜合子或純合子突變的個(gè)體能有效抵御HIV的感染[11],本組資料測序產(chǎn)物未發(fā)現(xiàn)CCR5△32純合或雜合子突變,結(jié)果不排除與所選樣本量少及入選人群突變率低有關(guān)。研究表明CCR5基因啟動(dòng)子59029A/G位點(diǎn),歐美人群突變頻率為39%~43%,亞洲人群為55%~61%[12],本研究MSM人群A/G突變頻率為59.59%,提示山東漢族MSM人群該位點(diǎn)等位基因突變頻率較高。既往研究顯示HIV血清陽性與陰性者GG基因型存在顯著差異,與感染HIV-1的風(fēng)險(xiǎn)有關(guān)[6],本組資料G等位基因頻率病例組(62.25%)高于對照組(56.59%),多因素分析也發(fā)現(xiàn)A/G位點(diǎn)等位基因變異可能是HIV-1感染的風(fēng)險(xiǎn)因素,是否與感染風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)尚待更多研究數(shù)據(jù)進(jìn)一步證實(shí)。國外研究報(bào)道59029A/G基因突變可減少CCR5的轉(zhuǎn)錄,從而減緩HIV的感染過程,相對于AA個(gè)體,GG基因型對感染具有保護(hù)作用[13],本組資料A的基因頻率病例組低于對照組,現(xiàn)有數(shù)據(jù)不支持GG基因型對感染具有保護(hù)作用這一結(jié)論。
王福生等[14]研究發(fā)現(xiàn)中國人群CCR2-64I等位基因突變頻率為19.15%~28.79%,既往報(bào)道白種人該突變頻率9.8%,本研究發(fā)現(xiàn)MSM人群為19.95%,與報(bào)告的中國人群研究數(shù)據(jù)相近,并明顯高于歐美人群。研究表明CCR2最常見的多態(tài)性突變?yōu)镃CR2-64I,本組資料發(fā)現(xiàn)79例樣本存在CCR2-64I突變,為編碼區(qū)第190位核苷酸G→A突變導(dǎo)致第64位的纈氨酸替代為異亮氨酸。本研究也發(fā)現(xiàn)CCR2第3外顯子區(qū)域出現(xiàn)23例A>T突變,為cDNA水平上1109位置發(fā)生的雜合突變,第370位天冬氨酸替代為纈氨酸,病例組和對照組基因型差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,多因素logistic回歸模型分析發(fā)現(xiàn)與年齡、職業(yè)等無明顯關(guān)聯(lián),推測兩組之間差異可能系混雜因素影響所致。
SDF1是CXCR4的主要配體,文獻(xiàn)報(bào)道最常見的突變?yōu)镾DF1-3'A,該突變可延緩AIDS疾病進(jìn)展,另有研究發(fā)現(xiàn)SDF1-3'A等位基因純合子突變可以加速疾病進(jìn)展和死亡[15],本研究未發(fā)現(xiàn)SDF1-3'A發(fā)生純合子突變,5例突變均為雜合子突變,其中兩例均為HIV感染者,CD4均在500個(gè)/μL以上,感染時(shí)間均在4年以上,暫未證實(shí)SDF1對HIV感染及感染較長時(shí)間疾病進(jìn)程等方面的保護(hù)作用。研究顯示SDF1-3'A等位基因頻率地域差異明顯,美國白人為21.1%,亞洲人為25.7%[16],我國人群呈現(xiàn)由南到北頻率呈梯度下降趨勢,最高廣東33.3%,河南21.8%,濟(jì)南21%[17],Winkler等[18]報(bào)道亞洲人SDF1的突變頻率為0.257%,本研究MSM人群SDF1突變頻率為0.26%,顯示該人群突變頻率與亞洲人群基本一致。
CXCR4是T細(xì)胞嗜性病毒HIV-1感染的主要輔助受體,與更具致病性和更快的艾滋病進(jìn)展相關(guān),并且由于CD4+T細(xì)胞的進(jìn)行性和定量下降而導(dǎo)致更高的艾滋病相關(guān)死亡率[10],本組資料發(fā)現(xiàn)SNP位點(diǎn)rs2228014密碼子138位置C>T雜合突變42例,氨基酸位置無變化,純合子突變病例組和對照組各1例,病例組和對照組比較多態(tài)性差異未見有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。病例組發(fā)現(xiàn)cDNA序列上17-18位置SNP位點(diǎn)發(fā)生雜合突變,缺失TG插入AT1例,既往未見相關(guān)報(bào)道,與HIV感染是否有相關(guān)性尚需更多數(shù)據(jù)進(jìn)一步探討。
綜合現(xiàn)有資料,關(guān)于山東漢族MSM人群CCR5、CCR2、SDF1、CXCR4基因多態(tài)性與HIV-1感染關(guān)聯(lián)性,可獲得的信息有限,結(jié)論不一,建議納入更多暴露未感染人群,開展不同人群不同地域艾滋病發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸等方面的HIV相關(guān)基因研究,為進(jìn)一步做好艾滋病防控工作提供更多的參考依據(jù)。