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新鄉(xiāng)地區(qū)支氣管哮喘患兒發(fā)病風險與相關(guān)核轉(zhuǎn)錄因子等位基因間相關(guān)性探討

2022-08-25 08:11郭麗娟
中國醫(yī)學工程 2022年8期
關(guān)鍵詞:等位基因基因型引物

郭麗娟

(河南省新鄉(xiāng)市第二人民醫(yī)院 兒科,河南 新鄉(xiāng) 457300)

支氣管哮喘是兒科常見慢性呼吸系統(tǒng)疾病之一,有報道顯示14 歲以下人群發(fā)病率約為3%~4%;目前該病已成為影響兒童生長發(fā)育重要疾病,給家庭及社會和帶來極大負擔[1]。目前有關(guān)支氣管哮喘病因及發(fā)病機制仍存在爭議,大部分學者認為支氣管哮喘發(fā)生受多種因素綜合影響,除環(huán)境因素外遺傳因素亦在其中發(fā)揮著關(guān)鍵作用[2]。核轉(zhuǎn)錄因子STAT3 已被證實可參與到人體正常生理、感染及腫瘤病理生理改變;有報道證實不同免疫系統(tǒng)疾病發(fā)生可由相同基因多態(tài)性介導并能夠相互影響疾病通路調(diào)節(jié)[3];而STAT3 基因多態(tài)性與系統(tǒng)性紅斑狼瘡和潰瘍性結(jié)腸炎易感性有關(guān)[4]?;谝陨献C據(jù),本次研究納入河南省新鄉(xiāng)市第二人民醫(yī)院2018 年1 月至2020 年1 月收治的小兒支氣管哮喘患兒260 例和體檢健康兒童290例,采用SSP-PCR 法檢測核轉(zhuǎn)錄因子STAT3 基因單核苷酸多態(tài)性(SNP),探討本地區(qū)小兒支氣管哮喘發(fā)病與相關(guān)核轉(zhuǎn)錄因子等位基因間的關(guān)系,現(xiàn)報道如下。

1 資料與方法

1.1 一般資料

本次研究納入河南省新鄉(xiāng)市第二人民醫(yī)院2018 年1 月至2020 年1 月收治的小兒支氣管哮喘患兒260 例和體檢健康兒童290 例;支氣管哮喘患兒中男148 例,女112 例,年齡4~9 歲,平均(6.27±2.40)歲;體檢健康兒童中男158 例,女132 例,年齡4~8 歲,平均(6.09±2.27)歲。兩組性別和年齡比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),具有可比性。

1.2 納入及排除標準

支氣管哮喘組:均符合兒童變應性哮喘診斷及分度標準[5],年齡≤14 歲,同時排除川崎病、炎癥性腸病及其他免疫系統(tǒng)疾病;體檢健康組:年齡≤14 歲,近4 周無感染或發(fā)熱,排除近4 周使用激素或免疫抑制劑,既往過敏或其他免疫系統(tǒng)疾病史。研究方案經(jīng)河南省新鄉(xiāng)市第二人民醫(yī)院倫理委員會批準,且患兒家長知情同意。

1.3 方法

1.3.1 DNA 提取和引物設計 抽取外周靜脈血2 mL 加入EDTA 抗凝管,取200 μL 采用DNA 提取試劑盒(Qiagen)完成目標DNA 提取,置入-80℃冰箱待檢。引物設計合成由英濰捷基公司完成,根據(jù)已知STAT3 基因組序列設計SNP 位點正向引物,包含SNP 位點質(zhì)控正向引物和通用反向引物。具體引物情況:rs2293152 特異正向引物為AACGCGCCTACTTCTTTCCTGCCC,特異反向引物為TAAGTTCCTCTCCTGGCTGTTCCG;rs957970 特異正向引物為CTTATGACATTCTCCAGGTTCATC;特異反向引物為TCTCGTCACGTTTACAAGTAATGCT。

1.3.2 SSP-PCR 反應和瓊脂糖凝膠電泳 采用25 μL 反應體系,包括特異性引物0.5 μL、質(zhì)控正向引物0.5 μL、通用反向引物1 μL、2×PowerTaq Master Mix 12.5μL、DNA 模板2μL,最后加入ddH2O 補足25 μL。rs2293152 反應條件設置:95℃預變性5 min,95℃變性30 s 共8 個循環(huán),60℃退火45 s,72℃延伸45 s;95℃變性30 s 共25 個循環(huán),50℃退火45 s,72℃延伸45 s,最后72℃延伸5 min。rs957970 反應條件設置:95℃預變性5 min,95℃變性30 s 共35 個循環(huán),50℃退火45 s,72℃延伸45 s,最后72℃延伸5 min。

1.3.3 瓊脂糖凝膠電泳 取5 μL PCR 產(chǎn)物加入瓊脂糖凝膠(15 g/L),電泳儀電壓設定110 V,電泳35 min,采用耶拿UVP Gelstudio touch 凝膠成像儀顯像。

1.3.4 質(zhì)控PCR 產(chǎn)物測序及驗證 每個位點隨機抽樣選取3 分樣本采用質(zhì)控正向引物和通用反向引物擴增,擴增產(chǎn)物包含SNP 位點,產(chǎn)物送至英濰捷基完成直接測序,將測序SNP 位點基因型結(jié)果和SSP-PCR 檢測結(jié)果對比驗證。

1.4 統(tǒng)計學方法

選擇SPSS 22.0 軟件處理數(shù)據(jù),計數(shù)資料以百分率(%)表示,比較采用χ2檢驗;相對危險度評估采用優(yōu)勢比法。P<0.05 為差異有統(tǒng)計學意義。

2 結(jié)果

2.1 H-W 遺傳平衡檢驗分析

H-W 遺傳平衡檢驗分析顯示,對照組STAT3基因兩個SNP 位點基因型分布頻率比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),提示納入研究對象具有群體代表性。

2.2 PCR 產(chǎn)物測序質(zhì)控結(jié)果分析

隨機抽取樣本采用質(zhì)控引物擴增后含SNP 位點產(chǎn)物直接測序基因型結(jié)果與SSP-PCR 法檢判定基因型相同,證實SSP-PCR 法檢測基因位點準確。

2.3 兩組基因型和等位基因分布差異分析

支氣管哮喘組rs2293152 位點CC 基因型比例高于體檢健康組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05);支氣管哮喘組rs2293152C/G 位點C 等位基因比例高于體檢健康組,差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05);C 等位基因兒童發(fā)生支氣管哮喘風險為G 等位基因1.57 倍(=1.57,95%CI:1.07~2.33)。兩組rs957970 位點基因型和等位基因比例比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。見表1。

表1 兩組基因型和等位基因分布差異分析 [n(%)]

3 討論

支氣管哮喘目前已成為全球性疾病,在發(fā)達國家和發(fā)展中國家發(fā)病率均較高,同時發(fā)病率、致死致殘率和病死率均呈逐年增高趨勢;而小兒支氣管哮喘患兒往往會對生長發(fā)育及身心健康產(chǎn)生不利影響[6]。如何進一步探索明確支氣管哮喘病因及發(fā)病機制以實現(xiàn)疾病早期預防對于改善兒童生活質(zhì)量及遠期預后越來越受到醫(yī)學界的關(guān)注。

喘息是學齡前兒童呼系統(tǒng)常見癥狀之一,根據(jù)病情進展情況可分為早期一過性喘息、早期持續(xù)性喘息及遲發(fā)性喘息或哮喘[7]。一般僅存在特應性因素的遲發(fā)性喘息患兒可進展形成支氣管哮喘;對于此類患兒早期診斷早期干預理論上可降低小兒支氣管哮喘發(fā)病風險,但目前臨床仍沒有具有較高準確性和特異性預測指標[4]。支氣管哮喘已被證實屬于多基因遺傳性疾病,直系親屬發(fā)病比例可達35%~75%[8]。近年來探索支氣管哮喘致病基因等分子遺傳學研究不斷深入,候選基因定位克隆是目前疾病易感基因主要遺傳學分析方法,目前200 個以上支氣管哮喘發(fā)病候選基因已被篩選,參與到機體炎性反應、免疫識別及細胞胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)到等多種生物學活動,如人類白細胞抗原Ⅱ(HLA II)、腫瘤壞死因子α(TNFα)、Toll樣受體及白細胞介素(IL)等,基因型均與支氣管哮喘有關(guān)[9-10]。

核轉(zhuǎn)錄因子STAT3 可在人體內(nèi)多種組織及細胞中表達,作為一種DNA 結(jié)合蛋白,其在無功能狀態(tài)下被胞外信號激活,磷酸化后在細胞核內(nèi)與特異DNA 片段結(jié)合,進而調(diào)控相應基因轉(zhuǎn)錄表達,發(fā)揮調(diào)解細胞增殖分化、腫瘤發(fā)生及感染進展等多方面[11-12]。已有研究[13]顯示,支氣管哮喘模型小鼠呼吸道上皮平滑肌細胞STAT3 基因敲除后,塵螨抗原激發(fā)呼吸道反應性顯著下降,推測STAT3 可能參與到支氣管哮喘病情進展過程中。另有報道[14]提示,支氣管哮喘患兒血清STAT3 表達水平可見顯著提高。此外SSP-PCR 法檢測基因多態(tài)性位點與直接測序法檢測結(jié)果具有較高一致性,檢測快速且價格相對低廉[2],故本研究采用SSP-PCR 法分析STAT3 基因多態(tài)性與小兒支氣管哮喘間關(guān)系。

本次研究采用SSP-PCR 法檢測本地區(qū)STAT3基因,結(jié)果顯示本地區(qū)STAT3 基因rs2293152 和rs957970 均存在SNP,其中rs2293152 位點基因型分布頻率與國外報道存在差異[15],筆者認為這可能與納入人群種族和地區(qū)差異有關(guān)。同時支氣管哮喘組rs2293152 位點CC 基因型比例高于體檢健康組(P<0.05);支氣管哮喘組rs2293152C/G 位點C 等位基因比例高于體檢健康組(P<0.05);C 等位基因兒童發(fā)生支氣管哮喘風險為G 等位基因1.57 倍(=1.57,95%CI:1.07~2.33),證實表明rs2293152C/G 位點C等位基因可能與小兒支氣管哮喘發(fā)生有關(guān),屬于易感基因,故可針對此類人群可能早期干預。但兩組rs957970 位點基因型和等位基因比例比較,差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05),則說明rs957970 位點SNP 與小兒支氣管哮喘發(fā)生無關(guān)。以上結(jié)果為明確小兒支氣管哮喘致病基因提供更為充足證據(jù)。

本次研究亦存在一定不足:①作為小樣本單中心回顧性報道,所得結(jié)論無法完全排除混雜因素影響;②因臨床資料不全無法進一步分析rs2293152 位點多態(tài)性與小兒支氣管哮喘疾病嚴重程度相關(guān)性,而是否可影響STAT3 基因表達及生理功能仍需后續(xù)研究確證。

綜上所述,本地區(qū)小兒支氣管哮喘發(fā)病與STAT3 基因rs2293152C/G 位點有關(guān),其中C 等位基因可能為常見易感基因。

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