關(guān)滄海,王海存,于少博,高欣,姜興明,孫東升(哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院.普通外科;b.心肌缺血重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,黑龍江 哈爾濱 150086)
膽管癌是一種可發(fā)生在膽管任何部位的消化系統(tǒng)惡性腫瘤[1?4],患者的5 年生存率不足30%,其原因包括患者早期癥狀不明顯、腫瘤解剖位置不易明確以及缺乏特異性的分子標(biāo)志物等[5?6]。環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)是由前體mRNA 經(jīng)反向剪切形成的閉合環(huán)狀的RNA,許多circRNA 在人體多種生理病理過程,特別是在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用[7?10]。有研究[11?13]發(fā)現(xiàn),circ_0000615 在乳腺癌、腎癌和胃癌等腫瘤中呈高表達(dá),并通過吸附miRNA 進(jìn)而調(diào)控腫瘤細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為,然而circ_0000615 在膽管癌中的表達(dá)及其在膽管癌中的作用和相關(guān)機(jī)制尚少見報(bào)道。既往研究[14?15]發(fā)現(xiàn),miR?432?5p 在乳腺癌和肝癌中呈低表達(dá)并發(fā)揮抑癌作用。本研究通過生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)circ_0000615 與miR?432?5p間是否存在互補(bǔ)序列并用實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證兩者的靶向關(guān)系,同時(shí)探索circ_0000615 是否通過靶向miR?432?5p 調(diào)控膽管癌細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移及其分子機(jī)制,以期為膽管癌的診斷和治療提供新的潛在的治療靶點(diǎn)和分子標(biāo)志物。
本實(shí)驗(yàn)所用細(xì)胞,包括正常膽管上皮HIBEC細(xì)胞和膽管癌CCLP?1、QBC939、TFK?1 和RBE 細(xì)胞,其中除RBE 細(xì)胞購(gòu)于中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院細(xì)胞資源中心外,其余細(xì)胞均為本實(shí)驗(yàn)室保存。DMEM 培養(yǎng)基、胎牛血清及細(xì)胞轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine?3000均購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司,si?NC、si?circ_0000615(si?circ?1、si?circ?2)、miR?NC、miR?432?5p mimic、inhibitor?NC 和inhibitor?miR?432?5p均購(gòu)自上海吉瑪公司,TRIzol試劑、cDNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和SYBR Green Master試劑盒均購(gòu)自瑞士Roche 公司,RNase R 購(gòu)自上海碧云天公司,CCK?8 試劑盒購(gòu)自日本Dojindo 公司,EdU 試劑盒購(gòu)自廣州Ribobio公司,基質(zhì)膠(matrigel)購(gòu)自美國(guó)BD公司,Transwell小室購(gòu)自美國(guó)Corning公司,雙熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)試劑盒購(gòu)自美國(guó)Promega公司。
將CCLP?1、QBC939、RBE 和TFK?1 細(xì)胞等膽管癌細(xì)胞和正常膽管上皮HIBEC細(xì)胞置于含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)液中,在37°C、5%CO2的條件下進(jìn)行培養(yǎng),當(dāng)細(xì)胞生長(zhǎng)至匯合度約70%時(shí),進(jìn)行傳代培養(yǎng)。轉(zhuǎn)染前將CCLP?1 和QBC939 細(xì)胞(500 個(gè)細(xì)胞/孔)接種于6孔板,待細(xì)胞匯合度達(dá)40%~50%時(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)染。
細(xì)胞分組及轉(zhuǎn)染:si?NC 組(轉(zhuǎn)染si?circ NC),si?circ?1 組(轉(zhuǎn)染si?circ?1),si?circ?2 組(轉(zhuǎn)染si?circ?1),si?NC+inh?NC 組(轉(zhuǎn)染si?circ NC+inhibitor NC),si?NC+inh?miR?432?5p 組(轉(zhuǎn)染si?circ NC+inhibitor?miR?432?5p),si?circ?1+inh?miR?432?5p 組(轉(zhuǎn)染si?circ?1+inhibitor?miR?432?5p)。用Lipofectamine?3000將不同組合的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染至CCLP?1 和QBC939 細(xì)胞。轉(zhuǎn)染后繼續(xù)培養(yǎng)細(xì)胞至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,收集細(xì)胞進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。
用TRIzol試劑盒提取轉(zhuǎn)染前后細(xì)胞總RNA,電泳驗(yàn)證完整性后,通過逆轉(zhuǎn)錄試劑盒將RNA 逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,利用SYBR Green試劑進(jìn)行qPCR實(shí)驗(yàn)。引物序列:circ_0000615正向引物為5'?GCGCTCAATCCT TTGGGAAC?3',反向引物為5'?GGACAACATCAT TGCTTTTCAGAC?3';miR?432?5p正向引物為5'?ACACTCCAGCTGGGTCTTGGAGTAGGTCA?3',反向引物為5'?TGGTGTCGTGGAGTCG?3';GADPH正向引物為5'?GGGAGCCAAAAGGGTCAT?3',反向引物為5'?GAGTCCTTCCACGATACCAA?3';U6正向引物為5'?GCTTCGGCAGCACATATACTAAAAT?3',反向引物為5'?CGCTTCACGAATTTGCGTGTCAT?3'。PCR擴(kuò)增條件:95°C 10 min,95°C 12 s、50°C 30 s、72°C 30 s,共40個(gè)循環(huán)。每個(gè)樣本設(shè)3個(gè)復(fù)孔。以GAPDH和U6作為內(nèi)參基因,用2?ΔΔCt方法計(jì)算circ_0000615、miR?432?5p的相對(duì)表達(dá)量。
從膽管癌CCLP?1、QBC939 細(xì)胞中抽提出總RNA,RNase R 組RNA 樣本與RNase R 酶混合反應(yīng)15 min,NC 組RNA 樣本經(jīng)稀釋緩沖液處理15 min,之后兩組RNA 樣本按1.3 方法,用qPCR 檢測(cè)細(xì)胞中GAPDH和circ_0000615的表達(dá)水平。
通過在線生物信息學(xué)分析網(wǎng)站(Circinteractome)預(yù)測(cè)circ_0000615 和miR?432?5p 之間存在互補(bǔ)結(jié)合位點(diǎn),將含有miR?432?5p與circ_0000615互補(bǔ)結(jié)合部位的序列插入雙熒光素酶基因報(bào)告基因載體pmirGLO 構(gòu)建野生型質(zhì)粒(circ_0000615?WT),將上述序列突變序列構(gòu)建突變型質(zhì)粒(circ_0000615?MUT)。用Lipofectamine?3000 將報(bào)告基因質(zhì)粒與miR?432?5p mimic 或miR?NC 共轉(zhuǎn)染至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的CCLP?1、QBC939 細(xì)胞,轉(zhuǎn)染48 h 后收集細(xì)胞,用雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)試劑盒檢測(cè)細(xì)胞中熒光素酶活性。
將轉(zhuǎn)染后處對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的各組細(xì)胞用胰酶消化后,以1×103個(gè)細(xì)胞/孔接種于96 孔板中,每組設(shè)5 個(gè)復(fù)孔,培養(yǎng)至0、24、48 和72 h 時(shí)加入10 μL 的CCK?8溶液,繼續(xù)培養(yǎng)4 h,用酶標(biāo)儀在450 nm 波長(zhǎng)處檢測(cè)每孔的光密度(D)值,以D值表示細(xì)胞的增殖能力。
將轉(zhuǎn)染后的各組細(xì)胞以1×104個(gè)細(xì)胞/孔接種到96 孔板,培養(yǎng)24 h 后在每個(gè)孔中加入100 μL EdU 溶液,繼續(xù)培養(yǎng)2 h,用多聚甲醛固定細(xì)胞,隨后在避光條件下用Apollo 567 和Hoechst 33342 進(jìn)行染色。用倒置熒光顯微鏡觀察、計(jì)算EdU 陽性細(xì)胞數(shù)量并拍照,將Apollo 567 陽性細(xì)胞與Hoechst 33342 標(biāo)記細(xì)胞數(shù)量的比值作為EdU陽性細(xì)胞率。
細(xì)胞遷移實(shí)驗(yàn):將含1×105個(gè)細(xì)胞的懸液(200 μL)接種于Transwell 上室,隨后在下室加入800 μL 含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基。培養(yǎng)24 h后用棉簽擦去上室中的細(xì)胞,并依次進(jìn)行甲醛固定以及結(jié)晶紫染色。細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn):在加入細(xì)胞懸液前在Transwell 上室預(yù)鋪基質(zhì)膠,后續(xù)實(shí)驗(yàn)步驟同遷移實(shí)驗(yàn)。實(shí)驗(yàn)最后,在光學(xué)顯微鏡下隨機(jī)選取5個(gè)視野進(jìn)行觀察、計(jì)數(shù)遷移或侵襲細(xì)胞并拍照。
以上實(shí)驗(yàn)均獨(dú)立重復(fù)3次。使用SPSS 22.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,用GraphPad Prism 6.0 軟件繪制相關(guān)圖像。符合正態(tài)分布的計(jì)量數(shù)據(jù)以表示,配對(duì)數(shù)據(jù)采用配對(duì)t檢驗(yàn),多組間比較采用單因素方差分析,以P<0.05 或P<0.01 表示差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
qPCR 檢測(cè)結(jié)果顯示,與HIBEC 細(xì)胞比較,CCLP?1、QBC939、RBE 和TFK?1 細(xì)胞中circ_0000615 呈高水平表達(dá)(P<0.05 或P<0.01,圖1A),CCLP?1 和QBC939 細(xì)胞中表達(dá)水平較其他細(xì)胞更高,故選取這2種細(xì)胞進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn);與HIBEC細(xì)胞比較,miR?432?5p在CCLP?1、QBC939、RBE和TFK?1細(xì)胞中呈低水平表達(dá)(P<0.05 或P<0.01,圖1B)。RNase R酶切實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖1C)顯示,與NC 組樣本比較,RNase R處理的樣本中,雖然GAPDH含量明顯降低(P<0.01),但circ_0000615 含量無明顯明顯變化(P>0.05),說明circ_0000615 可以抵抗RNase R 酶切,上述結(jié)果證明circ_0000615 具有比線性RNA 更穩(wěn)定的環(huán)狀結(jié)構(gòu)。
根據(jù)生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(Circinteractome)的預(yù)測(cè)顯示,circ_0000615與miR?432?5p之間存在互補(bǔ)結(jié)合序列(圖2A)。雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)結(jié)果(圖2B)顯示,與miR?432?5p NC比較,miR?432?5p mimic+circ_0000615 WT 組細(xì)胞的熒光素酶活性顯著降低(P<0.01),miR?432?5p mimic+circ_0000615 MUT 組細(xì)胞的熒光素酶活性無顯著變化(P>0.05),這一結(jié)果證實(shí)circ_0000615 與miR?432?5p 之間存在靶向結(jié)合關(guān)系。
qPCR檢測(cè)結(jié)果(圖3A、B)顯示,與si?NC組比較,si?circ?1 和si?circ?2兩組中兩種細(xì)胞中的circ_0000615表達(dá)水平均顯著低降低(P<0.05 或P<0.01),miR?432?5p 的表達(dá)水平顯著升高(P<0.01或P<0.001),說明敲減circ_0000615的實(shí)驗(yàn)成功;同時(shí)還發(fā)現(xiàn)敲減circ_0000615 后miR?432?5p表達(dá)升高,說明前者負(fù)調(diào)控后者的表達(dá)。CCK?8 法(圖3C)和EdU 實(shí)驗(yàn)(圖3D)結(jié)果顯示,與si?NC 組相比,si?circ_0000615 組的細(xì)胞增殖能力明顯降低(P<0.05 或P<0.01)。Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)(圖3E)和遷移實(shí)驗(yàn)(圖3F)結(jié)果顯示,與si?NC組相比,si?circ_0000615 組細(xì)胞的遷移和侵襲能力明顯降低(P<0.05或P<0.01)。上述結(jié)果說明,敲減circ_0000615 可抑制CCLP?1、QBC939 細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移能力。
qPCR(圖4A)、CCK?8 法(圖4B)、EdU 增殖實(shí)驗(yàn)(圖4C)、Transwell遷移(圖4D)和侵襲實(shí)驗(yàn)(圖4E)結(jié)果顯示:與si?NC+inh?NC組相比,si?NC+inh?miR?432?5p 組miR?432?5p 的表達(dá)明顯降低(P<0.05),說明inhibitor?miR?432?5p轉(zhuǎn)染成功后顯著抑制了miR?432?5p的表達(dá);同時(shí),CCLP?1 和QBC939 細(xì)胞的增殖、遷移、侵襲能力明顯升高(P<0.01 或P<0.001),說明下調(diào)miR?432?5p 可增強(qiáng)CCLP?1 和QBC939細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲能力,此外,si?circ?1+inh?miR?432?5p 組細(xì)胞的增殖、遷移、侵襲能力明顯弱于si?NC+inh?miR?432?5p 組(P<0.05 或P<0.01),但又高于si?NC+inh?NC組(P<0.05),說明下調(diào)miR?432?5p可部分逆轉(zhuǎn)由敲減circ_0000615產(chǎn)生的對(duì)CCLP?1 和QBC939 細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為的促進(jìn)作用。
手術(shù)切除是目前治療膽管癌最有效的手段,但大多數(shù)膽管癌患者直到晚期才被診斷,難以通過手術(shù)進(jìn)行根治切除。因此,探索膽管癌發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制以及有效的生物學(xué)標(biāo)志物是十分必要的。circRNA 在腫瘤發(fā)生和發(fā)展中的關(guān)鍵作用已成為研究焦點(diǎn)[16?18]。circ_0000615 在乳腺癌中表達(dá)上調(diào)并通過海綿吸附miR?145?5p 促進(jìn)細(xì)胞增殖、遷移和侵襲[11];circ_0000615 通過miR?138?5p/FoxP4 軸促進(jìn)腎癌的發(fā)生發(fā)展[12]。然而,circ_0000615 在膽管癌中的表達(dá)及其能否調(diào)控膽管癌的發(fā)生發(fā)展,目前尚不清楚。此外,miRNA 在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程中也起重要作用[19?22]。例如,miR?432?5p 在膠質(zhì)瘤中通過抑制下游促癌基因RAB10的表達(dá)從而起到抑癌作用[23]。目前,尚無研究指出miR?432?5p 在膽管癌中能否發(fā)揮調(diào)控作用。
本研究首次發(fā)現(xiàn)circ_0000615 和miR?432?5p在膽管癌細(xì)胞中呈異常表達(dá),qPCR 檢測(cè)結(jié)果表明膽管癌CCLP?1、QBC939、RBE 和TFK?1 細(xì)胞中circ_0000615 的表達(dá)水平明顯高于正常膽管上皮HIBEC 細(xì)胞;miR?432?5p 在膽管癌細(xì)胞中明顯低表達(dá)。值得注意的是,circRNA 可以與mRNA 競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA,miRNA 也能直接結(jié)合circRNA或通過影響相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)間接調(diào)控circRNA,從而促進(jìn)或抑制腫瘤的發(fā)生發(fā)展[11?13]。本研究通過在線生物信息學(xué)分析網(wǎng)站預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn)circ_0000615 與miR?432?5p 之間存在結(jié)合位點(diǎn),并用雙熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn)證實(shí)circ_0000615與miR?432?5p 存在靶向結(jié)合關(guān)系。本研究體外轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),敲減circ_0000615 表達(dá)后可使CCLP?1、QBC939 細(xì)胞中miR?432?5p 表達(dá)水平升高,細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移能力降低,說明miR?432?5p可能是一個(gè)抑癌基因,上調(diào)其表達(dá)水平可以抑制膽管癌細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為;在未經(jīng)干預(yù)的膽管癌細(xì)胞中circ_0000615 呈高表達(dá)狀態(tài),circ_0000615抑制了miR?432?5p 在膽管癌細(xì)胞中的表達(dá),后者的抑癌效應(yīng)沒有顯示出來,在敲減circ_0000615后,miR?432?5p的抑癌作用就表現(xiàn)出來了。
綜上所述,本研究證實(shí)circ_0000615在膽管癌細(xì)胞中呈高水平表達(dá),而miR?432?5p 呈低水平表達(dá);circ_0000615 促進(jìn)膽管癌細(xì)胞的增殖、侵襲、遷移等惡性生物學(xué)行為,這一結(jié)果與靶向抑制miR?432?5p的表達(dá)有關(guān)。這些結(jié)果提示,circ_0000615可能成為膽管癌診斷和治療的分子靶標(biāo),敲減circ_0000615或過表達(dá)miR?432?5p 有望作為膽管癌的治療有效措施,進(jìn)而為臨床轉(zhuǎn)化提供理論基礎(chǔ),但circ_0000615/miR?432?5p 軸如何調(diào)控膽管癌細(xì)胞的惡性生物學(xué)行為的上下游分子機(jī)制仍然需要深入探索。