劉 瑞, 于文庚, 胡順鑫, 尚 帥*
(1.濱州學(xué)院, 山東 濱州 256600;2.山東省海洋資源與環(huán)境研究院, 山東 煙臺(tái) 264001)
植物葉際微生物群落中含有豐富的細(xì)菌、真菌和病毒,葉際微生物具有多種功能,如固氮[1-3]、促進(jìn)植物生長(zhǎng)[4-5]、抑制病原微生物[5]、降解環(huán)境污染物[6]等。植物葉際微生物群落的多樣性、擴(kuò)散性和群落發(fā)育與寄主植物的生理生化、生活環(huán)境和免疫力有關(guān)[7]。
白蠟(Fraxinuschinensis)作為重要的耐鹽堿植物,雌雄異株,廣泛分布于黃河三角洲區(qū)域,其樹(shù)干挺拔直立,外形美觀,樹(shù)皮也可以作為藥用,是重要的景觀植物。然而在雌雄異株植物的研究進(jìn)展中,對(duì)于白蠟雌雄株的葉際微生物菌群的研究很缺乏。漫長(zhǎng)的進(jìn)化歷程導(dǎo)致雌雄植株在諸多方面表現(xiàn)出顯著差異。因此,本研究分析白蠟雌雄植株微生物組成差異的影響因素,能夠更好地了解雌雄株的適應(yīng)特性與差異。
采樣點(diǎn)位于黃河三角洲區(qū)域(北緯37°22′、東經(jīng)118°02′),該地區(qū)屬于溫帶大陸性氣候,全年平均氣溫12.9 ℃,年降水量632 mm,土地為鹽堿地。分別取4棵不同的雌性(BC1~BX4)和雄性白蠟樹(shù)(BX1~BC4),選擇枝葉繁盛,無(wú)病蟲(chóng)害,樹(shù)齡3年以上的白蠟雌雄植株。樹(shù)的性別根據(jù)有無(wú)種子辨別,采樣時(shí)戴上無(wú)菌手套平均采摘(東南、西南、東北)枝干上的完整嫩綠的、無(wú)病蟲(chóng)害斑點(diǎn)的葉片共50~100 g。將摘取的樣品放入無(wú)菌封口袋中,液氮保存,儲(chǔ)存于-20 ℃冰箱中。
稱取白蠟雌雄株葉片樣品3 g,剪碎放入滅菌的錐形瓶中,加入1∶20(葉重/體積TE緩沖液=1∶20)無(wú)菌TE緩沖液(10 mmol/L Tris-HCl, 1 mmol/L EDTA, pH為8.0),用滅菌膜封口在室溫條件下200 r/min的搖床上振蕩30 min,分離微生物,振蕩后的葉片在40 kHz超聲15 min,在無(wú)菌環(huán)境中使用真空抽濾設(shè)備將振蕩液中的微生物收集到0.22 μm的滅菌的濾膜上,使用試劑盒提取濾膜上的總DNA[7]?;?6S rDNA基因的V3~V4區(qū),利用高通量測(cè)序儀對(duì)白蠟雌雄株樣品的細(xì)菌進(jìn)行測(cè)序。
由圖1可知,8個(gè)樣本序列數(shù)目均在10 000之后趨于平緩,表明測(cè)序結(jié)果具有合理性,本研究所獲取的測(cè)序數(shù)據(jù)真實(shí)可信。
圖1 樣品的稀疏曲線
alpha多樣性指數(shù)用來(lái)反映雌雄白蠟葉際微生物群落多樣性,分別采用Observed-otus、Chao1、Shannon、Simpson、Goods-coverage 5種指數(shù)來(lái)描述(表1)。雌雄白蠟alpha多樣性的coverage指數(shù)均為1,說(shuō)明測(cè)序質(zhì)量較好,可以進(jìn)行后續(xù)的多樣性分析,雌株葉際細(xì)菌群落的observed-otus指數(shù)大于雄株細(xì)菌菌群;另外,雌株葉際細(xì)菌的Shannon指數(shù)(表示群落多樣性,其數(shù)值與多樣性成正比)明顯高于雄株細(xì)菌菌群。結(jié)果表明,白蠟雌株葉際細(xì)菌菌群在物種數(shù)目和群落結(jié)構(gòu)多樣性上遠(yuǎn)高于白蠟雄株葉際細(xì)菌菌群。
表1 樣本多樣性指數(shù)
通過(guò)韋恩圖直觀展示各分組特有及共有的otu數(shù)目,以此來(lái)分析雌雄白蠟樣品間的相似性。由圖2顯示,白蠟雌株葉片特有otu為901個(gè),白蠟雄株特有otu為680個(gè),白蠟雌雄葉片共有otu為251個(gè)。雌雄白蠟葉際菌群組成存在差異,白蠟雌株葉際特有菌群多于白蠟雄株。
圖2 雌雄白蠟葉際菌群韋恩圖
由圖3顯示,白蠟葉際細(xì)菌屬于13門,18綱,30目,40科,67屬。在門水平上,白蠟雌株葉際優(yōu)勢(shì)菌群為藍(lán)藻菌門(72.38%),變形菌門(17.10%),棲熱菌門(4.57%),放線菌門(2.53%),擬桿菌門(2.07%);白蠟雄株葉際優(yōu)勢(shì)菌群為藍(lán)藻菌門(84.06%),變形菌門(10.30%),放線菌門(1.53%),擬桿菌門(1.52%),棲熱菌門(1.38%)。
圖3 雌雄白蠟葉際菌門組成
在屬水平上,白蠟雌株葉際優(yōu)勢(shì)菌群為生氧光細(xì)菌、異常球菌屬、鞘氨醇單胞菌、甲基桿菌屬等;白蠟雄株的主要菌屬為生氧光細(xì)菌、鞘氨醇單胞菌和薄層菌屬等(圖4)。
圖4 雌雄白蠟葉際菌屬組成
葉際微生物廣泛分布于各類植物中,影響植物的生長(zhǎng)發(fā)育和代謝活動(dòng),植物為葉際微生物提供營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)與生存空間,葉際微生物與植物相互影響,并處于動(dòng)態(tài)平衡過(guò)程中。隨著葉際微生物組研究的不斷深入,植物與葉際微生物間的研究也越來(lái)越多。葉際環(huán)境作為特殊的生境,具有很大的不穩(wěn)定性,存活于葉際的微生物面臨水分匱乏、營(yíng)養(yǎng)缺乏及強(qiáng)光、高溫和紫外線的影響。本研究發(fā)現(xiàn),白蠟雌雄株葉片雖然都具有一定數(shù)量的特有otu,但存在251個(gè)共有otu,表明白蠟雌雄株葉片既存在差異,又有共性。
相關(guān)研究發(fā)現(xiàn),葉際優(yōu)勢(shì)菌群主要包括變形菌門、厚壁菌門、擬桿菌門和放線菌門[8-11]。本研究發(fā)現(xiàn),白蠟葉際細(xì)菌中藍(lán)藻菌門占優(yōu)勢(shì),其次是變形菌門,放線菌門和擬桿菌門。藍(lán)藻菌門可以通過(guò)氮?dú)獾墓潭▉?lái)提高稻田和其他土壤的肥力,在水體進(jìn)化中也起到積極的作用。因此葉片中的藍(lán)藻菌門能夠產(chǎn)生氧氣,凈化空氣和固氮的作用,能夠促進(jìn)白蠟的生長(zhǎng)。
白蠟雌雄株葉際微生物群落的多樣性指數(shù)存在一定的差異,白蠟雌株菌群結(jié)構(gòu)多樣性高于白蠟雄株葉際菌群。此外,白蠟雌雄株葉際微生物在門水平差異不大,在屬水平存在顯著差異。通過(guò)比較白蠟雌雄株菌群發(fā)現(xiàn),殺雄菌屬(0.18%)為雌株特有,前人研究發(fā)現(xiàn)殺雄菌屬共生菌廣泛分布于節(jié)肢動(dòng)物中,能夠殺死寄主的雄性胚胎,具有改變白蠟蟲(chóng)后代雌雄比例的作用[12],推測(cè)白蠟雌株葉片對(duì)于白蠟蟲(chóng)具有一定的防御能力。