龐連慧,羅雙雙,石林林,陳天圣,劉紅,王煥嶺
1.華中農(nóng)業(yè)大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部淡水生物繁育重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,武漢 430070;2.集美大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部東海海水健康養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廈門(mén) 361021
魚(yú)類(lèi)性腺成熟是生殖細(xì)胞不斷增殖、分化成成熟配子的過(guò)程,而配子的成熟需要經(jīng)過(guò)2次減數(shù)分裂,其中涉及了同源染色體的配對(duì)、聯(lián)會(huì)、重組和分離等,其中任何環(huán)節(jié)的異常都會(huì)導(dǎo)致減數(shù)分裂過(guò)程無(wú)法正常進(jìn)行,進(jìn)而導(dǎo)致配子發(fā)育的異常[1],因此,這個(gè)過(guò)程需要精確而復(fù)雜的分子調(diào)控。細(xì)胞分裂周期蛋白20(cell division cycle 20 homolog,CDC20)是細(xì)胞周期、有絲分裂和減數(shù)分裂的重要調(diào)節(jié)因子[2]。據(jù)報(bào)道,不同物種CDC20蛋白的結(jié)構(gòu)域十分保守,一般含有7個(gè)WD40基序形成穩(wěn)定的7葉螺旋槳狀結(jié)構(gòu),作為支架介導(dǎo)泛素結(jié)合酶與底物之間相互結(jié)合[3]。在卵母細(xì)胞減數(shù)分裂中,CDC20蛋白是同源染色體分離的關(guān)鍵因子,通過(guò)影響減數(shù)分裂的重要調(diào)控蛋白——后期促進(jìn)復(fù)合物(anaphase promoting complex/cyclosome,APC/C)的活性促進(jìn)Ⅱ期姐妹染色體分離。研究發(fā)現(xiàn)CDC20蛋白表達(dá)量降低會(huì)導(dǎo)致小鼠受精卵幾乎不能正常發(fā)育[4],而其蛋白失活會(huì)引起胚胎死亡[5]。在人類(lèi)中,CDC20基因的突變導(dǎo)致女性不育[6]和男性的生殖能力降低[7]。這些研究表明CDC20在動(dòng)物生殖、胚胎發(fā)育中發(fā)揮重要作用。目前,CDC20的功能研究在魚(yú)類(lèi)中尚未涉及。因此,為了解魚(yú)類(lèi)cdc20基因的功能,本研究以團(tuán)頭魴為試驗(yàn)對(duì)象,對(duì)其cdc20基因的序列特征、系統(tǒng)進(jìn)化和時(shí)空表達(dá)模式進(jìn)行初步研究,旨在為后續(xù)的基因功能研究奠定基礎(chǔ)。
使用TRIzol(康為世紀(jì)生物科技股份有限公司)提取團(tuán)頭魴成魚(yú)不同組織的總RNA,包括腦、眼睛、鰓、心臟、肝臟、脾臟、腸、腎臟、卵巢、精巢和肌肉。采集不同發(fā)育時(shí)期(受精卵、2-細(xì)胞期、16-細(xì)胞期、囊胚期、原腸期、神經(jīng)期、體節(jié)期、心跳期和孵化期)的胚胎并提取總RNA。將提取的總RNA用Prime-Script?RT reagent Kit With gDNA Eraser(TaKa-Ra)試劑盒進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄合成第一鏈cDNA。
將斑馬魚(yú)的cdc20cDNA序列(Accession:NM_213080)與筆者所在實(shí)驗(yàn)室的團(tuán)頭魴轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì),獲得團(tuán)頭魴cdc20基因的編碼區(qū)序列。并根據(jù)此序列使用Oligo 7和Beacon Designer 7軟件設(shè)計(jì)PCR引物以擴(kuò)增團(tuán)頭魴cdc20基因的編碼區(qū)序列。根據(jù)預(yù)測(cè)的氨基酸序列利用ClutsalX軟件進(jìn)行多序列比對(duì)以及使用SWISS在線(xiàn)網(wǎng)站(https://swissmodel.expasy.org/)預(yù)測(cè)蛋白結(jié)構(gòu)域;基于MEGA 6.0軟件的Neighbor-joining方法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。
采用sqRT-PCR方法檢測(cè)cdc20基因在團(tuán)頭魴成魚(yú)各組織中的表達(dá)模式,以β-actin作為內(nèi)參基因,引物序列見(jiàn)表1。PCR條件如下:95℃5 min;95℃30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 10 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃ 5 min。PCR擴(kuò)增結(jié)束后,取10 μL PCR產(chǎn)物,使用1%的瓊脂糖凝膠,140 V電壓下電泳15 min,檢測(cè)該基因在各組織中的表達(dá)量。
表1 本研究所用引物Table 1 All primers used in this study
使用SYBR?Green qPCR Mix試劑盒,在CFX96 Real-Time PCR Dectection System中進(jìn)行qRT-PCR。每個(gè)樣品3次重復(fù),以β-actin作為內(nèi)參基因。以團(tuán)頭魴不同發(fā)育時(shí)期胚胎的cDNA為模板,參照下列反應(yīng)體系進(jìn)行PCR擴(kuò)增:模板cDNA 1 μL,正向引物和反向引物各0.4 μL;SYBR?Green qPCR Mix 10 μL,ddH2O 8.2 μL。反應(yīng)條件為:95 ℃5 min;95 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 10 s,39個(gè)循環(huán);72℃5 min。結(jié)果通過(guò)2-ΔΔCt法計(jì)算cdc20的相對(duì)表達(dá)量,數(shù)值用“平均值±標(biāo)準(zhǔn)差”(n=3)表示,用GraphPad Prism 8軟件作圖。采用單因素方差分析方法(ANOVA)和Duncan’s檢測(cè)mRNA表達(dá)水平的差異,當(dāng)P<0.05時(shí),認(rèn)為差異顯著。
團(tuán)頭魴的性腺組織用4%PFA(DEPC水處理)固定后送武漢賽維爾公司做切片,依次將切片進(jìn)行如下操作:二甲苯洗2次,每次20 min;無(wú)水乙醇洗2次,每次10 min;95%乙醇5 min;90%乙醇5 min;80%乙醇5 min;70%乙醇5 min;蒸餾水沖洗后,蘇木素染色3~8 min,自來(lái)水洗;1%的鹽酸乙醇分化數(shù)秒,自來(lái)水沖洗;0.6%氨水返藍(lán),流水沖洗;伊紅染液中染色1~3 min;將切片放入95%乙醇洗2次,每次5 min;無(wú)水乙醇洗2次,每次5 min;二甲苯洗2次,每次5 min,切片拿出來(lái)稍晾干,中性樹(shù)膠封片。以上操作完成后于顯微鏡(Leica,DFC550)下觀察。
以團(tuán)頭魴cdc20cDNA序列作為模板,設(shè)計(jì)探針引物(表1),在反向引物的5′端加上T7啟動(dòng)子序列,并參照下列反應(yīng)體系進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄:DNA模板1 μg,10×transcription buffer 2 μL,T7/SP6 RNA 聚合酶2 μL,DIG-NTP Mix 2 μL,RNase Inhibitor 1 μL,RNase-free水加至20 μL;體系混勻后,37℃水浴4 h后完成體外轉(zhuǎn)錄,合成的探針大小為342 bp。利用石蠟切片進(jìn)行原位雜交,具體如下:二甲苯洗5次,每次5 min;二甲苯∶無(wú)水乙醇(體積比)=1∶1洗2次,每次3 min;無(wú)水乙醇洗2次,每次3 min;依次用95%、90%、85%、75%、50%乙醇各洗1次,每次3 min;85℃DEPC水洗3 min;滴加65℃預(yù)熱的預(yù)雜交液,預(yù)雜交1~2 h;然后將5 ng/μL探針滴加到組織塊上,放入濕盒,65℃雜交過(guò)夜;用2×SSCT 65℃清洗切片2次,每次30 min;0.2×SSCT 65℃清洗切片15 min,50%甲酰胺/2×SSCT 65℃清洗切片2次,每次30 min;用5%的羊血清封閉1~2 h;二抗(Anti-Digoxigenin-AP)室溫孵育 1.5 h;滴加 BCIP/NBT(1 mL平衡液加4.5 μL NBT和3.5 μL BCIP)染色;顯色完成后置于顯微鏡下觀察。
通過(guò)PCR測(cè)序及生物信息學(xué)分析證實(shí)團(tuán)頭魴cdc20編碼區(qū)的基因組長(zhǎng)3 960 bp,包含10個(gè)外顯子和9個(gè)內(nèi)含子,cDNA長(zhǎng)1 482 bp,編碼493 aa;預(yù)測(cè)蛋白的理論分子質(zhì)量為5.44 ku,等電點(diǎn)為7.68。氨基酸序列多重比對(duì)結(jié)果顯示(圖1),團(tuán)頭魴C(jī)dc20與鯉和斑馬魚(yú)的相似度分別高達(dá)95.74%和90.12%,與大鼠、人類(lèi)和非洲爪蟾的相似度分別為59.96%、59.36%和63.58%。結(jié)構(gòu)域分析顯示Cdc20有7個(gè)WD40重復(fù)基序,且該基序在不同物種中都相對(duì)保守,進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)每個(gè)WD40基序形成4股反向平行β折疊,7個(gè)WD40基序構(gòu)成穩(wěn)定的7葉螺旋槳狀結(jié)構(gòu)(圖2)。
圖1 團(tuán)頭魴C(jī)dc20蛋白的多序列比對(duì)Fig.1 Multiple sequence alignment of Cdc20 proteins of Megalobrama amblycephala
圖2 團(tuán)頭魴C(jī)dc20蛋白預(yù)測(cè)的三級(jí)結(jié)構(gòu)Fig.2 Predicted structure model of M.amblycephala Cdc20 protein
基于多個(gè)物種Cdc20氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,團(tuán)頭魴與鯉的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系最近,其次是斑馬魚(yú)。而親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的兩棲類(lèi)、鳥(niǎo)類(lèi)和哺乳類(lèi)形成一個(gè)獨(dú)立分支(圖3)。
圖3 脊椎動(dòng)物CDC20蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.3 Phylogenetic analysis of the protein sequences of CDC20 in vertebrates
通過(guò)sqRT-PCR檢測(cè)cdc20基因在團(tuán)頭魴成魚(yú)不同組織中的表達(dá)情況,結(jié)果如圖4所示,cdc20mRNA在腦、鰓、心臟、脾臟、腸道、腎臟和肌肉中有微弱的表達(dá),而在卵巢和精巢中表達(dá)量最高,說(shuō)明cdc20可能與團(tuán)頭魴性腺發(fā)育有關(guān)。
圖4 團(tuán)頭魴cdc20基因在成魚(yú)各組織中的表達(dá)Fig.4 Expression of cdc20 gene in different tissues of M.amblycephala
通過(guò)qRT-PCR檢測(cè)cdc20在團(tuán)頭魴各發(fā)育階段胚胎中的表達(dá)情況,包括受精卵、2-細(xì)胞期、16-細(xì)胞期、囊胚期、原腸期、神經(jīng)期、體節(jié)期、心跳期和孵化期。結(jié)果(圖5)顯示該基因在受精卵中的表達(dá)水平最高,隨著胚胎發(fā)育的進(jìn)行,其表達(dá)量呈逐漸下降的趨勢(shì),推測(cè)團(tuán)頭魴cdc20可能是1個(gè)母源基因,對(duì)維持胚胎的早期發(fā)育具有重要作用。
圖5 團(tuán)頭魴cdc20基因在胚胎發(fā)育各時(shí)期中的表達(dá)Fig.5 Expression of cdc20 gene at different embryonic development stages of M.amblycephala
根據(jù)團(tuán)頭魴性腺切片原位雜交的結(jié)果(圖6),cdc20基因在Ⅰ期卵母細(xì)胞信號(hào)最弱。卵母細(xì)胞進(jìn)入Ⅱ期后,其表達(dá)量開(kāi)始升高,且在卵母細(xì)胞的胞質(zhì)內(nèi)表達(dá),而在皮質(zhì)泡和細(xì)胞核中幾乎沒(méi)有表達(dá)。而在Ⅲ期卵母細(xì)胞的卵黃顆粒中檢測(cè)到了強(qiáng)烈的探針信號(hào),但細(xì)胞核中信號(hào)較弱。Ⅳ期卵母細(xì)胞中充滿(mǎn)了卵黃顆粒,觀察不到細(xì)胞核和皮質(zhì)泡,cdc20基因在Ⅳ期卵母細(xì)胞的卵黃顆粒中表達(dá),而在放射帶幾乎不表達(dá)。與H.E染色(圖7A)對(duì)比,基于精巢切片原位雜交的結(jié)果顯示,在精原細(xì)胞以及生精小管的生殖上皮中該基因的表達(dá)量最高,而在成熟精子中的表達(dá)量低(圖7B)。
圖6 cdc20基因在團(tuán)頭魴不同發(fā)育時(shí)期卵母細(xì)胞中的表達(dá)Fig.6 Expression of cdc20 gene at different development stages of M.amblycephala oocytes
圖7 團(tuán)頭魴cdc20基因在精巢中的表達(dá)Fig.7 Expression of cdc20 gene in testis of M.amblycephala
CDC20蛋白通過(guò)C端的WD40結(jié)構(gòu)域(即WD40基序)識(shí)別、激活和結(jié)合APC/C調(diào)節(jié)細(xì)胞分裂中姐妹染色體的分離[8],被認(rèn)為是生殖細(xì)胞成熟的重要調(diào)節(jié)因子[9],在生物體生長(zhǎng)和生殖中發(fā)揮重要作用。WD40蛋白最早在牛的G蛋白β亞基中發(fā)現(xiàn)[10],該蛋白的7個(gè)WD40基序形成穩(wěn)定的螺旋槳狀結(jié)構(gòu)[11],參與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、染色質(zhì)組裝、凋亡、細(xì)胞周期調(diào)控等過(guò)程[12]。本研究發(fā)現(xiàn)團(tuán)頭魴C(jī)dc20包含的7個(gè)WD40基序可形成7葉螺旋槳狀結(jié)構(gòu),這種特殊的結(jié)構(gòu)形成穩(wěn)定的支架,為蛋白質(zhì)的識(shí)別和組裝提供位點(diǎn),并增強(qiáng)蛋白之間的互作[12]。氨基酸序列和結(jié)構(gòu)域的保守性說(shuō)明團(tuán)頭魴cdc20基因可能與在小鼠、人類(lèi)中的功能相類(lèi)似,參與了細(xì)胞周期調(diào)控、有絲分裂和減數(shù)分裂的過(guò)程。
本研究還發(fā)現(xiàn),團(tuán)頭魴cdc20主要在性腺中表達(dá)。類(lèi)似地,有研究發(fā)現(xiàn)cdc20基因在斑馬魚(yú)性腺中高表達(dá),且對(duì)斑馬魚(yú)卵子和精子發(fā)生過(guò)程具有重要作用[13]。在其他物種中,該基因同樣與生殖相關(guān)。小鼠CDC20蛋白表達(dá)量的降低導(dǎo)致雌性失去生殖能力[5],人類(lèi)CDC20基因發(fā)生突變導(dǎo)致女性不孕[6]和男性無(wú)精子癥[7]。因此,我們推測(cè)團(tuán)頭魴cdc20基因可能參與生殖和性腺發(fā)育。另外,本研究發(fā)現(xiàn)在卵巢成熟過(guò)程中,隨著卵母細(xì)胞的發(fā)育,該基因的表達(dá)量逐漸升高,這與在豬卵母細(xì)胞中的表達(dá)一致[14]。而精巢切片的原位雜交結(jié)果與卵巢相反,cdc20在精原細(xì)胞中的表達(dá)量最高,而在發(fā)育成熟的精子中表達(dá)量最低。這些研究結(jié)果說(shuō)明,cdc20基因可能在團(tuán)頭魴卵巢和精巢中發(fā)揮的功能不同,在卵巢中可能參與卵母細(xì)胞的成熟過(guò)程,而在精巢中對(duì)精原細(xì)胞早期的形成具有重要作用。
此外,團(tuán)頭魴cdc20在胚胎發(fā)育早期大量表達(dá),然后逐漸下降,因此推測(cè)該基因是一個(gè)母源基因,對(duì)早期胚胎發(fā)育具有重要意義,包括激活卵子、促進(jìn)早期的卵裂、促進(jìn)合子基因的表達(dá)等[15]。在秀麗隱桿線(xiàn)蟲(chóng)中的研究發(fā)現(xiàn),CDC20蛋白與APC/C復(fù)合物結(jié)合后參與母源因子卵母細(xì)胞成熟蛋白(oocyte maturation proteins,OMA)介導(dǎo)的卵母細(xì)胞到早期胚胎發(fā)育的過(guò)程[16]。此外,有文獻(xiàn)報(bào)道APC/C復(fù)合物是一個(gè)母源因子[17],而APC/C復(fù)合物的激活需要CDC20蛋白,由此推測(cè)CDC20蛋白存在于胚胎發(fā)育的早期。這些結(jié)果說(shuō)明團(tuán)頭魴cdc20可能是1個(gè)母源基因。
綜上,本研究克隆并分析了團(tuán)頭魴cdc20基因的序列特征及其時(shí)空表達(dá)模式,結(jié)果可為后續(xù)深入研究該基因的功能奠定理論基礎(chǔ)。