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葡萄糖酸銅和雙硫侖對SARS-CoV-2 PLpro的抑制作用

2022-05-11 07:07柳曉春辛全娟趙廣健袁文敏王一帆章思語徐錫明
中國藥理學(xué)通報 2022年5期
關(guān)鍵詞:底物半胱氨酸葡萄糖

王 娟,柳曉春,辛全娟,趙廣健,袁文敏,王一帆,章思語,徐錫明

(1.中國海洋大學(xué)醫(yī)藥學(xué)院,山東 青島 266003;2.青島海洋生物醫(yī)藥研究院,山東 青島 266100;3.日照市中心醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科,山東 日照 276800)

2019年底,新型冠狀病毒肺炎暴發(fā),并以迅猛的速度在世界范圍內(nèi)傳播,對全球公民的健康造成很大影響[1]。新型冠狀病毒通過人與人之間的飛沫或直接接觸而傳播,病毒感染后常見的癥狀是發(fā)熱,并伴有咳嗽,呼吸困難,肌痛和疲勞[2]。SARS-CoV-2是單股正鏈RNA病毒,編碼4種結(jié)構(gòu)蛋白(刺突蛋白、包膜蛋白、膜蛋白和核衣殼蛋白)以及兩種多聚蛋白(polyprotein 1a and polyprotein 1ab,pp1a和pp1ab),pp1a和pp1ab被兩種蛋白酶:木瓜樣蛋白酶(papain-like protein,PLpro)和3C樣蛋白酶(3C-like protein,3CLpro)切割成16種非結(jié)構(gòu)蛋白(non-structure protein,NSPs),這16種非結(jié)構(gòu)蛋白是新型冠狀病毒基因表達(dá)的關(guān)鍵功能性蛋白[3]。因此,PLpro和3CLpro是抗新型冠狀病毒藥物研發(fā)的重要靶點。PLpro是NSP3自裂解產(chǎn)生的一種非結(jié)構(gòu)蛋白,可以水解病毒蛋白多聚體成為功能性的NSPs,在病毒復(fù)制過程中起關(guān)鍵作用。抗新型冠狀病毒藥物靶向PLpro不僅可以在病毒的復(fù)制中起作用,還可以抑制Ⅰ型干擾素的產(chǎn)生,從而抑制非特異性免疫反應(yīng)[4]。另外,泛素(ubiquitin,Ub)和類泛素蛋白干擾素刺激基因(interferon-stimulated gene 15,ISG15)都在其C末端帶有LXGG序列,PLpro能夠識別和水解LXGG序列,將Ub和ISG15從宿主細(xì)胞蛋白中切除,幫助冠狀病毒逃避宿主天然免疫反應(yīng)[5]。

半胱氨酸蛋白酶是一類重要的蛋白酶家族,廣泛參與人和動物的多種生理過程。半胱氨酸蛋白酶家族在結(jié)構(gòu)上有著很高的同源性,其催化核心是一個三聯(lián)體結(jié)構(gòu),影響半胱氨酸蛋白酶的蛋白水解活性,在決定酶的特異性方面起著重要作用[6]。PLpro是半胱氨酸蛋白酶家族的一類,具有半胱氨酸(Cys)、組氨酸(His)、天冬氨酸(Asp)催化三聯(lián)體,其中半胱氨酸的巰基是酶活性的關(guān)鍵位點,化合物和巰基反應(yīng)可抑制酶活性[7]。另外,新冠狀病毒與嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒(SARS-CoV)、中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)基因組有很高的同源性,尤其表達(dá)幾種關(guān)鍵酶的基因非常相似,這為針對SARS-CoV和MERS-CoV的藥物研究成果直接應(yīng)用到針對新型冠狀病毒的治療中提供了理論依據(jù)。已有文獻(xiàn)證明,金屬離子和雙硫侖可以抑制SARS-CoV和MERS-CoV的活性[8]。

銅元素是人體內(nèi)必需的微量元素之一,各種組織的代謝都需要銅元素,缺銅易引起貧血、白細(xì)胞減少、生長緩慢等癥狀,目前臨床上大都使用硫酸銅治療缺銅癥。半胱氨酸蛋白酶的巰基可以與金屬銅離子形成配位鍵,金屬銅已經(jīng)被證明對半胱氨酸蛋白酶家族的木瓜蛋白酶有很好的抑制效果[9]。雙硫侖(disulfiram,DSF)是一種常見的戒酒藥,是已知的很好的硫醇反應(yīng)化合物,可以共價修飾甲基轉(zhuǎn)移酶,脲酶的半胱氨酸殘基。雙硫侖對MERS-CoV和SARS-CoV的PLpro蛋白分別表現(xiàn)出一定的抑制作用[8]。在體內(nèi),雙硫侖在酸性條件下或其二硫鍵被還原時分解,生成兩個二乙基二硫代氨,在甲基轉(zhuǎn)移酶作用下,生成二硫代氨基甲酸甲酯,也可通過細(xì)胞色素P450介導(dǎo)的亞砜作用最終形成S-甲基-N-二乙基硫代氨基甲酸酯砜[10]。近年來,有研究發(fā)現(xiàn),雙硫侖是一種有效的抗癌藥,雙硫侖聯(lián)合銅可以增強抗腫瘤效果,且雙硫侖的體內(nèi)代謝產(chǎn)物如二硫代氨基甲酸甲酯等聯(lián)合金屬銅離子在臨床前模型中顯示出抗癌活性,能夠殺傷包括黑色素瘤、直腸癌、肺癌、腦膠質(zhì)瘤、乳腺癌等多種腫瘤[11]。本研究針對葡萄糖酸銅和雙硫侖對SARS-CoV-2的PLpro蛋白的抑制作用展開實驗,且對二者聯(lián)合使用及其代謝物對PLpro蛋白的影響做了進(jìn)一步探索。

1 材料與方法

1.1 藥品與試劑96孔板(Costar Corning Incoporated)、默克millipore 10 K 15 mL超濾離心管(上海未熹生物科技有限公司)、TB培養(yǎng)基(金克隆生物技術(shù)有限公司)、Ni Smart Beads 6FF(常州天地人和生物科技有限公司)、E.coli BL21(DE3)菌株(上海昂羽生物技術(shù)有限公司)、質(zhì)粒小提中量試劑盒(天根生化科技有限公司)、考馬斯亮藍(lán)染液(南京凱基生物科技發(fā)展有限公司)、底物Ub-AMC和Cbz-RLRGG-AMC(合肥科生景肽生物科技有限公司)。

1.2 儀器多功能酶標(biāo)儀(SpectraMax I3,Molecular Devices,LLC),震蕩培養(yǎng)箱(上海知楚儀器有限公司),冷凍式離心機(SIGMA 3-30K,創(chuàng)合盛科教儀器有限公司),超聲波細(xì)胞粉碎機(寧波新芝生物科技股份有限公司),NanoDrop微型分光光度計(Thermo Fisher Scientifics,Gene Company Limited基因有限公司)。

1.3 方法

1.3.1新型冠狀病毒PLpro蛋白的表達(dá)純化 新型冠狀病毒PLpro蛋白的基因根據(jù)其原始編碼序列中G/C含量和適用于大腸桿菌原核表達(dá)系統(tǒng)密碼子的應(yīng)用進(jìn)行優(yōu)化,優(yōu)化后的編碼核苷酸序列如下所示:3′-GAAGTGCGTACCATTAAGGTGTTTACCACCGTTGATAATATTAATCTGCATACCCAGGTTGTTGAT ATGAGCATGACCTATGGTCAGCAGTTTGGCCCGACC TATCTGGATGGTGCAGATGTGACCAAAATTAAGCCG CATAATAGCCATGAAGGTAAAACCTTTTATGTTCTGC CGAATGATGATACCCTGCGTGTTGAAGCATTTGAATA TTATCATACCACCGATCCGAGTTTTCTGGGCCGTTAT ATGAGTGCACTGAATCATACCAAAAAATGGAAATAT CCGCAGGTTAATGGCCTGACCAGTATTAAGTGGGCA GATAATAATTGTTACCTGGCAACCGCCCTGCTGACC CTGCAACAGATTGAACTGAAATTCAATCCGCCGGCA CTGCAAGATGCCTATTATCGTGCACGCGCAGGTGA AGCCGCCAATTTTTGTGCACTGATTCTGGCCTATTG CAATAAGACCGTTGGCGAACTGGGCGATGTGCGTG AAACCATGAGTTATCTGTTTCAGCACGCTAATCTGG ATAGTTGCAAACGTGTTCTGAATGTTGTGTGCAAAA CCTGTGGTCAGCAGCAGACCACCCTGAAAGGCGTG GAAGCCGTGATGTATATGGGCACCCTGAGTTATGAA CAGTTTAAAAAAGGTGTGCAGATTCCGTGCACCTGC GGTAAACAGGCAACCAAATATCTGGTTCAGCAGGA AAGCCCGTTTGTTATGATGAGCGCCCCGCCGGCCC AGTATGAACTGAAACATGGTACATTCACTTGTGCAA GCGAATATACCGGCAATTATCAGTGCGGTCATTATA AACATATCACCAGTAAAGAAACCCTGTATTGCATTG ATGGTGCCCTGCTGACAAAAAGTAGTGAATATAAAG GCCCGATTACCGATGTGTTTTATAAAGAAAATAGCT ACACCACCACCATTTAA-5′。

選擇pET-28a(+)質(zhì)粒作為表達(dá)載體,酶切位點為NdeⅠ-XhoⅠ,N端帶6× His-tag,將測序正確的pET-28a(+)重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至E.coliBL21(DE3)中,挑單克隆菌落至10 mL的LB培養(yǎng)基中37 ℃搖床培養(yǎng)過夜,再轉(zhuǎn)移至1 L的體系中37 ℃搖床培養(yǎng)至OD600為0.8-1.0,加入異丙基硫代半乳糖苷(isopropyl β-D-thiogalactoside,IPTG)至終濃度為0.2 mmol·L-1,16 ℃誘導(dǎo)過夜表達(dá);菌液4 500×g4 ℃離心30 min,棄上清用磷酸緩沖鹽溶液(phosphate buffer saline,PBS)重懸菌體,再次4 500×g4 ℃離心30 min,棄上清收集菌體。用裂解液(20 mmol·L-1HEPES,0.5 mmol·L-1NaCl,pH 7.4,200 mg·L-1溶菌酶和0.05% Triton X-100)[12]重懸菌體至50 mL離心管,置于搖床上4 ℃孵育30 min后冰上超聲破碎,1 0000×g,4 ℃離心取上清備用。用5倍柱體積的雙蒸水清洗鎳柱,10倍柱體積平衡液(20 mmol·L-1HEPES,0.5 mmol·L-1NaCl,10 mmol·L-1imidazole,pH 7.4)平衡,隨后加入菌體上清,4 ℃孵育1 h,棄流出液,加入洗雜液(20 mmol·L-1HEPES,0.5 mmol·L-1NaCl,20 mmol·L-1imidazole,pH 7.4)洗雜蛋白,加入洗脫液(20 mmol·L-1HEPES,0.5 mmol·L-1NaCl,250 mmol·L-1imidazole,pH 7.4)洗脫并收集目的蛋白。通過SDS-PAGE、考馬斯亮藍(lán)染色方法分析各組分的純度,收集純度較高的蛋白至Millipore Amicon Ultra-15超濾管中離心濃縮除鹽,即得純化好的重組PLpro蛋白。

1.3.2PLpro米氏常數(shù)的測定 Ub-AMC和Cbz-RLRGG-AMC是去泛素化酶的一種熒光底物,AMC是一類穩(wěn)定性好、位移性好的香豆素類熒光染料,底物與去泛素化酶孵育釋放AMC,使得熒光值增加來檢測酶的活性(Ex./Em.=360/460 nm),用這種方法能夠評價去泛素化酶的活性或篩選去泛素化酶的抑制劑[13-14]。PLpro是一類去泛素化酶,在PLpro的作用下,Ub-AMC和Cbz-RLRGG-AMC水解產(chǎn)生去淬滅AMC,通過測定熒光強度的變化來評價PLpro的活性。在酶總濃度為100 nmol·L-1、熒光底物濃度為0.125~40 μmol·L-1的條件下,測定新型冠狀病毒PLpro的酶活。新型冠狀病毒PLpro活性測定的緩沖體系為:20 mmol·L-1磷酸鹽緩沖液(pH 6.8)。在25 ℃的孵育溫度下,加入100 nmol·L-1的PLpro,迅速加入熒光底物Cbz-RLRGG-AMC或Ub-AMC,每隔1.5 min時間記錄一次熒光讀數(shù),共測定30 min。根據(jù)實驗得到不同底物濃度下的反應(yīng)速率值,運用GraphPad Prism 8中的Michaelis-Menten模型非線性擬合出Michaelis-Menten方程曲線,并得到擬合值Vmax和Km值,Michaelis-Menten方程式如下:

其中,Vmax表示酶被底物飽和時的反應(yīng)速率,Km值表示米氏常數(shù),是酶促反應(yīng)速率V為最大反應(yīng)速率一半時的底物濃度。

1.3.3抑制劑葡萄糖酸銅和雙硫侖IC50值和Ki值的測定 測定葡萄糖酸銅和雙硫侖IC50值的實驗在黑孔96孔板中進(jìn)行,總體系為100 μL,50 μL的PLpro的濃度為40 nmol·L-1,在25 ℃的孵育溫度下,加入20 μL濃度為1~200 nmol·L-1的葡萄糖酸銅或0.02~10 μmol·L-1的雙硫侖,室溫震蕩孵育15 min,迅速加入30 μL熒光底物Ub-AMC(2.4 μmol·L-1),進(jìn)行化合物的IC50檢測。每隔1.5 min記錄一次熒光讀數(shù),共測定30 min。以葡萄糖酸銅濃度和雙硫侖濃度的對數(shù)值為橫坐標(biāo),對應(yīng)的抑制率的值為縱坐標(biāo),用GraphPad Prism 8中的非線性回歸(曲線擬合)模塊中的四參數(shù)法制作曲線,并分析計算出葡萄糖酸銅和雙硫侖的IC50值。用Dixon作圖法求葡萄糖酸銅和雙硫侖的Ki值。實驗在黑色96孔板中進(jìn)行,總體系為100 μL,50 μL的PLpro的濃度為40 nmol·L-1,在25 ℃的孵育溫度下,分別加入20 μL濃度為0、25、50、100 nmol·L-1的葡萄糖酸銅或0、1.25、2.5、5 μmol·L-1的雙硫侖,室溫震蕩孵育15 min,迅速加入30 μL熒光底物Ub-AMC(2.5 μmol·L-1或者10 μmol·L-1),每隔1.5 min記錄一次熒光讀數(shù),共測定30 min。以不同的抑制劑濃度為橫坐標(biāo),酶活反應(yīng)速率的倒數(shù)為縱坐標(biāo)作圖,兩種不同底物濃度的曲線交點的橫坐標(biāo)即為該抑制劑的Ki值。

1.3.4抑制劑葡萄糖酸銅和雙硫侖的酶動力學(xué)研究 用Lineweaver-Burk作圖法判斷葡萄糖酸銅和雙硫侖對PLpro的抑制作用類型[15]。實驗在黑孔96孔板中進(jìn)行,總體系為100 μL,PLpro總濃度為40 nmol·L-1,葡萄糖酸銅用去離子水分別配制成濃度為0、25、50、100 nmol·L-1的濃度梯度,雙硫侖用去離子水分別配制成濃度為0、1.25、2.5、5 μmol·L-1的濃度梯度,在25 ℃的孵育溫度下,分別加入不同濃度(5~80 μmol·L-1)的熒光底物Ub-AMC,對新型冠狀病毒PLpro酶活進(jìn)行測定。每隔1.5 min記錄一次熒光讀數(shù),共測定30 min。根據(jù)實驗結(jié)果,以底物濃度的倒數(shù)為橫坐標(biāo),以反應(yīng)速率的倒數(shù)為縱坐標(biāo)繪制Lineweaver-Burk雙倒數(shù)曲線,由此判定抑制劑的抑制類型。若曲線相交于Y軸,抑制劑的抑制類型為競爭性抑制劑,若曲線相交于X軸,則抑制劑的抑制類型為非競爭性抑制,若曲線相互平行不相交,則為反競爭性抑制劑[8]。

用Yonetani-Theorell作圖法進(jìn)一步探究葡萄糖酸銅和雙硫侖對PLpro蛋白作用的相互影響。實驗在黑孔96孔板中進(jìn)行,總體系為100 μL,PLpro總濃度為40 nmol·L-1,將不同濃度的葡萄糖酸銅(0~500 nmol·L-1)和300 nmol·L-1的雙硫侖聯(lián)合使用,在25 ℃的孵育溫度下,加入2.4 μmol·L-1熒光底物Ub-AMC,對新型冠狀病毒PLpro酶活進(jìn)行測定。每隔1.5 min記錄一次熒光讀數(shù),共測定30 min。根據(jù)實驗結(jié)果,以葡萄糖酸銅的濃度值為橫坐標(biāo),以反應(yīng)速率的倒數(shù)為縱坐標(biāo)繪曲線,并通過兩條曲線的關(guān)系得到評價兩種抑制劑相互作用的常量α,其定義了一種抑制劑與蛋白的結(jié)合對另一種抑制劑對蛋白親和力的影響。若曲線形成一系列平行線,則α=∞,表示兩個抑制劑之間是互相排斥的,作用于同一結(jié)合位點;若曲線相交于原點,則α=1,表示兩個抑制劑之間完全獨立,互不影響;若曲線相交于X軸上方,則α<1,表示一個抑制劑和蛋白的結(jié)合增加了蛋白對另一個抑制劑的親和力,兩個抑制劑被認(rèn)為是協(xié)同的;若曲線相交于X軸下方,則α>1,表示一個抑制劑和蛋白的結(jié)合降低了蛋白對另一個抑制劑的親和力,兩個抑制劑則被認(rèn)為是拮抗的。

1.3.5雙硫侖代謝物對PLpro的作用 選用DSF的代謝物二硫代氨基甲酸甲酯和S-甲基-N-二乙基硫代氨基甲酸酯砜作為研究對象,將其配置為10~1 500 μmol·L-1的階梯濃度,測定新型冠狀病毒PLpro的酶促反應(yīng)的初速率,實驗體系和條件與上述IC50值測定保持一致。

2 結(jié)果

2.1 PLpro蛋白純化重組的PLpro蛋白在大腸桿菌中表達(dá),經(jīng)鎳柱親和層析純化后,得到純度較高的PLpro重組蛋白,通過SDS-PAGE檢測蛋白純度,結(jié)果如Fig 1所示,PLpro蛋白的純度高,且得到的SARS-CoV-2 PLpro重組蛋白的分子量在35~40 ku之間,符合PLpro蛋白38.5 ku的理論分子量[16],純化的蛋白儲存在在50 mmol·L-1的Tris-HCl中,將其分裝并于-80 ℃保存。

Fig 1 SDS-PAGE analysis of SARS-CoV-2 PLpro

2.2 PLpro米氏常數(shù)測定根據(jù)實驗的得到不同的底物濃度下的反應(yīng)速率值,運用GraphPad Prism 8中的Michaelis-Menten模型非線性擬合出Michaelis-Menten方程曲線并得到擬合值Vmax和Km值,如Fig 2所示,對于熒光底物Cbz-RLRGG-AMC,PLpro的米氏常數(shù)Km值為32.39 μmol·L-1,最大反應(yīng)速率Vmax為1.26 nmol·L-1·s;對于熒光底物Ub-AMC,PLpro的米氏常數(shù)Km值為7.322 μmol·L-1,最大反應(yīng)速率Vmax為0.519 nmol·L-1·s。實驗結(jié)果表明對于兩種不同的熒光底物,Ub-AMC與PLpro蛋白計算得到的Km值較小,因此,相比較Cbz-RLRGG-AMC,Ub-AMC有更好的親和力,靈敏度更好,在后續(xù)的實驗中選擇Ub-AMC作為PLpro蛋白的底物進(jìn)行一系列實驗研究。

Fig 2 Michaelis constant curve of SARS-CoV-2 PLpro

2.3 葡萄糖酸銅和雙硫侖的IC50值以及Ki值測定以葡萄糖酸銅濃度和雙硫侖濃度的對數(shù)值為橫坐標(biāo),對應(yīng)的抑制率的值為縱坐標(biāo),用GraphPad Prism 8中的非線性回歸(曲線擬合)模塊中的四參數(shù)法制作曲線,并分析計算出葡萄糖酸銅和雙硫侖的IC50值。熒光底物Ub-AMC濃度為2.5 μmol·L-1時,葡萄糖酸銅的IC50為33.02 nmol·L-1(Fig 3A),雙硫侖的IC50為480.4 nmol·L-1(Fig 3B),且在相應(yīng)的濃度范圍以內(nèi)顯示出劑量依賴性。已有文獻(xiàn)報道,雙硫侖對SARS-CoV的PLpro的IC50為6.5 nmol·L-1[8],相比較可以看出,雙硫侖對SARS-CoV-2的PLpro蛋白抑制效果更好。根據(jù)實驗結(jié)果可以看出,葡萄糖酸銅和雙硫侖都對PLpro蛋白表現(xiàn)出很好的抑制活性,其抑制常數(shù)Ki值通過Dixon作圖法求得,兩條曲線交點橫坐標(biāo)的負(fù)值即為Ki值。如Fig 4所示,葡萄糖酸銅的Ki值為55.3 nmol·L-1,雙硫侖的Ki值為821.6 nmol·L-1。Dixon作圖法得到的Ki值在一定程度可以反映抑制劑的抑制類型,葡萄糖酸銅的兩條曲線相交于X軸上方,則為競爭性抑制劑,雙硫侖相交于X軸,則為非競爭性抑制劑,為了進(jìn)一步驗證其抑制類型以及兩者相互作用的影響,設(shè)計了酶動力學(xué)實驗做更深的探索。

Fig 3 IC50 curves of copper gluconate and disulfiramagainst SARS-CoV-2 PLpro

Fig 4 Dixon Plot for copper gluconate and disulfiram attwo different substrate concentrations

2.4 葡萄糖酸銅和雙硫侖的酶動力學(xué)測定葡萄糖酸銅和雙硫侖都對PLpro蛋白有很好的抑制作用,但是關(guān)于兩種抑制劑對于PLpro蛋白的抑制類型需要進(jìn)一步的實驗測定。將實驗結(jié)果用Lineweaver-Burk雙倒數(shù)作圖法判斷葡萄糖酸銅和雙硫侖的抑制類型,如Fig 5所示,葡萄糖酸銅的4條不同濃度的曲線相交于y軸,具有固定的Vmax值,不同的Km值,表現(xiàn)出的抑制類型為競爭性抑制,而相反,雙硫侖的四條不同濃度的曲線相交于X軸,具有不同的Vmax值,相同的Km值,表現(xiàn)的抑制類型為非競爭性抑制。

Fig 5 Lineweaver-Burk double reciprocal curveof copper gluconate and disulfiram

為了闡明葡萄糖酸銅和雙硫侖與PLpro之間相互作用的動力學(xué)機制,采用Yonetani-Therell方法對兩種抑制劑相互作用對PLpro蛋白影響做了分析。在不同濃度的葡萄糖酸銅和一定濃度的雙硫侖存在下測量PLpro蛋白的水解活性,數(shù)據(jù)用Dixon圖展示。如Fig 6所示,我們發(fā)現(xiàn)葡萄糖酸銅和雙硫侖對PLpro蛋白表現(xiàn)出協(xié)同抑制作用。在葡萄糖酸銅存在和不存在的兩種情況下,Yonetani-Theorell圖中的兩條線在X軸上方相交,α值<1,這表明葡萄糖酸銅和雙硫侖對PLpro具有協(xié)同抑制效應(yīng),一種抑制劑與PLpro蛋白的結(jié)合增加另一種抑制劑和PLpro蛋白的親和力。根據(jù)葡萄糖酸銅的抑制類型的分析結(jié)果,以及已經(jīng)有文獻(xiàn)證明金屬離子可以與半胱氨酸蛋白酶的活性位點結(jié)合,葡萄糖酸銅可能與PLpro蛋白活性中心的催化三聯(lián)體相互作用,如Fig 7A所示,其中催化三聯(lián)體中的Cys的-SH部分被修飾,導(dǎo)致蛋白的性質(zhì)發(fā)生變化,最終PLpro活性被抑制。雙硫侖的抑制類型為非競爭性抑制劑,且可以與葡萄糖酸銅協(xié)同抑制PLpro,雙硫侖或許可以與PLpro蛋白活性口袋以外的結(jié)合位點相互作用,比如鋅指結(jié)構(gòu),如Fig 7B所示,鋅離子不穩(wěn)定,由4個保守的半胱氨酸殘基四面體配位,對PLpro蛋白結(jié)構(gòu)的正確折疊起著至關(guān)重要的作用。雙硫侖可能通過與半胱氨酸的巰基結(jié)合破壞了鋅指結(jié)構(gòu)域的四面體結(jié)構(gòu),導(dǎo)致PLpro蛋白的活性發(fā)生變化。

Fig 6 Yonetani-Theorell Plot for copper gluconateand disulfiram(α<1)

Fig 7 Crystal structure of SARS-CoV-2 PLpro (PDB 7cmd) representing two domains

2.5 雙硫侖代謝物對PLpro蛋白影響分析雙硫侖的代謝物在低濃度的時候?qū)Lpro抑制效果不佳,濃度達(dá)到1 000 μmol·L-1時才能對PLpro蛋白表現(xiàn)出一定的抑制作用(Fig 8)。上述結(jié)果表明,與雙硫侖代謝產(chǎn)物在抗腫瘤的研究結(jié)果不同的是,在對新型冠狀病毒的研究中,雙硫侖代謝物對PLpro蛋白無明顯抑制活性。

Fig 8 The inhibitory rate of methyl dithiocarbamate andS-methyl-N-diethylthiocarbamate sulfone againstSARS-CoV-2 PLpro

3 討論

PLpro參與新型冠狀病毒的復(fù)制、翻譯和水解過程,在新型冠狀病毒生命周期至關(guān)重要,通過研究發(fā)現(xiàn)葡萄糖酸銅和雙硫侖對新型冠狀病毒PLpro具有較強的抑制活性,葡萄糖酸銅可以競爭性抑制PLpro的活性來阻斷新型冠狀病毒的生命周期,進(jìn)而成為一種預(yù)防或者治療新型冠狀病毒感染潛在藥物,葡萄糖酸銅還可以單獨作為一種原料藥,或與其他已知的藥物、化合物或載體相配合制成口服劑、注射劑、涂劑、洗劑、氣霧劑、油制劑或透皮貼劑等各種形式的藥劑用來預(yù)防或者治療新型冠狀病毒感染。雙硫侖非競爭性抑制PLpro,是一種已知的戒酒藥,臨床使用多年,藥動學(xué)和安全性有保障。葡萄糖酸銅和雙硫侖單獨使用對新型冠狀病毒的PLpro具有較好的抑制效果,聯(lián)合使用對PLpro的抑制活性增強,具有協(xié)同抑制效應(yīng),綜上所述,葡萄糖酸銅和雙硫侖有望成為抗新型冠狀病毒的候選藥物。

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