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內(nèi)蒙古傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中乳酸菌的分離及其耐藥性研究

2022-03-10 12:09韓慧玲包振江趙家齊袁曉霞冀照君
中國釀造 2022年2期
關(guān)鍵詞:萬古霉素球菌乳制品

韓慧玲,李 華,包振江,趙家齊,李 晴,袁曉霞,冀照君*

(內(nèi)蒙古民族大學 生命科學與食品學院,內(nèi)蒙古 通遼 028000)

內(nèi)蒙古通遼地區(qū)的牧民長期以來沿用傳統(tǒng)的自然發(fā)酵方法制作具有民族特色的傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品,主要有奶豆腐、酸馬奶、酸性奶油(烏日莫)、奶皮子等,這些傳統(tǒng)乳制品工藝獨特、品種繁多、味道極美、營養(yǎng)豐富,并較好地保存了當?shù)刈匀画h(huán)境中的乳酸菌,曾經(jīng)是皇帝王室的貢品,至今還是蒙族地區(qū)最重要的主食,該地區(qū)獨特的氣候、環(huán)境和食品的特色加工方法使得傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中乳酸菌資源十分豐富[1-2]。有研究表明,新疆、青海、西藏地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中的優(yōu)勢菌群分別為瑞士乳桿菌(Lactobacillushelveticus)、植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)和德氏乳桿菌(Lactobacillus delbrueckii)[3],內(nèi)蒙古西部地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中的優(yōu)勢菌群為干酪乳桿菌(Lactobacillus casei)、瑞士乳桿菌、植物乳桿菌和乳酸乳球菌乳酸亞種(Lactococcus lactissubsplactis)[4-5]。這些乳酸菌對腸道內(nèi)病原菌生長和定殖有抑制作用,對維持腸道健康有著重要作用[6-7],被公認為安全性(generally regarded as safe,GRAS)菌株[8]。因此,內(nèi)蒙古東部地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中豐富的乳酸菌資源尚待進一步開發(fā)利用。

近年來,隨著抗生素的廣泛使用,細菌耐藥性問題越來越嚴重,已由多重耐藥性發(fā)展為普遍耐藥性[9]。有研究表明,乳酸菌對萬古霉素、慶大霉素、鏈霉素、四環(huán)素、環(huán)丙沙星等藥物具有較強的耐藥性,且部分菌株具有多重耐藥性[10],但乳酸菌對各種抗生素的耐藥性因樣品來源、生存環(huán)境等差異顯著[11-14]。因此,研究傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中乳酸菌的耐藥性具有重要的意義。

本研究以內(nèi)蒙古通遼地區(qū)自制的奶豆腐和酸性奶油(烏日莫)兩種傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品為材料,采用稀釋涂布法從中分離純化乳酸菌,借助保守序列16S rRNA鑒定乳酸菌種屬關(guān)系,并采用8種常見抗生素藥敏性實驗深入分析乳酸菌的耐藥率和多重耐藥性,為傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中乳酸菌安全性評價提供重要參考,為乳酸菌耐藥分子機制和優(yōu)良乳酸菌資源開發(fā)奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

1.1.1 樣品

奶豆腐(NDF)和烏日莫(WRM)兩種自制傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品均采集自內(nèi)蒙古通遼地區(qū)的牧民家庭。

1.1.2 培養(yǎng)基

MRS固體培養(yǎng)基[7]:蛋白胨10 g,牛肉膏10 g,酵母提取物5 g,K2HPO42 g,檸檬酸二銨2 g,乙酸鈉5 g,葡萄糖20 g,吐溫80 1 mL,MgSO4·7H2O 0.58 g,MnSO4·H2O 0.25 g,瓊脂粉18 g,蒸餾水1 000 mL,pH 6.2~6.4。121 ℃滅菌20 min。MRS液體培養(yǎng)基中不添加瓊脂。

1.1.3 藥敏紙片及主要試劑

氯霉素(chloramphenicol,C)、萬古霉素(vancomycin,VA)、四環(huán)素(tetracycline,T)、鏈霉素(streptomycin,SM)、環(huán)丙沙星(ciprofloxacin,CIP)、利福平(rifampicin,RD)、萘啶酸(nalidixic acid,NA)、紅霉素(erythromycin,EM)抗生素藥敏試紙:杭州濱和微生物試劑有限公司;無水乙醇(分析純):天津市致遠化學試劑廠;瓊脂糖(分析純):北京索萊寶科技有限公司;聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)引物:生工生物工程(上海)股份有限公司;磷酸氫二銨(分析純):國藥集團化學試劑有限公司;硫酸錳(分析純):天津市天力化學試劑有限公司;無水乙酸鈉(分析純):天津市德恩化學試劑有限公司;酵母浸粉(生化試劑):北京奧博星生物技術(shù)有限責任公司;2×Master Mix:北京擎科新業(yè)科技有限公司。

1.2 儀器與設(shè)備

3K-15型臺式高速離心機:德國Sigma公司;Mastercycler nexus PCR擴增儀:德國Eppendorf公司;DYY-6C電泳儀:北京六一電子儀器廠;ProteinSimple凝膠成像系統(tǒng)HP:美國ProteinSimple公司;DZF-6051型生化培養(yǎng)箱:寧波市東南儀器有限公司;BS-1E型振蕩培養(yǎng)箱:蘇州威爾實驗用品有限公司;LS-35HD型立式壓力蒸汽滅菌器:江陰濱江醫(yī)療設(shè)備有限公司;V8型漩渦混合器:美國Essenscien公司。

1.3 方法

1.3.1 乳酸菌菌株的分離與純化

將奶豆腐樣品置于無菌研缽中搗碎后待用,準確稱取奶豆腐、烏日莫樣品10.0 g于90 mL無菌生理鹽水(含量為0.9%)中,充分振蕩5 min,使樣品與生理鹽水混合均勻[15]。采用10倍系列梯度稀釋法將樣品稀釋至10-3,取稀釋度為10-1、10-2、10-3的樣品分別涂布于MRS固體培養(yǎng)基上,每個梯度做3次平行[16],37 ℃靜置培養(yǎng)48 h后,根據(jù)乳酸菌菌落特征,挑取單菌落并純化2次,將純化菌株保存于20%甘油中,-80 ℃冷凍保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3.2 分子生物學鑒定

采用異硫氰酸胍(guanidine thiocyanate,GUTC)法提取乳酸菌的基因組脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)[17]。以其為模板,27F(5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3')和1492R(5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3')為引物,對其16SrRNA基因序列進行PCR擴增。PCR擴增體系:2×Mix(含Loading)23.00 μL、引物27F和1492R各1.00 μL、DNA模板2.00 μL,以雙蒸水(ddH2O)補至50.00 μL。PCR擴增條件:95 ℃預變性5 min;94 ℃變性1 min,55 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,共循環(huán)30次;72 ℃再延伸10 min。取PCR擴增產(chǎn)物3.00 μL,采用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測。將單一條帶的樣品送至生工生物工程(上海)股份有限公司進行測序,將測序結(jié)果提交到美國國立生物技術(shù)信息中心(nationalcenterforbiotechnologyinformation,NCBI)的GenBank數(shù)據(jù)庫中采用基本局部比對搜索工具(basic local alignment searchtool,BLAST)進行同源性比對,鑒定菌株的種屬關(guān)系。

1.3.3 抗生素耐藥性敏感試驗

首先將乳酸菌菌株活化,挑取單菌落于MRS液體培養(yǎng)基中,37 ℃靜置培養(yǎng)48 h,將菌液用無菌水調(diào)整至OD600nm值為1.0的菌懸液。然后將15 mL MRS固體培養(yǎng)基倒入培養(yǎng)皿中,待培養(yǎng)基凝固后,取200 μL菌懸液加入4 mL 0.6%瓊脂,45 ℃混勻,均勻涂布于MRS固體培養(yǎng)基上,于室溫放置15 min。最后在無菌條件下取出藥敏紙片,置于固體培養(yǎng)基上(每皿3個相同藥敏紙片),37 ℃培養(yǎng)48 h后,測量并記錄抑菌圈直徑。根據(jù)臨床實驗室標準化協(xié)會(clinical and laboratory standards institute,CLSI)(2018)和《抗微生物藥物敏感性試驗執(zhí)行標準》第十七版信息增刊提供的紙片法標準,制定評價乳酸菌對抗生素的耐藥性標準,具體判定標準見表1。

表1 藥敏紙片種類、含藥量及判定標準Table 1 Types,drug contents and determination standards of drug sensitive paper

1.3.4 耐藥率的計算

菌株的耐藥率[18]計算公式如下:

2 結(jié)果與分析

2.1 乳酸菌的分離

采用稀釋涂布法從內(nèi)蒙古通遼地區(qū)自制的奶豆腐和烏日莫中共分離得到80株乳酸菌,部分典型菌株的菌落形態(tài)及革蘭氏染色鏡檢觀察結(jié)果見圖1。

圖1 部分分離菌株的菌落形態(tài)(a)及革蘭氏染色結(jié)果(b)Fig.1 Colony morphology (a) and Gram staining results (b) of some isolated strains

由圖1可知,乳酸菌菌落在MRS固體培養(yǎng)基上多呈圓形,凸起,微白色,濕潤,邊緣整齊;所有菌株鏡檢結(jié)果均呈革蘭氏陽性,細胞形態(tài)多樣。

2.2 乳酸菌的分子生物學鑒定

分離乳酸菌的分子生物學鑒定結(jié)果見表2。由表2可知,經(jīng)16S rRNA基因測序與鑒定,80株乳酸菌歸屬于13個種,分別為短乳桿菌(7株)、糞腸球菌(5株)、乳酸片球菌(2株)、乳酸乳球菌(12株)、瑞士乳桿菌(4株)、屎腸球菌(13株)、戊糖片球菌(5株)、副干酪乳桿菌(7株)、食二酸乳桿菌(4株)、奧塔基乳桿菌(5株)、耐久腸球菌(4株)、植物乳桿菌(6株)、開菲爾乳桿菌(6株),表明內(nèi)蒙古東部地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中乳酸菌生物多樣性較高。

表2 分離乳酸菌的分子生物學鑒定結(jié)果Table 2 Molecular biological identification results of isolated lactic acid bacteria

2.3 乳酸菌耐藥性結(jié)果與分析

2.3.1 乳酸菌藥敏紙片結(jié)果

分離得到的80株乳酸菌對8種抗生素的耐藥性見表3。

由表3可知,利福平、鏈霉素、紅霉素、四環(huán)素、環(huán)丙沙星、萬古霉素、奈啶酸、氯霉素抗性培養(yǎng)基上無抑菌圈(耐藥(R))的乳酸菌分別是36株、59株、13株、26株、49株、53株、80株、16株,這些乳酸菌對相應(yīng)抗生素表現(xiàn)出強耐藥性;抑菌圈直徑較大(敏感(S)型)的菌株數(shù)分別為39株、4株、59株、43株、11株、22株、0株、61株,這些菌株對相應(yīng)抗生素表現(xiàn)出強敏感性。另外,有7株乳酸菌(L.brevisIMUNJL0111、E.faecalisIMUNJL0096、E.faecalisIMUNJL0039、L.acidilacticiiIMUNJL0115、E.faeciumIMUNJL0213、E.faeciumIMUNJL0226、E.faeciumIMUNJL0229)對所有8種抗生素均無抑菌圈(強耐藥性)。由此可見,從內(nèi)蒙古通遼地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中分離得到的80株乳酸菌對8種抗生素的耐藥性差異顯著,部分菌株表現(xiàn)出強耐藥性,部分菌株表現(xiàn)出強敏感性,這可能與菌株自身的固有性耐藥以及外部環(huán)境的影響有關(guān)[19]。

表3 80株乳酸菌對8種抗生素的耐藥性結(jié)果Table 3 Drug resistance results of 80 strains of lactic acid bacteria to 8 antibiotics

續(xù)表

續(xù)表

2.3.2 乳酸菌對不同抗生素的耐藥率分析

13個乳酸菌菌種對8種抗生素的耐藥率見表4。

表4 乳酸菌對8種抗生素的耐藥率Table 4 Drug resistance rates of lactic acid bacteria to 8 antibiotics

由表4可知,80株乳酸菌對抗生素的耐藥率由高到低依次為萘啶酸(100%)、鏈霉素(95.00%)、環(huán)丙沙星(80.00%)、萬古霉素(72.50%)、利福平(51.25%)、四環(huán)素(45.00%)、紅霉素(26.25%)、氯霉素(23.75%)。13種乳酸菌對8種抗生素的耐藥率差異明顯。乳酸片球菌對萘啶酸、利福平、鏈霉素、四環(huán)素、環(huán)丙沙星、萬古霉素的耐藥率均為100%;戊糖片球菌對鏈霉素、環(huán)丙沙星、萬古霉素、萘啶酸的耐藥率均為100%;副干酪乳桿菌對鏈霉素、萬古霉素、萘啶酸的耐藥率均為100%。然而,植物乳桿菌對紅霉素、萬古霉素、氯霉素的耐藥率均為16.67%,耐藥率較低;奧塔基乳桿菌(對紅霉素、四環(huán)素、氯霉素的耐藥率為0)、耐久腸球菌(對紅霉素和萬古霉素的耐藥率為0)、戊糖片球菌和副干酪乳桿菌(對紅霉素耐藥率為0)對不同抗生素表現(xiàn)出高度的敏感性。

上述結(jié)果與新疆北部[16]、西藏[20-21]、內(nèi)蒙地區(qū)[22]發(fā)酵乳制品中分離出的乳酸菌耐藥性高度一致,均發(fā)現(xiàn)植物乳桿菌、副干酪乳桿菌對鏈霉素耐藥,對四環(huán)素、紅霉素敏感,這表明傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中的乳酸菌在遺傳分化過程中具備一定的固有耐藥能力,這與乳酸菌基因組上的大環(huán)內(nèi)酯-林肯酰胺類ML(ermA,ermB,msrA/B,lnuA)及四環(huán)素類(tetM,tetK)、氨基糖苷類(aac(6')-aph(2″),aph(3')-III,strA,strB)、β-內(nèi)酰胺類(blaZ)、氯霉素(cat)和萬古霉素(vanX)等耐藥基因有關(guān)[23-24]。然而,河南新鄉(xiāng)市售酸奶中分離出的乳酸菌對四環(huán)素(61.3%)的耐藥率更高,并檢測到乳酸菌具有四環(huán)素耐藥基因tetM[25];廣州市售酸奶中的乳酸菌對環(huán)丙沙星和萬古霉素耐藥率只有54.17%~35.42%,對四環(huán)素、青霉素、氯霉素、紅霉素和利福平的耐藥率均較低或完全敏感[19]。因此,乳酸菌抗生素耐藥性可能與地理位置、樣品來源、污染程度等均有關(guān),也可能與其耐藥基因沉默或表達不充分有關(guān)[26-27],有待于更深入研究。

2.3.3 乳酸菌多重耐藥性分析

13個乳酸菌菌種的多重耐藥性分析結(jié)果見表5。

表5 乳酸菌的多重耐藥率Table 5 Multiple drug resistance rates of lactic acid bacteria

由表5可知,76株(95%)乳酸菌具有多重耐藥性,其中短乳桿菌、糞腸球菌、乳酸片球菌、瑞士乳桿菌、屎腸球菌、戊糖片球菌、副干酪乳桿菌、食二酸乳桿菌、奧塔基乳桿菌、開菲爾乳桿菌均表現(xiàn)為抗3種及以上抗生素,表明這10個種的乳酸菌具有較強的耐藥性,比前期研究結(jié)果中具有多重耐藥性的乳酸菌所占比例(90.3%和70.33%)更高[28-29],可能是由于具有多重耐藥性的乳酸菌對自然環(huán)境的適應(yīng)能力更強[30]。此外,有11株(13.75%)乳酸菌(短乳桿菌1株、糞腸球菌2株、乳酸片球菌1株、乳酸乳球菌2株、瑞士乳桿菌1株、屎腸球菌3株、植物乳桿菌1株)具有8重抗生素耐藥性,表明該地區(qū)傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中的乳酸菌資源多重耐藥性現(xiàn)象十分普遍。這可能與農(nóng)牧區(qū)飼養(yǎng)動物長期接觸抗菌藥物有關(guān),致使傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中抗生素殘留量較高,耐藥型菌株大量繁殖,以及抗性基因或R質(zhì)粒[31-32]在菌株間橫向轉(zhuǎn)移使乳酸菌由單重耐藥演化為多重耐藥[33]。

3 結(jié)論

采用稀釋涂布法從內(nèi)蒙古通遼地區(qū)自制的奶豆腐和烏日莫中共分離純化出80株乳酸菌,經(jīng)16S rRNA序列分析,歸屬于13個種,分別為短乳桿菌(Lactobacillus brevis)、糞腸球菌(Enterococcus faecalis)、乳酸片球菌(Lactobacillus acidilacticii)、乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)、瑞士乳桿菌(Lactobacillushelveticus)、屎腸球菌(Enterococcusfaecium)、戊糖片球菌(Pediococcus pentosaceus)、副干酪乳桿菌(Lactobacillus paracasei)、食二酸乳桿菌(Lactobacillus digitalis)、奧塔基乳桿菌(Lactobacillusottaki)、耐久腸球菌(Enterococcus durans)、植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)、開菲爾乳桿菌(Lactobacillus kefir),說明內(nèi)蒙古通遼地區(qū)傳統(tǒng)自然發(fā)酵乳制品中具有非常高的生物多樣性。80株乳酸菌對萘啶酸的耐藥率為100%,對鏈霉素、環(huán)丙沙星、萬古霉素、紅霉素、氯霉素的耐藥率分別為95.00%、80.00%、72.50%、26.25%、23.75%。此外,76株(95%)乳酸菌具有多重耐藥性(≥3種抗生素培養(yǎng)基上判斷為耐藥或中敏),這表明內(nèi)蒙古傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中的乳酸菌抗生素耐藥性問題非常突出。因此,抗生素的使用頻率和劑量將致使傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品中乳酸菌耐藥性改變,今后應(yīng)加強對傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品的耐藥監(jiān)測和溯源,制定嚴格的衛(wèi)生標準。

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