楊衛(wèi)軍,董艷蕾,吳秋芳,張美玲,韓麗濱,張元臣,*
(1.安陽工學(xué)院 生物與食品工程學(xué)院,河南 安陽 455000;2.河南省太行山林業(yè)有害生物野外科學(xué)觀測研究站,河南 林州 456550)
棉蚜[(Glover)]是一種世界性分布的多食性害蟲,能夠危害300多種寄主植物,主要以葫蘆科、錦葵科、茄科和蕓香科植物為主。棉蚜以口器刺入植物韌皮部吸食汁液,常造成植物葉片蜷曲和植物矮縮;且可分泌蜜露導(dǎo)致細(xì)菌滋生,嚴(yán)重影響植物光合作用。此外,棉蚜是多種植物病毒的傳播載體,能夠?qū)е轮参锊《静〉念l繁發(fā)生。目前防治棉蚜主要以化學(xué)防治為主,然而農(nóng)藥對環(huán)境污染嚴(yán)重,對人畜有害,同時抗藥性也頻繁產(chǎn)生,亟需尋找對環(huán)境友好的害蟲防治新途徑,從基因水平上干擾昆蟲的生理系統(tǒng)來防治害蟲具有較好的發(fā)展前景。
ATP合成酶(ATP synthase)廣泛存在于生物細(xì)胞的細(xì)胞器中,通常由嵌入生物膜的疏水端F0亞基和生物膜外的親水端F1亞基組成,在動物包括昆蟲細(xì)胞內(nèi)催化供能物質(zhì)ATP的合成。ATP合成酶B亞基在不同物種中保守性非常低,主要起連接和固定F0和F1復(fù)合體的裝配作用。ATP合成酶B亞基對于維持ATP合成酶的空間構(gòu)型非常重要,一旦缺失,將導(dǎo)致ATP合成酶構(gòu)象發(fā)生改變,影響ATP的合成。ATP合成酶B亞基在蚊子抗性品系中表達(dá)量顯著高于非抗性品系,表明其與昆蟲抗藥性有密切關(guān)系。在黑腹果蠅()生殖細(xì)胞中抑制ATP合酶B亞基的表達(dá)后,雄性果蠅生殖細(xì)胞不能發(fā)育成熟,從而導(dǎo)致生育能力的降低。缺少ATP合酶B亞基的褐飛虱()和果蠅死亡率明顯上升,同時該亞基屬于豌豆蚜()和柑橘木虱()唾液腺中的效應(yīng)蛋白。以上研究表明,ATP合成酶在昆蟲體內(nèi)主要參與氧化磷酸化過程中ATP的合成,對昆蟲的生長發(fā)育、繁殖,以及適應(yīng)環(huán)境起重要作用。若將ATP合成酶作為棉蚜控制的一個靶標(biāo),不僅可以開辟害蟲分子調(diào)控的新領(lǐng)域,而且能夠有效提高對棉蚜的防治效果,為棉蚜防治提供新策略。
目前,已鑒定出多種昆蟲的ATP合成酶B亞基基因,尚未見有關(guān)棉蚜基因克隆與表達(dá)分析的研究報道。本研究以棉蚜為研究對象,克隆得到基因的全長序列,利用實時熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)分析該基因在棉蚜不同組織和日齡,以及棉蚜取食不同寄主植物后的表達(dá)水平,為后續(xù)深入研究該基因的功能奠定基礎(chǔ)。
2017年4月10日在安陽工學(xué)院校內(nèi)木槿上采集棉蚜,帶回實驗室將棉蚜轉(zhuǎn)接到棉花葉片上飼養(yǎng),葉片葉柄用沾水的脫脂棉包被起來,放于直徑為15 cm的玻璃培養(yǎng)皿中。培養(yǎng)皿用保鮮膜封口,并用昆蟲針刺破保鮮膜,保持空氣流通。棉蚜飼養(yǎng)的溫度、光周期和相對濕度分別設(shè)置為(25±1)℃、14 h/10 h(L/D)和60%±5%。
將棉花、黃瓜、西葫蘆和甜瓜種子播種于直徑為20 cm、高度為15 cm的花盆中,用2 m×2 m尼龍網(wǎng)網(wǎng)罩(200目)將花盆罩起來,放置于室外進(jìn)行培養(yǎng),每間隔5 d澆一次水,植株6個葉片(含子葉)后取葉片用于飼養(yǎng)蚜蟲。本實驗中所用棉花、黃瓜、西葫蘆和甜瓜品種分別為中棉所49、早青二號、歐曼和綠寶石,均購買于市場。
隨機(jī)收集在棉花葉片上生長的仔蚜(1~5日齡)和母蚜(產(chǎn)仔后1~5 d)共30~50頭,立刻放置于TRIzol(Invitrogen)中,然后用TRIzol法提取總RNA。用瓊脂糖凝膠電泳和Nano2000測定RNA的完整性和濃度。以700 ng RNA為模板,按照PrimeScriptRT Reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)試劑盒(TaKaRa)說明書,合成cDNA模板。
根據(jù)轉(zhuǎn)錄組序列信息,獲得棉蚜基因的部分編碼區(qū)序列。設(shè)計引物ATPb-1F和ATPb-1R(表1),以合成的cDNA為模板進(jìn)行RT-PCR,對該基因的核苷酸序列進(jìn)行驗證。PCR擴(kuò)增體系(20 μL):10 μL PCR Mix,上下游引物(10 μmol·L)各0.5 μL,3 μL cDNA模板,ddHO 6 μL。PCR擴(kuò)增條件:95 ℃ 3 min;95 ℃ 20 s,58 ℃ 20 s,72 ℃ 60 s,35個循環(huán);72 ℃ 8 min;10 ℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1.0%~1.5%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測,切膠回收目的條帶?;厥债a(chǎn)物用DNA回收試劑盒(OMEGA)回收,將回收產(chǎn)物連接到pEASY-T3(全式金)克隆載體上,導(dǎo)入到感受態(tài)細(xì)胞DH5α中,進(jìn)行藍(lán)白斑篩選,鑒定陽性克隆質(zhì)粒,將陽性質(zhì)粒送往生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序。
利用1.3節(jié)提取的RNA,按照寶生物SMARTer RACE 5′/3′ Kit試劑盒(Takara)說明書合成5′和3′端RACE擴(kuò)增模板。根據(jù)1.3節(jié)克隆的基因的部分核苷酸序列分別設(shè)計5′和3′端GSP引物和NGSP引物(表1)。按照試劑盒要求的PCR擴(kuò)增體系和條件進(jìn)行PCR擴(kuò)增,之后用1.0%~1.5%的瓊脂糖凝膠進(jìn)行檢測,回收目的條帶,進(jìn)行連接、轉(zhuǎn)化、藍(lán)白斑篩選和陽性克隆的測序,方法與1.3節(jié)相同。
表1 棉蚜AgoATPb基因克隆與qRT-PCR引物
用在線工具ORF Finder預(yù)測基因的閱讀框架;用在線軟件ExPASy(https://web.expasy.org/translate/)預(yù)測氨基酸的等電點與分子量;利用在線工具h(yuǎn)ttp://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/預(yù)測跨膜區(qū);用在線軟件Blastp(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)進(jìn)行AgoATPb氨基酸序列比對,并下載其他物種同源序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹和多重連配圖的構(gòu)建;利用在線軟件SignalP 5.0 Server預(yù)測AgoATPb蛋白的信號肽。
吸取50 μL PBS磷酸緩沖液(pH值8.0)滴在體式顯微鏡鏡頭中央,用毛筆挑取4日齡棉蚜置于PBS溶液中,用消毒昆蟲針和顯微手術(shù)鑷解剖分離唾液腺、腦、卵巢、中腸和脂肪體等部位。解剖完成后立即放入裝有200 μL TRIzol的1.5 mL離心管中,-80 ℃保存?zhèn)溆?。收集胚胎期?日齡、3日齡、5日齡、7日齡、9日齡、13日齡和17日齡的棉蚜,分別提取總RNA,經(jīng)過瓊脂糖電泳和Nano2000確定總RNA質(zhì)量與濃度后,放置于-80 ℃保存?zhèn)溆?。以提取的總RNA為模板,按照PrimeScriptRT Reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)試劑盒(TaKaRa)說明書反轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,用于qRT-PCR反應(yīng),以確定基因的表達(dá)水平。每個部位收集50頭蚜蟲作為一個生物學(xué)重復(fù),每個齡期收集30頭蚜蟲作為一個生物學(xué)重復(fù)。每個部位和每個日齡3次生物學(xué)重復(fù)。
將在棉花上長期飼養(yǎng)的棉蚜,轉(zhuǎn)接到西葫蘆葉片上3代后,將1日齡棉蚜分別轉(zhuǎn)接到棉花、黃瓜、西葫蘆和甜瓜葉片上,每個葉片轉(zhuǎn)接15頭仔蚜,待在4種植物上生長3個世代后,收集10頭4日齡的仔蚜,提取總RNA,經(jīng)過瓊脂糖凝膠電泳和Nano2000確定總RNA質(zhì)量,根據(jù)試劑盒要求反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,進(jìn)行qRT-PCR反應(yīng)。每種植物3次生物學(xué)重復(fù)。
為了避免基因組DNA對qRT-PCR反應(yīng)的影響,棉蚜700 ng 總RNA用gDNA Eraser去除基因組DNA。之后,根據(jù)PrimeScriptRT Reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)(TaKaRa)試劑盒的說明,以處理過的總RNA為模板合成cDNA。目的基因特異性引物ATPb-2F和ATPb-2R用于確定的表達(dá)水平。選取-為內(nèi)參基因,內(nèi)參基因的引物為β-actin-F和β-actin-R。引物設(shè)計在Primer Premier 5.0中進(jìn)行,引物序列見表1。qRT-PCR反應(yīng)在ABI 7500(Carlsbad)上進(jìn)行,反應(yīng)體系和反應(yīng)條件按照說明書進(jìn)行設(shè)置。每個處理設(shè)置3個生物學(xué)重復(fù)和3個技術(shù)重復(fù)。
基因的表達(dá)水平用2法計算。棉蚜不同部位、不同日齡和不同植物寄主棉蚜基因表達(dá)差異用單因素方差分析(ANOVA)方法的鄧肯氏檢驗進(jìn)行比較,差異水平=0.05。所有數(shù)據(jù)分析都在SPSS軟件中完成(Version 14.0)。
以棉蚜cDNA為模板擴(kuò)增獲得了基因的部分核苷酸序列,測序結(jié)果表明,該片段長度為697 bp,與預(yù)期大小相同。根據(jù)獲得的部分核苷酸序列設(shè)計引物,通過RACE技術(shù),得到了棉蚜基因的全長序列。該基因全長1 247 bp,其中,閱讀框822 bp,5′端非編碼區(qū)128 bp,3′端非編碼區(qū)297 bp,共編碼274個氨基酸殘基(圖1)。利用生物信息學(xué)在線工具(https://web.expasy.org/translate/)對氨基酸序列進(jìn)行分析,預(yù)測棉蚜AgoATPb蛋白分子量為31.40 ku,等電點為8.95。SignalP Server和TMHMMServer預(yù)測結(jié)果表明,該基因的氨基酸序列無信號肽和跨膜區(qū)。
紅色代表為起始密碼子;*代表終止密碼子;黑色橫線部分為加尾信號(AATAAA)。
系統(tǒng)發(fā)育樹分析結(jié)果表明,昆蟲的親緣關(guān)系越近,ATP合成酶B亞基氨基酸序列一致性越高,棉蚜、高粱蚜()、豌豆蚜()、大豆蚜()等聚集在一起,與褐飛虱()、茶翅蝽()、二化螟()親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖2)。多重連配結(jié)果表明,AgoATPb與其他昆蟲同源氨基酸序列有78個高度保守位點,存在ATP合成酶家族的典型結(jié)構(gòu)域(圖3)。將基因的氨基酸序列在NCBI上進(jìn)行比對發(fā)現(xiàn),其與其他昆蟲的一致性為47%~99%。
采用鄰接法,自舉檢驗1 000次;圖中標(biāo)尺為遺傳距離。
黑色橫線部分代表ATP合成酶B亞基的典型結(jié)構(gòu)域。黑色陰影為氨基酸具有100%一致性,灰色表示一致性在50%以上,白色表示一致性在50%以下。AaeATPb,埃及伊蚊;CquATPb,致倦庫蚊;GmeATPb,大蠟螟;SfrATPb,草地貪夜蛾;AgoATPb,棉蚜;MpeATPb,桃蚜;ApiATPb,豌豆蚜。
基因在棉蚜唾液腺、腦、卵巢、中腸、脂肪體中都有表達(dá),且在不同部位表達(dá)水平存在顯著差異(=37.429,<0.001)。在唾液腺和腦中的表達(dá)水平雖無顯著差異,但是二者表達(dá)量均顯著高于卵巢和脂肪體,而在中腸表達(dá)水平最低;總體上基因在卵巢、中腸和脂肪體中相對表達(dá)量較低(圖4)。
圖中的數(shù)值用平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤表示,柱上無相同小寫字母表示差異顯著(P<0.05)。下同。
基因在不同日齡棉蚜間表達(dá)水平存在著顯著差異(=23.343,<0.001)。除了在胚胎期不表達(dá)外,在其他日齡均有表達(dá),從胚胎期開始表達(dá)量上升,3日齡棉蚜中表達(dá)水平最高,之后降低,在17日齡表達(dá)量最低(圖5)。
圖5 AgoATPb基因在胚胎和不同日齡棉蚜中表達(dá)水平
在棉蚜取食不同植物后,基因表達(dá)水平存在顯著差異(=64.822,<0.001)。在棉花上棉蚜體內(nèi)基因表達(dá)水平最高,顯著高于黃瓜、甜瓜和西葫蘆,在黃瓜和西葫蘆上表達(dá)水平相當(dāng),甜瓜上表達(dá)水平最低,顯著低于在其他植物上(圖6)。
圖6 不同寄主植物上4日齡棉蚜體內(nèi)AgoATPb基因的表達(dá)量
ATP合成酶B亞基是昆蟲催化供能物質(zhì)ATP合成的關(guān)鍵基因,但對重要害蟲棉蚜ATP合成酶B亞基基因的研究目前還未見有報道?;诖耍狙芯繌拿扪赁D(zhuǎn)錄組中篩選出了ATP合成酶B亞基基因的部分核苷酸序列,結(jié)合RACE技術(shù)獲得了棉蚜ATP合成酶B亞基基因的1 247 bp全長序列,其閱讀框為822 bp,5′端非編碼區(qū)128 bp,3′端非編碼區(qū)297 bp,共編碼274個氨基酸殘基,其分子量為31.40 ku,等電點為8.95。通過在GenBank數(shù)據(jù)庫中的Blastp進(jìn)行比對發(fā)現(xiàn),AgoATPb氨基酸序列與其他物種同源氨基酸序列一致性均在47%以上。
根據(jù)基因在不同部位表達(dá)和齡期的表達(dá),可以推測基因的功能。通常認(rèn)為ATP合成酶B亞基與能量物質(zhì)ATP的合成有重要關(guān)系,而脂肪體是昆蟲能量儲存和代謝的主要部位,推測應(yīng)該在脂肪體具有高水平的表達(dá);然而,本研究發(fā)現(xiàn)該基因在脂肪體的表達(dá)含量最低,這也說明該基因不僅僅參與能量物質(zhì)的合成。同時,基因在棉蚜唾液腺中表達(dá)水平最高,這可能與棉蚜適應(yīng)寄主植物有關(guān)。因為唾液腺既能夠幫助刺吸式昆蟲應(yīng)對植物的防御反應(yīng),又能夠幫助其順利取食植物韌皮部的汁液。基因在棉蚜的多個部位均有表達(dá),說明其具有多種生理功能?;虺嗽谂咛テ诓槐磉_(dá)外,在棉蚜其他各個日齡均有不同水平的表達(dá),表明其在棉蚜生長發(fā)育過程中也起著重要作用。
對豌豆蚜和柑橘木虱唾液腺的研究發(fā)現(xiàn),ATP合成酶B亞基基因存在于昆蟲的唾液腺中,推測其與適應(yīng)寄主植物有關(guān)。本研究中,棉蚜取食黃瓜、棉花、西葫蘆和南瓜后其體內(nèi)基因表達(dá)水平存在著顯著差異。基因表達(dá)水平與昆蟲適應(yīng)寄主植物有密切關(guān)系,因此昆蟲在取食新寄主植物時基因表達(dá)水平會發(fā)生改變。基因在不同寄主植物上表達(dá)水平變化也有可能與棉蚜適應(yīng)寄主植物有關(guān),基因在棉蚜適應(yīng)寄主植物中的生理功能有待深入驗證。