陸碧云 李亞軍 龔 玲 劉代順 (遵義醫(yī)科大學(xué)第三附屬醫(yī)院,遵義市第一人民醫(yī)院,遵義563002)
癌癥是世界范圍內(nèi)的主要公共衛(wèi)生問題,在諸多國(guó)家中,位于人類死亡原因的首位,并且其發(fā)病率和死亡率仍逐年上升[1]。長(zhǎng)期以來癌癥的早期診斷、治療以及評(píng)估預(yù)后均是醫(yī)學(xué)領(lǐng)域急需解決的難題。盡管近10年來在腫瘤的診療方面已取得顯著進(jìn)展,多種成熟的個(gè)體化癌癥治療手段已應(yīng)用于臨床,如:手術(shù)、放療、化療、靶向治療、激素治療、免疫治療及多學(xué)科聯(lián)合治療,已使許多癌癥患者的生存和預(yù)后得到了改善。但大多數(shù)癌癥患者的生存質(zhì)量不高,5年生存率不理想。這主要是由于他們無法得到早期診斷和治療[2]。因此,尋找與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展以及預(yù)后相關(guān)的生物學(xué)標(biāo)志物具有重要的臨床意義。
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(LncRNA)是一類長(zhǎng)度超過200個(gè)核苷酸序列的非編碼RNA,缺乏蛋白質(zhì)編碼能力[3]?,F(xiàn)有研究已證實(shí)LncRNA在多種分子調(diào)控中發(fā)揮重要作用,如表觀遺傳調(diào)控、選擇性剪接、轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控以及修飾等[4-5];此外,LncRNA還參與細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、分化、凋亡、細(xì)胞周期進(jìn)展等多種生物學(xué)過程,在人類各種疾病的生理、病理過程中發(fā)揮不可或缺的作用[6]。越來越多的研究表明LncRNA在腫瘤組織中異常表達(dá),可同時(shí)作為致癌基因與抑癌因子,并可通過調(diào)控癌細(xì)胞的增殖、分化、侵襲、遷移和凋亡影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展[7]。
LncRNA SBF2-AS1位于11p15.1位點(diǎn),是具有2 708個(gè)核苷酸的反義RNA[8]。最近越來越多的研究表明SBF2-AS1在多種癌癥中異常表達(dá),SBF2-AS1高表達(dá)可促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移、分化和浸潤(rùn)。研究證實(shí)它與多種癌癥患者的臨床病理特征和預(yù)后密切相關(guān),如非小細(xì)胞肺癌、宮頸癌、胰腺癌、結(jié)腸癌和肝細(xì)胞癌等[8-12]。但是由于目前已有研究結(jié)果的不一致性和單個(gè)研究樣本的不足,本研究首次整合現(xiàn)有關(guān)于SBF2-AS1的研究結(jié)果進(jìn)行Meta分析,以進(jìn)一步驗(yàn)證其在腫瘤中的潛在預(yù)后價(jià)值。
1.1 文獻(xiàn)檢索 采用PubMed,Web of Science,Co‐chrane Library、Embase、中國(guó)知網(wǎng)以及萬方等數(shù)據(jù)庫檢索2020年3月前發(fā)表的相關(guān)研究,檢索策略為主題詞和自由詞相結(jié)合,中文檢索詞包括長(zhǎng)鏈非編碼RNA、SBF2-AS1、SBF2反義RNA、癌癥、預(yù)后和臨床病理特征,外文數(shù)據(jù)庫檢索式為SBF2-AS1,SBF2 antisense RNA 1,cancer,survival,prognosis,clinico‐pathological features。中文數(shù)據(jù)庫檢索式為(長(zhǎng)鏈非編碼RNA SBF2-AS1)OR(LncRNA SBF2-AS1)OR(SBF2反義RNA)AND(腫瘤OR癌癥AND預(yù)后OR臨床病理特征)。
1.2 文獻(xiàn)納入與排除標(biāo)準(zhǔn) 納入標(biāo)準(zhǔn):①腫瘤組織樣本取自癌癥患者,并采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)檢測(cè)組織中SBF2-AS1表達(dá)水平;②癌癥患者分為高表達(dá)組和低表達(dá)組,分類標(biāo)準(zhǔn)為腫瘤組織中SBF2-AS1表達(dá)情況;③評(píng)估SBF2-AS1不同表達(dá)水平與癌癥患者預(yù)后或臨床病理特征的相關(guān)性;④提供可靠數(shù)據(jù),用于提取或計(jì)算危險(xiǎn)比(HR)、比值比(OR)及95%CI;⑤以英文或中文形式出版。排除標(biāo)準(zhǔn):①重復(fù)文章、病例報(bào)告、評(píng)論文章、信件、會(huì)議報(bào)告和動(dòng)物研究;②缺乏完整數(shù)據(jù)計(jì)算HR、OR、95%CI和P值;③僅涉及細(xì)胞水平研究;④未將患者分為高、低表達(dá)組。
1.3 數(shù)據(jù)的提取和文獻(xiàn)質(zhì)量評(píng)價(jià) 2名研究者嚴(yán)格按照納入和排除標(biāo)準(zhǔn)篩選相關(guān)文獻(xiàn),評(píng)估和提取符合條件的文獻(xiàn)數(shù)據(jù),遇到分歧通過與第三位研究者協(xié)商最終達(dá)成一致。每篇文獻(xiàn)中需提取以下信息:第一作者、出版年份、腫瘤類型、截止(cutoff)值、SBF2-AS1檢測(cè)方法、病例總數(shù)、患者的年齡和性別、SBF2-AS1不同表達(dá)組中的患者總數(shù)、在不同表達(dá)組中淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、TNM分期、腫瘤大小和腫瘤分化的病例數(shù),以及HR值和95%CI。若研究同時(shí)包含單因素和多因素分析,采用多因素分析結(jié)果。若僅提供了生存曲線,則采用軟件Engauge Digitizer 10.4提取生存數(shù)據(jù)。采用紐卡斯?fàn)?渥太華量表(Newcastle-Ottawa quality as‐sessment Scale,NOS)評(píng)估研究質(zhì)量。評(píng)分項(xiàng)目分為3個(gè)主要類別:選擇、結(jié)果評(píng)估和可比性。NOS評(píng)分總分為9分,分?jǐn)?shù)≥7則認(rèn)為研究質(zhì)量高。2名研究者分別打分,遇到分歧通過與第三位研究者協(xié)商解決。
1.4 GEPIA在線分析 GEPIA為癌癥和正?;虮磉_(dá)譜的公共數(shù)據(jù)庫,可用于分析TCGA的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)庫采用單因素方差分析進(jìn)行目標(biāo)基因差異表達(dá)分析。生存分析采用Kaplan-Meier法和Logrank檢驗(yàn);HR和95%CI在Kaplan-Meier曲線中展現(xiàn)。
1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用stata12.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。利用合并的HR或OR以及95%CI值評(píng)估SBF2-AS1與癌癥患者預(yù)后和臨床病理特征的關(guān)系。采用Q和I2進(jìn)行異質(zhì)性檢驗(yàn),如不存在異質(zhì)性(I2<50%,P>0.05)采用固定效應(yīng)模型,反之則采用隨機(jī)效應(yīng)模型。如各研究存在異質(zhì)性,則采用亞組分析和敏感性分析探討異質(zhì)性來源,采用Begg法檢測(cè)潛在發(fā)表偏倚。
2.1 納入研究的特征 嚴(yán)格按照納入和排除標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選后,共納入12篇文獻(xiàn),篩選流程見圖1,12個(gè)研究均來自中國(guó),共包含1 125例患者,樣本量為20~180,均在2016年至2020年出版,其中2篇以中文發(fā)表,10篇以英文發(fā)表。共涉及9種癌癥:胰腺癌2篇[10-13]、小細(xì)胞肺癌1篇[14]、結(jié)直腸癌1篇[11]、肝細(xì)胞癌2篇[12-15]、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤1篇[16]、非小細(xì)胞肺癌2篇[8-17]、宮頸癌1篇[9]、乳腺癌1篇[18]、胃癌1篇[19]。研究均采用qRT-PCR檢測(cè)SBF2-AS1表達(dá),根據(jù)SBF2-AS1表達(dá)差異分為高表達(dá)組和低表達(dá)組。研究質(zhì)量較高,其中5篇為7分,6篇為8分,1篇為9分。所有符合條件的文章特征見表1。
圖1 研究選擇和鑒別的流程圖Fig.1 Flow diagram of study selection and identification
2.2 SBF2-AS1表達(dá)與總生存期的關(guān)系 納入文獻(xiàn)中共有9篇包含945例患者探討不同癌癥患者SBF2-AS1表達(dá)水平與OS的關(guān)系。因研究間不存在明顯異質(zhì)性,故采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行分析(I2=0.0%,P=0.581),結(jié)果顯示,SBF2-AS1高表達(dá)組患者總生存期較短(HR=1.84,95%CI:1.31~2.36,P≤0.001,圖2A)。此外,本研究根據(jù)腫瘤類型、HR評(píng)估方法和樣本大小進(jìn)行亞組分析,結(jié)果表明以上3組中,SBF2-AS1高表達(dá)均會(huì)導(dǎo)致患者總生存期縮短(圖2B~D)。敏感性分析驗(yàn)證了結(jié)果的穩(wěn)健性(圖3A);Begg法表明在OS相關(guān)文獻(xiàn)中不存在明顯發(fā)表偏倚(圖3B)。表明高表達(dá)SBF2-AS1有望成為預(yù)測(cè)患者總生存期的標(biāo)志物。
2.3 SBF2-AS1的表達(dá)與臨床病理特征的關(guān)系 采用OR及95%CI評(píng)估SBF2-AS1表達(dá)與臨床病理特征的關(guān)系如圖4、表2所示,SBF2-AS1高表達(dá)患者TNM分期傾向于向II/IIV期(HTS)發(fā)展(I2=0.0%,P=0.909;OR=3.15,95%CI:2.34~4.22,P≤0.001,4A),更易發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(LNM)(I2=59.8%,P=0.015;OR=2.61,95%CI:1.61~4.24,P≤0.001,圖4B),腫瘤直徑(LTS)更大(I2=67.4%,P=0.005;OR=1.98,95%CI:1.16~3.38,P=0.012,圖4C),但SBF2-AS1高表達(dá)與癌癥患者腫瘤低分化級(jí)別(PHG)(I2=80.6%,P≤0.001;OR=1.30,95%CI:0.65~2.59,P=0.458,圖4D)、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移(DM)、年齡和性別無明顯相關(guān)性。
圖2 SBF2-AS1表達(dá)與總生存期的關(guān)系森林圖Fig.2 Forest plot for SBF2-AS1 expression and overall survival
表1 納入研究的主要特征Tab.1 Main characteristics of included studies
圖3 總生存期相關(guān)文獻(xiàn)的敏感性分析和Begg檢測(cè)Fig.3 Sensitivity analysis and Begg′s test of included studies related to overall survival
圖4 SBF2-AS1表達(dá)與臨床病理特征關(guān)系的森林圖Fig.4 Forest plot of SBF2-AS1 expression and clinico?pathological features
2.4 GEPIA分析驗(yàn)證結(jié)果 為進(jìn)一步驗(yàn)證以上結(jié)果的可靠性,采用GEPIA研究SBF2-AS1在各種腫瘤中的作用。SBF2-AS1在膽管癌(CHOL)、彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤(DLBC)、腎嫌色細(xì)胞癌(KICH)和胸腺瘤(THYM)等腫瘤中異常表達(dá)(圖5A)。小提琴圖表明SBF2-AS1表達(dá)在多種腫瘤中與臨床分期密切相關(guān)[F=3.01,P(r>F)=0.010 2,圖5B]。9 481例患者分為高、低表達(dá)組前提下,GEPIA分析將SBF2-AS1在各種腫瘤中的表達(dá)情況與其生存數(shù)據(jù)進(jìn)行合并,結(jié)果發(fā)現(xiàn)SBF2-AS1高表達(dá)與較差的總生存期確實(shí)密切相關(guān)(HR=1.3,Log-rankP<0.01,圖5C)。SBF2-AS1有望成為預(yù)測(cè)多種癌癥預(yù)后的生物學(xué)標(biāo)志物。
圖5 GEPIA分析驗(yàn)證SBF2-AS1表達(dá)與癌癥患者預(yù)后的關(guān)系Fig.5 Verification of relation between SBF2-AS1 and prognosis of cancer patients via analysis of GEPIA
表2 納入研究的患者的主要臨床病理特征Tab.2 Clinicopathological features of included studies
癌癥對(duì)人類健康造成嚴(yán)重威脅,至今仍無法治愈,因此,研究者致力于尋找新的腫瘤標(biāo)記物和治療靶點(diǎn)以改善腫瘤患者的早期診斷、治療和遠(yuǎn)期預(yù)后。目前研究認(rèn)為,LncRNA不僅在細(xì)胞生物學(xué)各方面具有重要作用,其異常表達(dá)與癌癥發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),因此被認(rèn)為是最有潛力的生物學(xué)標(biāo)志物之一[20]。最近Meta分析表明,多種LncRNA均可作為癌癥患者的預(yù)后標(biāo)志物,進(jìn)一步證實(shí)LncRNA在腫瘤患者預(yù)后預(yù)測(cè)中的潛力[21-23]。
LV等[24]發(fā)現(xiàn)SBF2-AS1在非小細(xì)胞肺癌中高表達(dá),并與癌癥患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和TNM II/IIV期相關(guān),而沉默SBF2-AS1表達(dá)可抑制癌癥細(xì)胞轉(zhuǎn)移和侵襲。ZHAO等[8]發(fā)現(xiàn)SBF2-AS1在非小細(xì)胞肺癌中高表達(dá),并與患者總生存期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和病理分級(jí)相關(guān)。膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中,SBF2-AS1高表達(dá),敲低SBF2-AS1表達(dá)可抑制膠質(zhì)母細(xì)胞瘤血管生成和細(xì)胞增殖[25]。SBF2-AS1在多種癌癥中表達(dá)上調(diào),與患者總生存期和臨床病理特征密切相關(guān),并參與癌癥細(xì)胞生長(zhǎng)、轉(zhuǎn)移和侵襲等生物學(xué)過程[9-10,14]。
但由于單個(gè)研究樣本量較小,且研究結(jié)果存在差異,為進(jìn)一步驗(yàn)證SBF2-AS1作為腫瘤預(yù)后標(biāo)記物的潛力,課題組進(jìn)行了Meta分析,共納入12篇文獻(xiàn),1 125例腫瘤患者,包含9種癌癥。結(jié)果表明,與低表達(dá)組相比,SBF2-AS1高表達(dá)組癌癥患者生存率明顯降低。根據(jù)癌癥類型、樣本量和HR提取方法進(jìn)行亞組分析結(jié)果表明,在以上亞組中SBF2-AS1高表達(dá)與較差的總生存期密切相關(guān)。此外,SBF2-AS1表達(dá)與腫瘤TNM II/IIV期分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、更大的腫瘤直徑密切相關(guān),但與癌癥患者年齡、性別、腫瘤分化級(jí)別和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移無關(guān)。表明SBF2-AS1有望成為新的癌癥預(yù)后標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。
目前研究致力于探索SBF2-AS1調(diào)控癌癥發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制。研究發(fā)現(xiàn),SBF2-AS1通過miR-188-5p/ZFP91途徑,作為致癌基因促進(jìn)急性髓系白血病細(xì)胞生長(zhǎng)[26]。CHEN等[27]發(fā)現(xiàn)SBF2-AS1可通過吸附miR-338-3p和miR-362-3p提高E2F1表達(dá),促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞生長(zhǎng)。肝細(xì)胞癌中,SBF2-AS1可通過提高TGFBR表達(dá)調(diào)控miR-140e5p表達(dá),促進(jìn)腫瘤發(fā)生發(fā)展[15]。另有研究發(fā)現(xiàn),SBF2-AS1可通過提高HDAC3表達(dá)調(diào)控miR-619-5p進(jìn)而促進(jìn)結(jié)直腸癌細(xì)胞生長(zhǎng)[11]。GAO等[9]發(fā)現(xiàn)SBF2-AS1高表達(dá)可通過海綿式吸附miR-361-5p調(diào)節(jié)FOXM1表達(dá),進(jìn)而調(diào)控宮頸癌細(xì)胞增殖。HUA等[10]報(bào)道在胰腺癌中高表達(dá)的SBF2-AS1可通過調(diào)控miR-142-3p/TWF1途徑影響胰腺癌細(xì)胞上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化、細(xì)胞增殖遷移和侵襲等過程,進(jìn)而影響胰腺癌發(fā)生發(fā)展。此外,LIANG等[19]發(fā)現(xiàn),在胃癌中,SBF2-AS1與miR-302b-3p的相互作用可通過調(diào)控E2F3表達(dá)影響胃癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲等過程。綜上所述,SBF2-AS1在癌癥中的調(diào)控機(jī)制主要表現(xiàn)為:通過對(duì)各種miRNA吸附進(jìn)而調(diào)控下游靶基因或蛋白,影響癌癥細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移、侵襲和凋亡等生物學(xué)過程,從而促進(jìn)癌癥發(fā)生發(fā)展,為未來研究SBF2-AS1調(diào)控癌癥的機(jī)制提供了重要線索。
本研究局限性主要表現(xiàn)為:①納入研究的患者均來自中國(guó),可能導(dǎo)致本研究結(jié)果僅適用于中國(guó)人或亞洲人;②樣本量相對(duì)較小,可能導(dǎo)致研究結(jié)果缺少可信度;③部分研究未直接提供HR和95%CI,而是從生存曲線中提取,相比直接提取的數(shù)據(jù)可能會(huì)影響結(jié)果的準(zhǔn)確性。因此,本研究結(jié)果可能夸大SBF2-AS1在各種腫瘤中的預(yù)后價(jià)值。
綜上所述,SBF2-AS1高表達(dá)可能導(dǎo)致癌癥患者總生存期縮短,并與癌癥患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM的II/IIV期分期及更大的腫瘤直徑相關(guān)。因此,SBF2-AS1有望成為多種癌癥的預(yù)后標(biāo)志物,今后將通過更大的樣本量、更廣泛的人群來源和標(biāo)準(zhǔn)化的臨床試驗(yàn)進(jìn)一步驗(yàn)證SBF2-AS1在各種腫瘤中的預(yù)后價(jià)值。