于秋麗,王 峰
肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)是最常見的肝臟惡性腫瘤[1],肝癌的發(fā)生發(fā)展是環(huán)境、病毒、癌基因激活和抑癌基因突變等多種因素共同作用的結(jié)果。目前其治療以手術(shù)、介入治療、分子靶向治療以及全身系統(tǒng)化療等多種治療手段聯(lián)合應(yīng)用為主。由于肝癌發(fā)病早期缺乏典型特征和特異性生物標(biāo)志物,多數(shù)患者確診時(shí)已處于中晚期,失去了最佳的治療時(shí)機(jī),以致肝癌是所有癌癥相關(guān)死亡的第三大死亡原因[2]。闡明肝癌發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)移的分子基礎(chǔ),找到用于肝癌早期檢測(cè)和分子靶點(diǎn)的生物標(biāo)志物,將為肝癌的早期診斷和治療提供新的視角。叢生蛋白(clusterin,CLU)是一種應(yīng)激誘導(dǎo)的細(xì)胞保護(hù)伴侶蛋白,在多種癌癥中過表達(dá),以應(yīng)對(duì)化療、激素消融術(shù)和放射治療等癌癥治療方法,從而產(chǎn)生抵抗性[3,4]。為探究HCC中CLU的表達(dá),Kang等[5]用組織微陣列方法檢查了100例手術(shù)切除的HCC組織,發(fā)現(xiàn)共有89例HCC組織表現(xiàn)出CLU過表達(dá),這與腫瘤不良的Edmondson組織學(xué)分級(jí)和高TNM分期有關(guān)。另一項(xiàng)研究[4]表明CLU過表達(dá)是肝癌轉(zhuǎn)移的重要因素,這可能與人類軟骨糖蛋白-39在HCC中的轉(zhuǎn)移作用有關(guān)。鑒于CLU在肝癌的發(fā)生、發(fā)展中的重要作用,本研究對(duì)CLU在肝癌細(xì)胞HepG2中的表達(dá)情況進(jìn)行定量并構(gòu)建其啟動(dòng)子的表達(dá)質(zhì)粒,以期對(duì)其在肝癌中的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制進(jìn)行進(jìn)一步的研究。
1.1細(xì)胞培養(yǎng) 肝癌細(xì)胞株HepG2和人正常肝細(xì)胞L02均是本實(shí)驗(yàn)室保存。上述細(xì)胞分別培養(yǎng)于含有10%胎牛血清(Gibco公司)的DMEM高糖培養(yǎng)基(Gibco公司)和含有10%胎牛血清的1640培養(yǎng)基(Gibco公司)培養(yǎng)液中。培養(yǎng)箱條件設(shè)置為37 ℃、5% CO2。待細(xì)胞匯合度達(dá)到85%以上時(shí)用于后續(xù)研究實(shí)驗(yàn)。
1.2RNA的提取及實(shí)時(shí)熒光定量PCR(real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)
嚴(yán)格按照TaKaRa試劑盒說明書的步驟進(jìn)行L02細(xì)胞和HepG2細(xì)胞RNA的提取和逆轉(zhuǎn)錄,按照SYBR Master Mix試劑盒(Roche公司)說明書配制反應(yīng)體系和設(shè)置反應(yīng)條件,進(jìn)行RT-qPCR檢測(cè)。每個(gè)樣本至少重復(fù)3次,計(jì)算平均Ct值,根據(jù)2-ΔΔCt計(jì)算相對(duì)表達(dá)量。CLU的引物序列:F:5′-CTACTTCTGGATGAATGGTGACC-3′;R:5′-CGGGTGAAGAACCTGTCCT-3′。內(nèi)參GAPDH的引物序列:F:5′-GCACCGTCAAGGCTGAGAAC-3′;R:5′-TGGTGAAGACGCCAGTGGA-3′。
1.3CLU基因的啟動(dòng)子的分析 CLU基因的啟動(dòng)子序列通過冷泉港的轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(http://rulai.cshl.edu/cgi-bin/TRED/tred.cgi?process=searchPromForm)分析獲得,序列為-700~+300。該數(shù)據(jù)庫以Genebank中的序列為基礎(chǔ)。見表1。
表1 CLU基因啟動(dòng)子序列信息
1.4細(xì)胞基因組DNA的提取 按照TaKaRa試劑盒說明書進(jìn)行肝癌細(xì)胞HepG2基因組DNA的提取。檢測(cè)DNA的純度為1.91(A260/A280),符合要求。
1.5HepG2細(xì)胞CLU基因的啟動(dòng)子序列測(cè)序 提取的HepG2基因組送上海生工公司進(jìn)行CLU基因啟動(dòng)子序列測(cè)序,并合成測(cè)序后的啟動(dòng)子序列。
1.6CLU基因啟動(dòng)子克隆質(zhì)粒構(gòu)建 合成測(cè)序后的啟動(dòng)子序列,并在啟動(dòng)子序列的兩端加上酶切位點(diǎn)(XmaⅠ/XhoⅠ)序列,用2種限制性內(nèi)切酶對(duì)pGL3-Basic質(zhì)粒進(jìn)行酶切,膠回收載體片段,然后通過連接反應(yīng)將目的啟動(dòng)子序列插入到pGL3-Basic表達(dá)載體中,并轉(zhuǎn)化到感受態(tài)大腸桿菌DH5α中,經(jīng)篩選獲得單克隆。
1.7質(zhì)粒轉(zhuǎn)化、提取及驗(yàn)證 將含有pGL3-CLU質(zhì)粒的菌種接種到含有氨芐青霉素的(100 mg/L)LB液體培養(yǎng)基中,于37 ℃搖床中培養(yǎng)16 h。提取質(zhì)粒后進(jìn)行酶切(XmaⅠ/XhoⅠ限制性內(nèi)切酶),酶切后質(zhì)粒通過瓊脂糖凝膠電泳鑒定。提取的質(zhì)粒進(jìn)一步通過測(cè)序鑒定。
2.1HepG2細(xì)胞和L02細(xì)胞的CLU mRNA表達(dá)水平比較 RT-qPCR檢測(cè)結(jié)果顯示,HepG2細(xì)胞CLU mRNA的表達(dá)水平顯著高于L02細(xì)胞(t=20.670,P=0.002)。HepG2細(xì)胞CLU mRNA的相對(duì)表達(dá)量約是L02細(xì)胞的9.38倍。見圖1。
圖1 HepG2細(xì)胞和L02細(xì)胞的CLU mRNA表達(dá)水平比較圖
2.2HepG2細(xì)胞CLU基因啟動(dòng)子測(cè)序結(jié)果與Genebank中的序列比對(duì)結(jié)果 測(cè)序比對(duì)結(jié)果顯示,HepG2細(xì)胞的CLU基因啟動(dòng)子區(qū)序列與Genebank中的序列一致,未發(fā)現(xiàn)突變。見圖2。
2.3pGL3-CLUP表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定 構(gòu)建后的重組pGL3-CLUP質(zhì)粒用XmaⅠ/XhoⅠ酶切后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,電泳結(jié)果顯示pGL3-CLUP質(zhì)粒在雙酶切之后,出現(xiàn)兩條片段,一條在5 000 bp附近,一條在1 000~1 500 bp處。經(jīng)單酶切的原質(zhì)粒pGL3-CLUP電泳條帶在5 000~6 000 bp之間,提示表達(dá)啟動(dòng)子的重組質(zhì)粒構(gòu)建成功,見圖3。pGL3-CLUP表達(dá)質(zhì)粒圖譜見圖4。
圖2 HepG2細(xì)胞CLU基因啟動(dòng)子測(cè)序結(jié)果與Genebank中的序列比對(duì)結(jié)果圖
條帶1為DNA ladder,條帶2為經(jīng)雙酶切之后的pGL3-CLUP質(zhì)粒,條帶3為經(jīng)單酶切的pGL3-CLUP質(zhì)粒
圖4 pGL3-CLUP質(zhì)粒圖譜
3.1肝癌的發(fā)生涉及癌基因及其產(chǎn)物的多個(gè)突變,這些突變通過多種信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑調(diào)節(jié)腫瘤的發(fā)生與發(fā)展。由于缺乏有效的特異性生物標(biāo)志物,早期肝癌的成功檢測(cè)是一個(gè)挑戰(zhàn),以至于發(fā)現(xiàn)癥狀時(shí)多數(shù)患者已處于晚期。肝癌的傳統(tǒng)治療以化療、肝臟切除、肝移植和射頻消融為主,但療效均不理想,導(dǎo)致肝癌患者的病死率較高[6]。早期診斷可為肝癌患者盡早接受有效治療提供機(jī)會(huì),改善預(yù)后。
3.2肝癌在發(fā)生發(fā)展過程中會(huì)差異性表達(dá)很多基因,這些基因在肝癌中的差異性表達(dá)大多受其啟動(dòng)子的調(diào)控,有些基因已被作為肝癌的差異性診斷標(biāo)志物,還有一些基因參與了肝癌發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。如本研究團(tuán)隊(duì)在此前的一項(xiàng)研究[7]中發(fā)現(xiàn),鈣調(diào)蛋白2(calponin 2,CNN2)在肝癌中高表達(dá),并對(duì)肝癌的發(fā)生發(fā)展起著重要作用;而我們的另一項(xiàng)研究[8]還發(fā)現(xiàn),蛋白衰老標(biāo)記蛋白30(senescence marker protein 30,SMP30)在肝癌中特異性低表達(dá),可作為肝癌的潛在預(yù)后指標(biāo)。
3.3CLU基因是一個(gè)單拷貝基因,位于8p21-p12染色體上,由9個(gè)外顯子、8個(gè)內(nèi)含子和一個(gè)5′-未翻譯區(qū)域構(gòu)成,它編碼人類的三種不同轉(zhuǎn)錄異型體[9]:亞型1,NM_001831,mRNA(GenBank);亞型2,NR_038335,非編碼RNA(GenBank);亞型3,NR_045494,非編碼RNA(GenBank)。GenBank數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)顯示,亞型1編碼功能蛋白,而亞型2和亞型3代表非編碼RNA。在人類中,有兩種由該基因編碼的蛋白質(zhì):分泌型叢生蛋白(secretory clusterin,sCLU)(75~80 kda)和核CLU蛋白(55 kda)[10]。CLU基因首次在公羊睪丸網(wǎng)液中被檢測(cè)到,隨后在許多不同的組織中發(fā)現(xiàn)CLU基因的存在[11,12]。因此,在對(duì)該基因的研究之初,它有許多不同的名稱,如SGP-2、SP40-40、TRPM-2和ApoJ。后來經(jīng)過完整的cDNA克隆、測(cè)序和比較,證實(shí)SGP-2和TRPM-2與CLU完全相同,后來被正式命名為CLU[4]。
3.4熱休克處理HepG2細(xì)胞可以誘導(dǎo)CLU mRNA表達(dá),且這種熱休克誘導(dǎo)在不同物種的培養(yǎng)細(xì)胞中都可以觀察到。由于臨床上可能存在熱休克與細(xì)胞凋亡的關(guān)聯(lián),故CLU可能在細(xì)胞凋亡過程中起作用[13,14]。隨著研究的深入,CLU被發(fā)現(xiàn)在許多人類腫瘤中表達(dá),包括乳腺癌、肺癌、膀胱癌、腎癌和前列腺癌,且其表達(dá)與化療藥物的廣泛耐受有關(guān)。
3.5sCLU是一種80 kda糖蛋白,幾乎存在于所有體液中,對(duì)CLU基因的研究使人們對(duì)腫瘤耐藥的全新機(jī)制有了新的認(rèn)識(shí)。sCLU在多種不同的肝癌組織中表達(dá)水平存在差異,并可能促進(jìn)HCC轉(zhuǎn)移和參與HCC對(duì)化療的抵抗。但sCLU在HCC組織中的表達(dá)與HCC患者臨床病理參數(shù)之間的關(guān)系仍不清楚,未來需要收集更多的乙型肝炎病毒或丙型肝炎病毒感染的HCC患者的樣本來研究[15]。越來越多的研究[16]表明,CLU基因在肝癌細(xì)胞中異常高表達(dá),其有望成為HCC的一種新型生物標(biāo)志物。然而CLU在肝癌組織和血清中表達(dá)的相關(guān)性還不是很清楚,如果能找到CLU在肝癌組織中的表達(dá)與血清中表達(dá)的關(guān)系,了解CLU在HCC耐藥的機(jī)制和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,對(duì)于解決HCC多藥耐藥問題及肝癌的個(gè)體化治療具有重要意義[4]。
綜上所述,肝癌細(xì)胞CLU基因的表達(dá)量明顯高于正常肝細(xì)胞。pGL3-CLUP質(zhì)粒的成功構(gòu)建為后續(xù)研究CLU基因在肝癌發(fā)生發(fā)展中的機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。