張志愿
上海交通大學醫(yī)學院附屬第九人民醫(yī)院·口腔醫(yī)學院,國家口腔疾病臨床醫(yī)學研究中心,上海市口腔醫(yī)學重點實驗室,上海市口腔醫(yī)學研 究所,上海 200011
1990 年,人類基因組計劃(Human Genome Project,HGP)正式啟動,開啟了生命科學的全新時代。HGP 通過測定人類染色體中30 億個堿基對組成的核苷酸序列,繪制人類基因組圖譜以實現(xiàn)破譯人類遺傳信息的最終目的[1]。HGP 在研究過程中建立起來的策略、方法與技術(shù),構(gòu)成了生命科學領(lǐng)域的新學科——基因組學(genomics)[2],并被譽為生命科學的“登月計劃”。
“萬事皆因果”,若將基因比作“因”,表型就是基因與環(huán)境共同作用的“果”。表型,即指特定基因型的個體,在一定環(huán)境條件下,所表現(xiàn)出來的性狀特征的總和[3]。所謂性狀,即指生物體的形態(tài)、結(jié)構(gòu)和理化等特性。人類可被觀察到的結(jié)構(gòu)和功能方面的特性,包括健康的表現(xiàn)、疾病的特征等,都是表型。作為生命信息的另外“半邊天”,對人類表型開展系統(tǒng)的收集和研究意義重大,影響深遠。2016 年,復(fù)旦大學聯(lián)合上海交通大學、中國科學院上海生命科學研究院等共同啟動人類表型組計劃(Human Phenome Project,HPP),對基因、環(huán)境、表型之間多層次的關(guān)聯(lián)、整合以及三者整體性進行研究,為全面解讀人類生命健康密碼提供科技支撐。HPP 是科學研究領(lǐng)域的重大理論創(chuàng)新和突破,是新的國家科技戰(zhàn)略,標志著國際大科學時代的到來,已經(jīng)成為生物醫(yī)學研究新的突破口,也為口腔醫(yī)學的可持續(xù)發(fā)展提供了科學的理論基礎(chǔ)。
作為與臨床醫(yī)學并行的一級學科,必須利用科學的新戰(zhàn)略、新理念、新方法、新技術(shù)推動口腔醫(yī)學科學研究和臨床診治的進步,更應(yīng)與時俱進,融入已經(jīng)到來的國際大科學時代。口腔頜面部結(jié)構(gòu)復(fù)雜,表型多樣,其生長發(fā)育受到基因調(diào)控和外周環(huán)境的共同影響。越來越多的證據(jù)表明一些基因簇共同控制頜面部的形態(tài)發(fā)育,例如唐氏綜合征、魯賓斯坦-泰比(Rubinstein-Taybi)綜合征、特雷徹·柯林斯(Treacher Collins)綜合征等疾病均伴隨頜面部的特征性表型[4-5]。此外,口腔疾病的特征性表型也與全身系統(tǒng)性疾病關(guān)系密切,例如牙周病中牙齦卟啉單胞菌與動脈粥樣硬化表型顯著相關(guān)[6],口腔炎癥與心律失常、心肌梗死等表型可能存在因果關(guān)系[7]等,都說明口腔頜面部表型研究的價值和意義,也能直接銜接金力院士牽頭開展的“泰州隊列”等大樣本研究[8]。實踐證明,口腔醫(yī)學的發(fā)展是一直注重與臨床醫(yī)學、生物醫(yī)學等多學科交叉融合的結(jié)果。HPP 應(yīng)用于口腔醫(yī)學領(lǐng)域,對于解析口腔醫(yī)學未來的“密鑰”,推動其實現(xiàn)跨越式前進意義非凡,前景廣闊。建立口腔頜面表型組計劃是創(chuàng)新口腔醫(yī)學發(fā)展的戰(zhàn)略 取向,將以此確立未來口腔醫(yī)學的新路徑、新定位、新高度。
牙頜面畸形與顳下頜關(guān)節(jié)病位列口腔第三、第四大高發(fā)疾病,2 種疾病各自的特征表型具有重要研究價值。以往的臨床經(jīng)驗認為,顳下頜關(guān)節(jié)盤移位的臨床表征是疼痛、雜音和運動受限;如果沒有明顯的臨床癥狀,可以不治療[9]。然而,研究表明,關(guān)節(jié)盤移位的臨床表型與頜面部發(fā)育表型(牙、頜骨、面型等)有密切的聯(lián)系[10]。顳下頜關(guān)節(jié)病患者的面部表型通常是單側(cè)盤移位的患者下頜骨向患側(cè)偏斜,雙側(cè)盤移位患者下頜后縮。但究竟是關(guān)節(jié)盤移位引發(fā)了牙頜面畸形,還是牙頜面畸形導(dǎo)致了關(guān)節(jié)盤移位,國際學術(shù)界一直存在爭議。要解決這一爭議,大數(shù)據(jù)前瞻性隨機對照臨床試驗(randomized controlled trial,RCT)是最佳方法。由筆者和楊馳、房兵教授共同領(lǐng)銜的顳下頜關(guān)節(jié)病與牙頜面畸形的臨床研究通過建立關(guān)節(jié)盤移位、牙頜面畸形的診斷標準,形成共識和指南,并進行隊列研究、RCT 和孟德爾隨機化分析解決因果關(guān)系推論。在構(gòu)建青少年頜面部表型庫的基礎(chǔ)上,對入庫的人群進行隨訪觀察,從而幫助研究者更加客觀、準確地評價不同顳下頜關(guān)節(jié)狀態(tài)下的牙頜面表型的發(fā)育和變化。這不僅可以為長達數(shù)十年的爭論畫上句號,還將革新臨床治療的理念,從“對癥治療”發(fā)展到“對因治療”,既減輕患者的病痛和精神壓力,還能節(jié)約醫(yī)療費用,合理分配醫(yī)療資源??谇活M面表型組計劃為這類具有重要意義的臨床研究提供了新的平臺,也從新的戰(zhàn)略高度引領(lǐng)口腔醫(yī)學臨床研究走向規(guī)范化、系統(tǒng)化和常態(tài)化。
人源腫瘤異種移植模型(patient-derived tumor xenograft,PDX)是將患者的腫瘤組織直接移植到免疫缺陷鼠而建立的模型[11]。其在組織病理學、分子生物學和基因水平上保留了大部分原代腫瘤的特點和表型,具有較好的臨床療效預(yù)測性。目前,該平臺廣泛地應(yīng)用于新藥開發(fā),尤其是靶點藥物的臨床試驗患者的篩選和預(yù)測性生物標志物的研究中。我國科技部也將PDX 相關(guān)的腫瘤研究作為重點支持的戰(zhàn)略方向,筆者的博士后孫樹洋教授在2017 年獲得國家重點研發(fā)計劃資助,開展PDX 模型與惡性黑色素瘤的相關(guān)研究。該課題組聚焦于具有顯著中國人種特異性的口腔-頭頸部黏膜惡性黑色素瘤(mucosal melanoma,MM),對這類口腔頜面部惡性程度極高(患者5 年生存率10%~25%)的腫瘤進行了一系列的轉(zhuǎn)化研究實驗;報道了迄今最大規(guī)模的口腔-頭頸MM 基因組特征圖譜描繪結(jié)果及相關(guān)靶向治療的轉(zhuǎn)化研究成果;并首次利用遺傳信息學注解的MM PDX 模型隊列開展了“1×1×1”模式的小鼠臨床替代性試驗,進一步證實針對CDK4 基因擴增的MM 患者進行Palbociclib 靶向用藥的可行性[12];還報道了利用MM 患者組織源性細胞模型開展高通量藥物篩選,并在遺傳信息學注解的PDX 模型進行體內(nèi)藥效驗證,證實了Ponatinib 可作為存在KIT 特定突變位點MM 患者的潛在治療策略等[13]。因此,在前期扎實的研究基礎(chǔ)之上,依托三級甲等綜合性醫(yī)院臨床研究的強大平臺和口腔頜面表型組計劃的進一步支持,有理由相信,該研究成果可以轉(zhuǎn)化為臨床指南,為口腔-頭頸MM患者帶來新的希望。因此,口腔頜面表型組計劃實現(xiàn)了人類表型研究從臨床到基礎(chǔ)的轉(zhuǎn)移和銜接,為轉(zhuǎn)化醫(yī)學研究架起一座新橋梁。
口腔頜面表型組計劃的理論意義,在于引領(lǐng)我國口腔醫(yī)學未來的方向和趨勢;口腔頜面表型組計劃的創(chuàng)新實踐,是口腔醫(yī)學破浪揚帆的源頭和活水;兩者的有機結(jié)合必將有力推動我國口腔醫(yī)學的跨越式發(fā)展,助力“科技強國”“健康中國”戰(zhàn)略實施,在國際醫(yī)學科學舞臺上展示中國口腔人的自信和風采。
參·考·文·獻
[1] Lander ES. Initial impact of the sequencing of the human genome[J]. Nature,2011, 470(7333): 187-197.
[2] Lappalainen T, Scott AJ, Brandt M, et al. Genomic analysis in the age of human genome sequencing[J]. Cell, 2019, 177(1): 70-84.
[3] Ahnert SE. Structural properties of genotype-phenotype maps[J]. J R Soc Interface, 2017, 14(132): 20170275.
[4] 程衍楊, 劉奧杰, 魏麗, 等. Rubinstein-Taybi 綜合征臨床特點及基因診斷[J]. 臨床兒科雜志, 2018, 36(3): 207-209.
[5] 殷斌, 石冰, 賈仲林. Treacher Collins 綜合征的致病基因和臨床治療策略[J]. 華西口腔醫(yī)學雜志, 2019, 37(3): 330-335.
[6] Tonetti MS, van Dyke TE, on behalf of working group of the joint EFP/AAP workshop. Periodontitis and atherosclerotic cardiovascular disease:consensus report of the Joint EFP/AAP Workshop on Periodontitis and Systemic Diseases[J]. J Periodontol, 2013, 84(4 Suppl): S24-S29.
[7] Hajishengallis G. Periodontitis: from microbial immune subversion to systemic inflammation[J]. Nat Rev Immunol, 2015, 15(1): 30-44.
[8] Liu J, Zhang H, Dong Z, et al. Mendelian randomization analysis indicates serum urate has a causal effect on renal function in Chinese women[J]. Int Urol Nephrol, 2017, 49(11): 2035-2042.
[9] Naeije M, te Veldhuis AH, te Veldhuis EC, et al. Disc displacement within the human temporomandibular joint: a systematic review of a ‘noisy annoyance’[J]. J Oral Rehabil, 2013, 40(2): 139-158.
[10] Choi HJ, Kim TW, Ahn SJ, et al. The relationship between temporomandibular joint disk displacement and mandibular asymmetry in skeletal Class Ⅲ patients[J]. Angle Orthod, 2011, 81(4): 624-631.
[11] Mauri G, Arena S, Siena S, et al. The DNA damage response pathway as a land of therapeutic opportunities for colorectal cancer[J]. Ann Oncol, 2020, 31(9): 1135-1147.
[12] Zhou R, Shi CJ, Tao WJ, et al. Analysis of mucosal melanoma whole-genome landscapes reveals clinically relevant genomic aberrations[J]. Clin Cancer Res, 2019, 25(12): 3548-3560.
[13] Han Y, Gu ZY, Wu J, et al. Repurposing ponatinib as a potent agent against KIT mutant melanomas[J]. Theranostics, 2019, 9(7): 1952-1964.