劉奕含, 陽 鶯,2, 覃柳術(shù)
(1.桂林電子科技大學(xué) 數(shù)學(xué)與計算科學(xué)學(xué)院,廣西 桂林 541004;2.桂林電子科技大學(xué) 廣西高校數(shù)據(jù)分析與計算重點實驗室,廣西 桂林 541004)
Poisson-Nernst-Planck(PNP)方程[1]是由Poisson方程和Nernst-Planck(NP)方程耦合而成的非線性偏微分方程,用于描述溶質(zhì)生物分子體系中移動離子的電擴散,常應(yīng)用于生物分子[1]、電化學(xué)[2]和半導(dǎo)體[3]等相關(guān)領(lǐng)域。因PNP方程的非線性性和非對稱性,其解析解只在極少數(shù)情況下存在,人們提出了各種數(shù)值方法求解PNP方程,如有限差分法[4]、有限體積法[5]及有限元法[6]。有限差分法廣泛用于求解描述生物離子通道等跨膜孔的電擴散PNP方程[7-8],但將其應(yīng)用于表面高度不規(guī)則的PNP方程時,其精度不高;有限體積法可求解不規(guī)則表面的PNP方程,但高精度有限體積控制元的構(gòu)造較困難;有限元方法可處理邊界不規(guī)則區(qū)域問題,且其解的收斂速度依賴解的正則性。
有限元方法的基本思想是將連續(xù)的求解區(qū)域離散成有限個且按某些方式連接在一起的單元組合體,利用每一單元內(nèi)假設(shè)的近似函數(shù)分片表示求解區(qū)域待求的未知函數(shù),將連續(xù)的無限自由度問題變成離散的有限自由度問題。為此,利用有限元方法的思想對非線性穩(wěn)態(tài)PNP方程進(jìn)行離散,提高其求解效率。
設(shè)Ω?R3是一個多面體,且滿足Lipchitz連續(xù),?Ω為其邊界,使用標(biāo)準(zhǔn)的Sobolev空間記號Ws,p(Ω)及相應(yīng)的范數(shù)和半范數(shù)[9],當(dāng)p=2時,有
Ws,2(Ω)=Hs(Ω),
‖·‖s,p,Ω=‖·‖Ws,p(Ω)。
定義相關(guān)的線性有限元空間:
Sh={v∈H1(Ω):v|?Ω=0∩v|e∈p1(e),
?e∈Γh(Ω)},
SH={v∈H1(Ω):v|?Ω=0∩v|e∈p1(e),
?e∈ΓH(Ω)},
考慮非線性穩(wěn)態(tài)的PNP方程:
(1)
方程(1)的邊界滿足齊次的Dirichlet邊界條件p1=p2=φ=0,其中pi(x)為第i種帶電荷量qi的粒子濃度,qi為第i種離子的電荷量,φ(x)為靜電勢,β=1/(κβT)為逆Boltzmann能量,ε(x)為電介質(zhì)常量。
c1(pi,v)+d1(pi,φ,v)+f1(pi,v)=
(2)
c2(φ,w)+d2(pi,w)=(F3,w),
(3)
其中,
c1(pi,v)=(pi,v),
d1(pi,φ,v)=(βqipiφ,v),
f1(pi,v)=(f(pi),v),
c2(φ,w)=(εφ,w),
(4)
(5)
引理1假設(shè)pi∈L∞(Ω),則有
證明
證畢。
其中C為與h無關(guān)的任意常數(shù)。
(6)
f1(e,vh)=0,
(7)
因此,有
f1(e,pi-vh)-f1(e,e)。
(8)
由引理1及引理2可得,
(9)
同理
(10)
其中ε<1。由于f(pi)是Lipchitz連續(xù)函數(shù),
(11)
(12)
由式(8)~(12)可得,
因此
記(pi)I=∏hpi,取vh=(pi)I,由插值誤差估計有
‖pi-(pi)I‖1,Ω≤Chs。
其中C為與h無關(guān)的任意常數(shù)。證畢。
求解具有光滑解的非線性穩(wěn)態(tài)PNP方程:
設(shè)Ω=[0,1]3,q1=1,q2=-1,邊界條件和右端函數(shù)依賴于解析解,其中解析解定義為:
表1為H1范數(shù)下有限元解和精確解的誤差,收斂階接近1階,表明有限元法的數(shù)值結(jié)果與理論一致。
表1 有限元解和精確解在H1范數(shù)下的誤差