劉國強(qiáng) 海小 羅建興
摘要:禽源性成分檢測既可以預(yù)防禽流感又能分析肉類的摻假問題。本研究參考行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(SN/T 2727-2010),對(duì)鴨和其它12種不同源性動(dòng)物DNA進(jìn)行特異性檢測;將鴨來源DNA模板原液進(jìn)行梯度稀釋確定其檢出限,同時(shí)進(jìn)行靈敏度實(shí)驗(yàn)和摻假實(shí)驗(yàn);在加工制品中檢測其適用性。結(jié)果表明:此引物和探針特異性強(qiáng),只針對(duì)鴨有特異性擴(kuò)增曲線,對(duì)其它12種動(dòng)物源性無擴(kuò)增曲線;當(dāng)鴨模板DNA濃度為10fg·μL-1時(shí),仍能檢測到鴨源性,靈敏度可達(dá)到1%,同時(shí)可以很好地檢測摻假;此引物和探針在加工制品中檢測結(jié)果良好,適用于加工肉制品的檢測。本實(shí)驗(yàn)通過所建立標(biāo)準(zhǔn)曲線y=-3.4554x+42.663,R2=0.9942,其PCR擴(kuò)增效率為95%,可以有效地進(jìn)行定量。同時(shí)利用靈敏度檢測可以判斷此方法的摻假檢測能力較強(qiáng)。綜上所述,本研究可以有效檢測鴨源性的摻假問題,并能為標(biāo)準(zhǔn)提供一定的借鑒。
關(guān)鍵詞:鴨源性成分;特異性;檢出限;靈敏度;加工制品;定量檢測
中圖分類號(hào):S-3
文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
作者簡介:劉國強(qiáng)(1994-),男,本科,研究實(shí)習(xí)員。研究方向:動(dòng)物源性成分檢測和轉(zhuǎn)基因成分檢測;通訊作者郭梁(1986-),男,博士,助理研究員。研究方向:動(dòng)物源性成分檢測和轉(zhuǎn)基因成分檢測以及微生物資源開發(fā)。
肉類是人們飲食中不可缺少的一部分,其含有多種營養(yǎng)物質(zhì)(如蛋白質(zhì)、脂肪以及微量元素等)[1,2]。目前在肉及肉制品的生產(chǎn)和運(yùn)輸中會(huì)時(shí)常發(fā)生一些摻假的問題[3-6],如將雞、鴨肉(低價(jià)肉)摻雜到牛、羊肉(高價(jià)肉)中。動(dòng)物源性檢測技術(shù)針對(duì)上述問題,除了能保護(hù)消費(fèi)者合法權(quán)益、維持市場公平交易機(jī)制,還能預(yù)防動(dòng)物來源性疾病的傳播(瘋牛病、口蹄疫、牛海綿狀腦病等)[7-10]。
目前,動(dòng)物源性檢測技術(shù)建立在對(duì)樣品蛋白質(zhì)、脂肪酸以及核酸等種屬特異分子鑒別肉與肉制品的動(dòng)物來源[11-15]。動(dòng)物源性檢測所涉及的技術(shù)手段包括電泳[16,17]、免疫組化[18,19]、質(zhì)譜[20]、色譜[21]、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction, PCR)[22,23]。因?yàn)槊撗鹾颂呛怂幔―NA)的熱穩(wěn)定性[24],使得以DNA為基礎(chǔ)的PCR技術(shù)成為了檢測動(dòng)物源性檢測主流技術(shù)[25,26]。其中,熒光染料(SYBR Green 或Eva Green)[27,28]和TaqMan探針[29,30]成為了PCR檢測的主要技術(shù)。探針技術(shù)因?yàn)槠浞N屬特異性探針提高了實(shí)時(shí)熒光PCR的擴(kuò)增效率和特異性,從而快速并且準(zhǔn)確地得到檢測結(jié)果。
本文參考行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(SN/T 2727-2010)[31],建立肉與肉制品中鴨源性成分的TaqMan實(shí)時(shí)熒光PCR檢測方法,保證鴨源性成分的快速檢測,規(guī)范食品市場。
1材料與方法
1.1樣品準(zhǔn)備
鮮肉及加工肉制品均購買于本地農(nóng)貿(mào)市場,鮮肉包括鴨肉、羊肉、牛肉、豬肉、馬肉、鹿肉、驢肉、兔肉、狗肉、鵪鶉肉、雞肉、火雞肉和鴿子肉。加工肉制品包括口口丫鴨翅根、口口丫蜜汁烤腿、金鑼火腿腸、肉粒多火腿腸、尚清齋烤腸、蒙羊羊肉干、呼納斯牛肉干。樣品采集處理去除脂肪,并用滅菌水清洗,置于-20℃保存。
1.2試劑
TransStart Probe qPCR SuperMix (北京全式金生物技術(shù)有限公司);實(shí)時(shí)熒光定量PCR引物和探針合成(北京睿博興科公司);Takara MiniBEST Universal基因組提取試劑盒(寶生物工程(大連)有限公司)。
1.3儀器
Eppendorf 5418R Centrifuge高速臺(tái)式離心機(jī)(德國Eppendorf AG公司);Nanodrop 2000c 核酸蛋白測定儀(美國Thermo Fisher公司);7300plus實(shí)時(shí)熒光PCR擴(kuò)增儀(美國ABI公司)。
1.4方法
1.4.1引物和探針
引物和探針均由北京睿博興科公司合成。引物與探針序列如下表1。
1.4.2DNA提取
取1.1準(zhǔn)備好的鮮肉和肉制品樣品,利用Takara MiniBEST Universal基因組提取試劑盒其DNA,利用Nanodrop 2000c核酸蛋白分析儀測量其濃度,將母液稀釋至100ng·μL-1左右,保存于-20℃。
1.4.3反應(yīng)體系與反應(yīng)條件
反應(yīng)體系(總體積20μL):TransStart Probe qPCR SuperMix 10μL,左右引物各1μL,探針1μL,模板2μL,補(bǔ)ddH2O至20μL。
反應(yīng)條件:95℃5min,1個(gè)循環(huán);95℃5s,60℃30s,45個(gè)循環(huán),在每次循環(huán)退火時(shí)收集熒光信號(hào)。
1.4.4特異性實(shí)驗(yàn)
分別取鴨、羊、牛、豬、馬、鹿、驢、兔、狗、鵪鶉、雞、火雞和鴿子13種不同源性動(dòng)物DNA模板進(jìn)行鴨源性特異性分析實(shí)驗(yàn)。
1.4.5檢出限檢測實(shí)驗(yàn)
從100ng·μL-1的鴨肉模板DNA稀釋液加滅菌ddH2O開始稀釋,每1/10稀釋1次,共稀釋7次。分別為100ng·μL-1、10ng·μL-1、1ng·μL-1、0.1ng·μL-1、0.01ng·μL-1、0.001ng·μL-1、0.0001ng·μL-1、0.00001ng·μL-1的鴨肉模板DNA稀釋液進(jìn)行檢出限檢測實(shí)驗(yàn)。
1.4.6靈敏度和模擬摻假實(shí)驗(yàn)
將鴨肉DNA與羊肉DNA以一定比例混合,制成鴨肉DNA含量分別為1%、5%、10%、30%、70%、90%、95%、99%的混合DNA樣品,進(jìn)行模擬摻假檢測實(shí)驗(yàn),同時(shí)依照1.4.3反應(yīng)體系對(duì)該方法的靈敏度進(jìn)行分析,每次實(shí)驗(yàn)設(shè)3個(gè)平行。
1.4.7數(shù)據(jù)處理
利用Real-Time PCR Software 對(duì)結(jié)果進(jìn)行擴(kuò)增曲線和循環(huán)(Cycle threshold,Ct)的分析。每次實(shí)驗(yàn)結(jié)果都是3個(gè)平行實(shí)驗(yàn)的平均值±標(biāo)準(zhǔn)差表示。
2結(jié)果與分析
2.1特異性實(shí)驗(yàn)
將鴨、羊、牛、豬、馬、鹿、驢、兔、狗、鵪鶉、雞、火雞、鴿子的模板DNA(如圖1、表2所示),分別利用鴨的引物和探針進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn),特異性擴(kuò)增結(jié)果如圖2所示,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)過瓊脂糖凝膠電泳處理之后如圖3所示,產(chǎn)物條帶均為單一條帶,無非特異性擴(kuò)增,說明引物和探針組合具有較高的特異性。由圖2和表2可以看出,僅鴨的樣品出現(xiàn)典型擴(kuò)增曲線,Ct值為14.01±0.18(鴨肉樣品1),13.92±0.35(鴨肉樣品2),13.86±0.12(鴨肉樣品3),13.78±0.43(鴨肉樣品4),13.74±0.07(鴨肉樣品5),其它12種動(dòng)物(其它肉樣:羊、牛、豬、馬、鹿、驢、兔、狗、鵪鶉、雞、火雞和鴿子)均未有出現(xiàn)典型擴(kuò)增曲線且Ct值均為0。
2.2檢出限檢測實(shí)驗(yàn)
通過鴨引物和探針對(duì)100ng·μL-1、10ng·μL-1、1ng·μL-1、0.1ng·μL-1、0.01ng·μL-1、0.001ng·μL-1、0.0001ng·μL-1、0.00001ng·μL-18個(gè)不同質(zhì)量濃度梯度的樣品DNA進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)。結(jié)果如圖4所示和表3所示。由圖4和表3可知,稀釋至0.00001ng(即10fg)的鴨基因組DNA模板(3個(gè)平行實(shí)驗(yàn))出現(xiàn)典型擴(kuò)增曲線,Ct值為38.37±0.19;以擴(kuò)增結(jié)果Ct<40時(shí)判定為確認(rèn)檢出,上述結(jié)果表明此探針已達(dá)到檢出限度,說明鴨特異性引物和探針的檢測限度可達(dá)到10fg。
2.3定量檢測
利用100ng·μL-1、10ng·μL-1、1ng·μL-1、0.1ng·μL-1、0.01ng·μL-1、0.001ng·μL-1、0.0001ng·μL-1、0.00001ng·μL-1的鴨肉模板DNA稀釋液,進(jìn)行引物和探針的檢測,制作鴨源性定量檢測標(biāo)準(zhǔn)曲線,如圖5所示。所得鴨的特異性探針的標(biāo)準(zhǔn)曲線為y=-3.4554x+42.663,R2=0.9942。由于PCR擴(kuò)增效率E(%)=[10(-1/slope)-1]×100,其PCR擴(kuò)增效率為95%,PCR效率的接受范圍在90%~110%[32,33],對(duì)應(yīng)于回歸斜率在-3.1~-3.6,R2值≥0.98。綜上所述,此方法具有較好的定量檢測能力。
2.4靈敏度實(shí)驗(yàn)
因?yàn)轼喨饨?jīng)常被摻雜到羊肉中,所以本實(shí)驗(yàn)通過鴨引物和探針對(duì)鴨組分DNA和羊組分DNA混合樣(鴨組分含量分別為1%、5%、10%、30%、70%、90%、95%、99%)進(jìn)行模擬摻假實(shí)驗(yàn),結(jié)果如圖6所示,具體數(shù)值如表4所示。由圖6和表4可知,當(dāng)混合DNA樣品中鴨組分含量為1%時(shí),出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,Ct值為27.34±0.71。因?yàn)楫?dāng)混合DNA樣品中鴨組分含量為1%時(shí),3個(gè)平行中均出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線,所以可以證明此探針對(duì)鴨肉摻假羊肉檢測效果明顯,同時(shí)上述結(jié)果能充分證明此引物和探針具有較高的靈敏度。
2.5加工肉制品的檢測
提取1.1中已處理好加工肉制品的DNA,進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。其擴(kuò)增曲線結(jié)果和Ct值如表5和圖7所示。
3討論
與實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)相比,普通PCR檢測的普遍弱點(diǎn)就是耗時(shí)長[25-27],檢測人員常常需要花費(fèi)大量時(shí)間來對(duì)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行重復(fù)工作,而且一個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果通常都需要進(jìn)行一系列實(shí)驗(yàn)才能得出。而實(shí)時(shí)熒光定量PCR由于添加了TaqMan探針和熒光信號(hào),使得其靈敏度與特異性都高于普通PCR,特別是檢測大批量樣品時(shí)其優(yōu)勢尤為明顯。實(shí)時(shí)熒光定量PCR不僅能夠?qū)崟r(shí)監(jiān)測,同時(shí)得到檢測的結(jié)果迅速,在1~2h就可以得到結(jié)果,而且結(jié)果簡單直觀,易于分析。
本研究通過出入境檢驗(yàn)檢疫行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(SN/T 2727-2010)合成檢測鴨源性成分的引物和探針,通過實(shí)驗(yàn)探索了最佳的反應(yīng)體系和反應(yīng)條件。創(chuàng)新點(diǎn)在于基于行業(yè)標(biāo)準(zhǔn),增加了特異性實(shí)驗(yàn)、檢出限實(shí)驗(yàn)、模擬摻假實(shí)驗(yàn)和適用性實(shí)驗(yàn),并且通過建立標(biāo)準(zhǔn)曲線來評(píng)價(jià)方法的定量檢測能力。本研究對(duì)鴨、羊、牛、豬、馬、鹿、驢、兔、狗、鵪鶉、雞、火雞和鴿子13種不同源性動(dòng)物進(jìn)行特異性實(shí)驗(yàn)。結(jié)果顯示,只有鴨肉有特異性擴(kuò)增,其它動(dòng)物均沒有;將鴨來源的DNA模板原液進(jìn)行濃度梯度稀釋,分別為100ng·μL-1、10ng·μL-1、1ng·μL-1、0.1ng·μL-1、0.01ng·μL-1、0.001ng·μL-1、0.0001ng·μL-1、0.00001ng·μL-1的鴨肉模板DNA稀釋液進(jìn)行檢出限檢測實(shí)驗(yàn),檢出限為10fg;建立標(biāo)準(zhǔn)曲線,其PCR擴(kuò)增效率為95%,在90%~110%,標(biāo)準(zhǔn)曲線R2=0.9942≥0.98可以評(píng)價(jià)此引物和探針定量檢測能力較好。同時(shí)還將鴨模板DNA與羊模板DNA按照1%、5%、10%、30%、70%、90%、95%、99%體積比例混合來模擬摻假實(shí)驗(yàn)。結(jié)果顯示,鴨模板DNA體積比例為1%時(shí)仍可以檢測到鴨源性,同時(shí)證明此引物和探針的靈敏度可達(dá)1%。通過實(shí)時(shí)熒光PCR在鴨翅根、蜜汁烤腿、金鑼火腿腸、肉粒多火腿腸、尚清齋烤腸、蒙羊羊肉干、呼納斯牛肉干進(jìn)行適用性實(shí)驗(yàn),只有在具有鴨源性的鴨翅根和蜜汁烤翅中才能檢測到鴨源性,說明此引物和探針適用性較好。
本方法的檢出限為10fg,在本研究中的引物和探針組合與已報(bào)道的研究相比具有較大的優(yōu)勢,同時(shí)檢出限已超越了之前的研究[37-39]。林彥星等[40]建立了實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測畜禽肉制品中的鴨源性成分,可檢測到1.0pg鴨源DNA的存在;金萍等[41]基于鴨線粒體細(xì)胞色素Cytb基因建立了肉制品中鴨源性成分檢測的Real-time PCR檢測方法,檢出限為8pg;史艷宇等[42]建立了一種快速、特異、靈敏的鴨源性成分檢測方法,其檢出限為1.0mg;張弛等[43]建立肉制品中鴨源性成分定性和定量檢測的檢出限達(dá)到1.78pg;張秀平等[44]設(shè)計(jì)可特異檢測鴨肉成分的引物和探針,其檢出限為1pg;程欣[45]建立了添加有擴(kuò)增內(nèi)標(biāo)的用于檢測食品中鴨肉成分的實(shí)時(shí)熒光PCR方法,可檢出0.05ng的鴨DNA;董洋洋[46]建立了鑒別鴨肉單一成分的實(shí)時(shí)熒光PCR的方法檢測快速準(zhǔn)確,檢出限可達(dá)0.2ng。上述研究的檢出限均低于本研究。
綜上所述,此方法具有較強(qiáng)的特異性、較高的靈敏度和適用性廣等特點(diǎn)??梢杂行z測摻假,從而維護(hù)消費(fèi)者權(quán)益和防止禽類疾病的傳播,為推動(dòng)肉類食品領(lǐng)域向透明化、標(biāo)準(zhǔn)化發(fā)展提供技術(shù)支持。
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(責(zé)任編輯 李媛媛)