周 寧,武 睿,馬振凱,陳微微,李雪琳,宮凱凱,楊麗娟,代娟娟,武 艷
(1. 濱州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科,山東 濱州 256600;2. 濱州醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院腫瘤研究實(shí)驗(yàn)室,山東 濱州 256600;3. 山東省濱州市人民醫(yī)院神經(jīng)外科,山東 濱州 256600)
肺癌的發(fā)生發(fā)展與異常的基因表達(dá)調(diào)控有密切關(guān)聯(lián),RNA編輯是一種重要的基因轉(zhuǎn)錄后修飾方式,在調(diào)控基因表達(dá)中發(fā)揮重要作用。作用于RNA的腺苷酸脫氫酶1(adenosine deaminase acting on RNA enzyme 1,ADAR1)能夠催化RNA上腺嘌呤轉(zhuǎn)化為次黃嘌呤(A-I),并將次黃嘌呤識(shí)別為鳥嘌呤,與胞嘧啶進(jìn)行配對(duì),最后導(dǎo)致蛋白質(zhì)中氨基酸的改變,是一種重要的RNA編輯酶[1]。ADAR1的主要功能是編輯內(nèi)源的雙鏈核糖核酸(double-stranded RNA,dsRNA)使之與病毒來(lái)源的dsRNA區(qū)分開來(lái)[2]。研究[3-4]表明:缺失ADAR1的造血干細(xì)胞導(dǎo)致干擾素刺激基因(interferon-stimulated genes,ISGs)表達(dá)上調(diào),ADAR1在免疫應(yīng)答中起重要作用。ADAR1還具有非依賴編輯的功能,例如能夠防止轉(zhuǎn)錄本的降解。雙鏈RNA結(jié)合蛋白staufen1和staufen2與mRNA的結(jié)合能招募上游移碼突變體(up-frameshift mutant 1,UPF1),并能激活staufen進(jìn)而促進(jìn)RNA降解(SMD)[5-6]。ADAR1表達(dá)水平變化還與黑色素瘤[7]、食道癌[8]、慢性白血病[9]和宮頸癌[10]等的發(fā)生發(fā)展有密切關(guān)聯(lián)。有文獻(xiàn)[11]報(bào)道:ADAR1通過(guò)增強(qiáng)局部黏著斑激酶(focal adhesion kinase,F(xiàn)AK)mRNA的穩(wěn)定性促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞的遷移和浸潤(rùn)。但敲低ADAR1對(duì)肺癌細(xì)胞增殖和上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的調(diào)控機(jī)制尚無(wú)報(bào)道。本研究利用RNA干擾技術(shù)敲低細(xì)胞中ADAR1表達(dá)水平,建立了穩(wěn)定表達(dá)shADAR1的H1299和H520細(xì)胞系,并通過(guò)細(xì)胞增殖、克隆形成、細(xì)胞劃痕實(shí)驗(yàn)及Western blotting法評(píng)價(jià)ADAR1對(duì)細(xì)胞增殖、遷移和EMT的調(diào)節(jié)作用,以期為研究ADAR1在肺癌發(fā)展中的作用機(jī)制奠定基礎(chǔ),同時(shí)為以ADAR1為靶點(diǎn)的抗癌藥物設(shè)計(jì)提供理論依據(jù)。
1.1 細(xì)胞、主要試劑和儀器人肺癌H1299和H520細(xì)胞購(gòu)自美國(guó)模式培養(yǎng)物研究所(ATCC)。胰蛋白酶、胎牛血清(FBS)和RPMI 1640培養(yǎng)基均購(gòu)自美國(guó)Gibco公司,shADAR1和對(duì)照質(zhì)粒(negative shRNA)購(gòu)自上海吉?jiǎng)P基因化學(xué)技術(shù)有限公司,Lipofectamine 2000 購(gòu)于美國(guó)Invitrogen公司,TRIzol試劑和PCR所需引物購(gòu)于上海生物工程有限公司,逆轉(zhuǎn)錄試劑購(gòu)于Thermo公司,ADAR1單克隆抗體、Tubulin抗體和辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記的羊抗兔IgG抗體購(gòu)于美國(guó)Proteintech公司,波形蛋白(vimentin)抗體和E鈣黏蛋白(E-cadherin)抗體購(gòu)自美國(guó)Abcam公司,CCK-8 試劑購(gòu)于上海碧云天公司。CO2細(xì)胞培養(yǎng)箱(美國(guó)Thermo公司),激光共聚焦顯微鏡(美國(guó)Leica公司),酶標(biāo)儀(美國(guó)Bio-Tek公司)。
1.2 細(xì)胞轉(zhuǎn)染和穩(wěn)定細(xì)胞系的構(gòu)建細(xì)胞用含10%胎牛血清和1%(V/V)青霉素-鏈霉素的RPMI-1640培養(yǎng)基于37℃、5% CO2及飽和濕度環(huán)境的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。H1299和H520細(xì)胞均分為對(duì)照組和shADAR1組,分別將1.5 μg negative shRNA質(zhì)?;騭hADAR1質(zhì)粒與Lipofectamine 2000 4 μL 混合后,加入培養(yǎng)基100 μL,室溫孵育25 min,分別加入到生長(zhǎng)密度為60%~80%的H1299和H520細(xì)胞中,繼續(xù)培養(yǎng)24~48 h后,以野生型細(xì)胞為平行對(duì)照進(jìn)行嘌呤霉素篩選,藥物濃度為2 mg·L-1,2周后平行對(duì)照細(xì)胞全部死亡,并且熒光顯微鏡下轉(zhuǎn)染后細(xì)胞全部發(fā)出綠色熒光,即穩(wěn)定細(xì)胞系構(gòu)建成功,后續(xù)改為嘌呤霉素半量維持培養(yǎng)。
1.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)法檢測(cè)細(xì)胞中ADAR1 mRNA表達(dá)水平收集各組細(xì)胞,TRIzol 法提取細(xì)胞總RNA,將提取的RNA應(yīng)用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,應(yīng)用TransStart Green qPCR SuperMix進(jìn)行PCR 驗(yàn)證。qRT-PCR的反應(yīng)條件:95 ℃、30 s 預(yù)變性;95 ℃、5 s,60 ℃、30 s,共40個(gè)循環(huán)。引物序列:ADAR1,上游引物為5′-CCCTTCAGCCACATCCTTC-3′,下游引物為5′-GCCATCTGCTTTGCCACTT-3′;GAPDH,上游引物為5′-GGTGGTCTCCTCTGACTTCAACA-3′,下游引物為 5′- GTTGCTGTAGCCAAATTCGTTGT-3′。進(jìn)行3次重復(fù)實(shí)驗(yàn),以GAPDH 作為內(nèi)參,采用2-ΔΔCt法計(jì)算ADAR1 mRNA相對(duì)表達(dá)水平。
1.4 CCK-8法檢測(cè)細(xì)胞增殖活性將各組細(xì)胞以5×103/孔接種于96 孔板,每組設(shè)置3個(gè)平行孔,每過(guò)12 h 加入CCK-8 繼續(xù)培養(yǎng)3 h,采用酶標(biāo)儀測(cè)定各孔在450 nm 波長(zhǎng)處的吸光度(A)值,共測(cè)定至72 h,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次,取平均A值,以A值代表細(xì)胞增殖活性,對(duì)0 h平均A值進(jìn)行均一化處理后,采用GraphPad Prism 7.0軟件繪制各組細(xì)胞隨時(shí)間變化的增殖曲線。
1.5 克隆形成實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞的克隆形成能力將各組細(xì)胞以1×103個(gè)/孔的密度接種于6孔板中,每組設(shè)2個(gè)復(fù)孔。培養(yǎng)14 d后,吸盡培養(yǎng)基并用PBS清洗細(xì)胞,加入4%多聚甲醛固定5 min,再用0.1%結(jié)晶紫染液染色15 min,用PBS清洗后拍照并計(jì)算克隆形成數(shù),代表細(xì)胞的克隆形成能力。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.6 劃痕實(shí)驗(yàn)檢測(cè)細(xì)胞劃痕愈合率各組細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)夜后,用200 μL槍頭進(jìn)行劃痕,PBS洗滌后,加入新鮮無(wú)血清培養(yǎng)基后繼續(xù)培養(yǎng),分別在0 和48 h進(jìn)行拍照。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次,應(yīng)用Image J 軟件對(duì)劃痕距離進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,并采用Graph Pad Prism 7.0軟件繪制各組細(xì)胞的劃痕愈合率圖。細(xì)胞劃痕愈合率=(0 h劃痕間距-48 h劃痕間距)/0 h劃痕間距×100%。
1.7 Western blotting法檢測(cè)細(xì)胞中ADAR1、E-cadherin和vimentin蛋白表達(dá)水平收集各組H1299和H520細(xì)胞,NP-40 裂解液裂解細(xì)胞,BCA法測(cè)定濃度后,通過(guò)10% SDS-PAGE進(jìn)行電泳,轉(zhuǎn)膜,封閉后分別孵育抗ADAR1(1∶1 000)、抗Tubulin(1∶1 000)、抗vimentin(1∶1 000)和抗E-cadherin(1∶1 000)抗體過(guò)夜,次日PBST洗滌3次,孵育HRP標(biāo)記的羊抗兔或羊抗鼠IgG 抗體(1∶1 000),加入ECL顯色底物,應(yīng)用成像系統(tǒng)進(jìn)行成像拍照,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。利用Image J分析軟件分析各條帶灰度值,以目的蛋白條帶灰度值/Tubulin蛋白條帶灰度值比值作為目的蛋白表達(dá)水平。
2.1 敲低ADAR1穩(wěn)定細(xì)胞系的構(gòu)建和鑒定將攜帶有綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)基因的shADAR1載體和對(duì)照質(zhì)粒分別瞬時(shí)轉(zhuǎn)染H1299及H520細(xì)胞后,應(yīng)用熒光顯微鏡檢測(cè)GFP的表達(dá)情況,以此檢測(cè)脂質(zhì)體的轉(zhuǎn)染效率。結(jié)果顯示:H1299和H520細(xì)胞中轉(zhuǎn)染對(duì)照質(zhì)粒和shADAR1后,90%以上細(xì)胞中均可見綠色熒光。見圖1(插頁(yè)一)。
與對(duì)照組(1.000±0.081和1.000±0.040)比較,shADAR1組H1299和H520細(xì)胞中ADAR1 mRNA表達(dá)水平(0.530±0.040和0.405±0.045)均明顯降低(t=5.255,P<0.05;t=9.882,P<0.01)。Western blotting法檢測(cè)結(jié)果顯示:shADAR1組H1299和H520細(xì)胞中ADAR1蛋白表達(dá)水平(0.296±0.014和0.371±0.052)明顯低于對(duì)照組(1.000±0.126和1.000±0.043)(P<0.05)。見圖2。
2.2 各組細(xì)胞增殖活性與對(duì)照組比較,shADAR1組H1299和H520細(xì)胞增殖活性明顯降低(H1299:t=3.106,P<0.05;H520:t=3.255,P<0.01)。見圖3。
2.3 各組細(xì)胞克隆形成數(shù)與對(duì)照組(172.500±10.607和213.500±6.364)比較,shADAR1組H1299和H520細(xì)胞克隆形成數(shù)(38.500±6.364和59.500±4.950)明顯降低(t=14.58,P<0.01;t=16.75,P<0.01),即克隆形成能力降低。見圖4。
A:H1299 cells;B:H520 cells;Lane 1: Control group; Lane 2: shADAR1 group.
2.4 各組細(xì)胞劃痕愈合率與對(duì)照組(59.1%±8.7%和57.7%±1.7%)比較,shADAR1組H1299和H520細(xì)胞劃痕愈合率(43.6%±8.9%和45.1%±5.0%)明顯降低(t=3.043,P<0.01;t=4.149,P<0.01)。見圖5。
A: H1299 cells; B: H520 cells. *P<0.05, **P<0.01 compared with control group.
A, B:Control group; C, D: shADAR1 group; A, C: H1299 cells; B, D: H520 cells.
2.5 各組細(xì)胞中轉(zhuǎn)移相關(guān)基因E-cadherin 和vimentin蛋白表達(dá)水平shADAR1組H1299和H520細(xì)胞中E-cadherin蛋白表達(dá)水平(1.700±0.018和2.481±0.152)明顯高于對(duì)照組(1.000±0.070和1.000±0.084)(t=13.8,P<0.01;t=12.02,P<0.01)。
shADAR1組H1299和H520細(xì)胞中vimentin蛋白表達(dá)水平(0.160±0.009和0.336±0.049)明顯低于對(duì)照組(1.000±0.056和1.000±0.056)(t=20.68,P<0.01;t=12.49,P<0.01)。見圖6。
化療在非小細(xì)胞肺癌治療中占重要地位,但是多數(shù)的治療效果并不理想,主要原因是癌細(xì)胞在治療過(guò)程中產(chǎn)生了抗藥性。因此,研究肺癌發(fā)生發(fā)展中的關(guān)鍵調(diào)控因子,發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)對(duì)肺癌的治療具有重要意義。
RNA編輯主要指在轉(zhuǎn)錄本上堿基的插入、缺失或者替換,是一種重要的轉(zhuǎn)錄后修飾[12],其中A-to-I(也稱為A-to-G編輯)是哺乳動(dòng)物中最常見的RNA編輯方式。ADAR1是一種重要RNA編輯酶,存在2種單體形式,分別為ADAR1p110和ADAR1p150[13]。ADAR1 相互作用的蛋白主要分為兩類,一類是早期發(fā)現(xiàn)能被ADAR1編輯的相互作用蛋白,如丙酮酸激酶(pyruvate kinase,PKR)[14];另一類是不依賴編輯功能,直接與ADAR1 相互作用的蛋白,如核因子(nuclear factor,NF)45[15]和NF90[16],隨后還發(fā)現(xiàn)移碼突變蛋白1(Upf1)[17]和Dice 酶[18],均可與ADAR1相互作用,在機(jī)體內(nèi)發(fā)揮重要的生物學(xué)功能。
A-D:0 h;E-H:48 h;A,B,E,F:H1299 cells;C,D,G,H:H520 cells;A,C,E,G:Control group;B,D,F,H:shADAR1 group.
A:H1299 cells;B:H520 cells; Lane 1: Control group;Lane 2: shADAR1 group.
ADAR1除在免疫應(yīng)答中的重要作用之外,在多種腫瘤中存在過(guò)表達(dá)的現(xiàn)象,并在腫瘤發(fā)生過(guò)程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用,例如在肝癌中,ADAR1 的表達(dá)水平上調(diào)后能穩(wěn)定抗酶抑制因子1(antizyme inhibitor 1,AZIN1)的水平,導(dǎo)致下游原癌基因表達(dá)上調(diào)[19]。在結(jié)直腸癌中,Ras同源基因家族成員Q(ras homolog family member Q,RHOQ)的A-to-Ⅰ的編輯能夠增加腫瘤細(xì)胞的侵襲潛能[20]。異常表達(dá)的ADAR1通過(guò)激活哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)/p70S6K信號(hào)通絡(luò)調(diào)控胃癌的發(fā)生發(fā)展[21]。本研究通過(guò)RNA干擾技術(shù)并通過(guò)抗生素篩選獲得穩(wěn)定低表達(dá)ADAR1細(xì)胞系,并通過(guò)CCK-8實(shí)驗(yàn)、克隆形成及劃痕實(shí)驗(yàn)證明:敲低ADAR1能夠抑制H1299和H520細(xì)胞的增殖和遷移能力。本研究結(jié)果與文獻(xiàn)[22]報(bào)道的異常表達(dá)的ADAR1促進(jìn)肺癌的發(fā)生發(fā)展過(guò)程的結(jié)果一致。最近研究[23]顯示:異常表達(dá)的ADAR1通過(guò)提高c-myc的穩(wěn)定性介導(dǎo)了胰腺癌細(xì)胞對(duì)布羅莫結(jié)構(gòu)域和外末端基元蛋白(bromodomain and extraterminal motif,BET)的抵抗性。上述結(jié)果說(shuō)明:ADAR1作為一種促癌基因在肺癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,也可能參與了腫瘤耐藥性的產(chǎn)生。
EMT是腫瘤細(xì)胞遷移浸潤(rùn)的重要途徑,E-cadherin表達(dá)下調(diào)、vimentin表達(dá)上調(diào)是EMT的特征之一[24]。E盒結(jié)合鋅指蛋白1(zinc finger E-box-binding homeobox 1,ZEB1)[25]、鋅指轉(zhuǎn)錄因子2(zinc finger transcription factor 2,snail2)[26]等在轉(zhuǎn)錄水平上抑制E-cadherin的表達(dá),促進(jìn)細(xì)胞的EMT轉(zhuǎn)化。EMT能夠促進(jìn)癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移、浸潤(rùn)和藥物抵抗。本研究結(jié)果表明:敲低ADAR1可激活E-cadherin,并抑制vimentin的表達(dá),抑制H1299和H520細(xì)胞的EMT過(guò)程,但ADAR1調(diào)控EMT的具體作用機(jī)制還需進(jìn)一步深入研究。
綜上所述,本研究首先通過(guò)RNA干擾技術(shù)抑制細(xì)胞中ADAR1表達(dá),并進(jìn)一步驗(yàn)證敲低ADAR1后可抑制肺癌H1299和H520細(xì)胞的增殖、遷移和EMT。本研究結(jié)果為肺癌的發(fā)病機(jī)制和治療靶點(diǎn)的研究提供了理論依據(jù)。