袁東芳
肉雞養(yǎng)殖中奇異變形桿菌的分離鑒定及其16S rRNA基因序列分析
袁東芳
(山東畜牧獸醫(yī)職業(yè)學(xué)院 山東 濰坊 261061)
為監(jiān)測(cè)商品肉雞養(yǎng)殖過(guò)程中奇異變形桿菌的攜帶情況,從山東7個(gè)不同地區(qū)的12個(gè)商品肉雞場(chǎng)采集雞泄殖腔棉拭子516份,根據(jù)菌落形態(tài)特征,革蘭氏染色,傳統(tǒng)的生化反應(yīng)以及16SrRNA基因序列測(cè)序分析,分離鑒定出奇異變形桿菌61株,攜帶陽(yáng)性率為11.82%。通過(guò)聚類(lèi)分析、序列比對(duì)、構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),從分子水平上證明分離菌株均為奇異變形桿菌,進(jìn)一步表明不同地區(qū)的奇異變形桿菌存在親緣性,但奇異變形桿菌的親緣關(guān)系與地理分布關(guān)系不大。
肉雞場(chǎng) 奇異變形桿菌 分離鑒定 16S rRNA
奇異變形桿菌(Proteus mirabillis,PM)屬于腸桿菌科變形桿菌屬,系無(wú)莢膜、無(wú)芽胞,有鞭毛、有菌毛的革蘭陰性桿菌,為條件致病菌,當(dāng)機(jī)體抵抗力較低時(shí)容易引起發(fā)病,多為繼發(fā)感染,可引起泌尿系統(tǒng)感染、腹瀉、菌血癥和食物中毒等[1-2]。奇異變形桿菌作為一種人畜共患病,在自然界分布極廣,人類(lèi)、家畜及家禽的帶菌率極高,應(yīng)該引起足夠重視[3]。近年來(lái),我國(guó)山東、河南、河北、四川、廣西等地不斷有雞群暴發(fā)奇異變形桿菌病,尤其是在季節(jié)更替、環(huán)境改變、轉(zhuǎn)群和混合感染其他病原時(shí),雞群抵抗力下降,病情加重,病死率升高,給畜禽養(yǎng)殖業(yè)帶來(lái)巨大的經(jīng)濟(jì)損失[4, 5]。
目前報(bào)道的奇異變形桿菌基本是從發(fā)病或病死的畜禽中分離的,為了監(jiān)測(cè)商品肉雞場(chǎng)在養(yǎng)殖過(guò)程中奇異變形桿菌的攜帶情況,有效防止奇異變形桿菌病的暴發(fā),本文自2017年6月至2018年6月,從山東7個(gè)不同地區(qū)的12個(gè)商品肉雞場(chǎng)采集雞泄殖腔棉拭子516份,經(jīng)細(xì)菌學(xué)鑒定及16Sr RNA基因序列測(cè)序分析[6],分離鑒定出奇異變形桿菌61株,攜帶陽(yáng)性率為11.82%。將不同地區(qū)分離菌株的16SrRNA基因序列以99%一致性[7]進(jìn)行聚類(lèi)分析,獲得12條代表序列并進(jìn)行分析。分析結(jié)果從分子水平證明分離菌株均為奇異變形桿菌。為養(yǎng)殖過(guò)程中奇異變形桿菌攜帶情況的監(jiān)測(cè),奇異變形桿菌病的臨床診斷、鑒定和有效防制提供參考。
1.1 樣品 商品肉雞泄殖腔拭子516份,來(lái)自于山東7個(gè)不同地區(qū),分別是寒亭區(qū)123份、昌邑市137份、安丘市80份、萊西市62份、平度市105份、萊陽(yáng)市82份、濰城區(qū)60份;
1.2 主要試劑 亞硒酸鹽胱氨酸增菌液(SC)、SS瓊脂培養(yǎng)基、普通營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基(NA)、營(yíng)養(yǎng)肉湯、革蘭氏染色液均購(gòu)自北京陸橋技術(shù)有限公司; A306細(xì)菌微量生化反應(yīng)管購(gòu)自杭州濱和微生物試劑有限公司;細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒購(gòu)自北京索萊寶科技有限公司;PCR試劑購(gòu)自北京天根生化科技有限公司;引物由生工生物(上海)工程有限公司合成。
1.3 細(xì)菌的分離培養(yǎng)及純化 將采集的泄殖腔拭子置于SC增菌液中,37℃,180r/m,培養(yǎng)24h,觀(guān)察細(xì)菌的生長(zhǎng)情況,SC增菌液呈紅色渾濁狀態(tài),挑取菌液劃線(xiàn)于SS平板,培養(yǎng)24h,觀(guān)察菌落特征,挑取可疑菌落于NA平板上分區(qū)劃線(xiàn),純化培養(yǎng)24h,挑取單菌落接種于營(yíng)養(yǎng)肉湯中,37℃,180r/m,培養(yǎng)24h。
1.4 細(xì)菌的生化鑒定 挑取單個(gè)菌落接種于A(yíng)306細(xì)菌微量生化反應(yīng)管中,37℃,培養(yǎng)24h,觀(guān)察記錄結(jié)果。
1.5 16S rRNA基因擴(kuò)增及序列測(cè)定 用試劑盒提取分離菌的DNA為模板,用細(xì)菌16srRNA的通用引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司測(cè)序。測(cè)序后,利用NCBI網(wǎng)站中Blast檢索系統(tǒng)對(duì)測(cè)序得到的16srRNA基因序列進(jìn)行同源性比對(duì)分析;對(duì)在Genbank中檢索到的國(guó)內(nèi)不同地域來(lái)源的奇異變形桿菌,通過(guò)Muscle比對(duì),運(yùn)用Fasttree構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。
2.1 細(xì)菌的分離及染色 分離菌株在SS平板上呈圓形隆起、邊緣整齊、無(wú)色透明、橘黃色或中心黑色的中等大小菌落,在NA上呈擴(kuò)散性生長(zhǎng),以接種點(diǎn)為中心形成波紋狀同心環(huán),布滿(mǎn)整個(gè)平板。鏡檢可見(jiàn)分離菌為革蘭氏陰性,呈桿狀、球桿狀、球狀或短鏈狀,表現(xiàn)多形性,主要以桿狀為主。分離出的61株菌分別命名,寒亭區(qū)18株分別為H1-H18,昌邑區(qū)4株分別為C1-C4,安丘市9株分別為A1-A9,萊西市8株分別為L(zhǎng)1-L8,平度市11株分別為P1-P11,萊陽(yáng)市5株分別為Y1-Y5,濰城區(qū)2株分別為W1-W2。
2.2 生化試驗(yàn)結(jié)果 通過(guò)對(duì)照A306細(xì)菌微量生化反應(yīng)管編碼鑒定手冊(cè),分離菌的生化特性顯示該61株分離菌均為奇異變形桿菌。
附表 分離菌的生化試驗(yàn)鑒定結(jié)果
生化試驗(yàn)結(jié)果判定生化試驗(yàn)結(jié)果判定生化試驗(yàn)結(jié)果判定 靛基質(zhì)-枸櫞酸鹽+棉籽糖- VP-尿素酶+戊糖- 苯丙氨酸+硫化氫+山梨醇- 賴(lài)氨酸-磷酶-側(cè)金盞花醇- 鳥(niǎo)氨酸+ONPG-二磷酶-