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常染色體D2S1338基因座被檢父稀有等位基因分析

2020-05-19 07:17:44萬靜鄧小娟唐澤英
醫(yī)學(xué)與法學(xué) 2020年1期
關(guān)鍵詞:親子鑒定基因座血樣

萬靜 鄧小娟 唐澤英

常染色體短串聯(lián)重復(fù)序列STR基因座,是目前廣泛運(yùn)用于親子鑒定的遺傳標(biāo)記;而在DNA親子鑒定中,隨著鑒定案件的增多,發(fā)現(xiàn)稀有等位基因的機(jī)率也在增大,這給親子鑒定結(jié)果分析帶來困擾。

一、材料與方法

某委托人為明確孩子身份,特委托西南政法大學(xué)司法鑒定中心對(duì)某被檢父、被檢子進(jìn)行單親親子鑒定。經(jīng)現(xiàn)場(chǎng)提取被鑒定人血樣2份,應(yīng)用北京基點(diǎn)認(rèn)知技術(shù)有限公司GoldeneyeTMDNA身份鑒定系統(tǒng)20A(免提?。┰?700擴(kuò)增儀上進(jìn)行復(fù)合擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物在ABI3500型遺傳分析儀上進(jìn)行DNA電泳,得結(jié)果后再經(jīng)GeneMapperID-X軟件判讀,得到各等位基因的基因型。檢驗(yàn)結(jié)果,被檢父在D2S1338基因座為雜合子OL/18;增加寧波海爾思基因科技有限公司STRtyper-21G_PLUS復(fù)合擴(kuò)增系統(tǒng)進(jìn)行復(fù)核檢測(cè),其結(jié)果仍然相同(詳見圖1、圖2)。

圖1 GoldeneyeTMDNA身份鑒定系統(tǒng)20A被檢父血樣

圖2 STRtyper-21G_PLUS被檢父血樣

圖3 GoldeneyeTMDNA身份鑒定系統(tǒng)20A Ladder

二、檢驗(yàn)結(jié)果

應(yīng)用GoldeneyeTMDNA身份鑒定系統(tǒng)20A復(fù)合擴(kuò)增,共檢出19個(gè)常染色體STR基因座且均符合遺傳規(guī)律,被檢父D2S1338基因座發(fā)現(xiàn)OL峰。OL峰又稱“off-ladder峰”,一般位于與Ladder上相應(yīng)等位基因0.5bp范圍之外,可分析其前后已自動(dòng)化正確命名的片段相對(duì)與Ladder等位基因的漂移偏離情況,對(duì)OL峰進(jìn)行漂移校正,人工修正命名[1]。

依據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)[2]鑒定標(biāo)準(zhǔn),對(duì)OL峰進(jìn)行分析計(jì)算。被檢父D2S1338基因座OL峰顯示size為203.20(詳見圖1);為準(zhǔn)確判斷OL峰的等位基因,依據(jù)檢材樣本等位基因18與同時(shí)電泳Ladder等位基因18的bp值分別為223.84(詳見圖1)和223.82(詳見圖3),參照文獻(xiàn)[3]對(duì)OL峰bp值計(jì)算,得:223.84-223.82=0.02,表明樣本等位基因18相對(duì)于Ladder漂移了0.02bp;OL峰bp值扣除漂移,即被Ladder等位基因18的bp值相減,得223.82-(203.20-0.02)=20.64 bp,OL峰實(shí)際長(zhǎng)度比Ladder等位基因18小20.64bp。由于D2S1338基因座是位于人類二號(hào)染色體上的短串聯(lián)重復(fù)序列,其核心序列為(TGCC/TTCC)[4],重復(fù)單位為4個(gè)堿基對(duì),故該被檢父OL峰分型比Ladder等位基因18少5個(gè)重復(fù)單位,因而該被檢父D2S1338基因座OL峰可判斷為稀有等位基因13。

三、分析與討論

筆者查閱了相關(guān)文獻(xiàn),在其中袁麗等、李莉等、曹林枝等、劉長(zhǎng)暉等、郝宏蕾等、肖莉等、趙芳芳等、霍振義等、于嘉源等、袁亮等、王曉勛等、白雪等、張旋等、劉勝等、朱巍等的16篇報(bào)道中,均未發(fā)現(xiàn)基因座D2S1338等位基因13。[5]

而徐志成等調(diào)研,在11250個(gè)日常檢案無關(guān)個(gè)體中發(fā)現(xiàn)1例[6];李天光等調(diào)研,在黑龍江綏化地區(qū)漢族2627例無關(guān)個(gè)體中該稀有等位基因的基因頻率為0.0002[7];張檸等調(diào)研,在云南苗族人群747例無關(guān)個(gè)體中,基因頻率為0.0013[8],可計(jì)算出該群體中僅有1例檢出該等位基因:這三篇文獻(xiàn)所涉人群中檢出該等位基因的例數(shù)和基因頻率都極低(詳見下表)。

林子清等的調(diào)研,在6788個(gè)新疆維吾爾族無關(guān)個(gè)體中,發(fā)現(xiàn)13例[9];馮春梅等的調(diào)研,在牡丹江市朝鮮族500例無關(guān)個(gè)體中基因頻率為0.0210[10];劉新勝等佛山漢族570例無關(guān)個(gè)體中,基因頻率為0.054386[11]。能看出來基因座D2S1338等位基因13分布相對(duì)集中(詳見下表)。

分析結(jié)果顯示,基因座D2S1338等位基因13雖屬稀有基因,但在基因頻率調(diào)查中,顯示出其相對(duì)集中地分布在新疆維吾爾族、牡丹江朝鮮族、佛山漢族中,具有明顯的地區(qū)和人群特異性,有利于地域、種族的確認(rèn);特別是在刑事案件法醫(yī)物證鑒定中,其對(duì)個(gè)體識(shí)別與嫌疑人的認(rèn)定具有重要價(jià)值和意義。

目前,基因座D2S1338是親緣關(guān)系鑒定中常用的STR基因座之一,也是常規(guī)親緣關(guān)系鑒定規(guī)范所推薦的基因座。稀有等位基因的存在,對(duì)DNA檢驗(yàn)的應(yīng)用會(huì)產(chǎn)生一定的影響;同時(shí),其對(duì)提高基因座的個(gè)體識(shí)別能力、非父排除率有重要的應(yīng)用價(jià)值。但是,若由其產(chǎn)生誤判,會(huì)影響數(shù)據(jù)庫的應(yīng)用及各實(shí)驗(yàn)室間的數(shù)據(jù)交流,所以建議在遇到稀有等位基因時(shí),最好采用不同試劑系統(tǒng)進(jìn)行復(fù)核檢驗(yàn)。本案被檢父的稀有等位基因雖對(duì)鑒定結(jié)果分析影響不大,但隨著案件量的不斷增加,鑒定風(fēng)險(xiǎn)會(huì)逐步加大,因此在司法鑒定實(shí)務(wù)中遇此類案件應(yīng)準(zhǔn)確把握,以避免發(fā)生錯(cuò)誤判斷。

表 國(guó)內(nèi)部分地區(qū)STR基因座D2S1338等位基因13頻率統(tǒng)計(jì)

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