王 雙,楊 瑞,白 薇
(1.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 植物逆境生理與分子生物學(xué)自治區(qū)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010018; 2.內(nèi)蒙古賽科星繁育生物技術(shù)(集團(tuán))股份有限公司,內(nèi)蒙古 呼和浩特 010018)
WRKY蛋白家族是植物中所特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,在其N(xiāo)端一般存在由60個(gè)氨基酸組成的DNA結(jié)合域,其中包含有WRKYGQK保守序列(因此被稱為WRKY結(jié)構(gòu)域)和一個(gè)鋅指結(jié)構(gòu)域(CX4-5CX22-23HXH或CX7CX23HXC)[1]。在對(duì)靶標(biāo)基因進(jìn)行調(diào)控時(shí),WRKY蛋白與順勢(shì)作用元件中的W-box(C/T)TGAC(C/T)或W盒(TGAC(C/T))進(jìn)行特異性識(shí)別和結(jié)合,來(lái)調(diào)節(jié)目的基因的轉(zhuǎn)錄,從而實(shí)現(xiàn)其生物學(xué)功能[2-3]。WRKY蛋白可參與調(diào)控植物的生長(zhǎng)發(fā)育、次生代謝物的合成及生物與非生物脅迫的過(guò)程[4-8]。在水稻的基因組中鑒定出100多個(gè)WRKY基因的存在[9],發(fā)現(xiàn)它們參與調(diào)控了水稻對(duì)生物和非生物脅迫的響應(yīng),水稻的生長(zhǎng)發(fā)育、形態(tài)建成,與SA、JA、GA、ET等激素信號(hào)途徑的相互作用[10]。為了探明OsWRKY76是否參與調(diào)控水稻系統(tǒng)獲得抗性,闡明OsWRKY76的功能,本試驗(yàn)根據(jù)其cDNA序列,構(gòu)建了發(fā)夾型結(jié)構(gòu)的RNA干擾(RNA interference, RNAi)載體,并轉(zhuǎn)化水稻,獲得了沉默株系,為后續(xù)的研究奠定了基礎(chǔ)。
以粳稻品種 Kitaake(Kit)為試驗(yàn)材料,溫室中種植,27~32 ℃的自然光下生長(zhǎng)。
試驗(yàn)中所用的克隆載體為改造的pENTR-D TOPO 載體(Invitrogen)-L16,即在pENTR-D TOPO載體的attL1后人為加入一段多克隆位點(diǎn)。所用雙元表達(dá)載體GVG-TA7002的啟動(dòng)子為受地塞米松誘導(dǎo)的啟動(dòng)子,Ubi C1300為組成型表達(dá)載體,均與pENTR載體兼容,可通過(guò)LR反應(yīng)將目的片段重組到雙元表達(dá)載體中。
LR ClonaseTM Ⅱ Enzyme Mix 購(gòu)自Invitrogen公司;TRIzol試劑、RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒Prime Script TM 1st Strand cDNA Synthesis Kit、Ex Taq DNA Polymerase、T4DNA ligase、限制性內(nèi)切酶、堿性磷酸酶 SAP、RNase A 等均購(gòu)自TaKaRa 公司; 質(zhì)粒提取試劑盒及瓊脂糖凝膠回收試劑盒等購(gòu)自天根生化科技有限公司; pEASY-T1克隆載體購(gòu)自全式金生物科技有限公司;卡那霉素(Kan)、利福平(Rif)等抗生素均購(gòu)自美國(guó)Amerisco公司;其他藥品及試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.3.1 總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄 剪取水稻葉片,用TRIzol法提取總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA。
1.3.2OsWRKY76-300片段的克隆 根據(jù)OsWRKY76的cDNA序列設(shè)計(jì)引物,OsWRKY76-5′(TGAATTCTG CCTCGACCTCTGCGTC)和OsWRKY76-3′(TCTGCAG CCGTCTCCATGCTCTCCCT),以cDNA為模板擴(kuò)增長(zhǎng)度為300 bp的片段。引物上分別添加EcoRⅠ和PstⅠ酶切位點(diǎn),用于后續(xù)克隆。將OsWRKY76-300片段克隆到pEASY-T1載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH10B感受態(tài)細(xì)胞,37 ℃過(guò)夜培養(yǎng)后,挑取單克隆鑒定。
1.3.3GUS片段的克隆GUS片段的克隆以實(shí)驗(yàn)室已有的含GUS基因的載體GUS-Ubi-AH27為模板,用引物GUS-5′(TGAATTCATGAAGATGACTTA CG),GUS-3′(TGAATTCGGTTCAGGCACAGCACA)擴(kuò)增長(zhǎng)度為500 bp的GUS片段(GUS500),引物上均添加EcoRⅠ酶切位點(diǎn),方便后續(xù)克隆。將GUS500片段克隆到pEASY-T1載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH10B感受態(tài)細(xì)胞,選取單克隆進(jìn)行鑒定。
1.3.4OsWRKY76-300RNAi載體的構(gòu)建 將OsWRKY76-300-pEASY T1克隆載體用EcoRⅠ和PstⅠ雙酶切,膠回收酶切產(chǎn)物;將GUS-pEASY T1克隆載體用EcoRⅠ酶切,膠回收酶切產(chǎn)物,用于后續(xù)RNA干擾載體中OsWRKY76-3002個(gè)反向重復(fù)片段之間的連接物。再用PstⅠ單酶切pENTR L16,用堿性磷酸酶SAP處理,去除5′末端的磷酸基團(tuán),防止載體自連。將OsWRKY76-300分別與GUS500、L16載體連接,構(gòu)建dsWRKY76pENTR L16克隆載體。dsWRKY76pENTR L16轉(zhuǎn)化DH10B,選取陽(yáng)性單克隆進(jìn)行鑒定。
利用Gateway重組技術(shù),將dsWRKY76pENTR L16載體中的插入片段(由GUS片段連接的OsWRKY76-300反向重復(fù)片段)通過(guò)LR反應(yīng)重組到誘導(dǎo)型雙元表達(dá)載體GVG-TA7002和組成型雙元表達(dá)載體Ubi-C1300中,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH10B,挑取單克隆鑒定。
1.3.5 誘導(dǎo)型RNAi載體轉(zhuǎn)化水稻 采用凍融法將誘導(dǎo)型RNAi載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌EHA105感受態(tài)細(xì)胞,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化水稻Kit獲得轉(zhuǎn)基因株系。
1.3.6 轉(zhuǎn)化株系OsWRKY76表達(dá)量檢測(cè) 用100 μmol/L的地塞米松葉面噴施水稻,8 h后取樣,提取水稻總RNA,反轉(zhuǎn)錄為cDNA。利用引物OsWRKY76-R(CCGGACCTCAAGGAGGTGTG)和OsWRKY76-L(CTAGAATTCGGGCAGCTTCTGGA)通過(guò)RT-qPCR分析OsWRKY76表達(dá)量,反應(yīng)程序如下:94 ℃變性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,40個(gè)循環(huán)。
OsWRKY76基因cDNA序列全長(zhǎng)984 bp,編碼327個(gè)氨基酸,預(yù)計(jì)分子量34.8 ku,預(yù)計(jì)等電點(diǎn)8.26。根據(jù)NCBI網(wǎng)站上預(yù)測(cè)并分析OsWRKY76具有明顯的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,位于165-225個(gè)氨基酸,見(jiàn)圖1。
圖1 WRKY76結(jié)構(gòu)Fig.1 Structures of rice WRKY76
PCR擴(kuò)增OsWRKY76-300片段,獲得了預(yù)期大小的條帶(圖2),將目的片段克隆到pEASY T1載體,測(cè)序結(jié)果顯示獲得了正確的片段。
M.DL5000分子量標(biāo)記;1.擴(kuò)增的OsWRKY76-300片段。 M.DL5000 molecular weight marker; 1.The amplified fragment of OsWRKY76-300.
以含GUS基因的載體GUS-Ubi-AH27為模板,擴(kuò)增GUS500片段,結(jié)果顯示獲得了預(yù)期大小的片段(圖3-A)。將目的片段克隆到pEASY T1載體,用EcoR Ⅰ 進(jìn)行酶切鑒定,結(jié)果見(jiàn)圖3-B,產(chǎn)生3 928 bp (pEASY T1載體)和500 bp左右的條帶,與預(yù)期結(jié)果一致。
用EcoRⅠ和PstⅠ將OsWRKY76-300片段從OsWRKY76-300-pEASY T1載體中切出,用EcoRⅠ將GUS500片段從GUS-pEASY T1載體中切出,pENTR L16載體用PstⅠ酶切后進(jìn)行脫磷酸處理,將OsWRKY76-300、GUS500與pENTR L16載體連接,構(gòu)建dsWRKY76pENTR L16克隆載體,見(jiàn)圖4。構(gòu)建好的載體用EcoRⅠ和PstⅠ酶切鑒定,結(jié)果見(jiàn)圖5,產(chǎn)生了2 628(L16),500,300 bp左右的條帶,與預(yù)期結(jié)果一致。
M. DL5000分子量標(biāo)記;A.GUS500片段PCR擴(kuò)增電泳圖:1.GUS500的擴(kuò)增片段;B.GUS500-pEASY T1酶切鑒定結(jié)果:1.GUS500-pEASY T1質(zhì)粒載體經(jīng)過(guò)EcoR Ⅰ單酶切鑒定圖譜。
M.DL5000 molecular weight marker; A.PCR amplification result ofGUS500fragment: 1.Amplified fragment ofGUS; B.Enzyme digestion result ofGUS500-pEASY T1: 1.Result ofGUS500-pEASY T1 vector after digestion withEcoR Ⅰ.
圖3GUS500片段的PCR擴(kuò)增與鑒定結(jié)果
Fig.3 PCR amplification and identificationresults ofGUS500fragment
圖4 dsWRKY76 pENTR L16干擾載體的構(gòu)建Fig.4 Construction of RNAi vector for dsWRKY76 pENTR L16
M.DL5000分子量標(biāo)記;1,2.dsWRKY76pENTR L16經(jīng)EcoR Ⅰ和PstⅠ酶切后產(chǎn)生的2 628,500,300 bp大小的片段.
M.The molecular weight marker of DL5000; 1,2.The 2 628,500,300 bp fragments ofdsWRKY76pENTR L16 after digestion withEcoR Ⅰ andPstⅠ, respectively.
圖5dsWRKY76pENTR L16酶切鑒定圖譜
Fig.5 Enzyme digestion result ofdsWRKY76pENTR L16
利用Gateway重組技術(shù),將dsWRKY76pENTR L16中的插入片段重組到誘導(dǎo)型雙元載體GVG-TA7002和組成型雙元載體Ubi-C1300中,用SpeⅠ和XhoⅠ對(duì)dsWRKY76-GVG-TA7002進(jìn)行雙酶切鑒定;用PstⅠ對(duì)dsWRKY76-Ubi-C1300進(jìn)行酶切鑒定。結(jié)果見(jiàn)圖6,重組質(zhì)粒dsWRKY76-GVG-TA7002酶切后產(chǎn)生2條帶,1條為GVG-TA7002載體片段,大小為10 kb,由于WRKY76序列中在170 bp左右有XhoⅠ的酶切位點(diǎn),所以產(chǎn)生第2條帶大小約為800 bp。重組質(zhì)粒dsWRKY76-Ubi-C1300酶切后產(chǎn)生3條帶,第1條為Ubi-C1300載體片段,Ubi-C1300載體在2 kb處有PstⅠ酶切位點(diǎn),所以產(chǎn)生了第2條帶,大小約為2 kb,第3條帶為dsWRKY76片段,大小約為1 kb。說(shuō)明2種載體都構(gòu)建成功。
M.DL10000分子量標(biāo)記;1.未經(jīng)酶切的WRKY76-GVG-TA7002質(zhì)粒;2.酶切后的WRKY76-GVG-TA7002;3.未經(jīng)酶切的WRKY76-Ubi-C1300;4.酶切后的WRKY76-Ubi-C1300。
M.The molecular weight marker of DL10000; 1.WRKY76-GVG-TA7002 plasmid; 2.WRKY76-GVG-TA7002 after enzyme digestion; 3.WRKY76-Ubi-C1300 plasmid; 4.WRKY76-Ubi-C1300 after enzyme digestion.
圖6WRKY76-GVG-TA7002和WRKY76-Ubi-C1300酶切鑒定圖譜
Fig.6 Enzyme digestion results ofWRKY76- GVG-TA7002 andWRKY76-Ubi-C1300
將WRKY76-GVG-TA7002轉(zhuǎn)化水稻,得到7個(gè)轉(zhuǎn)化株系,對(duì)其進(jìn)行OsWRKY76基因表達(dá)水平檢測(cè),結(jié)果顯示(圖7),其中dsWRKY76-2和dsWRKY76-7株系中OsWRKY76的表達(dá)量與未轉(zhuǎn)基因的對(duì)照相比具有顯著差異,表達(dá)量分別為對(duì)照組的16.2%,20.2%,表明成功獲得了2個(gè)沉默株系。
不同小寫(xiě)字母表示差異顯著(P<0.05)。 Lowercase letters indicate significant difference(P<0.05).
WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物防御病原體的攻擊中起到了非常重要的作用。在對(duì)水稻白葉枯病菌Xoo(Xanthomonasoryzaepv.)的免疫應(yīng)答中,OsWRKY45和OsWRKY72能夠直接結(jié)合SRWD1(Salt responsive WD40 protein 1)的啟動(dòng)子W-box,并分別通過(guò)與DELLA SLR1蛋白的相互作用激活或抑制SRWD1,調(diào)節(jié)水稻對(duì)Xoo病原菌的抗性[11]。OsWRKY68可以直接結(jié)合PR1bW-box啟動(dòng)子來(lái)促進(jìn)免疫應(yīng)答[12]。過(guò)表達(dá)OsWRKY51可增強(qiáng)對(duì)Xoo的抗性[13]。在稻瘟病菌(Magnaportheoryzae)感染下,OsWRKY13和OsWRKY45-2通過(guò)與其啟動(dòng)子W-box和類W-box序列結(jié)合來(lái)調(diào)節(jié)彼此的表達(dá)以應(yīng)對(duì)生物脅迫[14]。過(guò)量表達(dá)OsWRKY67可以增強(qiáng)對(duì)葉瘟(Leaf blast)、穗瘟(Panicle blast)和細(xì)菌性枯萎病(Bacterial blight)的抗病性[15]。水稻中的OsNH3(NPR1 homologue 3)是系統(tǒng)獲得抗性中的關(guān)鍵因子NPR1的旁系同源物,過(guò)量表達(dá)OsNH3可以大幅提高PR基因的表達(dá),增強(qiáng)對(duì)水稻白葉枯病Xoo的抗性[16-17]。對(duì)于OsWRKY76是否直接與OsNH3結(jié)合,激活相關(guān)抗病基因的表達(dá),還有待進(jìn)一步的試驗(yàn)研究。
大多數(shù)關(guān)于WRKY家族的研究中,較常用的手段是構(gòu)建過(guò)表達(dá)載體轉(zhuǎn)化植株,得到過(guò)表達(dá)植株進(jìn)行研究,如辣椒CaWRKY1過(guò)表達(dá)可加速超敏反應(yīng)[18];棉花GhWRKY15在煙草中過(guò)表達(dá)可增強(qiáng)對(duì)真菌以及病毒的抗性[19];將楊樹(shù)的PtrWRKY73在白楊中過(guò)表達(dá)可提高對(duì)黑斑病菌(M.brunneaf.sp.multigermtubi)的抗性[20];過(guò)表達(dá)OsWRKY76可導(dǎo)致對(duì)稻瘟病的易感性急劇增加,對(duì)冷脅迫的耐受性提高[21]。對(duì)于利用RNA干擾技術(shù)驗(yàn)證WRKY相關(guān)功能的試驗(yàn)卻鮮有報(bào)道。
RNAi作為反向遺傳學(xué)研究的一種手段,有著特異的機(jī)制和簡(jiǎn)單的試驗(yàn)操作過(guò)程,在多個(gè)領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用前景[22]。本研究在構(gòu)建RNAi載體時(shí)選用了組成型表達(dá)和誘導(dǎo)型表達(dá)2種不同的載體,用組成型表達(dá)的載體將會(huì)持續(xù)沉默相關(guān)基因,若此基因?yàn)樯L(zhǎng)發(fā)育所必需,則一般情況下不容易得到轉(zhuǎn)化沉默植株。因此,筆者又同時(shí)構(gòu)建了誘導(dǎo)型表達(dá)的載體,只有用誘導(dǎo)物處理后才會(huì)誘導(dǎo)相關(guān)基因的沉默。因誘導(dǎo)物具有高度專一性,可以人為調(diào)控基因的表達(dá)狀態(tài),并且對(duì)植物本身來(lái)說(shuō)是低毒或無(wú)毒的[23],能夠比較容易地獲得轉(zhuǎn)化沉默株系。在本研究中,通過(guò)RNA干擾技術(shù)獲得了OsWRKY76的誘導(dǎo)型沉默株系,為進(jìn)一步研究該基因是否參與調(diào)控系統(tǒng)獲得抗性提供了前期基礎(chǔ)。