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長鏈非編碼RNACBR3-AS1在乳腺癌中的表達及其功能

2019-12-04 00:54熊雄焉正慶張愛軍
中國普通外科雜志 2019年11期
關鍵詞:細胞系生存率試劑盒

熊雄,焉正慶,張愛軍

(湖北省武漢市武昌醫(yī)院 普通外科,湖北 武漢 430061)

乳腺癌是女性常見的惡性腫瘤,為女性癌癥相關死亡的主要原因,盡管癌癥診斷和治療取得一定進展,發(fā)展中國家發(fā)病率仍在增加,迫切需要進一步探索乳腺癌發(fā)病機制并尋找用于乳腺癌檢測和治療的新靶標[1]。乳腺癌進展是一個與遺傳和環(huán)境因素相關的復雜多步驟過程[2]。長鏈非編碼RNA(lncRNAs)是一類長度超過200個核苷酸的RNA分子,參與調控細胞凋亡和周期控制、細胞發(fā)育和分化等過程[3]。lncRNA失調與包括癌癥在內的人類許多疾病密切相關[4-5]。lncRNA RNA CBR3(CBR3-AS1)最早發(fā)現(xiàn)在前列腺癌組織中上調表達并調控細胞增殖和凋亡[6]。盡管如此,CBR3-AS1在乳腺癌中作用和功能尚未完全闡明。本研究旨在探討乳腺癌組織中CBR3-AS1表達狀態(tài),其與患者臨床病理參數間的關系和預后價值,并探討其對乳腺癌細胞功能的影響。

1 材料與方法

1.1 實驗材料

人乳腺癌細胞系(MCF-7、MDA-MB-453和SKBR3)和正常乳腺上皮細胞系(HS578Bst)購自美國ATCC細胞庫。Eagle培養(yǎng)基購自GIBCO公司,TRIzol 和SuperScript III逆轉錄酶試劑盒購自Invitrogen公司,qRT-PCR試劑盒(RR420)購自日本Takara公司;Transwell小室、基質膠Matrigel購至美國BD公司;ThermoND2000C超微量分光光度計(Thermo)、GeneAmp PCR system 9700擴增儀(PerkinElmer)、LightCycler?480 II System(Roche)。CBR3-AS1干擾序列、陰性對照序列及CBR3-AS1模擬物序列均由上海吉瑪生物科技有限公司合成。LipofectamineTM2000購買自美國Invitrogen 公司。凋亡檢測試劑盒購買自Sigma公司。

1.2 乳腺癌組織標本

收集我院2013年1月—2015年1月間于我院普外科行乳腺癌切除術的患者組織標本70例,收集患者癌組織標本和對應癌旁組織,從臨床病歷中收集患者全部臨床資料,所有患者均經過病理標本確定為原發(fā)性乳腺癌并根據世界衛(wèi)生組織標準[7]進行乳腺癌病理診斷分類。納入標準:⑴病理診斷為乳腺癌且不存在其他部位腫瘤;⑵患者手術前未接受放化療或生物治療;⑶患者存在完整的病歷和隨訪資料。排除標準:⑴患者存在乳腺癌外其他部位原發(fā)性腫瘤;⑵不符合納入標準者。本研究經醫(yī)院倫理委員會批準。

1.3 患者隨訪

患者無瘤生存時間為手術后出院第1天到腫瘤復發(fā)時間;總生存時間為手術后出院第1天到死亡時間或隨訪截止時間,采用門診或電話方式隨訪,毎半年隨訪1次,行乳腺彩超、鉬靶或CT檢查,隨訪內容包括腫瘤復發(fā)及死亡情況。隨訪截止時間為2019年3月1日,有4例失訪。

1.4 細胞分組及處理

參照文獻方法[8]進行細胞轉染,將乳腺細胞SKBR3在六孔板上生長至匯合到80%以上時采用LipofectamineTM2000按照制造商說明分別轉染CBR3-AS1干擾序列(干擾組)、CBR3-AS1模擬物序列(過表達組)、陰性對照序列(陰性對照組),轉染后48 h收獲細胞,采用qRT-PCR檢測以確定轉染效率。所有細胞系在37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),培養(yǎng)基為Eagle培養(yǎng)基,取對數生長期且生長良好的細胞用于后續(xù)實驗。

1.5 細胞活力和細胞凋亡檢測

使用MTT細胞增殖/活力測定試劑盒(Sigma,Germany)根據指南進行細胞活力測定。測量并記錄每個孔的吸光度(570 nm),細胞活力計算公式=(OD樣本/OD對照)×100。根據制造商方案,使用膜聯(lián)蛋白-V-Fluos(Annexin-V-Fluos)和碘化丙啶(propidium iodide,PI)凋亡檢測試劑盒通過流式細胞儀評估細胞凋亡率。

1.6 qRT-PCR檢測

使用TRIzol從腫瘤標本或細胞系中提取總RNA,并使用SuperScript III逆轉錄酶試劑盒根據制造商說明書反轉錄成cDNA。用SYBR Premix Ex Taq TM II試劑盒在ABI-7500平臺(Applied Biosystems,USA)上進行PCR擴增,GAPDH作為內參。CBR3-AS1引物序列,正向:5'-CAG TGG GGA ACT CTG ACT CG-3',反向:5'-GTG CCT GGT GCT CTC TTAC C-3'。GAPDH引物序列,正向:5'-GTC AAC GGA TTT GGT CTG TAT T-3',反向,5'-AGT CTT CTG GGT GGC AGT GAT-3'。

1.7 統(tǒng)計學處理

2 結 果

2.1 CBR3-AS1在乳腺癌組織和細胞系中上調表達

CBR3-AS1在乳腺癌組織中相對表達量明顯高于癌旁組織[(5.6±1.8)vs.(1.8±0.5),P<0.01]。正常乳腺上皮細胞系HS578Bst的CBR3-AS1相對表達量為2.03±0.42,乳腺癌細胞系MCF-7、MDA-MB-453和SKBR3中CBR3-AS1相對表達量分別為6.5±0.8、8.3±0.7、11.9±1.2,乳腺癌細胞系MCF-7、MDA-MB-453和SKBR3中CBR3-AS1相對表達量均明顯高于正常乳腺上皮細胞系HS578Bst(均P<0.01)(圖1)。

圖1 qRT-PCR檢測CBR3-AS1的表達 A:乳腺癌組織與癌旁組織;B:正常乳腺上皮細胞系與不同的乳腺癌細胞系Figure1 Determination of CBR3-AS1 expressions by qRT-PCR A:Breast cancer tissues and tumor adjacent tissues;B:Normal mammary epithelial cells and different breast cancer cells

2.2 CBR3-AS1表達與乳腺癌患者臨床病理參數間的關系

依據乳腺癌患者癌組織中CBR3-AS1的表達中位值,將患者分為CBR3-AS1高表達組(43例)和CBR3-AS1低表達組(27例)。統(tǒng)計分析結果顯示,乳腺癌CBR3-AS1表達與年齡(P=0.546)、腫瘤大?。≒=0.478)和組織學類型(P=0.145)無關,但與TNM分期(P=0.003)、淋巴結轉移(P=0.047)和遠處轉移(P=0.024)有關(表2)。

2.3 CBR3-AS1高表達與乳腺癌患者預后的關系

Kaplan-Meier生存分析結果顯示,CBR3-AS1高表達組3年無瘤生存率和總生存率分別為53.3%和62.8%,CBR3-AS1低表達組3年無瘤生存率和總生存率分別為70.7%和78.4%,CBR3-AS1高表達組3年無瘤生存率(P=0.0032)和總生存率(P=0.0057)均明顯低于CBR3-AS1低表達組(圖2)。

圖2 不同CBR3-AS1表達狀態(tài)乳腺癌患者的生存曲線 A:無瘤生存曲線;B:總生存曲線Figure2 Survival curves of breast cancer patients witn different CBR3-AS1 expression levels A:Disease-free survival curves;B:Overall survival curves

表2 CBR3-AS1表達與乳腺癌患者臨床病理參數間的關系[n(%)]Table2 Relations of CBR3-AS1 expression with clinical variables of the breast cancer patients [n (%)]

2.4 轉染效率檢測

轉染后24 h,陰性對照組CBR3-AS1相對表達量為20.4±2.5,干擾組為2.4±0.3,過表達組為54.3±4.7,過表達組CBR3-AS1相對表達量顯著高于陰性對照組(P<0.01);干擾組CBR3-AS1相對表達量明顯低于陰性對照組(P<0.01)(圖3)。

2.5 CBR3-AS1對乳腺癌細胞增殖的影響

轉染后24、48及72 h,細胞活力檢測示,過表達組細胞增殖活力明顯高于陰性對照組(P<0.01);干擾組細胞增殖活力明顯低于陰性對照組(P<0.01)(圖4)。

2.6 CBR3-AS1對乳腺癌細胞凋亡的影響

陰性對照組細胞凋亡率為(19.3±1.8)%,干擾組為(53.4±3.2)%,過表達組為(15.2±1.1)%,過表達組細胞凋亡率明顯低于陰性對照組(P<0.01);干擾組細胞凋亡率明顯高于陰性對照組(P<0.01)(圖5)。

圖3 qRT-PCR檢測轉染效率Figure3 Transfection efficiency determination by qRT-PCR

圖4 CBR3-AS1對乳腺癌細胞增殖活力的影響Figure4 Influence CBR3-AS1on proliferative viability in breast cancer cells

圖5 流式細胞術檢測細胞凋亡Figure5 Cell apoptosis measured by flow cytometry

3 討 論

乳腺癌是發(fā)生于乳腺導管上皮的惡性腫瘤,是世界范圍內女性常見的腫瘤。2012年,全球乳腺癌新發(fā)病例170萬例,占所有女性新發(fā)癌癥的25%,死亡病例52.2萬例,占所有女性死亡病例的15%[9-11]。深入研究乳腺癌發(fā)病分子機制對尋找乳腺癌新治療方法和指導預后尤為重要[12-14]。

人類基因組測序顯示約98%的基因轉錄產物不編碼蛋白質[15]。lncRNAs是一種新發(fā)現(xiàn)的非編碼基因,其涉及細胞發(fā)育和分化、轉錄和翻譯及代謝調節(jié)[16]。越來越多的證據表明lncRNA可作為致癌或腫瘤抑制基因參與多種癌癥的發(fā)生和進展[17-19]。人乳腺癌中l(wèi)ncRNA的微陣列表達譜分析顯示,乳腺癌組織及配對的鄰近組織中存在790個上調和637個下調lncRNA[20]。多種lncRNA如POU3F3、MT1DP、HOTAIR和PRNCR1在人類癌癥中發(fā)揮致癌或抑癌特性[5]。CBR3-AS1,也稱為PlncRNA-1,是21號染色體上的蛋白質編碼基因,位于羰基還原酶3(CBR3)的反義區(qū)域。先前研究[8,21-22]表明CBR3-AS1在前列腺癌和食道癌的癌組織中過度表達且體外調節(jié)細胞凋亡和增殖。在骨肉瘤[23]中,CBR3-AS1在癌組織中上調表達,并與Enneking分期、遠處轉移及組織學分級相關,CBR3-AS1高表達與骨肉瘤預后不良相關,敲低CBR3-AS1表達可抑制骨肉瘤細胞增殖、遷移及侵襲,并促進凋亡。呂波等[24]報道lncRNA CBR3-AS1在膽管細胞癌表達升高,升高的lncRNA CBR3-AS1與膽管細胞癌的惡性臨床病理特征及患者的不良預后密切相關。在本研究報道了與相應的癌旁組織和細胞系比,CBR3-AS1在乳腺癌組織和細胞系中顯著上調,CBR3-AS1高表達與較差的總生存率和無瘤生存率相關。上述結果表明CBR3-AS1可能參與乳腺癌腫瘤進展,并可作為潛在預后標志物。

本研究通過體外功能喪失和功能獲得實驗揭示CBR3-AS1在乳腺癌腫瘤進展中的作用。在體外,穩(wěn)定敲低CBR3-AS1可顯著抑制乳腺癌細胞增殖活力、誘導乳腺癌細胞凋亡;穩(wěn)定過表達CBR3-AS1可顯著促進乳腺癌細胞增殖、抑制乳腺癌細胞凋亡。研究結果提示CBR3-AS1作為致癌lncRNA在乳腺癌發(fā)生和進展中起關鍵作用。盡管如此,CBR3-AS1靶基因和乳腺癌致癌潛在機制尚不清楚。文獻報道lncRNA MALAT1作為miR-1靶標參與調節(jié)乳腺癌細胞增殖和凋亡[25],lncRNA XIST敲低通過上調miR-152抑制人膠質母細胞瘤干細胞腫瘤生長[26],上述結果提示lncRNA-miRNA功能網絡可能在乳腺癌發(fā)生發(fā)展中起重要作用,如文獻報道m(xù)iR-143調節(jié)ERBB3抑制乳腺癌細胞增殖和侵襲[27]。StarBase v 2.0(http://starbase.sysu.edu.cn/)預測CBR3-AS1和miR-143之間可能存在結合位點,因而進一步研究CBR3-AS1-miR-143通路對乳腺癌的影響將有助于闡明CBR3-AS1在乳腺癌中發(fā)揮致癌作用的分子機制。

總之,本研究發(fā)現(xiàn)CBR3-AS1在乳腺癌組織和細胞系中上調,與乳腺癌患者不良預后顯著相關。CBR3-AS1作為致癌lncRNA參與調節(jié)乳腺癌細胞增殖和細胞凋亡,可能是乳腺癌一種新的預后分子標志物和潛在治療靶點。

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