王家浩, 李永磊, 黨 健, 賀劉毅, 喬 敏, 汪春蕾
(東北鹽堿植被恢復(fù)與重建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 東北林業(yè)大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院, 黑龍江 哈爾濱 150040)
銀是天然環(huán)保的、優(yōu)異的廣譜殺菌劑,而且不產(chǎn)生耐藥性。隨著研究的深入以及納米技術(shù)的發(fā)展,納米銀以其優(yōu)異的物理化學(xué)性質(zhì),在近幾年得到快速發(fā)展,而其在抑菌滅菌方面的突出功效引起了科研人員的廣泛關(guān)注[1]。納米銀粒子直徑為1~100 nm,抗菌能力很強(qiáng)。納米銀與銀離子相比,具有比表面積大,抑菌活性強(qiáng)和穩(wěn)定性高等優(yōu)點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥載體、水質(zhì)凈化、抗菌涂料和催化等領(lǐng)域[2]。
納米銀能穿透微生物的細(xì)胞壁,進(jìn)入細(xì)菌體內(nèi),與蛋白質(zhì)的巰基結(jié)合后破壞細(xì)菌的呼吸鏈,產(chǎn)生活性氧簇,氧化并殺死細(xì)菌[3]。與傳統(tǒng)物理和化學(xué)的合成方法相比,納米銀的微生物合成法是一種環(huán)境友好的可持續(xù)發(fā)展方法,具有綠色環(huán)保、低成本、低能耗、反應(yīng)條件溫和等優(yōu)點(diǎn)[4],已經(jīng)成為納米銀合成領(lǐng)域研究的熱點(diǎn)[5]。因此,篩選出新穎的具有納米銀合成能力的菌株,以擴(kuò)大菌種的范圍,具有非常重要的意義。
銀離子具有較強(qiáng)的殺菌作用,因此只有對(duì)銀離子有較強(qiáng)抗性的菌株才能作為合成納米銀的菌株[4]。筆者從泥水混合樣中篩選分離到1株具有合成納米銀的芽孢桿菌屬菌株Ag2,通過(guò)透射電鏡(TEM)和X射線衍射(XRD)技術(shù)對(duì)該菌株合成的粒子進(jìn)行表征,并研究了納米銀的抑菌作用,以期為新型殺菌技術(shù)提供參考。
1.1.1樣品泥水混合樣采自黑龍江省哈爾濱市馬家溝東北林業(yè)大學(xué)流段。
1.1.2試劑細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(Bacteria DNA Kit)、Taq DNA Polymerase和E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)自天根生化科技有限公司;細(xì)菌微量生化反應(yīng)管購(gòu)買于杭州濱和微生物試劑有限公司;Agarose Gel DNA Extraction Kit、DNA Marker DL2000、dNTP和pMD18-T載體購(gòu)自TaKaRa公司;16S rDNA通用引物27F和1492R由華大基因公司合成;其余常規(guī)試劑為國(guó)產(chǎn)分析純制品。
1.1.3培養(yǎng)基液體選擇培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物 5 g/L,pH 7.0。固體選擇培養(yǎng)基:0.7 mmol/L AgNO3,胰蛋白胨10 g/L,酵母提取物 5 g/L,瓊脂 15 g/L,pH 7.0。
1.2.1菌種篩選稱量泥水混合樣3 g,加至30 mL蒸餾水中制成懸濁液,取懸濁液3 mL接種至液體選擇培養(yǎng)基中,150 r/min,避光,30℃培養(yǎng)2 d,傳代培養(yǎng)于含0.1 mmol/L AgNO3的液體選擇培養(yǎng)基中,150 r/min,避光,30℃培養(yǎng)2 d,取菌體培養(yǎng)液2.0 mL分別接種至AgNO3濃度為0.1 mmol/L、0.3 mmol/L、0.5 mmol/L、0.7 mmol/L和0.9 mmol/L的液體選擇培養(yǎng)基中,150 r/min,避光,30℃培養(yǎng)7 d。將生長(zhǎng)在含0.7 mmol/L AgNO3培養(yǎng)基中的菌液涂布于固體選擇培養(yǎng)基上,避光,30℃培養(yǎng)2 d。將長(zhǎng)勢(shì)良好的單克隆劃線純化培養(yǎng)3次[6]。
1.2.2菌種鑒定選取長(zhǎng)勢(shì)良好的菌株Ag2進(jìn)行革蘭氏染色,并利用生理生化反應(yīng)管測(cè)定菌株Ag2對(duì)糖的利用及各種生理生化反應(yīng)特性[7]。
利用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取菌株Ag2的基因組DNA,以菌株Ag2基因組DNA為模板,以27F和1492R為引物擴(kuò)增菌株Ag2的16S rDNA基因[8]。PCR體系和反應(yīng)條件見(jiàn)參考文獻(xiàn)[9],PCR產(chǎn)物經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳后,使用Agarose Gel DNA Extraction Kit回收16S rDNA片段。回收的16S rDNA與pMD18-T載體連接,轉(zhuǎn)化到E.coliDH5α感受態(tài)細(xì)胞中,連接體系、轉(zhuǎn)化及反應(yīng)條件見(jiàn)參考文獻(xiàn)[10]。
轉(zhuǎn)化子用氨芐青霉素篩選后,將經(jīng)菌落PCR鑒定為陽(yáng)性的單克隆送至華大基因有限公司進(jìn)行16S rDNA測(cè)序。利用CExpress對(duì)所測(cè)得的原始序列進(jìn)行拼接,在NCBI官網(wǎng)進(jìn)行BLAST分析,用Phylip-3.69中的最大簡(jiǎn)約法構(gòu)建基于16S rDNA序列菌株Ag2的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)[11]。
向菌液中連續(xù)3 d分3次補(bǔ)加AgNO3,使培養(yǎng)液中Ag+終濃度為0.7 mmol/L,37℃繼續(xù)培養(yǎng)1 d。離心菌體培養(yǎng)液,將菌體沉淀和培養(yǎng)液上清(樣品1)分離,無(wú)菌水洗滌菌體沉淀3次,去除附著的有機(jī)物。向菌體沉淀中加20 mL無(wú)菌水,超聲波破胞,功率200 W,工作與停止各15 s交替進(jìn)行30 min,離心后分別收集破胞后的上清(樣品2)和沉淀(樣品3)。使用透射電子顯微鏡檢測(cè)樣品1、樣品2和樣品3。樣品3經(jīng)真空干燥后,進(jìn)行XRD檢測(cè)分析。
取大腸桿菌和枯草芽孢桿菌接種于LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)過(guò)夜,將培養(yǎng)后的菌液稀釋1000倍,取100 μL稀釋后的菌液涂布于LB固體平板上,用黃色槍頭在平板上打2個(gè)孔,向2個(gè)樣品孔中分別加入40 μL無(wú)菌水和40 μL 50 mg/mL的樣品3,37℃培養(yǎng)過(guò)夜,觀察抑菌效果。
樣品經(jīng)篩選、分離和純化后得到5個(gè)單菌落,其中菌株Ag2長(zhǎng)勢(shì)最好,可用于試驗(yàn)。菌株Ag2在含0.1~0.9 mmol/L AgNO3的選擇培養(yǎng)基中均有生長(zhǎng),AgNO3濃度大于0.5 mmol/L的培養(yǎng)液顏色由黃色變?yōu)楹谏?,納米銀溶于水時(shí)的顏色為黑色[12],表明該菌株具有合成納米銀的能力。
2.2.1形態(tài)鑒定菌株Ag2的菌落為白色,圓形且表面光滑,革蘭氏染色結(jié)果呈紫色(圖1),為革蘭氏陽(yáng)性桿菌。菌株Ag2可以利用葡萄糖、蔗糖、阿拉伯糖和麥芽糖作為碳源,具有淀粉水解酶、硝酸鹽還原酶、馬尿酸水解酶和精氨酸雙水解酶的活性(表1)。
圖1 菌株Ag2革蘭氏染色形態(tài)(×1 000)
表1 菌株Ag2的生理生化反應(yīng)
注:+表示陽(yáng)性反應(yīng),-表示陰性反應(yīng)。
Note:+ indicates positive and - indicates negative.
2.2.2分子鑒定以提取菌株Ag2的總DNA為模板,克隆的16S rDNA條帶清晰明亮,長(zhǎng)度約1 500 bp,無(wú)非特異性擴(kuò)增條帶(圖2)。經(jīng)測(cè)序,菌株Ag2的16S rDNA大小為1 513 bp,提交Genbank后的序列號(hào)為MK920167。在NCBI上經(jīng)BLAST比對(duì)分析,菌株Ag2的16S rDNA序列與多種芽孢桿菌屬的細(xì)菌具有較高相似度,確定該菌株屬于芽孢桿菌屬。由圖3可見(jiàn),菌株Ag2與枯草芽孢桿菌、死谷芽孢桿菌、地衣芽孢桿菌和貝萊斯芽孢桿菌聚為一類。
注:M,分子量標(biāo)準(zhǔn)DL2 000;泳道1,空白對(duì)照;泳道2,樣品。
Note: M,DL2 000 marker; Lane 1, blank control; Lane 2, sample.
圖2菌株Ag2的16S rDNA的PCR電泳圖譜
Fig.2 PCR electrophoresis of 16S rDNA of strain Ag2
圖3 基于16S rDNA序列菌株Ag2的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
菌株Ag2與AgNO3共培養(yǎng)后在透射電鏡下均可觀察到納米粒子,分散性良好。菌體破胞沉淀樣品(樣品3)中粒子的密度和粒徑(圖4A)均大于培養(yǎng)液上清(樣品1)與破胞后上清樣品(樣品2)中的納米粒子(圖4B、C),粒徑在10~20 nm,在高倍鏡下可清晰地觀測(cè)到樣品3中粒子的晶格結(jié)構(gòu)(圖4D),其晶格條紋間距為0.229 nm,與Jade 6.5提供的PDF#04-0783卡片中納米銀晶體數(shù)據(jù)相符。從菌體破胞沉淀樣品(樣品3)的X射線衍射分析圖譜(圖5)可看出,菌株Ag2合成納米銀的晶面指數(shù)包含(111)、(200)、(222)和(311)4種類型,為多晶結(jié)構(gòu),且以(111)型納米銀含量最多。
注:A和D,菌體破胞沉淀樣品(樣品3);B,培養(yǎng)液上清(樣品1) ;C,破胞后的上清樣品(樣品2)。
Note: A and D, precipitatesample after cell broken (sample 3); B,culture solutionsupernatant (sample 1); C,supernatant sample after cell broken (sample 2).
圖4透射電鏡下菌株Ag2制備的納米粒子
Fig.4 Nanoparticles prepared by strain Ag2 under transmission electron microscopy
圖5 XRD鑒定菌株Ag2合成的納米銀
Fig.5 Silver nanoparticles synthesized by strain Ag2 under XRD
菌株Ag2胞內(nèi)合成的納米銀粒子對(duì)大腸桿菌和枯草芽孢桿菌均具有殺菌能力(圖6),表現(xiàn)出很強(qiáng)的應(yīng)用潛力。
注:A,大腸桿菌;B,枯草芽孢桿菌;樣品孔1,樣品3;樣品孔2,無(wú)菌水。
Note: A,Escherichiacoli;B,Bacillussubtilis; sample hole 1,sample 3; sample hole 2, sterile water.
圖6菌株Ag2胞內(nèi)合成納米銀的抑菌效果
Fig.6 Antibacterial effect of silver nanoparticles intracellular synthesised by strain Ag2
研究利用篩選出的芽孢桿菌屬菌株Ag2與AgNO3共培養(yǎng),在菌體細(xì)胞內(nèi)部大量合成了納米銀粒子,其粒徑在10~20 nm,晶面條紋間距為0.229 nm,與納米銀(111)的晶面間距相符,納米銀粒子對(duì)大腸桿菌和枯草芽孢桿菌具有抑菌效果。
利用化學(xué)法制備納米粒子具有一定的毒性,而生物法制備納米粒子,綠色環(huán)保,認(rèn)可度高[13]。細(xì)菌合成納米銀粒子主要有菌液胞內(nèi)合成與培養(yǎng)上清液胞外合成2種方式[4],菌株Ag2的胞內(nèi)外均合成了納米銀,菌株Ag2與AgNO3共培養(yǎng)后,培養(yǎng)液變?yōu)楹谏?,表明有納米粒子的合成,但透射電鏡結(jié)果表明,胞外合成的納米粒子密度及粒徑均小于菌體細(xì)胞內(nèi)合成的納米粒子。菌株Ag2具有硝酸鹽還原酶的活性,推測(cè)其與納米銀的合成有關(guān)[14]。
單質(zhì)銀具有殺菌功能,而納米銀粒子比表面積大,粒徑小,與細(xì)菌的接觸幾率大,具有更強(qiáng)的殺菌能力。菌株Ag2胞內(nèi)合成的納米銀粒子對(duì)大腸桿菌和枯草芽孢桿菌均具有殺菌效果。抑菌環(huán)是納米銀粒子殺菌效果的直接證明[15]。研究篩選出的菌株Ag2提供了生物合成納米銀的新菌株,利用菌株Ag2進(jìn)行生物方式合成的納米銀粒子具有抗菌應(yīng)用潛力。