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基于陽(yáng)離子共軛聚合物熒光共振能量轉(zhuǎn)移結(jié)合雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)信號(hào)擴(kuò)增檢測(cè)端粒酶活性

2019-08-05 07:51周曉毓趙建偉馬貴敏賈紅霞
分析化學(xué) 2019年7期
關(guān)鍵詞:活性

周曉毓 趙建偉 馬貴敏 賈紅霞

摘?要?檢測(cè)端粒酶活性對(duì)腫瘤、癌癥的早期診斷,以及開(kāi)發(fā)以端粒酶為靶標(biāo)分子的抗腫瘤、抗癌藥物具有重要意義。本研究基于陽(yáng)離子共軛聚合物Poly[(9,9-bis(6'-N,N,N-trimethylammonium)hexyl)fluorenylene phenylene (PFP)與熒光染料SYBR Green I (SG)之間的熒光共振能量轉(zhuǎn)移,建立了一種簡(jiǎn)單快速的端粒酶活性檢測(cè)方法。當(dāng)端粒酶存在時(shí),引物探針被延伸,生成具有-(GGTTAG)n重復(fù)序列的DNA。然后通過(guò)鏈霉親合素與生物素的特異性作用將端粒酶延伸產(chǎn)物連接在磁性微球上。加入與端粒酶延伸產(chǎn)物匹配的探針-(CTAACC)2。端粒酶延伸產(chǎn)物形成雙鏈結(jié)構(gòu)之后加入SG,SG能夠特異性的嵌入到DNA雙鏈結(jié)構(gòu)中。最后,加入PFP。PFP是一種帶有正電荷的水溶性共軛陽(yáng)離子聚合物,可以通過(guò)靜電作用與雙鏈DNA發(fā)生吸附。PFP與嵌入在雙鏈結(jié)構(gòu)中的SG發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)。根據(jù)FRET的效率可以實(shí)現(xiàn)對(duì)端粒酶活性的定量檢測(cè)。本方法可以檢測(cè)到3.0×105個(gè)Hela細(xì)胞中提取的端粒酶活性。將本方法與雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(HCR)反應(yīng)結(jié)合,可實(shí)現(xiàn)檢測(cè)信號(hào)的放大,提高檢測(cè)的靈敏度,可以檢測(cè)到6.0×104個(gè)Hela細(xì)胞中的端粒酶活性,靈敏度提高了一個(gè)數(shù)量級(jí)。本方法簡(jiǎn)單、快速,無(wú)需標(biāo)記、擴(kuò)增過(guò)程,無(wú)酶參與,檢測(cè)成本低,靈敏度高。

關(guān)鍵詞?端粒酶; 活性; 陽(yáng)離子共軛聚合物; 熒光共振能量轉(zhuǎn)移; 雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng); 無(wú)酶信號(hào)放大

1?引 言

在正常細(xì)胞中,端粒隨著細(xì)胞的有絲分裂而逐漸縮短,直至細(xì)胞凋亡[1,2]。端粒酶是一種具有反轉(zhuǎn)錄活性的核糖蛋白酶。它能夠以自身具有的RNA序列為模板,對(duì)端粒DNA進(jìn)行不斷復(fù)制,阻止其縮短,使細(xì)胞無(wú)限增殖,不再凋亡。端粒酶在正常細(xì)胞中(除永生細(xì)胞)活性很低,很難被檢測(cè)到; 它一般在腫瘤或癌細(xì)胞中被激活[3,4]。有研究表明,在腫瘤細(xì)胞中端粒酶的活性表達(dá)高達(dá)85%,腫瘤或癌細(xì)胞的強(qiáng)大活性與端粒酶被激活密切相關(guān)。通過(guò)檢測(cè)端粒酶活性可以實(shí)現(xiàn)腫瘤或癌癥的早期診斷。同時(shí),建立靈敏的端粒酶檢測(cè)方法對(duì)開(kāi)發(fā)以端粒酶為靶標(biāo)分子的抗癌藥物具有重要意義[5,6]。

1994年,Kim等[7]提出了基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)的端粒酶重復(fù)序列擴(kuò)增法(Telomerase repeat amplification protocal,TRAP)用于端粒酶活性的檢測(cè)。之后,各種基于TRAP的端粒酶活性檢測(cè)方法相繼被提出[8~11]。基于TRAP的端粒酶活性檢測(cè)方法,靈敏度較高,可以檢測(cè)到幾個(gè)癌細(xì)胞中的端粒酶活性(以癌細(xì)胞數(shù)量為活性單位); 但是,PCR過(guò)程操作步驟復(fù)雜,需要多個(gè)變溫循環(huán)過(guò)程,耗時(shí)長(zhǎng); 擴(kuò)增過(guò)程有聚合酶的參與,容易出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增。而且,端粒酶抑制劑可能會(huì)抑制PCR反應(yīng)中聚合酶的活性,造成假信號(hào)的出現(xiàn),不利于端粒酶抑制劑的篩選。

等溫?cái)U(kuò)增是近年出現(xiàn)的一類(lèi)恒定溫度下快速高效的核酸擴(kuò)增技術(shù)。與PCR擴(kuò)增相比,等溫?cái)U(kuò)增無(wú)需不斷變換反應(yīng)溫度,耗時(shí)短,擴(kuò)增效率高,已被用于端粒酶活性的檢測(cè)。2010年,Ding等[12]建立了基于等溫循環(huán)鏈頂替擴(kuò)增反應(yīng)檢測(cè)端粒酶活性的方法,可以檢測(cè)到40個(gè)Hela細(xì)胞中的端粒酶活性。2012年,Tian等[13]建立的基于等溫指數(shù)擴(kuò)增反應(yīng)(IEXPAR)檢測(cè)端粒酶的方法可以檢測(cè)低至1個(gè)癌細(xì)胞中的端粒酶活性。2016年,Wang等[14]建立的基于環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)檢測(cè)端粒酶活性的方法,實(shí)現(xiàn)了無(wú)背景信號(hào)的擴(kuò)增,可以檢測(cè)到1個(gè)癌細(xì)胞中端粒酶的活性。這些基于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)端粒酶活性的方法的靈敏度與TRAP法相當(dāng)。但是,這些擴(kuò)增技術(shù)都需要聚合酶的參與,容易出現(xiàn)假陽(yáng)性或假陰性信號(hào),而且大多設(shè)計(jì)復(fù)雜,檢測(cè)成本較高。

雜交鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(HCR)是一種無(wú)需酶參與,利用堿基互補(bǔ)配對(duì)進(jìn)行交替雜交的信號(hào)放大技術(shù)。無(wú)酶參與能夠避免由聚合酶導(dǎo)致的假信號(hào)的出現(xiàn),提高方法的檢測(cè)準(zhǔn)確性。2015年,Wang等[15]基于HCR建立了一種電化學(xué)檢測(cè)端粒酶活性的方法。該方法可以檢測(cè)到2個(gè)Hela細(xì)胞中的端粒酶活性。但該方法需要復(fù)雜的電極修飾過(guò)程,而且需要對(duì)金納米粒子進(jìn)行標(biāo)記,耗時(shí)長(zhǎng),過(guò)程繁雜。2016年,Hong等[16]基于HCR,利用熒光成像進(jìn)行端粒酶活性分析。該方法可以檢測(cè)到1個(gè)Hela細(xì)胞中的端粒酶活性,靈敏度高。該方法同樣需要對(duì)金納米粒子進(jìn)行標(biāo)記,而且需要結(jié)合金納米粒子與氧化石墨烯共同作用,設(shè)計(jì)復(fù)雜。張佳玉等[17]基于HCR和磁分離技術(shù)建立了一種非常簡(jiǎn)單的熒光檢測(cè)端粒酶活性的方法。該方法將端粒酶延伸產(chǎn)物特異性的DNA探針作為HCR引發(fā)探針,利用熒光直接檢測(cè)信號(hào)放大結(jié)果,可以檢測(cè)到1×105個(gè)Hela細(xì)胞中的端粒酶活性。該方法的主要缺點(diǎn)是靈敏度較低; 而且,DNA探針需要熒光標(biāo)記,增加了檢測(cè)成本。

共軛聚合物是一類(lèi)含有高度離域的π電子共軛結(jié)構(gòu)的高分子聚合物。水溶性共軛聚合物具有獨(dú)特的光電特性和電解質(zhì)的靜電特性[18,19]。陽(yáng)離子共軛聚合物已被廣泛用于生物傳感器的開(kāi)發(fā)[20~23]。熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是一種獨(dú)特的熒光現(xiàn)象,已成為一種備受關(guān)注的新熒光檢測(cè)技術(shù)[24,25]。2017年,Chen等[26]建立的基于共軛聚合物與熒光素之間的FRET檢測(cè)端粒酶活性的方法可達(dá)到5個(gè)細(xì)胞/mL的檢出限,方法簡(jiǎn)單,靈敏度高,但同樣需要用熒光素進(jìn)行標(biāo)記,檢測(cè)成本較高。

Poly[(9,9-bis(6'-N,N,N-trimethylammonium) hexyl)fluorenylene phenylene (PFP)是一種能夠發(fā)射熒光的水溶性共軛陽(yáng)離子聚合物,由于其帶有正電荷,可與帶負(fù)電的生物大分子發(fā)生靜電吸附[27]。本研究利用陽(yáng)離子共軛聚合物-PFP與熒光染料-SG之間的熒光共振能量轉(zhuǎn)移,結(jié)合HCR信號(hào)放大技術(shù),建立了一種無(wú)需熒光標(biāo)記、無(wú)酶參與的端粒酶活性分析新方法。無(wú)酶參與可有效避免聚合酶導(dǎo)致的假信號(hào)出現(xiàn),提高方法檢測(cè)的準(zhǔn)確性; 結(jié)合HCR,有效提高了端粒酶活性檢測(cè)的靈敏度。

2?實(shí)驗(yàn)部分

2.1?儀器與試劑

Fluorolog 3-211熒光光譜儀(法國(guó)Horiba Jobin-Yivon公司); 2720 熱循環(huán)儀(美國(guó)Applied Biosystems公司); KYC 100C搖床(上海福瑪實(shí)驗(yàn)設(shè)備有限公司)。

3-[(3-膽胺丙基)-二甲基胺]丙烷磺酸(CHAPS)細(xì)胞裂解液(美國(guó)Millipore公司)。鏈霉親和素(Streptavidin)表面功能化的磁性微球(直徑 2.8 μm,10 mg/mL, 美國(guó)Dynal Biotech公司)。 20× SYBR Green I (SG) (DMSO溶劑,廈門(mén)致善生物技術(shù)公司)。PFP由中國(guó)科學(xué)院化學(xué)所王樹(shù)課題組提供。實(shí)驗(yàn)用水均為二次去離子水。實(shí)驗(yàn)中所用DNA(聚丙烯酰胺電泳純化)購(gòu)于上海生物工程公司,序列見(jiàn)表1。

實(shí)驗(yàn)中所用緩沖溶液包括:1×PBS緩沖溶液(37 mmol/L NaCl, 10 mmol/L Na2HPO4-KH2PO4, 2.7 mmol/L KCl, pH 7.4); 1×Tris-HCl緩沖溶液(10 mmol/L Tris-HCl, 1.0 mmol/L EDTA, 2.0 mol/L NaCl, 0.05% Tween-20, pH 7.3); 端粒酶延伸反應(yīng)緩沖溶液(20 mmol/L Tris-HCl, 1.5 mmol/L MgCl2, 70 mmol/L KCl, 1.0 mmol/L乙二醇雙(2-氨基乙基醚)四乙酸 (EGTA), 0.05% Tween-20, pH 8.3)。

2.2?實(shí)驗(yàn)方法

2.2.1?端粒酶的提取?培養(yǎng)的Hela細(xì)胞計(jì)數(shù)后用冷的1×PBS洗滌3次,在4℃以2000 r/min離心10 min。分離出的細(xì)胞加入冷的 1× CHAPS細(xì)胞裂解緩沖液,在冰上放置30 min,期間多次振蕩,以保證細(xì)胞充分裂解。然后在4℃以12000 r/min離心30 min。取出含有端粒酶的上層溶液,于80℃保存,備用。

2.2.2?端粒酶的延伸?取適量端粒酶提取液、10 μmol/L標(biāo)記生物素的端粒酶延伸引物(biotin-TS)、200 μmol/L dNTPs,在端粒酶延伸反應(yīng)緩沖溶液中混合均勻,終體積為50 μL。置于熱循環(huán)儀中,37℃下進(jìn)行端粒酶延伸反應(yīng)1 h; 90℃保持10 min,使端粒酶變性失活,終止反應(yīng)。

2.2.3?FRET反應(yīng)及熒光檢測(cè)?取5 μL磁球,用1×Tris-HCl緩沖溶液洗滌3次,用1×PBS緩沖溶液懸浮,加入50 μL端粒酶延伸產(chǎn)物和250 nmol/L DNA probe,在熱循環(huán)儀中70℃高溫變性10 min,45℃復(fù)性雜交20 min。取出后,不斷振蕩,降至室溫后進(jìn)行雜交。磁分離,棄去上清液。磁球懸浮在1×PBS緩沖溶液中,加入0.6×SG熒光染料和100 nmol/L PFP,總反應(yīng)體積100 μL。檢測(cè)熒光強(qiáng)度,激發(fā)波長(zhǎng)為380 nm,掃描范圍為400 ~650 nm,激發(fā)狹縫和發(fā)射狹縫均為4.5 nm。

2.2.4?基于HCR的FRET反應(yīng)及熒光檢測(cè)?取5 μL磁球,用1×Tris-HCl緩沖溶液洗滌3次。將磁球懸浮在1×PBS緩沖溶液中,加入適量端粒酶延伸產(chǎn)物和終濃度為250 nmol/L的DNA probe Ⅰ,總反應(yīng)體積100 μL。在熱循環(huán)儀中70℃高溫變性10 min,45℃復(fù)性雜交20 min,自然冷卻至室溫。磁分離,棄去上清液,分別加入500 nmol/L的DNA probe Ⅱ和DNA probe Ⅲ,懸浮在100 μL 1×PBS緩沖溶液中。在30℃以200 r/min孵育2 h,進(jìn)行HCR反應(yīng)。

將HCR反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行磁分離,棄去上清液,加入0.6×SG 熒光染料和125 nmol/L PFP,重新懸浮在100 μL 1×PBS中,檢測(cè)熒光信號(hào)。激發(fā)波長(zhǎng)為380 nm,掃描范圍為400~650 nm,激發(fā)狹縫和發(fā)射狹縫均為4.5 nm。

3?結(jié)果與討論

3.1?基于FRET檢測(cè)端粒酶活性的原理

基于陽(yáng)離子共軛聚合物PFP與SG之間的FRET檢測(cè)端粒酶活性的原理如圖1所示。生物素標(biāo)記的端粒酶引物(Biotin-TS)在端粒酶和dNTPs作用下發(fā)生延伸反應(yīng),產(chǎn)生一條具有(GGTTAG)n重復(fù)序列的端粒酶延伸產(chǎn)物DNA。加入鏈霉親和素表面功能化的磁性微球(Steptavidin magnetic bead),通過(guò)Steptavidin-biotin的特異性結(jié)合,將端粒酶延伸產(chǎn)物連接到磁球上。而細(xì)胞提取物及延伸反應(yīng)中的其它反應(yīng)物通過(guò)磁分離去除。加入與端粒酶延伸產(chǎn)物重復(fù)序列匹配的DNA探針(DNA probe:(CTAACC)2)。DNA probe與端粒酶延伸產(chǎn)物結(jié)合,形成雙鏈結(jié)構(gòu)。加入可與雙鏈DNA特異性結(jié)合的熒光染料SYBR Green I (SG),SG嵌入到雙鏈DNA的小螺旋結(jié)構(gòu)中,加入帶有大量正電荷的陽(yáng)離子共軛聚合物PFP,通過(guò)靜電作用與雙鏈DNA結(jié)合,形成PFP-dsDNA-SG三聚體結(jié)構(gòu)。PFP與SG之間的距離被拉近,發(fā)生熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)。PFP的激發(fā)波長(zhǎng)為380 nm,發(fā)射波長(zhǎng)為425 nm。SG的激發(fā)波長(zhǎng)為480 nm,發(fā)射波長(zhǎng)為523 nm。通過(guò)檢測(cè)SG和PFP熒光發(fā)射峰強(qiáng)度的比值(I523 nm/I425 nm)變化,從而檢測(cè)端粒酶活性。定義I523 nm/I425 nm為熒光共振能量轉(zhuǎn)移效率(FRET efficiency),端粒酶延伸產(chǎn)物越多,I523 nm/I425 nm越大,即PFP與SG之間FRET效率越高。

考察了本方法檢測(cè)端粒酶活性的可行性。首先考察合成的端粒酶延伸產(chǎn)物(biotin-STEP)的FRET反應(yīng)。空白溶液中不含合成的biotin-STEP,加入DNA probe不能形成雙鏈結(jié)構(gòu),加入熒光染料SG無(wú)法發(fā)生PFP與SG之間的FRET。從圖2可見(jiàn),空白溶液在425 nm處熒光峰(PFP熒光峰位置)強(qiáng)度很大,而523 nm處熒光峰(SG熒光峰位置)非常弱; 樣品在425 nm處熒光峰強(qiáng)度明顯降低,523 nm處熒光峰強(qiáng)度顯著增加。證明端粒酶延伸產(chǎn)物可以引起PFP與SG之間有效的FRET。

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