王惟帥,楊世琦,楊正禮
(1中國農(nóng)業(yè)科學院 農(nóng)業(yè)環(huán)境與可持續(xù)發(fā)展研究所,北京 100081;2 農(nóng)業(yè)部 農(nóng)業(yè)環(huán)境與氣候變化重點開放實驗室,北京 100081)
延安屬黃河中游丘陵溝壑區(qū),土壤母質(zhì)疏松,植被覆蓋率低,由于長期的不合理開發(fā)利用,導致土質(zhì)退化、水土流失等問題[1]。自退耕還林、還草措施實施以來,該區(qū)域植被覆蓋面積明顯提高,然而,退耕過度又導致退耕規(guī)模超過了人均耕地需求下限,出現(xiàn)了人口與耕地不平衡的局面[2]。為緩解這一矛盾,延安政府大力開展治溝造地,但在使用機械化里切外墊等方法使新造地面積增長的同時,又致使熟土被壓、土壤結構遭到破壞;并且研究發(fā)現(xiàn),新造地農(nóng)田土壤氮和磷含量、土壤酶活性、微生物豐度等均較低[3-4]。
氮、磷作為植物生長必需的營養(yǎng)元素,對作物生長具有重要作用,但一般農(nóng)田土壤中氮、磷的有效供應量很少,通常通過施肥來滿足作物生長的需要。然而研究表明,化肥施用量的增加會導致化肥利用率降低;同時,化肥會污染空氣、土壤及水體,破壞土壤結構和微生物多樣性,還會降低農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)等[5]。因此,利用土著微生物進行固氮解磷,不僅在為作物提供營養(yǎng)物質(zhì)的同時減少了化肥施用量,而且還可以提高作物產(chǎn)量,改善作物品質(zhì),調(diào)節(jié)作物生長,改良土壤環(huán)境等[6-10]。
馬鈴薯是延安地區(qū)主要的糧食作物之一,能夠適應新造地土壤類型,隨著種植面積的不斷擴大,其已成為該地區(qū)農(nóng)業(yè)經(jīng)濟發(fā)展的重要推動力,在提升糧食產(chǎn)量和增加農(nóng)民收入方面起到積極作用[11]。因此,本研究從新造地馬鈴薯根際土壤中分離固氮解磷微生物,并從中篩選固氮解磷特性較好的有益功能菌株,以期為延安新造地馬鈴薯微生物菌肥的研制提供依據(jù)。
1.1.1 土壤樣品來源與處理 土壤樣品采自延安市安塞區(qū)南溝村(109°12′12″-109°22′12″ E,36°41′24″-36°46′12″ N),海拔1 219 m,年降水量500~550 mm;土壤以黃綿土為主,質(zhì)地為粉沙,抗侵蝕能力差。采用蛇型采樣法,選15個采樣點,每個采樣點取馬鈴薯根際土壤樣品500 g,混勻后,采用四分法留取約1 000 g土樣,將土樣保留于自封袋中并運回實驗室以分離固氮解磷菌。
1.1.2 培養(yǎng)基 (1)Ashby無氮培養(yǎng)基。甘露醇10 g,KH2PO40.2 g,MgSO40.2 g,NaCl 0.2 g,K2SO40.3 g,CaCO35 g,瓊脂18 g,蒸餾水1 000 mL,pH 7.0~7.5,121 ℃ 滅菌30 min。
(2)無機磷培養(yǎng)基。NaCl 0.3 g,MgSO4·7H2O 0.3 g,KCl 0.3 g,(NH4)2SO40.5 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.003 g,MnSO4·4H2O 0.003 g,Ca3(PO4)25.0 g,葡萄糖10 g,瓊脂18 g,蒸餾水1 000 mL,pH 7.0~7.5,121 ℃ 滅菌30 min;
(3)LB培養(yǎng)基。蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,NaCl 10 g,蒸餾水1 000 mL,pH 7.0~7.2,121 ℃滅菌30 min。
稱取10 g新鮮土壤樣品,置于250 mL三角瓶中,加入90 mL蒸餾水,30 ℃、150 r/min振蕩40 min,靜置后得到懸浮液。采用稀釋法[12]將該懸浮液稀釋至不同濃度,取0.1 mL稀釋液均勻涂布在Ashby無氮培養(yǎng)基上,于30 ℃恒溫培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)24 h,選擇不同類型的單個菌落,經(jīng)平板多次純化,純化后的菌落接種于無機磷培養(yǎng)基中,通過溶菌圈法[13]篩選固氮解磷菌,純化得到的菌株保存于4 ℃冰箱中備用。
1.3.1 形態(tài)學特征 將篩選出來的菌株劃線接種至LB平板上,30 ℃培養(yǎng)24 h,觀察其在平板上的菌落生長狀況、顏色、透明度、濕潤度、光滑度等[12]。
1.3.2 16S rDNA序列分析 利用SDS-CTAB法[14]提取各菌株基因組總DNA,采用細菌16S rDNA通用引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGAC-
TT-3′)進行16S rDNA的PCR擴增,擴增片段長度為1.5 kb。PCR反應體系為25 μL:10×PCR Buffer 2.5 μL,dNTPs (10 mmol/L) 0.5 μL,上、下游引物(50 μmol/L)各0.5 μL,模板DNA(40 ng/μL) 0.5 μL,TaqDNA聚合酶(3 U/μL) 0.5 μL,無菌ddH2O 20 μL。PCR反應條件:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性30 s,52 ℃退火30 s,72 ℃延伸10 min,共30個循環(huán)。PCR產(chǎn)物經(jīng)0.7%瓊脂糖凝膠電泳后回收純化,送北京君諾德生物技術有限公司測序。將獲得的16S rDNA序列在NCBI數(shù)據(jù)庫中進行比對,BLAST搜索同源序列,采用MEGA 5.0軟件,以Neighbor-joining法[14]建立固氮解磷菌16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.4.1 固氮能力測定 采用乙炔還原法[12]測定固氮解磷菌的固氮能力。挑取LB斜面培養(yǎng)基上的單菌落接種到Ashby無氮培養(yǎng)基上,28 ℃活化;選擇長勢良好的菌株,挑取菌落大小相近的單菌落接種于裝有6 mL Ashby液體培養(yǎng)基的西林瓶中,西林瓶體積為10 mL,壓蓋密封,30 ℃、150 r/min培養(yǎng)24 h。在無菌條件下將體積分數(shù)10%的空氣抽出,注入體積分數(shù)10%的高純乙炔。30 ℃、150 r/min培養(yǎng)48 h,用氣相色譜儀測定乙烯的生成量。按以下公式計算其固氮酶活性:
ARA=(Vst×Cst×Asa×Vtu)/(Vsa×Ast×H×22.4)。
式中:ARA為固氮酶活性,nmol/h;Vst為標準乙烯進樣體積,mL;Cst為標準乙烯濃度,nmol/mL;Asa為乙烯峰面積,cm2;Vtu為西林瓶體積,mL;Vsa表示樣品進樣體積,mL;Ast表示標準乙烯峰面積,cm2;H表示培養(yǎng)時間,h。
1.4.2 解磷能力測定 (1)將分離純化得到的固氮解磷菌接轉(zhuǎn)到無機磷固體培養(yǎng)基上,28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)4 d,用游標卡尺測量菌落直徑(d)和透明圈直徑(D),用D/d值表征其溶磷能力,值越大表示溶磷能力越強[13]。(2)將供試菌株接種于已滅過菌的裝有30 mL無機磷液體培養(yǎng)基的三角瓶中,30 ℃、150 r/min振蕩培養(yǎng),分別于培養(yǎng)1,3,5,7 d時取樣,將樣液4 ℃、10 000 r/min離心10 min,取上清液采用鉬藍比色法[9]測定有效磷含量。設不接種菌株為空白對照(CK)。
利用Excel 2010 軟件進行數(shù)據(jù)整理和制圖,采用SPSS 16.0統(tǒng)計軟件對數(shù)據(jù)進行方差分析和差異顯著性檢驗,采用MEGA 5.0軟件建立固氮解磷菌16S rDNA的系統(tǒng)發(fā)育樹。
通過土壤懸浮液富集培養(yǎng)并進行梯度稀釋培養(yǎng)純化后,觀察菌落形態(tài)的差異,從土樣中共分離出具有固氮活性的菌株37株,將這37株菌株分別接種到無機磷培養(yǎng)基中培養(yǎng),通過溶菌圈確定具有解磷功能的菌株,進一步利用固氮解磷交叉試驗最終篩選得到9株菌株,其皆具有固氮解磷功能,且菌株生長良好,各菌株的菌落形態(tài)及生長狀況如表1和圖1所示。
表1 從馬鈴薯根際分離的9株固氮解磷菌的生長狀況和菌落形態(tài)Table 1 Growth and colonial morphology of 9 nitrogen fixing and phosphate solubilizing bacteria isolated from potato rhizosphere
注:“++++”代表長勢旺盛(菌落濃、厚、密),“+++”代表長勢良好(滿足菌落濃、厚、密中的兩條)。
Notes:“++++” means growing vigorously(Dense,thick and numerous colony),“+++” means growing well(Meeting the above two).
圖1 從馬鈴薯根際分離的9株固氮解磷菌的菌落形態(tài)Fig.1 Colonial morphology of 9 nitrogen fixing and phosphate solubilizing bacteria isolated from potato rhizosphere
將9株固氮解磷菌的16S rDNA 基因測序后輸入NCBI數(shù)據(jù)庫進行BLAST比對,結果(表2)顯示,9株菌分屬于不同的菌屬,其中與N31基因相似性最高的菌株為假單胞菌PseudomonasaeruginosaGBAP5(100%),菌株N33與克雷伯氏菌KlebsiellapneumoniaeCRKP-1215的基因相似性最高(100%),N34與紅球菌RhodococcuserythropolisHX-2(100%)相似性最高,N46與節(jié)桿菌PaenarthrobacternitroguajacolicusBF-R19相似性最高(100%),P33與芽孢桿菌BacillussafensisXQ56的基因相似度最高(100%); P34與貪噬菌Variovoraxsp.553相似度最高(99%),P52與腸桿菌KosakoniacowaniiP4菌株的基因相似度最高(99%),OP1與副球菌Paracoccussp. ENF1相似度最高(99%),OP8與芽孢桿菌BacillusaryabhattaiFORT25相似度最高(99%)。
采用鄰接法構建9株固氮解磷菌及其最高相似性菌株16S rDNA基因序列的系統(tǒng)進化發(fā)育樹,結果(圖2)顯示,9株固氮解磷菌與其16S rDNA基因序列最高相似性菌株位于同一分支,說明它們具有高度的同源性。
綜上所述,本試驗從延安新造地馬鈴薯根際土壤分離得到9株具有固氮解磷功效的菌株,分別歸屬于假單胞桿菌屬(Pseudomonas)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)、紅球菌屬(Rhodococcus)、節(jié)桿菌屬(Paenarthrobacter)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、貪噬菌屬(Variovorax)、腸桿菌屬(Kosakonia)和副球菌屬(Paracoccus),其中菌株P33和OP8均屬于芽孢桿菌屬。
表2 從馬鈴薯根際分離的9株固氮解磷菌的鑒定結果Table 2 Identification of 9 nitrogen fixing and phosphate solubilizing bacteria isolated from potato rhizosphere
圖3顯示,通過篩選得到的9株菌均具有固氮功能,固氮酶活性為11.88~95.08 nmol/h,且各菌株的固氮酶活性存在差異,其中菌株N34的固氮酶活性最高,達到95.08 nmol/h,是菌株N31的8倍;N46的固氮酶活性次之,為75.58 nmol/h,且菌株N34和N46的固氮酶活性與其他菌株差異顯著;菌株N31與OP8的固氮酶活性相當,N33、P33、P52和OP1 之間的固氮能力均沒有顯著差異。
圖4表明,9株菌在無機磷培養(yǎng)基中培養(yǎng)4 d后,其D/d(透明圈直徑/菌落直徑)值為1.12~1.87,其中菌株N46的D/d值最大,且與其他菌株的溶磷能力差異顯著;N34與OP8的溶磷能力相當,其余各菌株間的溶磷能力均無顯著差異。這說明9株固氮解磷菌均具有溶解不溶性磷的能力,且菌株之間存在差異。
圖柱上標不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05)。下同Different lowercase letters indicate significant difference (P<0.05).The same below
圖3 從馬鈴薯根際分離的9株固氮解磷菌的固氮酶活性
Fig.3 Nitrogenase activity of 9 nitrogen fixing and phosphate solubilizing bacteria isolated from potato rhizosphere
“D/d”表示“透明圈直徑/菌落直徑”“D/d” means “transparent circle diameter/colony diameter”
圖4 從馬鈴薯根際分離的9株固氮解磷菌的溶磷能力
Fig.4 Phosphate solubilizing ability of 9 nitrogen fixing and phosphate solubilizing bacteria isolated from potato rhizosphere
采用鉬藍比色法[9]對9株菌的溶磷能力進行定量測定,結果(圖5)表明,9株菌7 d內(nèi)的溶磷量呈持續(xù)上升趨勢,其中菌株N46的溶磷能力最好,7 d的累積有效磷含量達到54.9 mg/L,與其他菌種差異顯著;菌株N34與OP8的溶磷能力相當,累積有效磷含量達到48 mg/L;N33、P33和OP1的溶磷能力基本一致,累積有效磷含量超過37 mg/L;與其他菌種相比,菌株N31和P34的溶磷能力較差。
圖5 從馬鈴薯根際分離的9株固氮解磷菌的有效磷含量Fig.5 Phosphorus solubilization capacity of 9 nitrogen fixing and phosphate solubilizing bacteria isolated from potato rhizosphere
已有研究發(fā)現(xiàn),從小麥、玉米、馬鈴薯等作物根際分離的固氮菌中,芽孢桿菌屬、節(jié)桿菌屬和假單胞桿菌屬為農(nóng)作物和經(jīng)濟作物根際常見的功能菌[15-18]。牛艷芳等[19]在白樺根際土壤中分離得到固氮菌的不同類群,并通過解磷試驗發(fā)現(xiàn)假單胞桿菌屬和節(jié)桿菌屬的微生物具備解磷特性。李瓊潔等[20]從玉米根際分離得到一株具有較高固氮活性的菌株,該菌株還具有較好的泌銨能力,經(jīng)鑒定,該菌株屬于腸桿菌屬。張磊[21]從馬鈴薯根際分離得到固氮菌,經(jīng)鑒定為節(jié)桿菌屬、假單胞菌屬等優(yōu)勢種群,且具有良好的解磷功能。姜瑛等[12]從灰潮土中分離得到一株固氮菌,經(jīng)固氮解磷試驗發(fā)現(xiàn),該菌株具有較強的固氮解磷功能,且可以促進花生對營養(yǎng)元素的吸收,經(jīng)鑒定該菌株屬于貪噬菌屬。門惠芹等[22]從枸杞根際分離純化得到固氮菌,且通過試驗驗證接種該菌株可以促進植株的生長,鑒定發(fā)現(xiàn)該菌株為紅球菌屬。本研究從延安新造地馬鈴薯根際土壤中分離得到9株固氮解磷菌,經(jīng)16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育分析,初步鑒定其屬于假單胞桿菌屬(Pseudomonas)、克雷伯氏菌屬(Klebsiella)、紅球菌屬(Rhodococcus)、節(jié)桿菌屬(Paenarthrobacter)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、貪噬菌屬(Variovorax)、腸桿菌屬(Kosakonia)和副球菌屬(Paracoccus)。
固氮解磷菌在土壤中會直接或間接影響土壤肥力和地上作物的生長,在豐富土壤微生物多樣性的同時,對土壤修復和作物生長起到積極的促進作用。此外,固氮解磷菌固定的氮素除供自身生長發(fā)育外,部分以無機狀態(tài)或簡單的有機氮化物分泌到體外;同時,固氮解磷微生物通過分泌有機酸、質(zhì)子和多糖等溶解不溶性磷,以供植物吸收利用,從而減少化肥的使用量,功能菌的這種特性使其在生產(chǎn)應用中具有重要意義[23]。
在自然狀態(tài)下,馬鈴薯根際也會存在固氮解磷菌,但與龐大的根際微生物系統(tǒng)相比,固氮解磷菌的種群數(shù)量相對較少,固氮量也很?。煌瑫r,新造地土壤微生物數(shù)量少,生物活性低,土壤肥力和土壤結構穩(wěn)定性較差,對這類土壤進行修復的最佳方式就是施用菌劑,輸入活性微生物。研究表明,將高效功能菌劑應用于生荒地后,土壤生物活性得以顯著改善,對于修復生荒地土壤生態(tài)具有重要意義[24-26]。本研究中分離篩選的固氮解磷微生物,種類豐富,打破了傳統(tǒng)菌肥菌種單一的現(xiàn)狀,9株菌種除具有固氮活性外,還具有溶磷功能,對于開發(fā)專用固氮解磷菌肥具有重大意義。通過此種方式篩選出的菌種,與特定作物根系互作性好,對當?shù)赝寥拉h(huán)境的適應性也更強,將分離出的固氮解磷微生物以回接的方式施于土壤中,可以達到增產(chǎn)和改善土壤環(huán)境的效果。
本研究從延安新造地馬鈴薯根際土壤中分離純化得到9株固氮解磷菌,均具有固氮和解磷功能,其中固氮能力最好的菌株為N34,固氮酶活性為95.08 nmol/h;解磷能力最好的菌株為N46,7 d累計溶磷量達到54.9 mg/L。