(安徽工程大學(xué) 生物與化學(xué)工程學(xué)院,安徽 蕪湖 241000)
腺苷(Adenosine)全稱為9-β-D-呋喃核糖基腺嘌呤,也稱作腺嘌呤核苷[1-2],是一種具有重要生理、生化功能的內(nèi)源性嘌呤核苷[3-4]。利用生物合成法中的微生物發(fā)酵生產(chǎn)腺苷有很大的優(yōu)勢(shì)[3]。早期,施慶珊等[5]對(duì)營(yíng)養(yǎng)缺陷型的產(chǎn)腺苷菌株做了誘變研究,王小茹等[6]通過選育抗代謝類似物8-氮鳥嘌呤提高了腺苷的產(chǎn)量。目前利用發(fā)酵法生產(chǎn)腺苷的主要目的是通過誘變手段來(lái)提高產(chǎn)量。ARTP中富含的氮分子二正系統(tǒng)、氮分子一負(fù)系統(tǒng)、激發(fā)態(tài)氦原子、氫原子、氧原子和OH等活性能量離子,會(huì)對(duì)微生物菌株、植物和動(dòng)物的遺傳物質(zhì)造成損傷,并能夠誘發(fā)細(xì)胞啟動(dòng)SOS修復(fù)機(jī)制[7]。而SOS修復(fù)是一種高容錯(cuò)率的修復(fù),修復(fù)過程中會(huì)產(chǎn)生種類豐富的錯(cuò)配位點(diǎn),最終穩(wěn)定遺傳。ARTP誘變具有低成本、操作方便等優(yōu)點(diǎn)。與傳統(tǒng)誘變方法相比,ARTP誘變對(duì)遺傳物質(zhì)的損傷機(jī)制多種多樣,因而獲得突變型的多樣性也隨之增多,ARTP誘變的特點(diǎn)在應(yīng)對(duì)微生物的誘變育種時(shí)顯示出獨(dú)特的優(yōu)勢(shì)。ARTP誘變對(duì)環(huán)境無(wú)污染,無(wú)論用何種氣體放電,均無(wú)有害氣體產(chǎn)生,且放電過程中沒有核聚變和裂變等反應(yīng),存在的僅是從幾十納米波長(zhǎng)到紫外光線、可見光線甚至更強(qiáng)的光線產(chǎn)生,這種長(zhǎng)波的光線與輻射射線不同,其對(duì)人體損傷較小。紫外誘變使DNA分子形成嘧啶二聚體,二聚體出現(xiàn)會(huì)減弱雙鍵間氫鍵的作用,并使雙鏈結(jié)構(gòu)發(fā)生扭曲,阻礙堿基間的正常配對(duì),從而有可能引起突變或死亡[8]。另外二聚體的形成,會(huì)妨礙雙鏈的解開,進(jìn)而引起堿基轉(zhuǎn)換、顛換、移碼突變或缺失。次黃嘌呤是合成腺苷的重要前體,6-巰基嘌呤(6-MP)的化學(xué)結(jié)構(gòu)與次黃嘌呤相似,兩者唯一的不同是次黃嘌呤分子中6位C上的羥基被巰基取代,6-MP則通過競(jìng)爭(zhēng)性抑制次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶,使5-磷酸核糖-1-焦磷酸(PRPP)分子中的磷酸核糖不能向鳥嘌呤及次黃嘌呤轉(zhuǎn)移,從而阻斷嘌呤核苷酸的補(bǔ)救合成途徑。6-MP可在體內(nèi)經(jīng)酶的作用磷酸核糖化生成6-MP核苷酸,并以這種形式抑制肌苷酸(IMP)轉(zhuǎn)變?yōu)橄佘账?AMP)及鳥苷酸(GMP)的反應(yīng)[9]。由于6-MP核苷酸結(jié)構(gòu)與IMP相似,因此能反饋抑制PRPP酰胺轉(zhuǎn)移酶從而干擾磷酸核糖胺的形成,阻斷嘌呤核苷酸的從頭合成途徑。筆者通過對(duì)腺苷產(chǎn)生菌枯草芽孢桿菌進(jìn)行ARTP誘變和紫外-LiCl誘變并結(jié)合腺苷合成前體次黃嘌呤的結(jié)構(gòu)類似物6-MP抗性理性來(lái)篩選腺苷高產(chǎn)菌株。
1.1.1 實(shí)驗(yàn)菌種
枯草芽孢桿菌B.subtilis4.8(命名為BS-0)。
1.1.2 培養(yǎng)基
固體培養(yǎng)基(100 mL):葡萄糖1 g,蛋白胨1 g,酵母膏1 g,牛肉膏1 g,尿素0.5 g,氯化鈉0.25 g,瓊脂粉2 g,pH 7.2。
種子培養(yǎng)基(100 mL):葡萄糖1 g,蛋白胨1 g,酵母膏1 g,牛肉膏0.3 g,尿素0.5 g,氯化鈉0.25 g,泡敵0.03 g,pH 7.2。
發(fā)酵培養(yǎng)基(100 mL):葡萄糖12 g,酵母膏1.6 g,磷酸二氫鉀0.3 g,七水硫酸鎂0.1 g,尿素0.5 g,氯化鉀0.2 g,硫酸銨1.5 g,一水硫酸錳0.001 g,硫胺素0.015 g,豆餅分水解液1.5 g,泡敵0.03 g,消后pH 7.0。
1.2.1 菌種的活化及保種
擊破安瓿管后用0.5~1.0 mL無(wú)菌水溶解枯草芽孢桿菌凍干粉并混勻,取適量溶解混勻后的凍干粉用V(質(zhì)量分?jǐn)?shù)為30%的甘油)∶V(凍干粉)=1∶1混勻后保存于-80 ℃冰箱中。用接種環(huán)蘸取適量混勻后的凍干粉液在斜面培養(yǎng)基上劃線,35 ℃培養(yǎng)1~2 d,4 ℃冰箱中保存待用,保存期限不超過15 d。
1.2.2 搖瓶種子及菌懸液的制備
用接種環(huán)無(wú)菌操作挑取斜面培養(yǎng)基中的單菌落接入30 mL種子培養(yǎng)基,于37 ℃,220 r/min搖床中振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)期。
取1 mL對(duì)數(shù)期菌液5 000 r/min離心1 min,取上清,用等量生理鹽水垂懸洗滌沉淀,稀釋,使OD600至0.6~0.8。
1.2.3 抗性濃度選擇
取100 μL菌懸液涂布在質(zhì)量濃度為0,0.20,0.40,0.60,0.75,0.78,0.80 g/L的6-MP的固體培養(yǎng)基中,35 ℃培養(yǎng)1~2 d,觀察含不同6-MP濃度平板上菌落生長(zhǎng)情況,計(jì)數(shù)并記錄未長(zhǎng)菌落的平板中含有的6-MP最低濃度,該濃度即為枯草芽孢桿菌的最低致死濃度[10]。
1.2.4 發(fā)酵培養(yǎng)條件
取對(duì)數(shù)期的種子液以6%的接種量接入到發(fā)酵培養(yǎng)基中,每組3個(gè)平行,控制搖床溫度為37 ℃,轉(zhuǎn)速240 r/min,連續(xù)培養(yǎng)3 d,測(cè)定其腺苷產(chǎn)量。
1.2.5 腺苷含量的測(cè)定
取發(fā)酵液煮沸5 min,冷卻至室溫后3 000 r/min離心10 min,精密量取5 μL離心上清加入到5 mL濃度為0.1 mol/L,pH為3的鹽酸溶液中混勻,測(cè)其260 nm處的吸光度。
1.2.6 ARTP誘變處理
ARTP誘變:準(zhǔn)備6個(gè)1.5 mL的EP管,每管加入990 μL無(wú)菌生理鹽水,將EP管標(biāo)記后卡在ARTP誘變儀卡槽內(nèi),紫外照射20 min以使待誘變環(huán)境處于無(wú)菌狀態(tài)。紫外滅菌結(jié)束后取10 μL菌懸液均勻鋪在ARTP載片上,用尖頭鑷子將鋪有菌液的載片轉(zhuǎn)移至凹槽中,每個(gè)載片對(duì)應(yīng)一個(gè)EP管。設(shè)置誘變時(shí)間為0,15,30,45,60,75,90 s,放電功率為120 W,氣流量為10 SLM。全部誘變結(jié)束后,載片落入EP管中,將EP管在漩渦振蕩儀中振蕩洗脫1~2 min以洗掉載片上的菌體,將含有菌液的EP管放置于-4 ℃冰箱中低溫保持2 h,使其自生不能對(duì)突變產(chǎn)生修復(fù)[11-12],之后進(jìn)行適當(dāng)稀釋并取100 μL分別涂布于無(wú)6-MP抗性的固體培養(yǎng)基和6-MP質(zhì)量濃度為0.78 g/L的固體培養(yǎng)基中,每組3個(gè)平行,35 ℃培養(yǎng)1~2 d,分別計(jì)算致死率和正突變率,表達(dá)式為
致死率=(1-B/A)×100%
正突變率=C/B×100%
式中:A為照射0 s平板上菌落數(shù)均值;B為各照射時(shí)間無(wú)抗性平板上菌落數(shù)均值;C為各照射時(shí)間含最低致死濃度6-MP抗性平板上菌落均值。
1.2.7 紫外-LiCl誘變
取5 mL菌懸液和無(wú)菌磁力轉(zhuǎn)子置于無(wú)菌平皿中,用磁力攪拌器使菌懸液始終處于被攪拌狀態(tài),保持紫外燈對(duì)含菌懸液和磁力轉(zhuǎn)子的平皿垂直照射距離為20~30 cm[12],在照射時(shí)間為0,40,80,120,160,200,240 s時(shí)快速取菌液1mL并置于暗處,待誘變結(jié)束后在紅光下對(duì)誘變過的菌液進(jìn)行10倍梯度稀釋[13],適當(dāng)稀釋后分別取100 μL涂布于LiCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.4%的無(wú)6-MP抗性的固體培養(yǎng)基和LiCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.4%,6-MP質(zhì)量濃度為0.8 g/L的固體培養(yǎng)基中(LiCl均在固體培養(yǎng)基冷卻至60 ℃左右時(shí)加入,待混勻后倒平板),每組3個(gè)平行,35 ℃避光培養(yǎng)1~2 d。致死率及正突變率[14-15]的算法參考1.2.6。
1.2.8 ARTP結(jié)合紫外-LiCl誘變
將菌懸液進(jìn)行ARTP誘變處理后低溫放置2 h,并培養(yǎng)4 h后進(jìn)行紫外誘變、稀釋并涂布于LiCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.4%的無(wú)6-MP抗性的固體培養(yǎng)基和LiCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.4%,6-MP質(zhì)量濃度為0.85 g/L的固體培養(yǎng)基中,每組3個(gè)平行,35 ℃避光培養(yǎng)1~2 d。
1.2.9 腺苷高產(chǎn)菌的發(fā)酵篩選
初篩:挑取抗性正突變菌落和對(duì)照菌落接種于種子培養(yǎng)基,37 ℃,220 r/min振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)期后以6%的接種量轉(zhuǎn)接到24孔板的發(fā)酵培養(yǎng)基中,每組3個(gè)平行,37 ℃,240 r/min振蕩培養(yǎng)3 d后,測(cè)其腺苷產(chǎn)量,測(cè)定方法參考1.2.5。
復(fù)篩:挑取初篩產(chǎn)量高的菌株接種于種子培養(yǎng)基,37 ℃,220 r/min振蕩培養(yǎng)至對(duì)數(shù)期后以6%的接種量轉(zhuǎn)接到搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)基中,每組3個(gè)平行,37 ℃,240 r/min振蕩培養(yǎng)3 d后,測(cè)其腺苷產(chǎn)量,測(cè)定方法參考1.2.5。
對(duì)誘變篩選后的高產(chǎn)量菌株進(jìn)行種子活化和搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)后測(cè)其腺苷產(chǎn)量,傳代考察其穩(wěn)定性。
以對(duì)照組即6-MP抗性濃度為0的平板上菌落的大小和數(shù)目為菌落生長(zhǎng)狀況標(biāo)準(zhǔn),將含不同6-MP抗性濃度的實(shí)驗(yàn)組平板上的菌落生長(zhǎng)狀況與之比較。由表1可知,隨著抗性濃度的增大,枯草芽孢桿菌單菌落數(shù)逐漸減少,菌落大小也明顯受6-MP濃度影響,當(dāng)6-MP質(zhì)量濃度增大到0.75 g/L時(shí),單菌落較少且體積小,6-MP質(zhì)量濃度增大到0.78 g/L時(shí)菌落已全部致死,故選擇0.78 g/L的6-MP為最低致死濃度。
表1 不同質(zhì)量濃度6-MP對(duì)腺苷產(chǎn)生菌生長(zhǎng)影響的情況1)Table 1 Effects of different concentrations of 6-MP on the growth of adenosine producing bacteria
注:1)+++表示多,++表示一般,+表示稀少,-表示無(wú);***表示大,**表示中等,*表示小,空白處表示平板上無(wú)菌落生長(zhǎng),因此對(duì)單菌落大小不作描述。
2.2.1 ARTP誘變致死率及正突變率
ARTP誘變致死情況如表2所示,該腺苷產(chǎn)生菌對(duì)ARTP比較敏感。誘變60 s時(shí)致死率已達(dá)到83%,當(dāng)誘變時(shí)間為90 s時(shí)已完全致死。
統(tǒng)計(jì)誘變后在6-MP質(zhì)量濃度為0.78 g/L的抗性平板上長(zhǎng)出的菌株,結(jié)合對(duì)照組菌落數(shù),得出誘變時(shí)間和正突變率的關(guān)系,由表2可知短時(shí)間的ARTP處理并不能得到較高的致死率和正突變率,誘變60 s時(shí)正突變率達(dá)16%,60 s后致死率持續(xù)增大但正突變率則大幅減少。
表2 ARTP誘變時(shí)間與致死率和正突變率的關(guān)系
表3 ARTP誘變菌株的腺苷產(chǎn)量Table 3 Adenosine yield of ARTP-mutated strain
2.2.2 ARTP誘變菌株的發(fā)酵篩選
多次誘變挑取誘變后的正突變菌株37 ℃,240 r/min發(fā)酵3 d后測(cè)其腺苷產(chǎn)量,得到10株比出發(fā)菌株BS-0產(chǎn)量高的菌株,高產(chǎn)菌株編號(hào)和產(chǎn)量如表3所示。其中第1輪誘變得到5株高產(chǎn)菌株A-1,A-3,A-7,A-13和A-33,第2輪得到5株高產(chǎn)菌株A-2-4,A-2-12,A-2-17,A-2-18和A-2-20。其中ARTP第1輪誘變的A-7和第2輪誘變的A-2-12較出發(fā)菌株腺苷產(chǎn)量有明顯提高,A-2-12產(chǎn)量達(dá)19.297 g/L。
2.3.1 紫外誘變致死率和正突變率
紫外誘變中加入助誘變劑LiCl誘變效果更好,以ARTP誘變的高產(chǎn)菌株A-2-12為出發(fā)菌株進(jìn)行紫外誘變,在固體培養(yǎng)基中加入質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.4%的LiCl,致死率和正突變率如表4所示。0~160 s內(nèi)致死率較低,且無(wú)正突變菌株產(chǎn)生。正突變率出現(xiàn)在誘變200 s和240 s時(shí),其中誘變時(shí)間為240 s的正突變率高達(dá)18.52%,其誘變致死率達(dá)83%。
表4 紫外誘變致死率和正突變率Table 4 Fatality rate and positive mutation rate of UV mutagenesis
2.3.2 紫外誘變菌株的發(fā)酵篩選
經(jīng)紫外和助誘變劑LiCl處理得到57株正突變株,編號(hào)為Z-L-1至Z-L-57,對(duì)正突變株進(jìn)行發(fā)酵得到10株產(chǎn)量比出發(fā)菌株A-2-12產(chǎn)量高的菌株,產(chǎn)量如表5所示,其中Z-L-5和Z-L-19產(chǎn)量均高于19.880 g/L。
表5 紫外誘變菌株的腺苷產(chǎn)量Table 5 Adenosine yield of UV-mutated strain
將Z-L-5和Z-L-19菌株混合接種命名為Z-L-H,以Z-L-H為出發(fā)菌株進(jìn)行ARTP和紫外復(fù)合誘變。查L(zhǎng)9(34)設(shè)計(jì)表設(shè)計(jì)3因素3水平的正交實(shí)驗(yàn)來(lái)提高正突變,正交因素水平如表6所示,依據(jù)表6的條件進(jìn)行實(shí)驗(yàn)進(jìn)而得到表7的正交實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
表6 復(fù)合誘變正交實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)Table 6 Design of compound mutagenesis orthogonal experiment
表7 復(fù)合誘變正交實(shí)驗(yàn)結(jié)果1)Table 7 Results of compound mutagenesis orthogonal experiment
續(xù)表7
注:1) 表中空白處表示非因素列,不作正交分析。
由表7可知,對(duì)正突變影響的大小順序是ARTP誘變>紫外誘變>LiCl濃度,最佳處理?xiàng)l件選擇ARTP誘變60 s低溫處理2 h,經(jīng)4 h培養(yǎng)后紫外誘變240 s稀釋涂布于LiCl質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.4%的平板和抗性平板中。對(duì)復(fù)合誘變抗性平板上的46個(gè)單菌落編號(hào),依次為A-Z-L-1至A-Z-L-46,產(chǎn)量如表8所示,得到8株高產(chǎn)菌株,其中A-Z-L-2產(chǎn)量達(dá)20.560 g/L。
對(duì)誘變篩選后的5株高產(chǎn)量菌株A-2-12,Z-L-5,Z-L-19,A-Z-L-2和A-Z-L-15進(jìn)行種子活化和搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)后測(cè)其腺苷產(chǎn)量,傳代考察其穩(wěn)定性,穩(wěn)定性情況如表9所示。
表8 復(fù)合誘變菌株腺苷產(chǎn)量Table 8 Adenosine yield of the complex mutagenesis strain
表9 穩(wěn)定性試驗(yàn)Table 9 Stability test
由表9可知,傳代中5株菌株產(chǎn)量均低于第1代的腺苷產(chǎn)量,隨著傳代次數(shù)的增加各菌株產(chǎn)量下降幅度不等,只有A-Z-L-2產(chǎn)量相對(duì)穩(wěn)定,傳代6次后產(chǎn)量依然能達(dá)到20.512 g/L,因此如何提高菌種的穩(wěn)定性還有待研究。
通過對(duì)腺苷產(chǎn)生菌枯草芽孢桿菌進(jìn)行ARTP誘變,UV-LiCl以及組合誘變并結(jié)合腺苷合成前體次黃嘌呤的結(jié)構(gòu)類似物6-MP抗性理性篩選,獲得了1株腺苷高產(chǎn)菌株A-Z-L-2,傳代6次后其腺苷產(chǎn)量達(dá)到20.512 g/L,較出發(fā)菌株腺苷產(chǎn)量提高了16.12%,該菌株具有較好的傳代穩(wěn)定性。目前腺苷高產(chǎn)菌株大多是經(jīng)過化學(xué)或者物理誘變所得,用一般的誘變劑進(jìn)一步處理時(shí)很難再篩選出更高產(chǎn)量的菌株,不但較難發(fā)生正突變,而且菌種極易發(fā)生退化。其主要原因是菌株的遺傳標(biāo)記不能穩(wěn)定傳代,培養(yǎng)條件或保種條件不當(dāng)易造成菌種回復(fù)突變,從而導(dǎo)致產(chǎn)量下降。有研究表明選育黃嘌呤或鳥嘌呤缺陷型有利于降低回復(fù)突變率[16],通過增加遺傳標(biāo)簽提高遺傳穩(wěn)定性是腺苷發(fā)酵的一個(gè)研究方向。研究者可以利用新的誘變手段,提高誘變效率,也可以通過分子手段[17-18]改善腺苷產(chǎn)生菌。