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云南甘蔗白條病的多基因聯(lián)合鑒定

2019-06-11 11:55張榮躍李文鳳王曉燕單紅麗倉(cāng)曉燕
植物保護(hù) 2019年1期
關(guān)鍵詞:云南

張榮躍 李文鳳 王曉燕 單紅麗 倉(cāng)曉燕

摘要甘蔗白條病是由白條黃單胞菌Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson引起的甘蔗重要病害。2017年在云南保山、孟定和金平蔗區(qū)的甘蔗上發(fā)現(xiàn)疑似白條病的病害。從病株蔗莖中分離得到圓形,凸面,光滑,有光澤,黃色的細(xì)菌菌落。經(jīng)柯赫氏法則驗(yàn)證,分離得到的細(xì)菌為該病害的病原菌。使用16S rRNA基因、gyrB基因和rpoD基因?qū)Ψ蛛x得到的病原菌進(jìn)行了分子鑒定,BLAST和系統(tǒng)發(fā)育分析表明本研究所獲得的病原菌的3個(gè)基因的核苷酸序列與白條黃單胞菌GPE PC73菌株(GenBank登錄號(hào): FP565176)對(duì)應(yīng)基因的核苷酸序列一致性均為100%,在系統(tǒng)發(fā)育樹中處于同一分支。根據(jù)田間癥狀診斷、柯赫氏法則驗(yàn)證及分子鑒定結(jié)果,確認(rèn)云南保山、孟定和金平發(fā)生的甘蔗病害為X. albilineans引起的甘蔗白條病。

關(guān)鍵詞甘蔗白條病;白條黃單胞菌;系統(tǒng)發(fā)育分析;云南

中圖分類號(hào):S 432.42

文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A

DOI:10.16688/j.zwbh.2018178

甘蔗白條病是由白條黃單胞菌Xanthomonas albilineans (Ashby) Dowson引起的甘蔗重要病害之一,其對(duì)甘蔗的危害是毀滅性的,常造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失[12]。該病害于19世紀(jì)20年代在印度尼西亞爪哇島、澳大利亞和斐濟(jì)被首次報(bào)道,現(xiàn)已廣泛發(fā)生于美國(guó)、古巴、巴西、澳大利亞、法國(guó)、印度和巴基斯坦等40多個(gè)植蔗國(guó)家和地區(qū)[3]。2016年在我國(guó)廣西蔗區(qū)首次檢測(cè)到甘蔗白條病[4]。甘蔗白條病是一種細(xì)菌性維管束病害,可通過帶病蔗種進(jìn)行遠(yuǎn)距離傳播,在田間還可通過刀具和收獲工具等機(jī)械傳播,也可通過氣流和雨水傳播,且傳播性極強(qiáng)[56]。X. albilineans目前仍是中國(guó)進(jìn)境植物重要的檢疫對(duì)象之一[7]。

目前,除云南外,在廣西、廣東、海南、福建均發(fā)現(xiàn)了甘蔗白條病[8]。2017年在云南保山、孟定和金平蔗區(qū)的甘蔗上發(fā)現(xiàn)了疑似白條病的病害。為明確這些病害是否是由X. albilineans引起的甘蔗白條病,本文采用了病害田間癥狀觀察、柯赫氏法則驗(yàn)證,同時(shí)結(jié)合16S rRNA基因、gyrB基因和rpoD基因序列分析對(duì)病原進(jìn)行了鑒定,旨在為該病害的防控和研究提供參考。

1材料與方法

1.1甘蔗白條病樣品

2017年從云南孟定、保山和金平蔗區(qū)采集18份疑似甘蔗白條病樣品,MD1S~MD7S來自孟定,品種為‘柳城031137;BSH1S~BSH5S來自保山,品種為‘桂糖081589;JP1S~JP6S 來自金平,品種為‘ROC1。

1.2病原分離培養(yǎng)及回接試驗(yàn)

將蔗莖用無菌水清洗干凈,切成5~8 cm,使用75%乙醇溶液表面消毒20 s,然后點(diǎn)火將蔗莖表面乙醇溶液燒盡,連續(xù)進(jìn)行2次。將蔗莖放入滅菌的50 mL離心管中,3 000 r/min離心10 min,吸取離心管底部蔗汁,使用1×PBS緩沖液按10-1~10-8進(jìn)行梯度稀釋,每個(gè)梯度稀釋液吸取50 μL在瓊脂MW培養(yǎng)基進(jìn)行涂板。瓊脂MW培養(yǎng)基配方參照Davis 等[9],培養(yǎng)基pH6.8~7.0。配制培養(yǎng)基的所有試劑均購(gòu)自生工生物工程(上海)股份有限公司。28℃培養(yǎng)6~8 d后,挑取單菌落進(jìn)行純化培養(yǎng)。收集純培養(yǎng)的菌體,用蒸餾水配制成1×108 cfu/mL接種懸浮液,對(duì)溫室種植的甘蔗進(jìn)行人工接種,接種方法參照Rott等[10]的方法。以無菌水處理作對(duì)照,觀察病害發(fā)生發(fā)展情況,并對(duì)接種后發(fā)病的植株進(jìn)行病原菌再分離。

1.3菌株DNA提取

將純化培養(yǎng)的菌株分別轉(zhuǎn)接至2 mL MW液體培養(yǎng)基中,于28℃、200 r/min條件下培養(yǎng)7 d,12 000 r/min離心收集菌體,棄上清,使用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(上海生工生物工程股份有限公司)提取DNA。DNA提取步驟參照試劑盒說明書。

1.4多位點(diǎn)基因序列擴(kuò)增

擴(kuò)增X. albilineans的16S rRNA基因、gyrB基因和rpoD基因的引物參考文獻(xiàn)[11],引物序列見表1。25 μL擴(kuò)增反應(yīng)體系包括ddH2O 10.5 μL、2×Easy Taq PCR SuperMix 12.5 μL、DNA 模板1.0 μL、上、下游引物各0.5 μL (20 μg/μL)。PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?95℃預(yù)變性5 min; 94℃變性1 min,55℃退火1 min, 72℃延伸1 min, 25個(gè)循環(huán); 72℃延伸10 min。取10 μL擴(kuò)增產(chǎn)物在1.5%的瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳檢測(cè)。

1.5PCR產(chǎn)物克隆、測(cè)序及序列分析

使用瓊脂糖凝膠回收試劑盒(北京天根生化科技有限公司)回收PCR產(chǎn)物目的片段,并將其與pEASYT5(北京全式金生物技術(shù)有限公司)進(jìn)行連接轉(zhuǎn)化,每個(gè)轉(zhuǎn)化挑選6個(gè)陽(yáng)性克隆送華大基因測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用BLAST進(jìn)行對(duì)比。使用DNAMAN V 6.0進(jìn)行序列一致性分析。運(yùn)用MEGA V 6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹[12],采用neighborjoining法建樹,模式選擇Kimura 2parameter,自舉檢測(cè)(bootstrap)重復(fù)1 000 次。

2結(jié)果與分析

2.1田間癥狀觀察

2017年在云南保山、孟定和金平蔗區(qū)的甘蔗上觀察到疑似白條病的病害。病害癥狀主要表現(xiàn)為葉片上產(chǎn)生白色條紋,沿維管束伸展,有的葉片大面積白化。染病較重的病株蔗莖節(jié)間變短,葉片短直,莖的節(jié)部長(zhǎng)出許多側(cè)芽和細(xì)小的分蘗,分蘗的葉片上也出現(xiàn)上述的白色條紋 (圖1a)。

2.2柯赫氏法則驗(yàn)證

從保山、孟定和金平采集的蔗莖樣品中均分離得到圓形,凸面,光滑,有光澤,黃色的細(xì)菌菌落 (圖1b)。對(duì)分離到的菌株進(jìn)行回接驗(yàn)證,接種20 d后,接種甘蔗植株的葉片上出現(xiàn)了白色條紋,新發(fā)出的葉片葉尖白化,癥狀與田間發(fā)病癥狀相似 (圖1c)。對(duì)照甘蔗沒有觀察到任何癥狀。從接種發(fā)病的蔗莖中重新分離得到了相同的黃色菌落。經(jīng)柯赫氏法則驗(yàn)證,從蔗莖中分離得到的該細(xì)菌為甘蔗白條病的病原菌。

2.3病原菌的多基因聯(lián)合鑒定

本研究測(cè)定了獲得的所有菌株的16S rRNA基因、gyrB基因和rpoD基因的部分序列(表2)。結(jié)果表明,來自云南孟定、保山和金平的18個(gè)菌株的這3個(gè)基因的核苷酸序列一致性均為100%,與X. albilineans菌株GPE PC73菌株 (GenBank登錄號(hào): FP565176) 的3個(gè)基因的核苷酸序列一致性也均為100%。分別使用這3個(gè)基因序列與黃單胞菌屬的其他種構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹 (圖2~4)。在基于16S rRNA基因、gyrB基因和rpoD基因構(gòu)建的3個(gè)系統(tǒng)發(fā)育樹中,本研究所獲得的菌株與X. albilineans菌株均處于同一分支,明顯區(qū)分于黃單胞菌屬的其他種,表明本研究獲得的病原菌與X. albilineans親緣關(guān)系最近。

3結(jié)論與討論

甘蔗白條病是由X. albilineans引起的甘蔗重要病害。本研究通過對(duì)采自云南保山、孟定和金平蔗區(qū)的疑似白條病病株進(jìn)行病原菌分離純化,柯赫氏法則驗(yàn)證,并結(jié)合16S rRNA基因、gyrB基因和rpoD基因部分序列對(duì)分離得到的菌株進(jìn)行了分子鑒定,最終確定云南保山、孟定和金平蔗區(qū)發(fā)生的病害為X.albilineans引起的甘蔗白條病。本研究可為中國(guó)今后開展甘蔗白條病的深入研究和科學(xué)有效防控奠定基礎(chǔ)和提供參考依據(jù)。

甘蔗白條病是一種易隨種苗傳播的危險(xiǎn)性病害,對(duì)甘蔗生產(chǎn)和發(fā)展有潛在的威脅。本研究采集的樣品均來自各蔗區(qū)的甘蔗新品種和良種繁育基地,因此,有必要加強(qiáng)對(duì)良繁基地?cái)U(kuò)繁種苗和引進(jìn)及外調(diào)甘蔗的白條黃單胞菌的檢疫和監(jiān)測(cè),從源頭上控制白條黃單胞菌擴(kuò)散蔓延,確保甘蔗安全生產(chǎn)和蔗糖產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展。另外,今后在加強(qiáng)白條病檢疫和監(jiān)測(cè)的同時(shí),應(yīng)加強(qiáng)甘蔗白條病優(yōu)良抗源材料和抗病品種的評(píng)價(jià)篩選,為選育和利用抗病品種有效防控甘蔗白條病提供優(yōu)良抗源材料。

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(責(zé)任編輯:楊明麗)

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