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基于文本挖掘技術(shù)分析治療精子活力低下癥的中醫(yī)用藥規(guī)律

2019-05-13 01:47陳曙輝林煦垚張明強(qiáng)陳立秦國政
云南中醫(yī)中藥雜志 2019年1期
關(guān)鍵詞:文本挖掘用藥規(guī)律中醫(yī)

陳曙輝 林煦垚 張明強(qiáng) 陳立 秦國政

摘要:目的 利用文本挖掘技術(shù)探索治療精子活力低下癥的常用中醫(yī)用藥規(guī)律,為臨床治療提供一定的參考依據(jù)。方法 登錄中國知網(wǎng)(CNKI)收集中醫(yī)治療精子活力低下癥的相關(guān)文獻(xiàn),使用MySQL數(shù)據(jù)庫,運用全文索引對數(shù)據(jù)進(jìn)行歸檔存儲,并人工降噪處理。利用數(shù)據(jù)挖掘中的關(guān)聯(lián)規(guī)則算法,統(tǒng)計分析常用中藥用藥頻率及藥物協(xié)同關(guān)系規(guī)律,繪制協(xié)同藥物網(wǎng)絡(luò)圖并進(jìn)行分析討論。結(jié)果 中藥協(xié)同關(guān)系分析顯示菟絲子、枸杞子、淫羊藿、熟地黃、黃芪是治療精子活力低下癥最常用的中草藥。結(jié)論 常用中藥用藥規(guī)律,對臨床應(yīng)用具有一定指導(dǎo)意義,文本挖掘技術(shù)可以為中醫(yī)藥研究提供技術(shù)支持。

關(guān)鍵詞:精子活力低下癥;中醫(yī);文本挖掘;用藥規(guī)律

中圖分類號:R256.56 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:1007-2349(2019)01-0019-04

根據(jù)《世界衛(wèi)生組織人類精液分析實驗室技術(shù)手冊》(第5版)的描述,精子活力低下癥是指男性精液參數(shù)分析中前向運動(PR)精子百分率低于參考值下限,即低于32%[1]。WHO命名為弱精子癥。據(jù)西方國家統(tǒng)計調(diào)查,10%~15%的育齡夫婦存在不育問題,其中男性因素大約占50%[2]。在中國約1/10的夫婦發(fā)生不育,屬于男方因素的約為40%[3]。而且無論是在國內(nèi)還是國外,男性精子的質(zhì)量在近10年內(nèi)都出現(xiàn)了明顯下降的趨勢[4]。中醫(yī)學(xué)中沒有“精子活力低下癥”或“弱精子癥”之說及記載。但該病與中醫(yī)“精寒”、“精冷”等癥有關(guān)。中醫(yī)學(xué)在精子活力低下癥治療中積累了寶貴的經(jīng)驗,關(guān)于中醫(yī)藥治療精子活力低下的文獻(xiàn)已有大量刊載,通過文本挖掘技術(shù)[5]對精子活力低下癥文獻(xiàn)進(jìn)行全面分析和整理,將有助于發(fā)現(xiàn)精子活力低下癥治療規(guī)律特征,為進(jìn)一步提高中醫(yī)臨床治療效果、深入開展中醫(yī)科研提供依據(jù)。

1 資料與方法

文本挖掘是從非結(jié)構(gòu)化的文本數(shù)據(jù)中,抽取有價值信息的處理技術(shù)[6]。文本挖掘應(yīng)用到生物、醫(yī)學(xué)上,可以分為文本數(shù)據(jù)收集、處理、結(jié)構(gòu)化分析、可視化以及評價5個步驟[7]。

1.1 數(shù)據(jù)收集 登錄中國知網(wǎng)(China National Knowledge Infrastructure,CNKI,http://www.cnki.net/)在關(guān)鍵詞檢索下檢索關(guān)鍵詞“弱精子癥”、“精子活力低下癥”。經(jīng)過檢索共得到文獻(xiàn)750篇,檢索日期2017年11月10日。

1.2 數(shù)據(jù)處理 將檢索到的相關(guān)文獻(xiàn)運用OCR 識別技術(shù),按照UTF-8編碼格式統(tǒng)一保存在新建文本文件(后綴TXT)中。然后利用文本提取工具,將非結(jié)構(gòu)化的文件內(nèi)容整理為[文章序號,關(guān)鍵詞]這樣的格式化結(jié)構(gòu),便于MySQL數(shù)據(jù)庫錄入與處理。

1.3 數(shù)據(jù)一次清洗 將1.2項中提取的結(jié)構(gòu)化文本信息存入數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)表中,表名為table_initial,針對“序號”和“關(guān)鍵詞”進(jìn)行處理。對于1篇文獻(xiàn)中重復(fù)出現(xiàn)的關(guān)鍵詞只需要計算1次,據(jù)此進(jìn)行數(shù)據(jù)清洗工作。

1.4 數(shù)據(jù)挖掘以及可視化分析 對于文獻(xiàn)檢索和查閱而言,在1篇文章中出現(xiàn)的關(guān)鍵詞,部分地反映整篇文章的信息。就某篇具體文獻(xiàn)來說,相關(guān)關(guān)鍵詞的“共同出現(xiàn)”蘊(yùn)含有一定的意義。基于以上分析,構(gòu)造針對每篇文獻(xiàn)共同出現(xiàn)的關(guān)鍵詞對算法,得到名為keypairs數(shù)據(jù)表。將相同的關(guān)鍵詞對進(jìn)行合并處理,只保留它們出現(xiàn)的頻數(shù),構(gòu)造進(jìn)一步算法實現(xiàn)得到key_pairs_frqcy 數(shù)據(jù)表,抽取不同頻數(shù)詞對,應(yīng)用 Cytoscape3.5進(jìn)行可視化處理。圓圈的大小表示某一藥物出現(xiàn)的頻數(shù)大小,例如,菟絲子的圓圈最大,共出現(xiàn)101次。這種頻數(shù)大小反映了某一藥物在精子活力低下癥診治中的重要程度。線條的粗細(xì)反映了某一藥物與其他藥物相兼出現(xiàn)的頻數(shù)大小。菟絲子與枸杞子的線條最粗,即兩者相兼出現(xiàn)的證型有85個。這種頻數(shù)大小反映了某一藥物在精子活力低下癥診治中的重要程度。

1.5 數(shù)據(jù)二次清洗 經(jīng)過專業(yè)知識評估,數(shù)據(jù)一次清洗后仍存在噪音問題,這些噪音主要是自然語言的二義性和表達(dá)方式的多樣性產(chǎn)生的,對于這類問題,只能逐個分析并建立規(guī)則,然后根據(jù)規(guī)則,依據(jù)專業(yè)知識對數(shù)據(jù)進(jìn)行二次清洗降噪。即中藥名稱根據(jù)《中藥學(xué)》(高學(xué)敏主編,中國中醫(yī)藥出版社,2007年)進(jìn)行規(guī)范,使同種藥物名稱統(tǒng)一,如中藥“仙靈脾”、“淫羊藿”統(tǒng)一規(guī)范為“淫羊藿”。

2 結(jié)果

2.1 中藥頻數(shù)統(tǒng)計 治療精子活力低下癥常用中藥頻數(shù)統(tǒng)計顯示,頻數(shù)由高至低排列,前15味中藥。菟絲子、枸杞子、淫羊藿、熟地黃、黃芪、當(dāng)歸、覆盆子出現(xiàn)頻次超過50,較其他藥更常用。頻數(shù)靠前的15位中藥可以構(gòu)成方劑五子衍宗丸,具有補(bǔ)腎益精之功效。

2.2 中藥協(xié)同關(guān)系分析 通過文本挖掘整理出的藥對組合中,頻次最多的35對組合如表1,從表中可知,枸杞子、菟絲子、淫羊藿、熟地黃之間的組合頻次最高,均大于55次,利用Cytoscape軟件將上述藥物組合進(jìn)行可視化處理,生成二維網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖。

菟絲子、枸杞子可與11個其他的中草藥配伍相兼使用,其次淫羊藿分別與9個其他的中草藥配伍相兼使用,熟地黃可與8個其他的中草藥配伍相兼使用,體現(xiàn)了治療精子活力低下癥復(fù)方的配伍核心。

3 討論

在生物學(xué)領(lǐng)域,由于生物學(xué)數(shù)據(jù)和生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)量的急驟增長,通過數(shù)據(jù)挖掘?qū)ふ乙?guī)律和新知成了生物學(xué)研究的一個新熱點和重要分支[8]。近年來,隨著各種信息傳媒和通量的不斷加大,中醫(yī)證用藥規(guī)律研究呈現(xiàn)多元化的趨勢[9]。采用文本挖掘進(jìn)行用藥規(guī)律研究是方法之一。文本挖掘是從文本集中發(fā)現(xiàn)潛在、隱藏的歸納性知識的一門技術(shù)[10],它能對海量數(shù)據(jù)進(jìn)行整合、分析,獲得的結(jié)果更具有代表性、可信度更高[11]。既往的研究表明,文本挖掘具有探索治療疾病用藥規(guī)律的技術(shù)特征和條件,可操作性強(qiáng)[12]。精子活力低下不育癥是男科的常見重大疾病。本研究從750篇文獻(xiàn)中挖掘中醫(yī)診治精子活力低下不育癥的用藥規(guī)律,文獻(xiàn)信息全面,挖掘過程恰當(dāng),質(zhì)量控制嚴(yán)格,所得結(jié)果具有指導(dǎo)臨床用藥價值。

本研究發(fā)現(xiàn),菟絲子、枸杞子、淫羊藿、熟地黃、黃芪是治療精子活力低下癥最常用的中草藥。菟絲子,味甘、辛,性平,歸肝、腎經(jīng),具有補(bǔ)陽益陰、固精縮尿、明目止瀉的功效?!端幮哉摗分^“治男子女人虛冷,添精益髓,去腰疼膝冷,又主消渴熱中。”現(xiàn)代藥理研究表明,菟絲子能增加小鼠精子數(shù),增強(qiáng)小鼠精子的質(zhì)量和活力,并能明顯促進(jìn)熱應(yīng)激小鼠睪丸和附睪損傷后的修復(fù)[13]。枸杞子,味甘,性平,歸肝腎經(jīng),具有補(bǔ)肝腎、明目的功效?!侗静萁?jīng)集注》云“補(bǔ)益精氣,強(qiáng)盛陰道”。研究表明枸杞子可下調(diào)生精細(xì)胞Caspase-3表達(dá),從而降低凋亡率,促進(jìn)生殖損傷的恢復(fù)[14]。淫羊藿,味辛、甘,性溫,歸肝、腎經(jīng),具有溫補(bǔ)腎陽,益氣強(qiáng)精的功效。《本草備要》記載“補(bǔ)命門(時珍曰∶手足陽明、三焦、命門藥),益精氣,堅筋骨,利小便?!睂嶒炞C明淫羊藿苷[15]能有效分泌精液,其自身存在類雄性激素作用,可以導(dǎo)致大鼠的前列腺、精囊等性腺重量增加。熟地黃,味甘,性微溫,歸肝、腎經(jīng),具有補(bǔ)血滋陰、益精填髓的功效?!侗静菥V目》注熟地“填骨髓,長肌肉,生精血,補(bǔ)五臟內(nèi)傷不足,通血脈,利耳目,黑須發(fā)”。熟地黃[16]可以提高人體免疫力,并能提高抗氧化性。黃芪,味甘,性溫,歸肺、脾經(jīng),具有補(bǔ)氣固表、利尿托毒的功效。黃芪為補(bǔ)氣要藥,《名醫(yī)別錄》謂之“補(bǔ)丈夫虛損,五勞羸瘦。止渴,腹痛,瀉痢,益氣……”。黃芪可增加精子線粒體活性,提高精子ATP 含量,改善精子活力及活率[17]。

綜上,文本挖掘技術(shù)可以全面、系統(tǒng)地總結(jié)精子活力低下癥臨床實踐中的中醫(yī)用藥規(guī)律,為疾病治療的科研思路提供參考,同時為臨床醫(yī)生優(yōu)化診治方案提供理論依據(jù)。分析所得用藥規(guī)律可以為臨床提供參考依據(jù),對中醫(yī)藥治療精子活力低下癥用藥具有一定的指導(dǎo)價值。參考文獻(xiàn)不足之處是目前文本挖掘只能根據(jù)現(xiàn)有文獻(xiàn)進(jìn)行匯總與分析,由于文獻(xiàn)質(zhì)量、關(guān)鍵詞設(shè)計等存在不同層次,仍需要文獻(xiàn)溯源來對所得結(jié)果進(jìn)行綜合判斷,從而降低噪音。因此,提高自動化分析能力,進(jìn)一步降低噪音與人工工作量是對文本挖掘技術(shù)提出的進(jìn)一步要求。

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