孔成成 賈紅兵 段惠娟 梁倩 馬異峰 尚媛媛 孫照剛
作者單位:101149 首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京胸科醫(yī)院 北京市結(jié)核病胸部腫瘤研究所轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究室(孔成成、賈紅兵、段惠娟、孫照剛),國家結(jié)核病臨床實驗室(梁倩、馬異峰、尚媛媛)
結(jié)核分枝桿菌(Mycobacteriumtuberculosis, MTB)培養(yǎng)并進行菌種鑒定是結(jié)核病病原學(xué)診斷的金標準。但由于MTB生長緩慢,培養(yǎng)時間長,痰標本前處理過程多且復(fù)雜,因而易受痰標本本身和外界細菌的污染,尤其是液體分枝桿菌培養(yǎng)管(Mycobacterium growth indicator tube, MGIT)培養(yǎng)法,污染率較改良羅氏培養(yǎng)基L-J法高[1]。筆者統(tǒng)計國內(nèi)文獻記載的MGIT 960液體培養(yǎng)法培養(yǎng)痰標本的平均污染率為4.13%(2.5%~6.57%)[2-11]。造成MGIT 960液體培養(yǎng)法污染率高的因素很多,如痰標本的儲存時間長[12]、痰標本的消化去污不徹底[13]、患者感染菌株對前處理劑耐受[14],等等。關(guān)于痰處理液沉渣對MGIT 960液體培養(yǎng)法發(fā)生污染率的影響尚未報道。本研究通過分析不同性狀的痰處理液沉渣質(zhì)量差異及其對痰培養(yǎng)結(jié)果的影響,并對培養(yǎng)污染標本用測序方法進行菌種鑒定,分析污染菌種分布特點,以期能更好地降低污染率,提高臨床診斷率。
收集2018年1—2月于北京胸科醫(yī)院門診就診疑似肺結(jié)核患者痰標本。共入組患者162例,每例患者收集痰標本1份,共162份,其中干酪痰和血痰標本各20份,黏液痰標本122份。
根據(jù)研究要求,由于唾液以透明或半透明水樣口腔分泌物為主,經(jīng)痰處理液消化處理后無沉渣,所以不對其進行研究。參考《分枝桿菌分離培養(yǎng)標準化操作程序及質(zhì)量保證手冊》[14],痰標本評價標準按照痰標本性狀將其分為以下3類:(1)干酪痰:標本外觀以黃色(或奶酪色)、膿樣、團塊狀的肺部分泌物為主;(2)黏液痰:標本外觀以白色、黏稠度較高的肺部和支氣管分泌物為主;(3)血痰:黏液痰或干酪痰標本中混有血液,顏色為褐色或深褐色、鮮紅色或伴有血絲。
BACTEC MGIT 960全自動分枝桿菌快速培養(yǎng)儀,其配套試劑包括分枝桿菌液體培養(yǎng)管(MGIT培養(yǎng)管)、生長添加劑、雜菌抑制劑(PANTA)(BD公司,美國),顯微鏡(Leica,德國),電子天平(Sartorius,德國),離心機(Sigma,美國),標本前處理液為3%N-乙酰-L半胱氨酸-NaOH消化液(3% NaOH-NALC)、pH 6.8的磷酸鹽緩沖液(自配),抗酸染液(珠海貝索生物技術(shù)有限公司)。
1.痰前處理液消化時間:根據(jù)《分枝桿菌分離培養(yǎng)標準化操作程序及質(zhì)量保證手冊》[14]及文獻[15-18]推薦的痰消化處理最佳時間≤20 min的標準,結(jié)合國家結(jié)核病臨床重點實驗室MGIT 960液體培養(yǎng)法操作流程,本研究中采用痰前處理液消化處理15 min對收集的162份痰標本進行消化處理。
2.痰標本的MGIT 960液體培養(yǎng):采用BACTEC MGIT 960全自動分枝桿菌快速培養(yǎng)儀液體培養(yǎng)痰標本中的MTB。(1)將收集到的162份痰標本每份吸取10 ml分裝于2個50 ml的無菌離心管中,每管5 ml痰,兩份痰標本均經(jīng)痰前處理液消化處理15 min。(2)痰標本消化處理后,1份記錄沉渣質(zhì)量,1份取0.5 ml上清及0.5 ml沉渣分別接種于MGIT 960液體培養(yǎng)管中進行培養(yǎng),其中接種上清液到管內(nèi)即為上清接種組,接種沉渣到管內(nèi)即為沉渣接種組,MGIT 960培養(yǎng)管置于儀器中培養(yǎng),儀器培養(yǎng)時間最長為42 d報告結(jié)果。(3)已報告培養(yǎng)結(jié)果的MGIT 960液體培養(yǎng)管,均經(jīng)涂片抗酸染色再次進行確認。若涂片結(jié)果顯示分枝桿菌,則最終結(jié)果判定為“真陽性”;若涂片鑒定未發(fā)現(xiàn)分枝桿菌及其他微生物,則為“真陰性”;若涂片結(jié)果顯示僅為分枝桿菌之外的其他微生物,則判定為“污染”。
3.污染標本的菌種鑒定方法:(1)吸取污染標本7 ml于50 ml無菌離心管中,3000×g離心15 min,去上清。(2)加20 μg/ml溶菌酶200 μl,37 ℃孵育過夜。(3)80 ℃金屬浴2 h,離心半徑8 cm,12 000 r/min 離心10 min,留取上清。(4)設(shè)計引物對16S rDNA進行擴增、產(chǎn)物測序。上游引物序列5′-AGAGTTTGATCATGGCTCAG-3′,下游引物序列5′-TAGGGTTACCTTGTTACGACTT-3′,擴增產(chǎn)物大小為1487 bp,以上擴增產(chǎn)物均送睿博興科公司測序,測序結(jié)果使用BLAST進行序列比對分析。
采用方差分析法對全部162份痰標本進行統(tǒng)計,分析5 ml不同性狀的痰標本經(jīng)前處理液消化處理15 min后所得沉渣質(zhì)量差異,結(jié)果顯示,干酪痰標本所得沉渣質(zhì)量[(0.17±0.14) g]高于黏液痰標本[(0.09±0.07) g]和血痰標本[(0.10±0.07) g],差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(F值分別為14.56、4.29,P值分別為0.00、0.01),血痰標本所得沉渣質(zhì)量略高于黏液痰,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(F=0.09,P=0.80)(表1)。
162份痰標本鑒定結(jié)果中,上清接種組與沉渣接種組中共同符合“真陽性”標準的痰標本有76份,共同符合“真陰性”標準的痰標本有53份。痰標本沉渣接種組經(jīng)MGIT 960檢測報陽標本共108份,報陰標本共54份,報陽標本經(jīng)涂片抗酸染色檢測,涂片陽性結(jié)果82份,涂片陰性結(jié)果26份,即沉渣接種組符合“污染”標準的痰標本有26份。上清接種組經(jīng)MGIT 960檢測報陽標本共82份,報陰標本共80份,報陽標本經(jīng)涂片抗酸染色檢測,涂片結(jié)果均為陽性,無涂片陰性結(jié)果,即上清接種組無符合“污染”標準的痰標本。6例患者痰標本在上清接種組診斷結(jié)果為真陰性而在沉渣接種組診斷結(jié)果為真陽性,1例患者痰標本在上清接種組診斷結(jié)果為真陽性,而在沉渣接種組診斷結(jié)果為真陰性。痰處理液上清接種組與沉渣接種組培養(yǎng)結(jié)果K值為0.65(<0.75),說明兩組培養(yǎng)結(jié)果的一致性一般。沉渣接種組污染率(16.05%,26/162)高于上清接種組(0.00%,0/162),采取Fisher精確檢驗,結(jié)果顯示P=0.00,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(表2)。
表1 3種性狀的痰處理液沉渣質(zhì)量比較
注a:采用方差分析比較干酪痰與黏液痰所得的F值和P值;b:采用方差分析比較干酪痰與血痰所得的F值和P值;c:采用方差分析比較黏液痰與血痰前處理液沉渣差異所得的F值和P值
表2 痰處理液上清接種組和沉渣接種組的檢測結(jié)果
注A+:為MGIT 960液體培養(yǎng)方法陽性結(jié)果;A-:為MGIT 960液體培養(yǎng)方法陰性結(jié)果;B+:為抗酸染色鑒定結(jié)果為分枝桿菌,即涂片陽性;B-:為抗酸染色鑒定無分枝桿菌,即涂片陰性;(+):表示“真陽性”結(jié)果;(-):表示“真陰性”結(jié)果
表3 沉渣接種組不同性狀的痰標本污染檢測結(jié)果
注a:采用χ2檢驗比較干酪痰與黏液痰所得的χ2值和P值;b:采用χ2檢驗比較干酪痰與血痰所得的χ2值和P值;c:采用χ2檢驗比較黏液痰與血痰污染率差異所得的χ2值和P值
表4 26例污染標本菌種鑒定結(jié)果及在不同性質(zhì)的痰標本中的分布情況
注“-”為未檢測出相應(yīng)菌株
沉渣接種組中,血痰標本、干酪痰標本和黏液痰標本的污染率存在差異,且差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=15.61,P=0.00),其中血痰標本污染率最高,為50.00%(10/20),其次為干酪痰標本(15.00%,3/20),黏液痰標本最低(10.66%,13/122)。血痰標本污染率分別與黏液痰標本和干酪痰標本相比,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(χ2值分別為19.60、4.10,P值分別為0.00、0.04)。而干酪痰標本和黏液痰標本污染率差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=0.04,P=0.70)(表3)。
26例患者的污染標本中有21例有測序結(jié)果,其余5例患者的標本未擴增出基因組DNA。 有明確測序結(jié)果的污染標本中,芽孢桿菌和鏈球菌較為突出,分別占23.08%(6/26)和15.38%(4/26)。其次,小韋榮球菌和奈瑟菌分別占11.54%(3/26)和7.69%(2/26)。其中黏液痰污染菌種主要集中在芽孢桿菌、鏈球菌和小韋榮球菌,而血痰和干酪痰污染菌種分布不集中(表4)。
MTB培養(yǎng)陽性并進行菌種鑒定是實驗室診斷結(jié)核病的金標準,MGIT 960液體培養(yǎng)法對MTB培養(yǎng)具有操作簡單、報告陽性時間比固體L-J培養(yǎng)法短等優(yōu)點,廣泛用于臨床檢測,但培養(yǎng)過程中污染率高也對診療帶來極為不利的后果,是最突出的缺點。包括痰處理液組成[19]、培養(yǎng)管抑菌劑[20]等造成污染的原因已有報道,本研究進一步探討痰標本前處理液處理后的沉渣對MGIT 960液體培養(yǎng)污染率的影響。
162份痰標本處理液中,沉渣接種組標本污染率為16.05%(26/162),高于上清接種組(0.00%,0/162),且差異具有統(tǒng)計學(xué)意義,沉渣接種組污染率高,說明沉渣接種是造成MGIT 960培養(yǎng)陽性結(jié)果過高的主要原因之一。分析沉渣接種造成污染的原因主要有以下3點:(1)痰處理液沉渣中含有的雜菌數(shù)量較多[13];(2)痰處理液對沉渣中的雜菌影響較小[13];(3)培養(yǎng)過程中,沉渣中的雜菌對抗生素不敏感[13]。因此建議接種前預(yù)先靜置前處理液,接種時盡量避免接種前處理液的沉渣。
沉渣接種組26例患者的污染標本中,不同性狀的痰標本培養(yǎng)污染率不同,雖然血痰的痰處理液沉渣少于干酪痰,但血痰的MGIT 960液體培養(yǎng)污染率最高,干酪痰次之,黏液痰污染率最低。分析原因可能為血痰污染標本患者并發(fā)肺部感染者較高50.00%(10/20),這與白大鵬[21]報道相一致。干酪痰患者肺部感染率最低,3份污染標本患者中有1例并發(fā)肺部感染,培養(yǎng)結(jié)果受感染菌株影響小。黏液痰患者雖然肺部感染較多(38.46%,5/13),但黏液痰消化去污相對容易,沉渣少,致使培養(yǎng)污染率最低。根據(jù)《分枝桿菌分離培養(yǎng)標準化操作程序及質(zhì)量保證手冊》[14]要求MGIT 960液體培養(yǎng)污染率應(yīng)不超過5%,本研究沉渣接種組的污染率達到16.05%(26/162),其原因除前述分析中提到的3點主要原因外,與收集到的標本類型也具有一定相關(guān)性,本研究標本中血痰標本(12.35%,20/162)和干酪痰標本(12.35%,20/162)所占比率較高。
在鑒定造成MGIT 960液體培養(yǎng)污染的菌種時有5份污染標本未擴增出DNA,分析其原因可能為標本由多種細菌混合污染,導(dǎo)致DNA測序失敗。剩余21份MGIT 960液體培養(yǎng)污染標本經(jīng)菌種鑒定,發(fā)現(xiàn)造成MGIT 960液體培養(yǎng)污染的菌種以芽孢桿菌、鏈球菌、小韋榮球菌和奈瑟菌為主,還包括腸球菌、銅綠假單胞菌、干酪乳桿菌和Anaerospora,提示培養(yǎng)污染率高與患者肺部感染[22]和口腔細菌有關(guān)。本研究中革蘭陽性菌屬占污染菌種的61.9%(13/21),是造成污染的主要組成部分,與吳龍章等[14]報道相符,但造成污染的主要菌種不相符,分析原因為檢測方法不同,造成與報道之間存在一定差別。
(1)本研究標本量相對較少,且標本全部來源于門診患者,所得結(jié)果可能存在偏差。有待進一步增加標本量以及豐富標本來源進行深入探討,以更好地找出MGIT 960液體培養(yǎng)污染的來源,從而降低污染率,為臨床痰培養(yǎng)工作提供一定的參考。(2)本研究痰處理液沉渣通過無菌吸管吸出全部上清后獲得,所獲結(jié)果會存在偏差,有待進一步完善和改進試驗方法。
綜上所述,痰標本前處理液沉渣是MGIT 960液體培養(yǎng)污染率高的主要原因之一,因此應(yīng)盡量避免沉渣的接種。同時應(yīng)注意肺部感染的患者,痰標本培養(yǎng)污染率也會增加,因此對伴有呼吸道感染的患者應(yīng)加強肺部抗炎治療,待感染控制后再送標本進行分枝桿菌培養(yǎng)。另外,建議以生理鹽水加3%雙氧水漱口后取痰標本,以此減少口腔細菌污染[23]。
志謝首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京胸科醫(yī)院流行病學(xué)研究室康萬里研究員對論文數(shù)據(jù)處理提供了多方面的幫助與指導(dǎo)。