申一凡,黃凱悅,任亞哲,陳婷,陸昌瑞,施宇,張?jiān)讫?/p>
(東華大學(xué) 化學(xué)化工與生物工程學(xué)院,上海 201620)
Birt-Hogg-Dube′(BHD)綜合征是一種常染色體單基因顯性遺傳病,由于FLCN基因缺失或突變引起。1970年,加拿大醫(yī)生Birt、Hogg和Dube發(fā)現(xiàn)其臨床表現(xiàn)為細(xì)胞纖維瘤、腎囊腫、肺囊腫[1-3]。利用基因連鎖分析發(fā)現(xiàn)BHD綜合征是由FLCN基因突變和缺失引起的[4]。通過(guò)動(dòng)物模型實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)FLCN雙基因敲除致死,而單基因敲除導(dǎo)致腎囊腫的產(chǎn)生[5-6]。目前的研究證實(shí)了FLCN作為腫瘤抑制因子在人體中發(fā)揮重要的作用,但FLCN誘發(fā)腫瘤的機(jī)制尚不明確。
FLCN蛋白具有高度保守性,并與目前已知的蛋白不具有同源性[7-8]。目前,F(xiàn)LCN的結(jié)構(gòu)與功能的研究還處于起步階段。Nookala R.K.通過(guò)X射線衍射技術(shù)解析了FLCN的C端(341~566)的結(jié)構(gòu),推測(cè)其具有鳥(niǎo)苷酸交換因子的功能,但尚未得到明確的功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)證據(jù)[9]。FLCN的N端結(jié)構(gòu)域及全長(zhǎng)的結(jié)構(gòu)和功能更是未知。目前已知FLCN通過(guò)mTOR、TGF-β、自噬等細(xì)胞增殖與發(fā)育信號(hào)通路中都發(fā)揮著重要的作用[10-11],但具體分子機(jī)制還存在一定缺陷。為了更有效地揭示其結(jié)構(gòu)與功能,F(xiàn)LCN的結(jié)構(gòu)解析尤為重要,結(jié)構(gòu)的解析將為功能的分析奠定基礎(chǔ)。
本實(shí)驗(yàn)通過(guò)pGEX-6p-1載體構(gòu)建GST-FLCN融合基因重組質(zhì)粒,通過(guò)Top10菌種擴(kuò)增基因和BL21菌種表達(dá)蛋白。通過(guò)GST親和介質(zhì)、離子交換介質(zhì)純化獲取GST-FLCN融合蛋白,再用Xa因子蛋白酶切除GST標(biāo)簽,經(jīng)二次分子篩純化獲取高純度FLCN蛋白,從而為FLCN的結(jié)構(gòu)和功能研究奠定基礎(chǔ)。
pGEX-6p-1載體、重組質(zhì)粒pET28a-FLCN,由實(shí)驗(yàn)室提供;E.coli Top10、E.coli BL21,質(zhì)粒抽提試劑盒,膠回收試劑盒購(gòu)自上海生工;限制性核酸內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶,購(gòu)自NEB公司;GST親和介質(zhì),購(gòu)自常州天地人和公司;高壓細(xì)胞破碎儀JNBIOJN-3000,購(gòu)自廣州聚能納米生物科技股份有限公司;其余試劑皆為分析純。
1.2.1 重組質(zhì)粒構(gòu)建
優(yōu)化并構(gòu)建pGEX-6p-1-GST-FLCN重組質(zhì)粒,首先利用PCR擴(kuò)增FLCN基因,模板為本實(shí)驗(yàn)室重組質(zhì)粒pET28a-FLCN,上、下游引物委托上海生工公司合成,上游引物:5'-ATACATGGATCCAATGCCA TTGTTGCCCTGTGTC-3';下游引物:5'-ATACATC TCGAGTTAATTACGAGATTCAGATGCG-3'。隨后,將PCR產(chǎn)物和pGEX-6p-1載體利用限制性內(nèi)切酶BamH Ⅰ和Xho Ⅰ進(jìn)行雙酶切,使用生工的膠回收試劑盒回收FLCN基因和載體,再在16 ℃下T4 DNA連接酶過(guò)夜連接。將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入Top10感受態(tài)細(xì)胞后,委托上海生工進(jìn)行測(cè)序鑒定。
1.2.2 表達(dá)純化GST-FLCN融合蛋白
將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)入BL21感受態(tài)細(xì)胞中,于平板上37 ℃過(guò)夜培養(yǎng)。挑取單克隆,加入LB培養(yǎng)基中37 ℃225 r/min培養(yǎng)至OD600=0.5左右,加入1 mmol/L的IPTG在16 ℃誘導(dǎo)表達(dá)。
將菌液4 000 r/min 4 ℃離心30 min,棄上清后在冰上加入預(yù)冷凋亡1 L菌液/20 mL bind buffer(50 mmol/L Tris,500 mmol/L NaCl,pH=8.0)重懸沉淀。再加入終濃度1 mmol/L的PMSF蛋白酶抑制劑,使用細(xì)胞高壓破碎儀在4 ℃,1.3×105kPa的壓力下破碎細(xì)胞。將破碎后的菌液兩次12 000 r/min 4 ℃離心30 min。使用Wash Buffer(50 mmol/L Tris,500 mmol/L NaCl,5 mmol/L谷胱甘肽,pH=8.0)洗雜蛋白,使用Elusion Buffer(50 mmol/L Tris,500 mmol/L NaCl,20 mmol/L谷胱甘肽,pH=8.0)洗脫蛋白。將洗脫液濃縮收集。
1.2.3 Xa因子蛋白酶酶切
將純化好的GST-FLCN融合蛋白和1 μL的Xa因子蛋白酶加入Buffer(50 mmol/L Tris,1 mmol/L DTT,pH=8.0)中,4 ℃酶切過(guò)夜。將酶切后的蛋白通過(guò)GST介質(zhì)親和純化,收集穿出液。
1.2.4 FLCN蛋白的分子篩純化
將酶切后的FLCN融合蛋白通過(guò)分子篩進(jìn)一步純化,以獲得更高純度的FLCN蛋白。FLCN蛋白的分子量為64 kDa,使用Superdex 75層析柱,在SCGp100蛋白層析系統(tǒng)下進(jìn)行純化。使用Buffer(50 mmol/L Tris-HCl,1 mmol/L DTT,1 mmol/L EDTA,500 mmol/L NaCl)進(jìn)行上樣、洗脫及純化。
在Uniprot官網(wǎng)上下載FLCN的蛋白序列,使用EditSeq軟件對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析,結(jié)果見(jiàn)圖1。如圖1a,發(fā)現(xiàn)FLCN蛋白中大部分蛋白為疏水性氨基酸,表明其水溶性不高,為此選用了GST標(biāo)簽增加其溶解性。在http://cbs.dtu.dk/services/NetNGlyc網(wǎng)站上對(duì)FLCN進(jìn)行糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè),發(fā)現(xiàn)其在494位點(diǎn)可能存在糖基化修飾。糖基化修飾有利于蛋白和細(xì)胞膜的接觸或結(jié)合,因而推測(cè)FLCN可能參與跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)。
圖1 FLCN蛋白生物信息學(xué)分析
以pET28a-FLCN為模板,使用PCR擴(kuò)增目的基因。使用BamH Ⅰ和Xho Ⅰ雙酶切將目的基因和載體,并用T4 DNA連接酶將FLCN連入pGEX-6p-1載體中。將構(gòu)建好FLCN重組質(zhì)粒與pGEX-6p-1電泳,檢測(cè)結(jié)果如圖2所示。在生工測(cè)序結(jié)果顯示構(gòu)建成功并且沒(méi)有基因突變。
圖2 FLCN重組質(zhì)粒的構(gòu)建結(jié)果
將構(gòu)建的GST-FLCN質(zhì)粒轉(zhuǎn)入大腸桿菌中誘導(dǎo)表達(dá),將菌液高壓破碎獲得含有目的蛋白的溶液,隨后通過(guò)GST介質(zhì)純化GST-FLCN融合蛋白。使用Wash Buffer多次洗脫能將大部分雜蛋白洗去,但是還會(huì)有一些雜蛋白和目的蛋白混在一起,無(wú)法洗脫,如圖3所示。
圖3 GST-FLCN蛋白的表達(dá)純化檢測(cè)結(jié)果
在蛋白濃縮樣品中加入適量Xa因子蛋白酶,4 ℃靜止過(guò)夜酶切。將酶切樣品再通過(guò)GST介質(zhì)親和純化,得到FLCN蛋白。如圖4所示,Xa因子蛋白酶酶切后得到了FLCN蛋白。
GST-FLCN經(jīng)過(guò)酶切后,得到的FLCN蛋白中還有一部分雜蛋白,為了獲得更高純度的FLCN蛋白,使用了分子篩進(jìn)行進(jìn)一步的純化。FLCN蛋白酶切后的分子量為64 kDa,所以選用Superdex 75層析柱,在SCGp100蛋白層析系統(tǒng)下進(jìn)行純化。如圖5所示,通過(guò)SDS檢測(cè),可以發(fā)現(xiàn)得到了純度較高的FLCN蛋白,其純度為90%左右。
圖4 GST-FLCN蛋白酶切檢測(cè)結(jié)果
圖5 FLCN蛋白分子篩純化結(jié)果
FLCN蛋白作為腫瘤抑制因子,在細(xì)胞中影響了細(xì)胞的增殖與凋亡,在機(jī)體中發(fā)揮著重要的作用。但目前為止,對(duì)FLCN蛋白的研究還不深入,其在機(jī)體中的作用機(jī)制還不明確。
在本實(shí)驗(yàn)中,以pGEX-6p-1作為載體,在原核體系中高表達(dá)FLCN蛋白,通過(guò)GST介質(zhì)親和純化,Xa因子蛋白酶酶切以及分子篩獲得的高純度的FLCN蛋白,為FLCN蛋白的結(jié)構(gòu)和功能研究提供了基礎(chǔ)。