王西西,吳映彤,吳 競(jìng),2,陳鴻軍,郭曉宇,朱鴻飛
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所,北京 100193;2.比利時(shí)列日大學(xué)讓布魯農(nóng)學(xué)院,列日 4000;3. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院上海獸醫(yī)研究所,上海 200241)
非洲豬瘟(African swine fever,ASF)是由非洲豬瘟病毒(African swine fever virus,ASFV)感染引起的一種急性、烈性、高度接觸性的傳染病,可導(dǎo)致不同品種、不同年齡段家豬的高致死性出血性疾病[1],是世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(Office international des épizooties,OIE)法定報(bào)告的烈性傳染病之一。與家豬不同,非洲疣豬(warthogs)或叢林豬(bushpigs)感染ASFV后通常無(wú)癥狀,病毒血癥滴度低,可造成持續(xù)感染[2]。ASFV是唯一已知的蟲(chóng)媒DNA病毒,可通過(guò)節(jié)肢動(dòng)物尤其是乳突鈍緣蜱傳播[2-3],持續(xù)感染的野豬和軟蜱是家豬感染ASF的重要傳染源[4]。
1921年,肯尼亞首次報(bào)道發(fā)現(xiàn)ASF[5],隨后該病在非洲大陸廣泛傳播,現(xiàn)主要在撒哈拉以南的非洲國(guó)家流行。1957年ASFV從非洲傳入歐洲南部國(guó)家并迅速蔓延,葡萄牙、西班牙、意大利等國(guó)家采取了撲殺和嚴(yán)格防控等綜合措施將其撲滅(撒丁島除外)[6]。ASF于2007年傳入高加索地區(qū)以及俄羅斯等國(guó)家,并于2014年傳入歐盟的東部國(guó)家地區(qū)[7-8]。2018年8月3號(hào),中國(guó)動(dòng)物衛(wèi)生與流行病學(xué)中心診斷首次報(bào)道我國(guó)出現(xiàn)非洲豬瘟病例,確診沈陽(yáng)市沈北新區(qū)發(fā)生非洲豬瘟疫情,疫點(diǎn)內(nèi)913頭生豬被撲殺和無(wú)害化處理[9]。
ASFV是在細(xì)胞質(zhì)內(nèi)復(fù)制的雙股大DNA病毒,為非洲病毒科、非洲病毒屬的唯一成員[10-11]。ASFV基因組長(zhǎng)度約為170~190 kb,表達(dá)150多個(gè)開(kāi)放閱讀框,編碼150~200種蛋白[10]。ASFV基因組結(jié)構(gòu)主要包含約125 kb的中央保守區(qū)、38~47 kb的左側(cè)可變區(qū)和13~16 kb的右側(cè)可變區(qū)[12]。ASFV Georgia 2007/1分離株(ASFV-G)屬于基因II型,基因組大小189 344 bp,表達(dá)166個(gè)開(kāi)放閱讀框[13]。UK(DP96R)基因位于右側(cè)可變區(qū),在不同病毒毒株基因組中序列高度保守,屬于病毒毒力基因,是導(dǎo)致家豬發(fā)病重要因素之一[14]。已有研究表明,ASFV E70 毒株缺失UK基因后,病毒毒力減弱;ASFV-G毒株雙缺失9GL和UK基因后,可導(dǎo)致病毒毒力下降,免疫基因缺失毒株2周后即可提供部分針對(duì)母本強(qiáng)毒株病毒的免疫保護(hù)力[14-15]。DP96R蛋白是ASFV早期表達(dá)蛋白,在病毒感染巨噬細(xì)胞后2 h即可以檢測(cè)到DP96R蛋白的表達(dá)[14]。本研究通過(guò)合成ASFV UK基因,構(gòu)建重組原核表達(dá)質(zhì)粒并進(jìn)行原核表達(dá),對(duì)重組蛋白進(jìn)行純化及其多克隆抗體的制備,為后續(xù)DP96R蛋白的血清學(xué)診斷技術(shù)及其生物學(xué)功能研究奠定基礎(chǔ)。
1.1 細(xì)胞、質(zhì)粒和實(shí)驗(yàn)動(dòng)物pET-28a、pEGFP-N1、pEGFP-N1-UK(UK基因序列已進(jìn)行密碼子優(yōu)化)及 HEK293T細(xì)胞均由北京畜牧獸醫(yī)研究所獸醫(yī)公共衛(wèi)生創(chuàng)新與管理團(tuán)隊(duì)保存;根據(jù)ASFV Georgia 2007/1 的UK(DP96R)(GenBank登錄號(hào):FR682468.1)基因序列,由南京金斯瑞生物有限公司合成UK基因并克隆入載體pUC57-simple;1.6~1.8 kg普通級(jí)新西蘭大白兔購(gòu)自北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司。
1.2 主要試劑DMEM、PBS、fetal bovine serum和胰酶購(gòu)自Gibco公司;BamH I/Xho I限制性內(nèi)切酶、T4連接酶、2×PrimeSTAR? HS DNA Polymerase、RNA提取試劑盒、反轉(zhuǎn)錄試劑盒均購(gòu)于TaKaRa生物公司;轉(zhuǎn)染試劑Polyplus jet PRIME kit購(gòu)于達(dá)科為公司;弗氏完全佐劑、弗氏不完全佐劑和IPTG購(gòu)自Sigma公司;EGFP-tag和Anti-rabbit IgG (Alexa Fluor? 594 Conjugate)抗體購(gòu)自Cell Signaling 公司;His-Tag、HRP-conjugated goat Anti-rabbit和抗體HRP-conjugated goat anti-mouse購(gòu)自Protech公司;HisTrap FF crude預(yù)裝柱購(gòu)自GE公司;SDS-PAGE Gel Kit和超敏ECL化學(xué)發(fā)光試劑盒購(gòu)自碧云天生物技術(shù)有限公司;DAB顯色試劑盒購(gòu)自TIANGEN公司;其余試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
1.3 UK基因的合成與重組質(zhì)粒的構(gòu)建根據(jù)ASFV Georgia 2007/1 株 UK基因序列(GenBank登錄號(hào):FR682468.1)合成UK全基因,并連入pUC57-simple載體。利用Primer Premier5.0軟件設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物,UK-F:5'-CGGGATCCATGTCTACACATGATTGT TCTCT-3',UK-R:5'-CCGCTCGAGATTATTCTT CTGGATGGAGCG-3'。上游引物含BamH I酶切位點(diǎn)、下游引物含Xho I酶切位點(diǎn)。引物由金唯智生物科技有限公司合成。
以合成的pUC57-UK質(zhì)粒為模板,UK-F/UK-R為引物,進(jìn)行UK基因的擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系50 μL:2×PrimeSTAR? HS DNA Polymerase 25 μL、上下游引物各2 μL、DNA模板50 ng,ddH2O補(bǔ)至50 μL。PCR反應(yīng)條件:98℃預(yù)變性2 min;98℃變性10 s,60℃退火15 s,72℃延伸20 s,共33個(gè)循環(huán);72℃延伸5 min。1%瓊脂糖凝膠電泳后回收并純化目的片段。目的片段和pET-28a(+)空載體分別經(jīng)BamH I/Xho I雙酶切,純化回收相應(yīng)目的片段,T4連接酶16℃過(guò)夜連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)DH5α,并涂布于相應(yīng)LB平板,37℃倒置培養(yǎng)。菌液PCR鑒定正確后,送至北京金唯智公司測(cè)序。測(cè)序正確的重組質(zhì)粒按照小提質(zhì)粒試劑盒說(shuō)明書(shū)提取質(zhì)粒,命名為pET-28aUK,-20℃保存。
1.4 DP96R蛋白的表達(dá)形式分析將原核表達(dá)質(zhì)粒pET-28a-UK轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,挑取單菌落接種于卡那抗性的LB液體培養(yǎng)基中,37℃、220 r/min培養(yǎng)OD600至0.6~0.8時(shí),加入終濃度為0.4 mmol/L IPTG,分別在37℃培養(yǎng)5 h或在16℃培養(yǎng)10 h后,4℃、12 000×g離心10 min,收集菌體沉淀。沉淀經(jīng)PBS洗滌后,冰浴條件下進(jìn)行超聲破碎(功率28%,超聲3 s,間隔5 s,共破碎60次),12 000×g離心10 min后分別取上清和沉淀,進(jìn)行SDS-PAGE分析。
1.5 DP96R蛋白純化與Western blot鑒定將重組pET-28a-UK接種至2 L卡那抗性LB液體培養(yǎng)基中,37℃、220 r/min培養(yǎng)OD600至0.6;加入終濃度為0.4 mmol/L IPTG,16℃誘導(dǎo)10 h;4℃、12 000×g離心10 min,收集菌體,以PBS洗滌沉淀后再次重懸,冰浴條件下進(jìn)行超聲波破碎至溶液澄清。收集上清液經(jīng)Ni親和層析預(yù)裝柱純化,首先用含30 mmol/L 咪唑的緩沖液洗脫雜質(zhì)蛋白,然后使用含500 mmol/L咪唑的洗脫緩沖液洗脫目的蛋白。將純化后的蛋白進(jìn)行SDS-PAGE、Western blot分析,并進(jìn)行蛋白定量。
1.6 兔多抗血清的制備與鑒定將400 μg DP96R重組蛋白與等體積的弗氏完全佐劑混勻后,在新西蘭大白兔大腿內(nèi)側(cè)肌肉和背部皮下多點(diǎn)注射進(jìn)行首免,同時(shí)對(duì)照組接種等量體積的PBS。首免后2周和4周,分別將DP96R蛋白與等體積的弗氏不完全佐劑混勻后進(jìn)行加強(qiáng)免疫并采集血清。三免后10 d心臟采血,收集血清。
采用方陣滴定法,將純化的DP96R蛋白進(jìn)行倍比稀釋后包被酶標(biāo)板,4℃包被過(guò)夜;用PBST洗滌4次,每次2~3 min,以5%脫脂乳粉37℃封閉2 h;PBST洗滌,DP96R蛋白一免、二免、三免后獲得的抗血清用5%脫脂乳粉進(jìn)行倍比稀釋,分別加入對(duì)應(yīng)蛋白孔,37℃孵育1 h,同時(shí)設(shè)陰性對(duì)照;PBST洗滌,加入用5%脫脂乳粉稀釋的HRP標(biāo)記二抗(稀釋比為1∶4000),37℃孵育1 h;PBST洗滌,每孔加入50 μL TMB顯色液,避光顯色20 min后加入2 mol/L H2SO4終止反應(yīng)并檢測(cè)OD450值。
1.7 Wstern blot及間接免疫熒光檢測(cè)將pEGFP-N1-UK與pEGFP-N1空載體質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,24 h后收獲細(xì)胞,用含1 mmol/L PMSF的細(xì)胞裂解液充分裂解細(xì)胞,離心取上清,進(jìn)行SDS-PAGE電泳,然后濕轉(zhuǎn)至硝酸纖維素膜(NC膜)。將NC膜用含5%脫脂乳粉的TBST溶液37℃封閉2 h,分別用含5%BSA的TBST溶液將EGFP標(biāo)簽單抗和抗DP96R蛋白多抗以1:4000稀釋后作為一抗,37℃作用1 h,洗滌,孵育相應(yīng)二抗,洗滌后進(jìn)行ECL發(fā)光顯色。
此外,將pEGFP-N1-UK和空載體質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)染96孔293T細(xì)胞,24 h后使用4%多聚甲醛室溫固定細(xì)胞30 min;PBS洗滌3次后,每孔加入200 μL含0.3%Triton 100的1%BSA溶液封閉1 h;PBS洗滌后,將 DP96R蛋白多抗以1:1000稀釋后加入對(duì)應(yīng)細(xì)胞孔中,4℃過(guò)夜孵育;PBS洗滌后,添加相應(yīng)熒光二抗在37℃避光孵育1 h,洗滌后進(jìn)行DAPI染色,置于熒光顯微鏡下觀察結(jié)果。
2.1 UK基因重組質(zhì)粒的構(gòu)建PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,在250~500 bp之間可見(jiàn)單一擴(kuò)增條帶(圖1),條帶大小與預(yù)期相符(UK:291 bp)。將PCR產(chǎn)物進(jìn)行回收,經(jīng)雙酶切后與載體質(zhì)粒pET-28a(+)連接并轉(zhuǎn)化DH5Hα,挑取菌落進(jìn)行菌液PCR鑒定后測(cè)序驗(yàn)證,測(cè)序正確后將重組質(zhì)粒分別命名為pET-28a-UK、pEGFP-N1-UK。
圖1 ASFV UK基因的PCR擴(kuò)增Fig. 1 PCR amplication of ASFV-UK gene
2.2 DP96R蛋白的表達(dá)形式分析SDS-PAGE結(jié)果表明,IPTG濃度為0.4 mmol/L時(shí),在16℃誘導(dǎo)10 h或37℃誘導(dǎo)5 h后,pET-28a-UK樣品中均出現(xiàn)1條明顯的蛋白條帶,大小約15 kDa,與預(yù)測(cè)的11 kDa相差較大。這種差異可能與串聯(lián)重復(fù)序列的存在而導(dǎo)致的異常凝膠遷移率有關(guān),蛋白以可溶性表達(dá)為主,空載體pET-28a對(duì)照組及未誘導(dǎo)的pET-28a-UK菌液樣品中均未出現(xiàn)對(duì)應(yīng)條帶(圖2)。
圖2 DP96R蛋白 SDS-PAGE分析Fig. 2 SDS-PAGE analysis of DP96R protein
2.3 DP96R蛋白純化的SDS-PAGE分析及Western blot驗(yàn)證利用HisTrap FF crude預(yù)裝柱純化重組DP96R蛋白,SDS-PAGE和Western blot結(jié)果表明,純化后的DP96R蛋白條帶較為單一(圖3A、3B)。蛋白純度達(dá)到90%以上,BCA法定量蛋白濃度為600 μg/mL,滿足后期免疫要求。
圖3 純化重組蛋白DP96R的SDS-PAGE(A)及Western blot(B)鑒定Fig. 3 SDS-PAGE(A) and Western blot(B) analysis of puri fied DP96R proteins
2.4 DP96R蛋白多克隆抗體的制備與鑒定利用純化的DP96R重組蛋白免疫新西蘭大白兔,分別在14、28、38 d采血,收集血清并進(jìn)行間接ELISA檢測(cè)。結(jié)果如圖4所示,DP96R蛋白首次免疫后2周,抗體水平開(kāi)始上升,加強(qiáng)免疫后2周抗體水平有顯著提高,3次免疫后抗體維持在較高水平,而對(duì)照組3次免疫血清抗體檢測(cè)均為陰性(OD450<0.10)。
圖4 抗DP96R蛋白多克隆抗體的制備與鑒定Fig. 4 Preparation and identi fication of anti-DP96R protein polyclonal antibodies
2.5 DP96R蛋白多克隆抗體特異性分析與鑒定為驗(yàn)證多克隆抗體的特異性,將pEGFP-N1-UK質(zhì)粒和pEGFP-N1空載體分別轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,進(jìn)行免疫熒光檢測(cè)(immunofluorescence assay,IFA)和Western blot分析。IFA結(jié)果顯示,DP96R蛋白多克隆抗體可特異性識(shí)別293T細(xì)胞中表達(dá)的DP96R蛋白,而與空白對(duì)照沒(méi)有反應(yīng)(圖5)。DP96R蛋白多抗與EGFP抗體均可識(shí)別蛋白分子量大小約為40 kDa的特異性蛋白條帶(圖6)。結(jié)果表明制備的抗DP96R蛋白的多克隆抗體具較好的反應(yīng)性和特異性。
圖5 DP96R蛋白免疫熒光檢測(cè)Fig. 5 Immuno fl uorescence assay analysis of DP96R protein
圖6 DP96R 蛋白的Western blot檢測(cè)Fig. 6 Western blot analysis of DP96R protein
ASF為OIE法定報(bào)告的烈性傳染病之一,給全球養(yǎng)殖業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。我國(guó)將其列為動(dòng)物一類傳染病,至今仍無(wú)有效的商品化疫苗問(wèn)世。現(xiàn)有ASF的防控方法主要包括流行病學(xué)監(jiān)測(cè)、劃定疫區(qū)以及撲殺受感染動(dòng)物等[16-17]。目前,在ASF的疫苗研究中,缺失活病毒疫苗是研究的重點(diǎn)[18-20]。UK基因是ASFV的毒力基因之一,UK基因位于基因組右側(cè)毒力相關(guān)基因NL-S的上游。已有研究表明,UK基因?qū)SFV在體外巨噬細(xì)胞內(nèi)的增殖是非必需基因,但卻是影響病毒毒力和對(duì)家豬致病力的重要因素之一[14]。ASFV E70缺失UK基因,ASFV Georgia 2007毒株同時(shí)缺失9GL和UK基因后,病毒毒力均明顯下降,且免疫后能提供一定的保護(hù)力[15]。
對(duì)歐洲、非洲等來(lái)源的ASFV毒株UK基因進(jìn)行序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)UK基因表達(dá)的DP96R蛋白氨基酸序列高度保守,遺傳數(shù)據(jù)庫(kù)未發(fā)現(xiàn)與UK基因具有顯著相似性的其他已知基因。ASFV Georgia 2007毒株中UK基因開(kāi)放閱讀框共有291 bp,表達(dá)96個(gè)氨基酸,其中包含4個(gè)連續(xù)重復(fù)序列,每個(gè)序列包含10個(gè)氨基酸(EKXXXXXXXX)[14],這些串聯(lián)重復(fù)序列的存在導(dǎo)致異常凝膠遷移率,因此重組原核DP96R蛋白的分子量在15 kDa左右。
本研究針對(duì)ASFV Georgia 2007/1的UK基因,構(gòu)建了含有His標(biāo)簽的重組原核表達(dá)質(zhì)粒。在原核表達(dá)系統(tǒng)中,低溫誘導(dǎo)時(shí),DP96R蛋白主要呈可溶性表達(dá),經(jīng)純化獲得純度>90%的重組蛋白。Western blot和ELISA結(jié)果表明DP96R蛋白具有較好的反應(yīng)原性,制備的多抗可用于Western blot檢測(cè)和IFA檢測(cè),為進(jìn)一步研究蛋白的生物學(xué)功能以及建立ASFV UK基因缺失毒株鑒別診斷方法奠定了基礎(chǔ)。